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Zotero紹介
1.
1 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Your personal research assistant Zotero is a free, easy-to-use tool to help you collect, organize, annotate, cite, and share research. https://www.zotero.org/ Zotero 【指導型演習】iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 〜iPadとPCを併用した文献管理術〜
2.
2 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 INDEX 03 2. Zoteroの概要 06 3. Zoteroのセットアップ 09 4. Zoteroへの論文の登録 16 5. 参考文献リストの作成 19 6. iPadとの連携方法 22 1. イントロダクション 7. 文献の管理・整理 99
3.
3 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 1. イントロダクション ・文献管理とは ・セミナーの目的 ・セミナーの内容
4.
4 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 イントロダクション ■ 文献管理とは 文献情報の 取り込み 出力 管理・整理 Bib TeXなどに出力 無料 有料
5.
5 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 ■ 目的: 文献の管理方法を学ぶ • 論文執筆時おいて、引用文献に関する情報を正しく記載する必要がある • 引用する論文の情報をミスなく記載するのは大変な重労働 • 文献管理ツールを用いることで、文献に関わる煩雑な作業を効率化できる → 文献を読むとき、執筆するときの作業・ストレスが格段に減る ■ 内容: Zoteroの導入と設定・使い方の解説 • 環境構築 • 使い方の解説 • 他サービスとの連携 イントロダクション
6.
6 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 2. Zoteroの概要 ・Zoteroの優れているとこと ・Zoteroでの文献管理の概要
7.
7 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 ■ Zoteroの優れているところ • 無料で実用的な運用が可能 • Mendeleyと比べて動作が軽い • メモ機能が充実している • 文献を外部ビューアで閲覧できる(要設定) • プラグインのZotFileや外部のクラウドサービスなどと組み合わせることで、高度な活用 法を構築可能 → クラウドストレーサービスにPDFを貯めれる → 他サービスとの連携がしやすくなる Zoteroの概要
8.
8 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 ■ Zoteroでの文献管理の概要 Zoteroの概要 Cloud storage PC iPad Zotero PDF Expert OR Documents 閲覧・書き込み 管理・閲覧 Web Zotero Connector 調査・購入 自炊PDF 電子書籍 PDFファイルの保存
9.
9 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 3. Zoteroのセットアップ ・デスクトップ版アプリ ・Zotero Connector ・デスクトップ版アプリの初期設定 ・ZotFile のインストールと設定 ・Better BibTeX for Zoteroのインストールと設定
10.
10 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■ デスクトップ版のZoteroをダウンロード • デスクトップ版アプリをダウンロード • Zotero Connectorをインストール 拡張機能をピン留めしておく zotero.org/download ■ Zotero Connectorをインストール
11.
11 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■ Zoteroデスクトップアプリの初期設定 1. 環境設定ウィンドウの「一般」を開く 2. 「Webページから…スナップショット を作成する」の✅を外す →必要ならそのまま 3. キーワードと件名標目…タグを付け る」の✅を外す →自分で付けた方がいい 4. ビューアの設定
12.
12 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■ Zoteroデスクトップアプリの初期設定 1. ローカルクラウドと同期したフォルダを 用意 →クラウドストレージのデスクトップ版をインス トールしてログイン 2. 適当な場所にZotero内の文献ファイル保 存用のフォルダ作成 「Zotero_Sync」など 3. 環境設定→「詳細」タブの「ファイルと フォルダ」を開く 4. “基本ディレクトリ”2で作成した文献ファイル 保存用のフォルダを指定する
13.
13 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■ Zotfileのイストール 1. Zotfile公式サイトのダウンロードから.xpiファイルを保存 2. Zoteroで「ツール」→「アドオン」を開く 3. 歯車アイコンをクリック 4. 「Install Add-ons From File…」で保存した.xpiファイルを指定してZotfile をインストール zotfile.com
14.
14 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■文献ファイルの保存先をクラウドストレージに設定 1. Zoteroで「ツール」→「Zotfile Preferences…」をひらく 2. 「General Settings」タブの“Location of Files” で保存先を指定 「詳細」→「ファイルとフォルダ」で設定した、 基本ディレクトリのパス
15.
15 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■Renaming Rulesの設定 1. Zoteroで「ツール」→「Zotfile Preferences…」をひらく 2. 「Renaming Rules」タブの “Renaming Format”でカスタマイズ • {%a_}{%y_}{%j_}{%t} →著者名 et al_出版年_雑誌_タイト ル.pdf • GANomalyの論文の例 Akcay et al_2018_ACCV_GANomaly.pdf
16.
16 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 4.Zoteroへの文献の登録 ・ Zotero Connectorを使って登録 ・手元のPDFファイルを登録
17.
