Weitere ähnliche Inhalte Ähnlich wie Prioritizing Scaffolds for Hit Selection in High Throughput Screening Programs Ähnlich wie Prioritizing Scaffolds for Hit Selection in High Throughput Screening Programs (19) Mehr von Rajarshi Guha (20) Kürzlich hochgeladen (20) Prioritizing Scaffolds for Hit Selection in High Throughput Screening Programs1. Priori%zing Scaffolds for Hit Selec%on
in High Throughput Screening
Programs
Rajarshi Guha, Dac‐Trung Nguyen
NIH Chemical Genomics Center
6th Indo‐US Workshop on Mathema%cal Chemistry
8th – 10th January, 2010
4. High Throughput Screening
• Assay thousands to
hundreds of thousands
of compounds
– Biochemical, gene%c,
pharmacological assays
• Rapidly iden%fy novel
modulators of biological
systems
• Lots of raw data –
automated analy%cs are
essen%al
5. Hun%ng for Leads
Target Lead Lead Clinical
Iden%fica%on Discovery Op%miza%on Development
HTS
Primary
Confirma%on
• Sensi%vity Screening • Select subset
• Scaling • Fluorescence to follow up • Counter
• High Content • Diversity screen
• Explore SAR
Assay
Cherry Picking
Op%miza%on
6. High Throughput Screening
• Given a screen, we
must iden%fy ac%ve
compounds and
confirm their ac%vity
• Most HTS campaigns
are run at a single
concentra%on
Negative
150 Positive ! !
! ! ! !
!
Sample !
!
!
!
! ! !
!!! ! ! ! ! ! ! !
!! ! !
! ! ! !! !
! ! !
! !! !
! ! ! !! !! ! !
!
! ! !! ! !
!!
! !! !
!! ! !
!
! ! ! ! ! ! !! !! ! !
! ! !!
!
!
! ! ! ! ! !!
!
!! ! ! !! ! ! !
! ! ! ! !
! ! ! ! ! ! !! ! ! ! !! ! ! !
!! ! ! ! ! !! !
!! ! !
!! !! ! ! !
! ! ! ! ! ! !! ! ! ! ! !! ! ! ! !
! !! ! !! !
!! ! !
! !! !! !
!! ! !!
! !! ! !! ! ! ! ! ! ! ! !! ! ! ! ! !! !
! ! ! !! ! !! ! !! ! !
! !! !! !! !
!! !! ! ! ! !! !! ! ! ! ! ! ! ! !! ! !
! ! ! !! !! ! ! ! !
! ! ! ! ! !! ! !
!!!! !!
! !! !
! ! ! ! !! ! ! ! ! ! !! ! ! !! ! ! !!
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !! ! ! ! !! ! ! ! ! !
Signal
! !
! !! ! ! ! !
! !! !! ! ! ! ! ! !! ! ! !
! ! ! ! !! ! ! ! !!! !
100
! ! !
! ! ! !
!! ! ! ! ! ! ! ! !! !
! ! !! ! ! ! !! ! !
! !! ! ! ! !! ! ! ! ! ! ! ! !!!! ! ! !! ! ! !! !! !! !! ! ! ! !
! ! !
! !! ! ! !
!! !!!! ! ! ! ! ! !
! !
! ! !! ! !
!! !!! ! ! ! !! ! !
! !
! !! ! !
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !! !! ! ! ! !! !
! ! ! ! ! ! !
! ! !!
! ! ! !!
! ! !!
!! !
!
! ! ! !!! !!! ! !! ! !!
!!
! ! ! ! ! ! !! ! !! ! ! ! ! !! !!! ! !!
!!
!! ! !
! ! ! !! !! !
!
!! !
!
!
!
!! ! ! ! !! ! ! ! !! !! ! ! ! !! !
!
! ! ! !! ! ! !! ! !
! !
!! ! !
!!
! ! ! !! ! ! ! !
!! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !! ! ! !! ! ! !!! ! !
!
! ! ! ! ! ! !! ! ! !!
! !! !
!
! ! !
! !
!
!
! ! ! !
!
! ! ! ! ! ! ! !! ! ! ! ! ! ! ! !!
! !! !! ! !! ! ! !!!! ! !!!! ! !! ! !! !! !! ! ! !!!! ! ! ! ! !!! !!! !! ! ! ! ! ! !! ! !!! !!!!
!! ! !
!
!
!
