GRASS a R
•
0 gefällt mir•464 views
prezentacja w formacie *.pdf z warsztatów "Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS" 13-16.09.2010. Autor: Jacek Ślopek.
Empfohlen
Weitere ähnliche Inhalte
Mehr von WGUG
Mehr von WGUG (11)
GRASS a R
- 1. GRASS a R Jacek Ślopek Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 2. GRASS a R Czym jest R? ● R jest systemem do obliczeń statystycznych i tworzenia wykresów i grafik naukowych. ● R stanowi środowisko, w którym uruchamiane są moduły. ● R jest interpreterem specyficznego języka programowania. ● W R można uruchamiać skrypty, oraz R może być wywoływany z wnętrza skryptów. System R powstał pod wpływem dwóch istniejących już systemów: S (autorstwa Beckera, Chambersa & Wilksa z Laboratoriów Bella) i Scheme (autorstwa Sussmana). Początkowe prace nad systemem prowadziło dwóch autorów - Ross Ihaka i Robert Gentleman na Wydziale Statystyki Uniwersytetu w Auckland w Nowej Zelandii. Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 3. GRASS a R R – język programowania Rdzeń systemu R obsługiwany jest przez interpretowany wewnętrzny język programowania zawierający instrukcje warunkowe i pętle, pozwalający tworzyć własne funkcje. Większość funkcji dostępnych dla użytkownika jest napisana w języku R. Niemniej istnieje możliwość użycia procedur z języków C, C++ lub FORTRANa w celu uzyskania większej wydajności w obliczeniach. Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 4. GRASS a R R – możliwości systemu Wraz z domyślną instalacją otrzymujemy możliwość skorzystania z wielu procedur statystycznych, takich jak np. (uogólnione) modele liniowe, nieliniowe modele regresyjne, analiza serii, klasyczne parametryczne i nieparametryczne testy, czy analiza skupień. Dodatkowo, możemy skorzystać z bardzo dużej liczby wyspecjalizowanych modułów (tzw. Add-On), czy bibliotek funkcji, o które można wzbogacić system. R jest wyposażony w wiele elastycznych funkcji pozwalających na tworzenie wykresów i grafik zgodnych z naukowymi standardami prezentacji danych. Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 5. GRASS a R R – systemy operacyjne, dodatkowe oprogramowanie R jest systemem, który można zainstalować na wszystkich głównych systemach operacyjnych bez dodatkowych komplikacji. Jeśli jednak chcemy skorzystać z dodatkowych bibliotek funkcji, może się zdarzyć, że konieczne będzie doinstalowanie dodatkowego oprogramowania, bądź bibliotek systemowych. Przykładowo, praca z danymi przestrzennymi w R wymaga obecności w systemie bibliotek z pakietów: xml, xml2, libxml(-devel), libxml2-(devel), gdal(-devel) i proj(-devel) Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 6. GRASS a R R – zasoby sieciowe R posiada swoją stronę domową: http://www.R-project.org/ Ponieważ jest to oprogramowanie rozprowadzane na zasadach licencji GNU, można je pobrać za darmo z jednego z istniejących mirrorów programu (tzw. The Comprehensive R Archive Network),np.: http://r.meteo.uni.wroc.pl/ Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 7. GRASS a R R – instalacja systemu System R może zostać skompilowany ze źródeł, bądź pobrany w postaci instalatorów ze wspomnianych wcześniej mirrorów CRAN. W systemie Linux istnieje również możliwość pobrania go z repozytoriów systemowych. Źródła natomiast dostępne są pod adresem: https://svn.R-project.org/R/ Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 8. GRASS a R R – instalowanie dodatkowych pakietów, podręczniki Dodatkowe pakiety/biblioteki funkcji instaluje się z wnętrza systemu za pomocą jednej z funkcji (install.packages()). Aby poznać składnię języka R warto skorzystać z podręczników i przykładów umieszczonych w sieci: http://r.meteo.uni.wroc.pl/manuals.html Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 9. GRASS a R R – uruchomienie systemu, przykładowa sesja... Startujemy R Uzyskujemy informacje początkowe... ...a linia komend już czeka na wydanie poleceń :) Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 10. GRASS a R R – przykłady działania, pomoc na bieżąco Wewnątrz R można wywołać polecenie demo(nazwa_biblioteki) by zobaczyć przykładowe obliczenia wykonywane za pomocą funkcji w niej zawartych. Listę prezentacji demo można uzyskać po użyciu polecenia: demo(). Dodatkowo w trakcie sesji w R można wywołać w swojej przeglądarce internetowej, z lokalnego dysku stronę z pomocą, poprzez wydanie polecenia help.start(). Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 11. GRASS a R R – wykresy z R w GRASS W R można wygenerować wykresy, a następnie zapisać je w formacie eps. Mając do dyspozycji takie grafiki, można umieścić je na mapach w GRASS (polecenie ps.map). Przykład takiego wykorzystania znajduje się na stronie wiki GRASSa. http://grass.osgeo.org/wiki/Ps.map_scripts http://geog-pc40.ulb.ac.be/grass/psmap/ Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 12. GRASS a R R – biblioteki dla danych przestrzennych Biblioteki systemu R, które mogą być przydatne do pracy z danymi przestrzennymi to m.in: akima, fields, geoR, grid, gstat, lattice, MASS, scatterplot3d, spatial. Są to biblioteki specjalizujące się w analizach czasowo-przestrzennych. Dla użytkowników GRASS 6.x najistotniejszą biblioteką, zapewniającą możliwość współpracy systemu R i GRASS jest biblioteka: spgrass6 spgrass6 bibliotekę grass zapewniającą połączenie z danymi systemu GRASS 5.x Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 13. GRASS a R R – interface dla GRASS Dodanie biblioteki dającej interface do danych GRASS: install.packages(”spgrass6”, dependecies=TRUE) A następnie jej włączenie w R następuje po wydaniu polecenia library(spgrass6) Polecenia dodawane do R przez tę bibliotekę: readRAST6, readVECT6, writeRAST6, writeVECT6, gmeta6, getLocationProj, gmeta2grd, vinfo, vColumns, vDataCount, vect2neigh Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 14. GRASS a R R – Przykładowa sesja w systemie wykorzystująca bibliotekę spgrass6 Zaczynamy od uruchomienia GRASSa: grass64 A następnie wywołujemy z jego wnętrza system R: R help.start() library(spgrass6) str(gmeta6()) miejscowosci <- readVECT6(”miejscowosci”, ignore.stderr=TRUE) (...) Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 15. GRASS a R R – Przykładowa sesja w systemie Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 16. GRASS a R R – geostatystyka i analizy przestrzenne z GRASS Aby dowiedzieć się co można osiągnąć za pomocą funkcji z biblioteki spgrass6 warto sięgnąć do wskazówek zamieszczonych w sieci, napisanych przez Marcusa Netelera (Short Introduction to Geostatistical and Spatial Data Analysis with GRASS and R statistical data language) znajdujących się pod adresem: http://grass.osgeo.org/statsgrass/grass_geostats.html Lub przejrzeć materiały na stronie wiki GRASSa: http://grass.osgeo.org/wiki/R_statistics Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010
- 17. GRASS a R Dziękuję za uwagę! Analizy przestrzenne z wykorzystaniem GRASS Wrocław 13-16.09.2010