17 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zotero Connectorを使って登録 Zoteroへの文献の登録 PC Zotero Web Zotero Connector クリック
18.
18 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 手元のPDFファイルを登録 Zoteroへの文献の登録 PC Zotero 自炊PDF 電子書籍
19.
19 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 5.参考文献リストの作成 ・BibTeX形式で出力 ・(おまけ)参考文献リストのテキストを取得
20.
20 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 参考文献リストの作成 ■BibTeX形式で出力 1. 参考文献リスト作成用のコレクションを 作成 2. 参考文献として引用したい登録済みの文 献をコレクションにまとめる 3. 1で作成したコレクションで右クリック 4. 「コレクションをエクスポート…」をク リック 5. フォーマットをBibTeXに指定 6. 「OK」をクリック 7. 出力先を選択
21.
21 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 参考文献リストの作成 ■ (おまけ)参考文献リストのテキストを取得 1. コレクションで右クリック 2. 「コレクションから参考文献目録を作成 する…」をクリック 3. 引用スタイルを指定 4. 言語を指定する 5. 出力モードを「参考文献目録」にする 6. 出力方法を「クリップボードにコピー」 にする 7. 「OK」をクリック
22.
22 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 6.iPadとの連携方法 ・PDFリーダーのインストール ・PDFリーダーとクラウドストレージを接続
23.
23 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 iPadとの連携方法 ■ PDFリーダーのインストール • 「PDF Expert」や「Documents」などの PDFリーダーをインストールする • Zoteroと同期しているクラウドストレージと 接続する PDF Expert OR Documents 編集
24.
24 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 7.文献の管理・整理 ・コレクション ・タグ ・関連アイテム
25.
25 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 iPadとの連携方法 ■ コレクションとタグ、関連アイテム • コレクション 階層構造にできる • タグ フィルターをかけて文献を表示できる AND検索も可能 • 関連アイテム 文献同士を紐づけることができる
26.
26 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■ Better BibTeX for Zoteroのインストール 1. GitHubのlatest releaseから.xpiを保存 2. Zoteroで「ツール」→「アドオン」を開く 3. 歯車アイコンをクリック 4. 「Install Add-ons From File…」で保存した.xpiファイルを指定して BBT for Zoteroをインストール https://github.com/retorquere/zotero-better- bibtex/releases/tag/v6.7.36
27.
27 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 Zoteroのセットアップ ■ Better BibTeX for Zoteroの設定 1. Citation key format 引用キーの形式をカスタマイズできる 詳しくはここ 文献ごとのカスタマイズも可能
28.
28 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 まとめ ■ Zoteroの初期設定の解説をした ■ ライブラリはZoteroで管理し、添付ファイルはクラウドストレージ 経由で同期する設定を構築した ■ Zoteroへの文献の登録から、文献リストの出力方法を解説した ■ iPadとPCの相互同期フローを確立した
29.
29 ©2022 | iPadユーザーのための文献管理ツールの紹介 徳永研究室
M1 石本 宝 参考 https://note.com/sdeso/n/n013952313c1b https://togotv.dbcls.jp/20200423.html https://www.noguchilabo.com/zotero/ https://qiita.com/Yarakashi_Kikohshi/items/39dfbf3059aaf0690761 https://www.med-english.com/tools/t-vol31.php http://datsuota-mens.site/2020/05/13/how-to-read-on-ipad-2020ss/ https://efficimmtzushi.hatenablog.com/entry/2020/03/16/003318
Hinweis der Redaktion
こんにちは、徳永研究室修士1年の石本です。 みなさん、ゼミなどで読んだ論文をどのように管理していますか? 今回は指導型演習の一環としてZoteroという文献管理ツールを紹介します。 Zoteroとは、学術論文の収集、整理、注釈、引用、共有を支援する無料の文献管理ツールです。 徳永研究室ではiPadが貸し出されているので、論文読みにもiPadを活用できると研究活動が充実したものになりますよね。 そこで、iPadとPCを併用した文献管理の方法を紹介させていただきます。
