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TEMA 1 - PROTEÍNAS
Biomoléculas
• La célula es la unidad básica de los seres vivos y está formada por una gran diversidad
de substancias que toman el nombre general de biomoléculas.
• Las biomoléculas pueden ser:
• Inorgánicas: Agua, gases, sales minerales.
• Orgánicas: Carbohidratos (azúcares), lípidos (grasas), proteínas, ácidos
nucleicos.
• Las biomoléculas orgánicas son muy diversas y pueden formar estructuras grandes y
complejas llamadas macromoléculas. Sin embargo, todas se forman o derivan de
unidades estructurales simples. Para los 4 tipos de biomoléculas orgánicas, las
unidades estructurales y las macromoléculas que forman son:
Tipo de biomolécula Unidad estructural Principales macromoléculas
Carbohidratos Monosacáridos Polisacáridos
Lípidos Ácidos grasos Triacilgliceroles, otros
Proteínas Aminoácidos Péptidos y proteínas
Ácidos nucleicos Nucleótidos ADN, ARN
-1-
• Los polisacáridos, las proteínas y los ácidos nucleicos se forman por cadenas de
unidades estructurales o monómeros unidas por enlaces covalentes. Esta unión se llama
polimerización, por lo cual la macromolécula es un polímero. Es decir, un polisacárido
es un polímero de monosacáridos, una proteína es un polímero de aminoácidos, el ADN
es un polímero de nucleótidos, etc. Las unidades estructurales son como ladrillos con
los cuales se construyen las macromoléculas. Aunque las unidades estructurales son
pocas, se pueden construir una inmensa variedad de macromoléculas.
• Los lípidos no son polímeros, pero todos contienen ácidos grasos o se derivan de ellos.
-2-
• Las principales funciones de las biomoléculas orgánicas son:
Biomolécula Funciones principales
Carbohidratos Proporcionar energía
Lípidos Proporcionar energía; estructural
Proteínas
Estructural; catálisis; transporte; regulación de procesos
fisiológicos; movimiento
Ácidos nucleicos Almacenamiento y transmisión de información genética
Proteínas
• Las proteínas son las biomoléculas más abundantes después del agua.
• En el organismo existen miles de proteínas distintas, de tamaños y estructuras muy
variados, lo cual permite a cada una cumplir una función distinta.
• En conjunto, las proteínas desempeñan una gran variedad de funciones: estructural,
catálisis de reacciones químicas, transporte de sustancias, regulación de procesos
fisiológicos, movimiento, entre otras.
• Las proteínas están formadas por una o más cadenas de aminoácidos.
• Las cadenas de aminoácidos reciben nombres distintos de acuerdo a su longitud: las
cadenas de menos de 100 aminoácidos se llaman péptidos, mientras que las cadenas de
100 o más aminoácidos se llaman proteínas. Es decir, las proteínas pequeñas se llaman
péptidos.
Aminoácidos
• Los aminoácidos son las unidades estructurales que conforman las proteínas. Son
moléculas orgánicas que poseen:
• Un grupo amino (NH2).
• Un grupo carboxilo (COOH).
• Una cadena lateral (representada por la letra R). Esta cadena lateral es diferente
para cada aminoácido.
• Estos tres elementos y un átomo de hidrógeno se unen a un átomo de carbono llamado
carbono .
-3-
• Solamente 20 aminoácidos forman parte de las proteínas de los seres vivos, aunque en
la naturaleza existen muchos más.
• La cadena lateral de cada aminoácido tiene propiedades químicas distintas:
• Las cadenas laterales de los aminoácidos glicina, alanina, prolina, valina,
leucina, isoleucina, metionina, triptófano y fenilalanina son no polares o
hidrofóbicas.
• Las cadenas laterales de los aminoácidos serina, treonina, tirosina, asparragina,
glutamina y cisteína son polares sin carga.
• Las cadenas laterales de los aminoácidos lisina, arginina e histidina tienen carga
positiva.
• Las cadenas laterales de los aminoácidos glutamato y aspartato tienen carga
negativa.