! ! ! !!! !! !! !
! ! ! ! ! !! !
! ! ! !!!
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !! !
! ! !!
!
! !! ! ! ! ! ! !
! ! ! ! !!!!
! ! ! ! ! ! ! !!
! ! !!
! !! !
! !!! !! !! !! !
!!! ! ! ! ! ! ! !!! !!! ! ! !
! !! ! !
! !! ! !!
!! ! !! !
!! ! !!! !! !! ! ! ! ! !! ! ! ! ! !! ! !! !! ! ! ! !! !!! !! !!!!! !! !! !!! ! ! !
!! !! ! ! !!!
!!! !! !!! !
!
! ! !!! ! ! ! !! ! !
! ! ! ! !!!! ! !!
! !! ! !!
!
! ! ! ! ! !!
!
! ! ! !! !! ! ! !! ! ! ! ! ! ! !! !! ! !! ! ! !! !
!
! ! !! !! ! ! !! !!
! ! ! ! ! !
! !! ! ! !! !!! ! ! !! ! ! !!! !!!! ! !
!! ! ! !!! ! ! ! ! ! ! !! !
! !! !!! ! !! ! !
!
! !! ! ! ! !!
!
!! ! ! !! ! ! ! ! !!! ! ! ! !! !!! !! ! ! !!!!!
! !!!
!! ! !
! !! ! !
!! ! !
! !
! !
! ! ! ! !! ! ! ! ! !!! ! ! ! !
!!!! !
! ! ! !! ! ! ! !!!! !
! ! ! ! ! !
!!! ! ! !! ! ! ! ! !! !
!! ! !
! ! ! !
!! !
!
! ! ! !
! ! !! !!!
! ! ! ! ! ! !!!! !! !
! ! ! ! !!!
!! ! ! ! ! ! ! ! ! !!!
!! ! ! ! ! !! !
!! ! ! ! !!!
! !! ! ! ! ! !!! !! ! !
!!! !
! !
! !!! ! ! !
! !!! ! ! !! ! ! ! ! ! ! !! ! ! ! ! !!! ! ! ! ! ! !! ! ! !
! ! !!! !!! !!! !
! ! ! !!!! ! ! !! !! ! ! !!!! !!! ! !!! !
!
! ! !! !! !!!
! !!!! !!
! !! !
!! ! ! !!! !
!!! ! ! ! !! ! ! ! !! ! !! ! ! ! !! ! !
! !! !!! ! ! !
!
!
! ! ! !! ! ! ! !! ! ! ! !! !!! !
! ! ! ! ! ! !! ! ! ! ! ! ! ! !!! ! !! ! !! !!!! ! ! !!!!! !!
!
!!
! ! ! !! ! ! ! !! !!! ! ! ! ! ! !! !! ! !
! ! !!! !! !!!! !! ! ! !! ! ! !! !! !! ! ! ! ! !!! !
!! ! ! ! !
!
! ! !! ! !! ! !!
! ! ! ! ! !!
! ! ! !! !!! !! ! !!! ! !!! ! ! !
! ! !! !!!!!
! !!!
! !! !
! ! !! ! ! ! !
!! ! ! ! ! ! !
!
!! !! ! !
!
!
!
! ! ! !! ! ! !
! ! ! !!!! !! !! ! ! ! !! ! ! ! !! ! ! ! ! ! ! !! ! !!! ! !!!!
! ! !! ! ! ! ! !!! ! !! ! ! !
! ! !! ! !! ! !!! ! !!!!!! !!!
!! ! !!
! !!! ! !
! ! ! !!
! !! ! !
! !! !! ! !
! !
!! !
! !! ! ! ! ! !! ! !
! !! !
!! ! !
!
!! ! !!! !
!! !! ! ! !
! ! !! ! !!!!!!! ! !
!! ! ! ! ! !! ! !! !
!! ! !! !!! !! !!
!
!! !!
! ! !
! ! ! !!!!!!
!! !! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !
!!! !! ! !! ! !! !
! ! ! ! !!
!
! ! ! !
! ! ! !
!! !
! ! ! !
!! !! !!! ! ! !! !
!! ! ! ! !!! ! ! ! ! !!! ! ! !
!!
!
! ! ! !! !
!!!! !! !
! ! !! ! ! !
! !! ! ! !! !
! ! ! !! ! !!!! !!
!! ! !!
!
! !! ! ! !