本セミナーでは、Zoteroの概要から使い方、iPadとの連携方法までを解説します。 それではどうぞ。
イントロダクション。
まずは文献管理について簡単に説明します。 文献管理とは、必要な論文や書籍などの文献の情報を管理することです。 文献管理ツールに保存している文献情報から簡単に引用文献リストを作成することができます。 Zoteroの他にも、MendeleyやEndNoteが代表的な文献管理ツールとして挙げられます。
論文執筆時おいて、引用文献に関する情報を正しく記載する必要があります。 論文入手の利便性が格段に上昇した現代では、一本の論文を執筆するために引用する論文の数も増えてきており、文献の著者・所属名、雑誌名、出版年数などを一文字もミスなく記載するのは大変な重労働です。 文献に関わる煩雑な作業を効率化し、文献を読むとき、執筆するときの作業・ストレスが減らすことができます。 本セミナーでは、「Zotero」という文献管理ツールでの文献管理方を習得することを目的とします。 私は去年までMendeleyを使用していましたが、日本語の文献に対応していなかったり、メモ機能が使いにくいといったUXの悪さからZoteroに移行しました。 他サービスとの連携を含めた、Zoteroでの文献管理のベストプラクティスを解説します。
Zoteroの概要。
次にZoteroの概要について説明します。 Zoteroの優れている点は、無料で実用的な運用ができるところです。 同じく無料の文献管理ツールであるMendeleyと比較しても、動作が軽く、メモ機能が充実しています。 また、アプリ内のビューアだけでなく、外部のビューアで文献を開くこともできます。 さらに、プラグインのZotFileや外部のクラウドサービスなどと組み合わせることで、高度な活用法を構築することが可能になります。 Google Driveなどのクラウドストレージと連携することで、自分のPC以外のデバイスからでも管理している文献を閲覧・編集することができます。
今回紹介するZoteroでの文献管理はこのようなフローとなっています。 Zoteroでは、arXivなどのオープンデータベースからブラウザの拡張機能を使ってインポートする他、自前のPDFファイルもを登録することができます。 デスクトップ版のZoteroでは文献の管理と閲覧、タイピングでのメモを行うことができます。 また、Zoteroをクラウドストレージとの連携することで、iPadなどの他のデバイスからでもアクセスすることが可能となります。 iPadでの手書きメモが同期できる無料の文献管理ツールはZoteroのみです。(石本調べ)
Zoteroのセットアップ
今回の解説は、macOSベースで説明しますので、Windows等の方は適宜読み替えてください。 はじめに、トップページからデスクトップアプリと、Zotero Connectorをインストールしてください。 この時、Zotero Connectorをピン留めしておいてください。 ちなみに、今回のZoteroの使用方法では、Zoteroのアカウント登録が必須ではありません。
次に、デスクトップアプリの初期設定についてです。 環境設定ウィンドウの「一般」を開き、不要なチェックを外してください。 PDFを開くビューアは好みのものを選択してください。
続いて、文献ファイルを保存するディレクトリを設定します。今回はクラウドストレージ上に文献ファイルを保存したいので、あらかじめクラウドと同期したフォルダを用意しておいてください。 Google DriveやOneDriveでは、デスクトップアプリをインストールし、ログインすることで同期フォルダが自動的に作成されると思います。 そこで、Zotero内の文献ファイルを保存するためのフォルダを作成してください。 私の場合は、サブアカウントのGoogle Drive直下に「Zotero_Sync」というフォルダを作成しました。 わからない人は、自分で調べたり人に聞いたりして解決してください。 保存先の指定は、環境設定の「詳細」、「ファイルとフォルダ」の基本ディレクトリで設定できます。 ここで先ほど用意した、クラウドと同期しているフォルダを指定してください。
次に、Zotfileをインストールしてください。 Zotfileを導入することで、Zoteroを拡張することができます。 主な拡張機能として、ファイル名一括変更等が挙げられます。 今回のメインテーマである、クラウドストレージを経由した添付ファイルの同期にも必要なので、導入しておきましょう。 公式サイトに行き、「Download」から xpi ファイルを保存します。Zoteroを開いて、メニューの「ツール」→「アドオン」を開き、右上の歯車アイコンをクリックして”Install Add-on From File...”から、先程ダウンロードしたZotFileの xpi ファイルを指定してZotFileをインストールします。Zoteroの再起動が求められるので、再起動すればインストール完了です。
続いて、Zotfileの設定です。今回はクラウドストレージへの保存と、保存するファイル名の設定までを行います。 まずは、文献ファイルの保存先をクラウドストレージに設定します。 「ツール」「ZotFile Preferences...」を開き、「General Settings」タブの“Location of Files”で保存先をカスタムできます。 ここで、先ほど「詳細」「ファイルとフォルダ」で設定した、基本ディレクトリのパスを指定します。 最後に、「Use subfolder defined by」にチェックを入れ、”スラッシュ%c”とすることで、Zoteroのコレクションの階層を維持したフォルダ構造でクラウドストレージに保存することができます。便利ですね。
