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Variante de Preocupación
Ómicron del SARS-CoV-2
Instituto Nacional de Salud
Centro Nacional Salud Pública
19 de diciembre 2021
Situación actual de variante Ómicron de SARS-CoV-2
• Nuevo linaje detectado en Sudáfrica y caracterizado el 24/nov/2021,
siendo designado por la OMS como Variante de Preocupación (VOC)
denominada “Ómicron” el 26/nov/2021.
• Al 19/dic/2021, Casos totales confirmados: 57,959 a nivel mundial en
mas de 70 países, todos los continentes.
• Mayoría de casos confirmados en: Reino Unido (37,101), Dinamarca
(11,559), Noruega (2,060), y Sudáfrica (1,247 confirmados, y 77,844
probables).
• En Norteamérica: EEUU (859), Canadá (799).
• En América Latina: Argentina (454), Chile (29), Brasil (22), México (7),
Cuba (5), Ecuador (3)
Ómicron ha desplazado a Delta rápidamente en Sudáfrica
UK Health Security Agency. Omicron Daily Overview 18/12/21
Se espera gran
cantidad de casos,
pero su traducción en
casos severos y
muertes es muy
incierta hasta el
momento
El número de casos
se está duplicando
cada 2-3 días
Ómicron no
necesariamente es tan
“benigna, ya se han
reportado 7 muertes e
incremento rápido de
hospitalizaciones
Omicron está
desplazando a
delta en una
semana
En Reino Unido
El Imperial College de Londres asegura que NO hay ninguna
evidencia de que la enfermedad por Omicron sea más “leve”
Imperial College COVID-19 response team. Reporte 49. 16/dic/2021.
https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/mrc-gida/2021-12-16-COVID19-Report-49.pdf
En reino unido, la efectividad para
todo tipo de estatus vacunal, es
menor para Ómicron que para Delta.
Incluso paradójicamente, se ha
observado enalgunos casos, los
vacunados tienen “más” riesgo de
estar infectados per son números
muy pequeños.
En comparación a la variante Delta, la variante Omicron no
mantiene la efectividad de las vacunas y el escape inmunológico es
significativo
Vigilancia Genómica en Perú para Ómicron
Aparte de las 382 muestras semanales que secuencia el INS como parte de la
vigilancia genómica, se implementó lo siguiente:
• Desde el 11/nov/21, el INS viene usando el kit para PCR Allplex Master
Assay, que señala la presencia de mutaciones encontradas en las Variantes
Alfa, Beta, Gamma, y Mu. Una de estas mutaciones también está en la VOC
Ómicron (HV69/70del), por lo que las muestras positivas a este kit pasan a
secuenciación.
• Canal directo con la Sanidad Aérea en el Aeropuerto Jorge Chávez, para el
envío de muestras de pacientes que estén retornando de países donde
circula Ómicron. Las muestras son procesadas para PCR, y en caso ser
positivas, se secuencian.
• Canal directo con Laboratorios Privados para el envío de muestras positivas
a PCR en personas con antecedentes de viajes al extranjero en las últimas 2
semanas, o contacto en las últimas 2 semanas con personas retornando del
extranjero.
• Plataforma MiniSeq para secuenciar muestras en Menor Tiempo.
Cuatro Casos Detectados a través de esta
estrategia diferenciada para Ómicron
• Como producto de la respuesta tomada por el INS frente a la nueva VOC Ómicron
se han detectado el día 18/dic/2021, cuatro (04) muestras positivas para esta
variante, todas del linaje BA.1.
• La Sanidad Aérea identificó un grupo de viajeros de Sudáfrica, Israel, y Bélgica el
13/12/2021. Todos tuvieron pruebas antigénicas negativas. De estas, 3 tuvieron
PCR positivo el 15/12/21. Dos conteniendo “mutaciones sospechosas” y una sin
mutaciones.
• La muestra sin mutaciones fue secuenciada como VOC Delta. De las dos muestras
con mutaciones sospechosas, una no se pudo secuenciar por tener poco material
genético, la tercera es compatible con VOC Ómicron:
Niño 9 años procedente de Sudáfrica, no mostraba síntomas, no tienen
antecedente de vacunación, y actualmente está en aislamiento domiciliario en
la casa familiar en Miraflores. Madre inicialmente negativa, Hoy PCR (+).
• La vigilancia en muestras PCR positivas con “mutaciones sospechosas” había secuenciado
previamente 33 muestras, todas sin Ómicron.
• El 16/12/2021, entraron 10 nuevas muestras “sospechosas” a secuenciación. Resultados
18/dic/2021. De las 10 muestras, tres (03) compatibles con VOC Ómicron, todos de Lima
Metropolitana:
 Varón, 52 años, migrante de origen EEUU. No especifica fecha de ingreso. Reside en
Surco. Síntomas leves el 10/12/2021, muestra el 12/12/2021 en clínica privada. Niega
contactos, declaró dos dosis de vacunación en Junio 2021, sin especificar el tipo.