! !! ! !! !
! ! !! !!! ! ! ! ! ! ! ! !!! ! ! ! ! ! !! !
!
! ! ! ! !
! !! !!
! ! ! !! ! !! !!! !! ! ! ! !! ! !! !! !! ! !
! !
! !
! !! ! ! !
! !!
! ! !! ! !! ! ! ! !! !!!
!
!!! !! !! ! ! ! !! ! ! ! ! !!!! ! !
!!
! ! ! ! !! !! ! ! ! !
! ! ! ! !! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !!! !
! ! ! !! ! ! !! ! ! !!
! !
! !! ! !! ! ! ! ! !! !
50
! !!! ! ! !
! ! ! !!
! ! !! !! !!! ! ! !
! ! ! ! ! !! !!!! ! ! ! ! ! ! ! ! !!! ! ! ! !! !! ! ! ! ! ! !! !! !
! ! ! !! ! !! ! !
!!
!! !
! !
!! ! ! !! !! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !! !! !! ! !
! ! ! ! ! !! ! ! ! !! !
! ! ! !!! !! ! ! !
! !!
!! ! ! ! !
! !! ! ! !
!! ! ! ! !! !! !
! ! ! ! ! ! ! !! ! ! !! ! !
!! !!
! ! ! !
! !! !!!! ! ! !! ! !!
! ! ! !
! !! ! !!
!!
! !!
!
!! ! !! ! !!! !!!! !! !! ! !!!!!
! ! ! !!
! ! ! ! !! ! !!!!
! ! !
! !
! ! ! ! ! ! ! !! !!! !
! ! ! !! !! !!!
! ! !
!! !
! ! ! !!!!! ! !
! ! ! ! !!
! !! !! ! ! ! !!!
! ! ! ! ! ! ! ! ! !! !
! ! !!
! ! ! !! ! ! ! ! !!
!
! ! ! !!
!! ! ! !
! !! !!! ! !!
! !!! !
! !! ! ! !
!! !
!
! ! !! ! !!! ! !
! !! ! !! ! ! ! !
!
! ! !!
!
! ! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !!! ! !!!
! ! !
!! ! ! ! ! ! !! !
!!
!!
!! ! ! ! ! ! !!
! !! ! ! !!! ! ! ! ! ! ! ! ! ! !!! ! !!! ! ! !
! !! ! ! ! ! ! ! !! ! ! !!! ! !! !
! ! !! ! ! ! !! ! ! ! ! ! !! ! !! ! ! !! ! !
! !!
! !! ! ! ! ! !! ! !! !! !!! ! ! !! !
! !! !! !! !
! ! ! ! !! ! ! !! !
!! !! !! ! !
! ! !!
! !! ! ! ! ! ! ! ! !!! ! ! !
!! ! !
!! ! ! !! !!
!
! ! ! ! ! ! !! ! ! ! ! !! ! ! ! ! !!
!
!! ! ! ! !
! !! ! !! !
! ! !
!! !! ! !
! ! ! ! ! !!
!!! !! !
!! !! ! ! ! !
!! ! ! ! !! !
!
! ! !
!
!
! ! !!
! !
! ! !! ! ! ! !
! !! ! ! ! !! ! !
! ! ! !
!
! ! !
! ! ! !! ! ! ! !
! !! !! !! ! ! !!
! !! !!
!
!
!! ! ! !
! ! ! ! !
! ! ! ! !!
! ! ! ! !! ! ! ! !! ! !
! ! !
! ! ! ! ! ! ! !! !!
! ! ! ! ! !! !!! !
! !!
!
! ! ! !
!
!!! !! ! ! ! !! ! ! ! !
!
! ! !
!! !! ! !
!
! !!! ! ! ! !!! !! ! !! !
! ! !!
! ! !
! !
! ! !!!!
!!
!!
!!
! ! ! ! !
! ! !!! !! ! !
! ! ! ! !
!
! !! ! !!!
! !! ! ! ! ! ! !
!
! ! !
! !! !
! !
! !
! !! ! ! !!
!
!!
!
! ! !
!! ! ! !
! ! !
!
!
! ! ! !!
! !
! ! !!
!!
! !
! !
! ! !! ! ! ! ! ! ! ! ! !
!
!
! ! ! !!
! ! !
!! ! !
!
!
!
! ! ! ! ! ! !! ! !
!! !! ! !
! ! ! !
!
0
Plate Number