Esitys lukiolaisille LUMA-keskuksen Dyna-miittiin. 2.10.2013

1. Kaiken takana on loinen
Tuomas Aivelo
Biotekniikan instituutti,
Helsingin yliopisto
Dyna-miitti 2.10.2013

2. Kaikilla maailman eliöillä on loisia.
Yli puolet maailman eliöistä on loisia.

3. Mitä on loiset?
Läheisyys
+
Mutualismi
Kommensalismi
Symbioosi
Saalistus /
laidunnus
Parasitoidismi
Ulkoloiset Sisäloiset

4. Loiselämä
Ongelma:
Loisen pitäisi käyttää niin
paljon isäntää hyödyksi
kuin pystyy vaarantamatta
omaa lisääntymiskykyä.
TRAGEDY OF
COMMONS!

5. Virulenssi
• Kuinka suurta haittaa
kelpoisuudelle tauti aiheuttaa?
• Trade-off: Jos tapat uhrisi
nopeasti, sinun pitää myös
siirtyä seuraavaan uhriin
nopeasti.
?

7. Tautien eri taktiikat
• Sukupuoliteitse
• Vektorin välityksellä
• Pisaratartunta
• Yms.

8. Miksei taudeista päästä koskaan
eroon?
John Tenniel

9. http://www.mpg.de/19341/Computational_di
sease_models?page=3

10. Monista taudeista on päästy eroon!
• Isorokko
– > rokotukset
• Guineamato
– > hygienia
• Malaria Suomessa
– > elintason nousu

11. Monet taudit ovat vaikeita
• Zoonoosit:
– Uusia tauteja koti- tai villieläimiltä
• Viimeaikaisia mm. HIV, Ebola, influenssat
– Taudit liikkuvat enemmän toiseen suuntaan!
• Antibioottiresistenssiä:
– Sairaalabakteerit: MRSA, VRE jne.
– Malarialoisiot

12. Madagaskar

Madagaskar
eristyneenä
viimeiset n. 85
miljoonaa vuotta

Ihmisasutus
vakiintui n. 1500
vuotta sitten

Merkittävä määrä
eläimiä kuollut
sukupuuttoon
viimeisen 1000
vuoden aikana

Alkuperäisestä
metsäalasta jäljellä
noin 15 prosenttia

14. Ranomafanan
kansallispuisto
• Itäisen Madagaskarin
vuoristosademetsä
• Perustettu 1990
• Kansainvälisen tason
tutkimusasema,
Centre Valbio

16. Madagaskarin eläimistö
• Neljä endeemistä nisäkäsryhmää:
– Makit, puoliapinoita
– Tanrekit, afrikkalaisia hyönteissyöjiä
– Madagaskarinrotat, jyrsijöitä
– Falanukit, kissamaisia
• Tulokaslajeja:
– Mustarotta, hiiri
– Koira, kissa
– Ihminen, zebu

17. • Puoliapinoita
• Pitkäikäisiä, jopa 10
vuotta luonnossa
• Pieniä
• Suhteellisen
pysyvät reviirit
• Monenlaisissa
elinympäristöissä
• Aktiivisimmillaan
lokakuussa (tää on
vaan bonus)
Hiirimakit

18. Makit
• Puoliapinoita
• Yleisesti naarasdominantteja

19. • Mallieläin Alzheimerin taudille?
• Vanhenevat vankeudessa, eivät luonnossa
• Horrostavat, naarasdominantteja, yöaktiivisia
• Tulevaisuuden suunnitelmat sekvenoida

20. Kenttätyö
• Syyskuulta joulukuulle
• Ansat öisin silmien
korkeudelle
• Sisälle banaania

21. Punkit ja täit:
Ulkoloisten määrä
Mikrosiru
 yksilöt
Karvanäyte
 genetiikka
Morfometriikka
-Paino
-Hännän, hauiksen
ja reiden
ympärysmitta
Ulostenäyte:
-Hormoonit
-Sisäloiset
-Ruokavalio
Vaginan ja kivesten koko
Lisääntymistila
Sukupuoli
Hammasvalos
 ikä
Persoonallisuus
Ansan sijainti
ja aika

23. Opportunistista ulosteenkeräystä

Ansoihin tulee monenlaisia muitakin eläimiä

Isoja makeja voi seurata ja kerätä ulosteet

24. Sukkulamadot
• Prevalenssi lähes 100%
• Helppo eristää
• Paljon tutkittuja, mutta…

25. Pyrosekvensointi
• Lajintunnistaminen 18S-geenisekvenssin
(ribosomin pieni yksikkö) perusteella
• Yhdessä näytteessä 0-1500 toukkamuotoa

26. Mitä tehdä miljoonan 700 emäksen
sekvenssin kanssa?

27. Alustavia tuloksia
• Mustarotilla ja koirilla samaa lajistoa, joka
eroaa hiirimakeista
• Hiirimakien loisia myös mustarotilla
– > tulokaslaji lisää loistaakkaa?
• Horrostaminen tappaa sukkulamadot suolesta

28. Kysymyksiä?

29. Lisätietoja
http://twitter.com/aivelo
http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernvall.shtml
http://fifi.voima.fi/blogit/tekija/tuomas-aivelo
http://blogs.helsinki.fi/t-retki/author/aivelo/
https://peda.net/oppimateriaalit/e-oppi/lukio/biologia/symbioosi2/1pje/haastattelu
http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/bioteknologia/hiirimakien-loisten-tutkimus-perustuu-dnan-
sekvensointiin
http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/perinnollisyys/tutkijan-kommentti-perinnollisyyden-opetus-
kaipaa-paivittamista