 Mujer, 22 años, peruana, no figura antecedentes de viaje. Reside en La Molina. Inicia
síntomas leves el 11/12/2021, muestra el 13/12/2021 en unidad móvil de EsSalud. No
contactos, no figuran datos de vacunación contra COVID-19.
 Mujer, 34 años, peruana, no figura antecedentes de viaje. Reside en Miraflores. Inicia
síntomas leves el 13/12/2021, muestra el mismo día en Hospital Arzobispo Loayza.
Trabajadora de Salud. Dos dosis de Sinopharm en Marzo 2021, y Pfizer en Octubre
2021. Niega contactos.
Cuatro Casos Detectados a través de esta
estrategia diferenciada para Ómicron
Esta información es importante en el contexto
epidemiológico actual
• Un análisis de los casos de
infección y defunción por
COVID-19 muestra un patrón
claro hasta antes de la
introducción de la variante
Omicron: una ola de delta
concentrada en personas
mayores no vacunadas con
tendencia al incremento en
las últimas semanas
Infecciones en mayores de 60
Defunciones en mayores de 60
A pesar de que esta ola no es muy grande gracias al
avance de la vacunación, ha sido suficiente para
incrementar la ocupación de camas UCI a nivel
nacional, dejando poco margen de camas libres
-Se habían “desinstalado” las
camas UCI COVID-19 para atender
la demanda habitual de
hospitalizaciones
mayor al 90%
Lo que se puede esperar: la superposición de
dos olas epidemiológicamente distintas
Ola Delta: actualmente en
incremento,
mayoritariamente por
población no vacunada
mayor a 60 años.
Genera demanda de
oxígeno y camas UCI que
se puede cubrir con lo
disponible en la actualidad
Ola Omicron: recién
iniciándose, será de gran
velocidad, generará un alto
porcentaje de infección en
la población general
incluyendo vacunados, lo
cual a su vez generará
incremento de oxígeno y
camas UCI que
probablemente no se
pueda cubrir con lo
disponible actualmente
3 pilares para prevención de muertes
• Acelerar la 3era
dosis de vacuna:
esto hará que el alto
título de anticuerpos
por vacunación
reciente brinde una
mayor protección
sobre todo a
población vulnerable
• Implementación de
centros masivos de
administración de
oxígeno –no UCI:
esto hará que el alto
administración
temprana de oxígeno
hará que el
requerimiento de camas
UCI no se incremente
súbitamente a un nivel
poco manejable
• Reactivación de
las camas UCI
que se
desinstalaron:
esto hará que se
pueda cubrir la
demanda generada
por pacientes
vacunados que hagan
enfermedad severa

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  • 1. Variante de Preocupación Ómicron del SARS-CoV-2 Instituto Nacional de Salud Centro Nacional Salud Pública 19 de diciembre 2021
  • 2. Situación actual de variante Ómicron de SARS-CoV-2 • Nuevo linaje detectado en Sudáfrica y caracterizado el 24/nov/2021, siendo designado por la OMS como Variante de Preocupación (VOC) denominada “Ómicron” el 26/nov/2021. • Al 19/dic/2021, Casos totales confirmados: 57,959 a nivel mundial en mas de 70 países, todos los continentes. • Mayoría de casos confirmados en: Reino Unido (37,101), Dinamarca (11,559), Noruega (2,060), y Sudáfrica (1,247 confirmados, y 77,844 probables). • En Norteamérica: EEUU (859), Canadá (799). • En América Latina: Argentina (454), Chile (29), Brasil (22), México (7), Cuba (5), Ecuador (3)
  • 3.
  • 4. Ómicron ha desplazado a Delta rápidamente en Sudáfrica UK Health Security Agency. Omicron Daily Overview 18/12/21 Se espera gran cantidad de casos, pero su traducción en casos severos y muertes es muy incierta hasta el momento
  • 5. El número de casos se está duplicando cada 2-3 días Ómicron no necesariamente es tan “benigna, ya se han reportado 7 muertes e incremento rápido de hospitalizaciones Omicron está desplazando a delta en una semana En Reino Unido El Imperial College de Londres asegura que NO hay ninguna evidencia de que la enfermedad por Omicron sea más “leve”
  • 6. Imperial College COVID-19 response team. Reporte 49. 16/dic/2021. https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/mrc-gida/2021-12-16-COVID19-Report-49.pdf En reino unido, la efectividad para todo tipo de estatus vacunal, es menor para Ómicron que para Delta. Incluso paradójicamente, se ha observado enalgunos casos, los vacunados tienen “más” riesgo de estar infectados per son números muy pequeños. En comparación a la variante Delta, la variante Omicron no mantiene la efectividad de las vacunas y el escape inmunológico es significativo
  • 7. Vigilancia Genómica en Perú para Ómicron Aparte de las 382 muestras semanales que secuencia el INS como parte de la vigilancia genómica, se implementó lo siguiente: • Desde el 11/nov/21, el INS viene usando el kit para PCR Allplex Master Assay, que señala la presencia de mutaciones encontradas en las Variantes Alfa, Beta, Gamma, y Mu. Una de estas mutaciones también está en la VOC Ómicron (HV69/70del), por lo que las muestras positivas a este kit pasan a secuenciación. • Canal directo con la Sanidad Aérea en el Aeropuerto Jorge Chávez, para el envío de muestras de pacientes que estén retornando de países donde circula Ómicron. Las muestras son procesadas para PCR, y en caso ser positivas, se secuencian. • Canal directo con Laboratorios Privados para el envío de muestras positivas a PCR en personas con antecedentes de viajes al extranjero en las últimas 2 semanas, o contacto en las últimas 2 semanas con personas retornando del extranjero. • Plataforma MiniSeq para secuenciar muestras en Menor Tiempo.