次に保存するファイル名を一括変更する設定です。 この設定は必須ではありませんので、不要な方はスキップしても構いません。 Zotfileの導入により、保存する文献ファイルの名前のフォーマットを統一することができます。 例えば、{%a_}{%y_}{%j_}{%t}と設定することで、「著者名 et al_出版年_雑誌_タイトル.pdf」と言う名前で文献ファイルを保存することができます。 好みの問題なので、各自でカスタマイズするといいと思います。 これでZoteroのセットアップは終了です。少し設定が多いですが頑張ってください。
4.Zoteroへの文献の登録
まずはZotero Connectorを使って、ブラウザから文献を登録する方法を解説します。 Google Scholarなどで調査した文献をZoteroに登録したい時は、見つけた文献のWebページで、Zotero Connectorをクリックしてください。 このとき、追加するコレクションを指定することができます。 また、PDFにアクセス可能な場合はPDFを自動で添付して追加してくれます。 保存した文献の情報に誤りがある場合は、文献情報を編集してから、PDFで右クリックをして「Manage Attachments」「Rename Attachments」でRename処理を実行できます。
次にローカルにあるPDFファイルの登録についてです。 Zoteroのライブラリ表示画面にドラッグ&ドロップするだけで追加されます。 このとき、Zoteroが自動的にPDFからメタデータを読み取って、文献情報を取得・記入してくれる場合もありますが、古い文献やOCR処理されていないものは失敗することが多いです。 その時は、諦めて自分で文献情報を編集しましょう。 他にもDOIやビブテフファイルからの文献のインポートにも対応していますが、必要な時に調べて使えればいいと思うので今回は省略します。
5.参考文献リストの作成
論文執筆時に楽をするために、最も重要なのが参考文献リスト作成の手間を省くことです。 Zoteroでは、登録済みの文献をあらゆるフォーマットで一括出力することができます。 1例として、ビブテフファイルへの出力方法を紹介します。 まず、参考文献として引用したい登録済みの文献をコレクションにまとめておきます。 次に、コレクションを右クリックして、コレクションをエクスポートをクリックします。 続いて、フォーマットをビブテフに指定することで、コレクション内の参考文献リストをビブテフファイルで出力することができます。
最後に、おまけとして参考文献リストをクリップボードにコピーする方法を紹介します。 参考文献リストとして出力したいコレクションを右クリックして、「コレクションから参考文献目録を作成する」をクリックします。 引用スタイルなどを指定して、出力方法を「クリップボードにコピー」にして出力すると、参考文献リストのコピーがクリップボードに保存されます。 今回紹介した2つの方法を使って、1つ1つの文献単位でも参考文献リストを作成することもできます。
6.iPadとの連携方法
iPadでぼ設定は、Zoteroと同期済みのクラウドストレージと接続して、編集できる環境を整えるだけです。 「PDF Expert」や「Documents」などのPDFリーダーをインストールして、クラウドストレージと接続してください。以上です。
7.文献の管理・整理
最後に文献の管理・整理に役立つ機能を紹介します。 コレクションとは、文献を階層的に整理できるフォルダのようなものです。 複数のコレクションに重複して文献を存在させることもできます。クラウドストレージに同期される文献ファイルは、土台となっているファイルのみなので注意してください。 タグとは、文献に付けることで検索をするのに役立ちます。タグは1つの文献に複数付けることができます。 関連アイテムは、文献同士を紐づけることができます。 紹介した3つの機能の使い方は人それぞれだと思うので、各人が好きなように活用してください。
次に、Better BibTeX for Zoteroをインストールしてください。 Zoteroに「Better BibTeX for Zotero」というアドオンを追加することで、BibTeX出力の機能を拡張できます。 GitHubのlatest releaseからxpi ファイルを保存します。Zoteroを開いて、メニューの「ツール」→「アドオン」を開き、右上の歯車アイコンをクリックして”Install Add-on From File...”から、先程ダウンロードしたZotFileの xpi ファイルを指定してZotFileをインストールします。Zoteroの再起動が求められるので、再起動すればインストール完了です。
最後に、Better BibTeX for Zoteroの設定をしたらセットアップ終了です。 これでZoteroのセットアップは終了です。少し設定が多いですが頑張ってください。 https://zenn.dev/sky_y/articles/pandoc-advent-2020-bib1
まとめ 今回は、無料で文献管理ができて、iPadでの手書きの同期が可能な便利ツールであるZoteroを紹介しました。 また、Zoteroへの文献の登録から、文献リストの出力などの最低限の機能を解説しました。 徳永研の論文読みや論文執筆の生産性向上の一助となれば幸いです。 それでは、Zotero導入セミナーは以上になります。お疲れ様でした。
今回は、無料で文献管理ができて、iPadでの手書きの同期が可能な便利ツールであるZoteroを紹介しました。 徳永研の論文読みや論文執筆の生産性向上の一助となれば幸いです。 Zoteroでは論文以外にも、あらゆるPDFの管理が行えるので、この機に電子書籍をZoteroに移行してみるのもいいかもしれませんね。 それでは、Zotero導入セミナーは以上になります。お疲れ様でした。
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