• Así mismo, las cadenas laterales pueden contener una variedad de elementos y grupos
químicos (por ejemplo, metionina y cisteína contienen azufre; serina, treonina y tirosina
contienen un grupo hidroxilo) o cadenas alifáticas o aromáticas.
• Estas propiedades de las cadenas laterales de los aminoácidos hacen que cada proteína,
que contiene distinta cantidad y secuencia de aminoácidos, tenga propiedades químicas
diferentes a las otras proteínas y pueda cumplir funciones distintas.
NH2 COOH
C
R
Grupo amino Grupo carboxilo
Cadena lateral
(diferente para cada aminoácido)
H
-4-
• En el siguiente gráfico se muestran las cadenas laterales de los 20 aminoácidos
agrupados por sus propiedades químicas:
Tomado de Lieberman, L., Marks, A., Peet A. (2013) Marks’ Basic Medical Biochemistry (p.
74). Philadelphia, PA: Lippincott, Williams & Wilkins.
-5-
Enlaces peptídicos
• Para formar una proteína, los aminoácidos se unen por enlaces covalentes llamados
enlaces peptídicos.
• Un enlace peptídico une el carbono del grupo carboxilo de un aminoácido con el
nitrógeno del grupo amino de otro aminoácido. Esta unión de dos aminoácidos forman
un dipéptido.
Aminoácido 1 Aminoácido 2 Dipéptido
Enlace
peptídico
Extremo
amino-terminal
Extremo
carboxi-terminal
• La unión de varios aminoácidos por enlaces peptídicos forma una cadena polipeptídica
que tiene una columna vertebral monótona formada por átomos de nitrógeno y
carbono, de la cual salen las cadenas laterales (R), distintas para cada aminoácido. Toda
cadena polipeptídica tiene un grupo amino en un extremo y un grupo carboxilo en el
otro extremo.
• Las cadenas de 2 a 99 aminoácidos se llaman péptidos.
• Los oligopéptidos tienen entre 2 y 20 aminoácidos (incluyen dipéptidos,
tripéptidos, tetrapéptidos, etc.)
• Los polipéptidos tienen entre 21 y 99 aminoácidos
• Las cadenas de 100 aminoácidos o más se llaman proteínas.
• Algunas proteínas se forman por más de una cadena polipeptídica y reciben el nombre
de proteínas multiméricas. En éstas, las cadenas que componen la proteína se llaman
subunidades y su unión por enlaces covalentes forma la proteína.
-6-
Estructura de las proteínas
• Cada péptido o proteína está formada por una secuencia particular de aminoácidos que
le da una estructura particular que le permite cumplir sus funciones.
• Las proteínas no están extendidas como una cadena, sino que inmediatamente después
de su síntesis adquieren una estructura definida por uniones entre las cadenas laterales
de sus aminoácidos llamada conformación nativa.
• La mayor parte de las proteínas se empacan en una esfera y reciben el nombre
de proteínas globulares.
• Algunas proteínas forman estructuras alargadas y reciben el nombre de proteínas
fibrilares.
• La estructura de las proteínas se describe en 4 niveles:
• Estructura primaria: es la secuencia lineal de aminoácidos. Esta secuencia es diferente
para cada proteína y se mantiene por los enlaces peptídicos.
• Estructura secundaria: es el plegamiento de la proteína a lo largo de un eje, que puede
formar varios tipos de estructuras. Dos de las estructuras más comunes son: hélices  y
hojas plegadas . Estas estructuras son estabilizadas por enlaces no covalentes,
principalmente puentes de hidrógeno.
• Estructura terciaria: se refiere al enrollamiento de las estructuras secundarias que
determina la configuración de la proteína en tres dimensiones. La estructura terciaria es
estabilizada por enlaces no covalentes como interacciones electrostáticas, puentes de
hidrógeno, interacciones de Van der Waals e interacciones hidrofóbicas, y también
pueden participar puentes disulfuro, que son un tipo de enlace covalente.
