Esitys Suomen nisäkästieteellisen seuran kokouksessa 31.3.2015.

1. Pikkunisäkkään
suolistoloisyhteisön seuranta
Tuomas Aivelo (@aivelo)
Helsingin yliopisto
Suomen nisäkästieteellisen
seuran kokous, 31.3.2015

2. Suolistoloisyhteisöt
• Isäntäeläin on dynaaminen elinympäristö
• Loisyhteisöjen sukkessio
• Loislajien keskinäisten vuorovaikutusten
ymmärtäminen
– Virulenssi, prevalenssi
– Resistenssi, toleranssi

3. Infrayhteisön seuraaminen
• Perinteisesti
keskitytty loisten
seuraamiseen
isäntäpopulaation
tasolla, koska
helpompaa
• Infrapopulaatioita
seurattu harvoin
Photo: St. Kilda Soay Sheep Project / Arpat Ozgul

4. • Miten loisyhteisöt
kehittyvät
• Minkälainen on
komponentti- ja
infrayhteisöjen suhde
toisiinsa?

5. Hiirimakit
• Ruskohiirimaki
(Microcebus rufus)
• Merkintä-
jälleenpyynti 3
vuoden ajan
Ranomafanassa,
Kaakkois-
Madagaskarilla
• 634 näytettä 78 eri
yksilöstä

6. …mutta
• N tuhatta
sukkulamatolajia
• Ei aikuisia yksilöitä
• Barcoding 18S-geenin
avulla pyrosekvenoinnilla

7. Aivelo et al., submitted
Medlar et al. 2014.,
BMC Evolutionary Biology

8. 2011
vs.
2012
Putative
species 1
Strongyloides
Putative
species 2
Rhabditidae
Putative
species 3
Strongylida
Putative
species 4
Chromadorea
Putative
species 5
Enterobius
Putative
species 6
Panagrellus
Aivelo et al. 2015.
Parasitology, in press

9. Ensimmäiset näytteet usein
loisettomia
Harvinaiset lajit
esiintyvät vain
lyhyen aikaa
Myös vaihtumista
yleisissä lajeissa
Infracommunities
Aivelo et al. 2015.
Parasitology, in press

10. Rafalinirina et al.,
submitted
Model n r P
CRT index vs
lice score
120 -0.19 0.04
CRT index vs
nematode abundance
119 -0.00 0.98
CRT index vs
cestode abundance
120 -0.14 0.13
CRT index vs parasite
richness
120 -0.19 0.03
n = sample size, r = correlation coefficient of spearman, P = probability

11. Pähkinänkuoressa

Sekvenointi mahdollistaa tehokkaan näytteiden
analysoinnin

Isäntäpopulaation tasolla loisyhteisö suht vakaa,
mutta yksittäisissä isännissä suuri vaihtelu

Tartuntareittien vaikutus

Horrostamisen vaikutus?

12. Seuraavaksi?

Mikrobiomin ja makrobiomin vertailu

Hiirimakien sekvenointiprojekti