  • 8. Cuatro Casos Detectados a través de esta estrategia diferenciada para Ómicron • Como producto de la respuesta tomada por el INS frente a la nueva VOC Ómicron se han detectado el día 18/dic/2021, cuatro (04) muestras positivas para esta variante, todas del linaje BA.1. • La Sanidad Aérea identificó un grupo de viajeros de Sudáfrica, Israel, y Bélgica el 13/12/2021. Todos tuvieron pruebas antigénicas negativas. De estas, 3 tuvieron PCR positivo el 15/12/21. Dos conteniendo “mutaciones sospechosas” y una sin mutaciones. • La muestra sin mutaciones fue secuenciada como VOC Delta. De las dos muestras con mutaciones sospechosas, una no se pudo secuenciar por tener poco material genético, la tercera es compatible con VOC Ómicron: Niño 9 años procedente de Sudáfrica, no mostraba síntomas, no tienen antecedente de vacunación, y actualmente está en aislamiento domiciliario en la casa familiar en Miraflores. Madre inicialmente negativa, Hoy PCR (+).
  • 9. • La vigilancia en muestras PCR positivas con “mutaciones sospechosas” había secuenciado previamente 33 muestras, todas sin Ómicron. • El 16/12/2021, entraron 10 nuevas muestras “sospechosas” a secuenciación. Resultados 18/dic/2021. De las 10 muestras, tres (03) compatibles con VOC Ómicron, todos de Lima Metropolitana:  Varón, 52 años, migrante de origen EEUU. No especifica fecha de ingreso. Reside en Surco. Síntomas leves el 10/12/2021, muestra el 12/12/2021 en clínica privada. Niega contactos, declaró dos dosis de vacunación en Junio 2021, sin especificar el tipo.  Mujer, 22 años, peruana, no figura antecedentes de viaje. Reside en La Molina. Inicia síntomas leves el 11/12/2021, muestra el 13/12/2021 en unidad móvil de EsSalud. No contactos, no figuran datos de vacunación contra COVID-19.  Mujer, 34 años, peruana, no figura antecedentes de viaje. Reside en Miraflores. Inicia síntomas leves el 13/12/2021, muestra el mismo día en Hospital Arzobispo Loayza. Trabajadora de Salud. Dos dosis de Sinopharm en Marzo 2021, y Pfizer en Octubre 2021. Niega contactos. Cuatro Casos Detectados a través de esta estrategia diferenciada para Ómicron
  • 10. Esta información es importante en el contexto epidemiológico actual • Un análisis de los casos de infección y defunción por COVID-19 muestra un patrón claro hasta antes de la introducción de la variante Omicron: una ola de delta concentrada en personas mayores no vacunadas con tendencia al incremento en las últimas semanas Infecciones en mayores de 60 Defunciones en mayores de 60
  • 11. A pesar de que esta ola no es muy grande gracias al avance de la vacunación, ha sido suficiente para incrementar la ocupación de camas UCI a nivel nacional, dejando poco margen de camas libres -Se habían “desinstalado” las camas UCI COVID-19 para atender la demanda habitual de hospitalizaciones mayor al 90%
  • 12. Lo que se puede esperar: la superposición de dos olas epidemiológicamente distintas Ola Delta: actualmente en incremento, mayoritariamente por población no vacunada mayor a 60 años. Genera demanda de oxígeno y camas UCI que se puede cubrir con lo disponible en la actualidad Ola Omicron: recién iniciándose, será de gran velocidad, generará un alto porcentaje de infección en la población general incluyendo vacunados, lo cual a su vez generará incremento de oxígeno y camas UCI que probablemente no se pueda cubrir con lo disponible actualmente
  • 13. 3 pilares para prevención de muertes • Acelerar la 3era dosis de vacuna: esto hará que el alto título de anticuerpos por vacunación reciente brinde una mayor protección sobre todo a población vulnerable • Implementación de centros masivos de administración de oxígeno –no UCI: esto hará que el alto administración temprana de oxígeno hará que el requerimiento de camas UCI no se incremente súbitamente a un nivel poco manejable • Reactivación de las camas UCI que se desinstalaron: esto hará que se pueda cubrir la demanda generada por pacientes vacunados que hagan enfermedad severa