• En las proteínas globulares, los aminoácidos con cadenas laterales hidrofóbicas (que
repelen las moléculas de agua) se localizan en el interior de la proteína, unidos por
interacciones hidrofóbicas, mientras que los aminoácidos con cadenas hidrofílicas
quedan hacia el exterior en contacto con el agua. Por esto, las proteínas son moléculas
solubles en agua.
• Los aminoácidos que están juntos en la estructura terciaria pueden estar muy alejados
en la estructura primaria y se juntan debido al enrollamiento de la cadena.
-7-
Alanina
Glicina
Valina
Serina
Leucina
Lisina
Glicina
Valina
Primaria Secundaria Terciaria Cuaternaria
Niveles de estructura de las proteínas
Modificado de Lieberman, L., Marks, A., Peet A. (2013) Marks’ Basic Medical Biochemistry
(p. 89). Philadelphia, PA: Lippincott, Williams & Wilkins.
• Estructura cuaternaria: se presenta solamente en las proteínas multiméricas y se refiere
a la manera cómo se unen y disponen las distintas subunidades de éstas. Las uniones de
este nivel se mantienen principalmente por puentes disulfuro aunque también
contribuyen enlaces no covalentes.
Síntesis de proteínas
• Los péptidos y proteínas se sintetizan en los ribosomas, organelos que pueden estar
libres en el citoplasma o unidos al retículo endoplásmico rugoso. Las proteínas
citoplasmáticas se sintetizan en ribosomas libres, mientras que las proteínas de
membrana y aquellas que van a ser secretadas por la célula hacia el exterior se
sintetizan en el retículo endoplásmico rugoso.
• Para sintetizar una proteína particular, el ribosoma debe formar los enlaces peptídicos
entre los aminoácidos correspondientes a la secuencia de esa proteína. Esto se logra
gracias a que el ribosoma usa una molécula de RNA mensajero (mRNA) como
plantilla.
-8-
• El mRNA está formado por ribonucleótidos, cuya secuencia particular define la
secuencia de aminoácidos de la proteína. Tres ribonucleótidos forman un codón, al cual
puede unirse un RNA de transferencia (tRNA) que tiene la secuencia complementaria
o anticodón. Cada tRNA particular se une a un aminoácido y lo lleva al ribosoma de
acuerdo a la secuencia del mRNA. En el ribosoma se forman los enlaces peptídicos y
así se forma la cadena peptídica con la secuencia requerida. La síntesis de una cadena
peptídica a partir del mRNA en el ribosoma se llama traducción.
• A su vez, la molécula de mRNA se origina usando como plantilla a una región de DNA,
molécula compuesta de desoxiribonucleótidos. Una secuencia de desoxiribonucleótidos
particular es capaz de generar la molécula de mRNA con la secuencia adecuada para
que se sintetice la proteína. La síntesis de RNA a partir del DNA se llama
transcripción y es llevada a cabo por la enzima RNA polimerasa en el núcleo.
a
a
a
TRADUCCIÓN
TRANSCRIPCIÓN
Modificado de Purves, W., Sadava, D., Orians G., Heller, C. (2001) Life The Science of
Biology (p. 261). Gordonsville, VA: W.H. Freeman and Company.
Gen
-9-
• La región de DNA que contiene la información necesaria para que se sintetice una
cadena peptídica se llama gen. Un péptido o proteína compuesta por una sola cadena
peptídica requiere solamente un gen, mientras que para sintetizar una proteína
multimérica que contiene dos o más cadenas peptídicas distintas, se requiere un gen
para cada cadena.
• La región de un gen que contiene la información para que se sintetice una proteína se
conoce como región codificante. Los genes tienen regiones no codificantes, entre las
cuales se encuentran regiones reguladoras que determinan si la transcripción del gen
está activa o no. Todos los genes tienen una región reguladora llamada promotor. La
accesibilidad de esta región a la RNA polimerasa determina si la transcripción del gen
se inicia o no.
Bibliografía
Lieberman, L., Marks, A., Peet A. (2013) Marks’ Basic Medical Biochemistry.
Philadelphia, PA: Lippincott, Williams & Wilkins.
Tymoczko, J. L., Berg, J.M., Stryer, L. (2010) Biochemistry: A Short Course. New York,
NY: W. H. Freeman and Company.

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Proteínas

  • 1. TEMA 1 - PROTEÍNAS Biomoléculas • La célula es la unidad básica de los seres vivos y está formada por una gran diversidad de substancias que toman el nombre general de biomoléculas. • Las biomoléculas pueden ser: • Inorgánicas: Agua, gases, sales minerales. • Orgánicas: Carbohidratos (azúcares), lípidos (grasas), proteínas, ácidos nucleicos. • Las biomoléculas orgánicas son muy diversas y pueden formar estructuras grandes y complejas llamadas macromoléculas. Sin embargo, todas se forman o derivan de unidades estructurales simples. Para los 4 tipos de biomoléculas orgánicas, las unidades estructurales y las macromoléculas que forman son: Tipo de biomolécula Unidad estructural Principales macromoléculas Carbohidratos Monosacáridos Polisacáridos Lípidos Ácidos grasos Triacilgliceroles, otros Proteínas Aminoácidos Péptidos y proteínas Ácidos nucleicos Nucleótidos ADN, ARN -1- • Los polisacáridos, las proteínas y los ácidos nucleicos se forman por cadenas de unidades estructurales o monómeros unidas por enlaces covalentes. Esta unión se llama polimerización, por lo cual la macromolécula es un polímero. Es decir, un polisacárido es un polímero de monosacáridos, una proteína es un polímero de aminoácidos, el ADN es un polímero de nucleótidos, etc. Las unidades estructurales son como ladrillos con los cuales se construyen las macromoléculas. Aunque las unidades estructurales son pocas, se pueden construir una inmensa variedad de macromoléculas. • Los lípidos no son polímeros, pero todos contienen ácidos grasos o se derivan de ellos.
  • 2. -2- • Las principales funciones de las biomoléculas orgánicas son: Biomolécula Funciones principales Carbohidratos Proporcionar energía Lípidos Proporcionar energía; estructural Proteínas Estructural; catálisis; transporte; regulación de procesos fisiológicos; movimiento Ácidos nucleicos Almacenamiento y transmisión de información genética Proteínas • Las proteínas son las biomoléculas más abundantes después del agua. • En el organismo existen miles de proteínas distintas, de tamaños y estructuras muy variados, lo cual permite a cada una cumplir una función distinta. • En conjunto, las proteínas desempeñan una gran variedad de funciones: estructural, catálisis de reacciones químicas, transporte de sustancias, regulación de procesos fisiológicos, movimiento, entre otras. • Las proteínas están formadas por una o más cadenas de aminoácidos. • Las cadenas de aminoácidos reciben nombres distintos de acuerdo a su longitud: las cadenas de menos de 100 aminoácidos se llaman péptidos, mientras que las cadenas de 100 o más aminoácidos se llaman proteínas. Es decir, las proteínas pequeñas se llaman péptidos. Aminoácidos • Los aminoácidos son las unidades estructurales que conforman las proteínas. Son moléculas orgánicas que poseen: • Un grupo amino (NH2). • Un grupo carboxilo (COOH). • Una cadena lateral (representada por la letra R). Esta cadena lateral es diferente para cada aminoácido. • Estos tres elementos y un átomo de hidrógeno se unen a un átomo de carbono llamado carbono .
  • 3. -3- • Solamente 20 aminoácidos forman parte de las proteínas de los seres vivos, aunque en la naturaleza existen muchos más. • La cadena lateral de cada aminoácido tiene propiedades químicas distintas: • Las cadenas laterales de los aminoácidos glicina, alanina, prolina, valina, leucina, isoleucina, metionina, triptófano y fenilalanina son no polares o hidrofóbicas. • Las cadenas laterales de los aminoácidos serina, treonina, tirosina, asparragina, glutamina y cisteína son polares sin carga. • Las cadenas laterales de los aminoácidos lisina, arginina e histidina tienen carga positiva. • Las cadenas laterales de los aminoácidos glutamato y aspartato tienen carga negativa. • Así mismo, las cadenas laterales pueden contener una variedad de elementos y grupos químicos (por ejemplo, metionina y cisteína contienen azufre; serina, treonina y tirosina contienen un grupo hidroxilo) o cadenas alifáticas o aromáticas. • Estas propiedades de las cadenas laterales de los aminoácidos hacen que cada proteína, que contiene distinta cantidad y secuencia de aminoácidos, tenga propiedades químicas diferentes a las otras proteínas y pueda cumplir funciones distintas. NH2 COOH C R Grupo amino Grupo carboxilo Cadena lateral (diferente para cada aminoácido) H
  • 4. -4- • En el siguiente gráfico se muestran las cadenas laterales de los 20 aminoácidos agrupados por sus propiedades químicas: Tomado de Lieberman, L., Marks, A., Peet A. (2013) Marks’ Basic Medical Biochemistry (p. 74). Philadelphia, PA: Lippincott, Williams & Wilkins.
  • 5. -5- Enlaces peptídicos • Para formar una proteína, los aminoácidos se unen por enlaces covalentes llamados enlaces peptídicos. • Un enlace peptídico une el carbono del grupo carboxilo de un aminoácido con el nitrógeno del grupo amino de otro aminoácido. Esta unión de dos aminoácidos forman un dipéptido. Aminoácido 1 Aminoácido 2 Dipéptido Enlace peptídico Extremo amino-terminal Extremo carboxi-terminal • La unión de varios aminoácidos por enlaces peptídicos forma una cadena polipeptídica que tiene una columna vertebral monótona formada por átomos de nitrógeno y carbono, de la cual salen las cadenas laterales (R), distintas para cada aminoácido. Toda cadena polipeptídica tiene un grupo amino en un extremo y un grupo carboxilo en el otro extremo. • Las cadenas de 2 a 99 aminoácidos se llaman péptidos. • Los oligopéptidos tienen entre 2 y 20 aminoácidos (incluyen dipéptidos, tripéptidos, tetrapéptidos, etc.) • Los polipéptidos tienen entre 21 y 99 aminoácidos • Las cadenas de 100 aminoácidos o más se llaman proteínas. • Algunas proteínas se forman por más de una cadena polipeptídica y reciben el nombre de proteínas multiméricas. En éstas, las cadenas que componen la proteína se llaman subunidades y su unión por enlaces covalentes forma la proteína.
  • 6. -6- Estructura de las proteínas • Cada péptido o proteína está formada por una secuencia particular de aminoácidos que le da una estructura particular que le permite cumplir sus funciones. • Las proteínas no están extendidas como una cadena, sino que inmediatamente después de su síntesis adquieren una estructura definida por uniones entre las cadenas laterales de sus aminoácidos llamada conformación nativa. • La mayor parte de las proteínas se empacan en una esfera y reciben el nombre de proteínas globulares. • Algunas proteínas forman estructuras alargadas y reciben el nombre de proteínas fibrilares. • La estructura de las proteínas se describe en 4 niveles: • Estructura primaria: es la secuencia lineal de aminoácidos. Esta secuencia es diferente para cada proteína y se mantiene por los enlaces peptídicos. • Estructura secundaria: es el plegamiento de la proteína a lo largo de un eje, que puede formar varios tipos de estructuras. Dos de las estructuras más comunes son: hélices  y hojas plegadas . Estas estructuras son estabilizadas por enlaces no covalentes, principalmente puentes de hidrógeno. • Estructura terciaria: se refiere al enrollamiento de las estructuras secundarias que determina la configuración de la proteína en tres dimensiones. La estructura terciaria es estabilizada por enlaces no covalentes como interacciones electrostáticas, puentes de hidrógeno, interacciones de Van der Waals e interacciones hidrofóbicas, y también pueden participar puentes disulfuro, que son un tipo de enlace covalente. • En las proteínas globulares, los aminoácidos con cadenas laterales hidrofóbicas (que repelen las moléculas de agua) se localizan en el interior de la proteína, unidos por interacciones hidrofóbicas, mientras que los aminoácidos con cadenas hidrofílicas quedan hacia el exterior en contacto con el agua. Por esto, las proteínas son moléculas solubles en agua. • Los aminoácidos que están juntos en la estructura terciaria pueden estar muy alejados en la estructura primaria y se juntan debido al enrollamiento de la cadena.
  • 7. -7- Alanina Glicina Valina Serina Leucina Lisina Glicina Valina Primaria Secundaria Terciaria Cuaternaria Niveles de estructura de las proteínas Modificado de Lieberman, L., Marks, A., Peet A. (2013) Marks’ Basic Medical Biochemistry (p. 89). Philadelphia, PA: Lippincott, Williams & Wilkins. • Estructura cuaternaria: se presenta solamente en las proteínas multiméricas y se refiere a la manera cómo se unen y disponen las distintas subunidades de éstas. Las uniones de este nivel se mantienen principalmente por puentes disulfuro aunque también contribuyen enlaces no covalentes. Síntesis de proteínas • Los péptidos y proteínas se sintetizan en los ribosomas, organelos que pueden estar libres en el citoplasma o unidos al retículo endoplásmico rugoso. Las proteínas citoplasmáticas se sintetizan en ribosomas libres, mientras que las proteínas de membrana y aquellas que van a ser secretadas por la célula hacia el exterior se sintetizan en el retículo endoplásmico rugoso. • Para sintetizar una proteína particular, el ribosoma debe formar los enlaces peptídicos entre los aminoácidos correspondientes a la secuencia de esa proteína. Esto se logra gracias a que el ribosoma usa una molécula de RNA mensajero (mRNA) como plantilla.
  • 8. -8- • El mRNA está formado por ribonucleótidos, cuya secuencia particular define la secuencia de aminoácidos de la proteína. Tres ribonucleótidos forman un codón, al cual puede unirse un RNA de transferencia (tRNA) que tiene la secuencia complementaria o anticodón. Cada tRNA particular se une a un aminoácido y lo lleva al ribosoma de acuerdo a la secuencia del mRNA. En el ribosoma se forman los enlaces peptídicos y así se forma la cadena peptídica con la secuencia requerida. La síntesis de una cadena peptídica a partir del mRNA en el ribosoma se llama traducción. • A su vez, la molécula de mRNA se origina usando como plantilla a una región de DNA, molécula compuesta de desoxiribonucleótidos. Una secuencia de desoxiribonucleótidos particular es capaz de generar la molécula de mRNA con la secuencia adecuada para que se sintetice la proteína. La síntesis de RNA a partir del DNA se llama transcripción y es llevada a cabo por la enzima RNA polimerasa en el núcleo. a a a TRADUCCIÓN TRANSCRIPCIÓN Modificado de Purves, W., Sadava, D., Orians G., Heller, C. (2001) Life The Science of Biology (p. 261). Gordonsville, VA: W.H. Freeman and Company. Gen
  • 9. -9- • La región de DNA que contiene la información necesaria para que se sintetice una cadena peptídica se llama gen. Un péptido o proteína compuesta por una sola cadena peptídica requiere solamente un gen, mientras que para sintetizar una proteína multimérica que contiene dos o más cadenas peptídicas distintas, se requiere un gen para cada cadena. • La región de un gen que contiene la información para que se sintetice una proteína se conoce como región codificante. Los genes tienen regiones no codificantes, entre las cuales se encuentran regiones reguladoras que determinan si la transcripción del gen está activa o no. Todos los genes tienen una región reguladora llamada promotor. La accesibilidad de esta región a la RNA polimerasa determina si la transcripción del gen se inicia o no. Bibliografía Lieberman, L., Marks, A., Peet A. (2013) Marks’ Basic Medical Biochemistry. Philadelphia, PA: Lippincott, Williams & Wilkins. Tymoczko, J. L., Berg, J.M., Stryer, L. (2010) Biochemistry: A Short Course. New York, NY: W. H. Freeman and Company.