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Tópicos de Biologia-Matemática

    Roberto André Kraenkel, IFT

     http://www.ift.unesp.br/users/kraenkel


                 Aula I
      Instituto de Física Teórica
             Julho de 2012
A aula de hoje

1   Populações

2   Modelos Simples I: Malthus

3   Modelos Simples II: equação logística

4   Generalizações

5   Comentários
      Escalas

6   O que ficou de fora
      Equação a diferenças

7   Bibliografia
Populações



   Nosso conceito primitivo será o de uma população.
        Trata-se de um grupo de organismos (plantas, animais,..) composto por
        indivíduos com comportamento dinâmico equivalente.
        Estes indivíduos vivem agregados e se reproduzem.
        Note: vamos tratar de populações e não de indivíduos.
   Populações crescem ou diminuem por ganharem ou perderem indivíduos.
   O crescimento ou decrescimento pode se dar por nascimento, morte,
   imigração ou emigração.

    O curso trata de modelar a dinâmica de populações.Como elas
 aumentam e diminuem no tempo,como elas se distribuem pelo espaço.
Modelos Simples I: Malthus




                     Figure: Thomas Malthus, circa 1830


A lei mais Simples
    A lei mais simples regendo a evolução temporal de uma população:

                                dN(t)
                                        = rN(t)
                                  dt

    onde N(t) é o número de indivíduos na população e r é a taxa de
    crescimento intrínsico da população, por vezes chamado de parâmetro
    malthusiano.
Crescimento Exponencial




A solução
A solução da equação malthusiana é:

                              N(t) = N0 ert



    A equação prevê o crescimento exponencial da população no tempo.
Crescimento Exponencial



   Evidentemente, a previsão de crescimento exponencial não pode ser
   verdade de forma absoluta, pois teríamos populações enormes depois de
   um certo tempo ( digamos, ocupando um espaço maior que a Terra...).
   Mas, nos estágios iniciais de crescimento de uma população podemos ter
   crescimento exponencial.
   Em outras palavras: quando a população não é muito grande, a lei
   malthusiana deve valer. Quando a população aumenta muito, algo deve
   conter a taxa de crescimento.Já veremos o que mais adiante.
   Primeiro, alguns exemplos.
Exemplos




Figure: A população dos E.U.A. Até 1920, o crescimento da população é bem aproximado por uma
exponencial. Depois, a taxa de crescimento diminui.
Exemplos




 Figure: A população da Jamaica apresenta uma taxa de crescimento exponencial entre 1860 e 1995l
Exemplos




    Figure: Crescimento de uma população de bactérias (Escherichia coli) em laboratório.
Exemplos




   Vemos que populações podem ter fases de crescimento exponencial, mas
   que ao atingir níveis elevados este crescimento é atenuado.
   Ou seja, o crescimento sofre uma saturação.
Modelos Simples II: equação logística


    A forma mais simples de incluir um termo de saturação do crescimento é
    modificar a equação malthusiana :

                      dN
                           = rN − bN2 ≡ rN(1 − N/K)
                      dt

    O termo −bN2 é sempre negativo ( assumimos b > 0),⇒ tende a fazer
    dN
    dt
       diminuir.
    Para N/K      1, podemos fazer 1 − N/K ∼ 1 e recuperamos a equação
    mathusiana.
    Qual será a solução desta equação?
    A propósito, esta equação é chamada de logística, ou de Verhulst.
Equação Logística




Figure: Pierre-François Verhust, introdutor da equação logística em 1838: “’Notice sur la loi que la
population pursuit dans son accroissement”
Solução da Equação Logística




                                                      dN
   Podemos facilmente resolver a equação logístiica   dt
                                                           = rN(1 − N/K).
   Basta fazer dt = dN/(rN(1 − n/K)), integrar e obter:

                                        N0 Kert
                         N(t) =
                                  [K + N0 (ert − 1)]

   Eis aqui um gráfico da solução para diversos valores de N0 :
Figure: Evolução temporal de uma população obedecendo a equação logística. Cada curva corresponde a
uma diferente condição inicial. Vê-se que não importa qual condição inicial, para t → ∞, teremos
N→K
Em outras palavras...




   A equação
                               dN
                                    = rN(1 − N/K)
                               dt
    tem dois pontos fixos:
        N =0e
        N = K,
   sendo primeiro instável e o segundo estável.
   Ou ainda: K é um atrator.
Mais sobre a equação logística



    O termo quadrático (rN2 /K) na equação logística

                            dN
                                 = rN(1 − N/K),
                            dt
     modela a competição entre os indivíduos da população por recursos
    vitais.
    Exemplo:
        Espaço,
        Alimentos .
    Chamamos esta competição de intra-específica.
Equação logística



Num lago com vitórias régias, evidentemente teremos competição por espaço
quando chegarmos próximos da capacidade de suporte do lago:
Equação logística



A mesma coisa acontece com a cobertura por flores numa plantação em uma
área restrita:
Equação logística


Árvores de clima temperado dependem essencialmente de nutrientes no solo.
A quantidade restrita destes limita a densidade de árvores. Exemplo: Em
montanhas altas, a quantidade de água disponível no solo depende da altitude.
Próximo de regioes suficientemente altas, a água congela e não está
disponível para “consumo”. Abaixo, a linha de árvores nos Alpes:




No caso de árvores temos, portanto, uma competição por nutrientes.
Equação logística


                    Linha das árvores.
Equação logística


                    Acima da linha das árvores.
Nomenclatura




   A constante K que aparece na equação logística,
                           dN
                                 = rN(1 − N/K)
                            dt
   é usualmente conhecida por capacidade de suporte do meio.
   Como vimos, a população tende ao valor limite K para grandes tempos.
Glória e Miséria da Equação Logística



Glórias
      Ela é simples e solúvel.
      Ela permite introduzir o conceito de capacidade de suporte.
      ela aproxima bem alguns dos fenômenos observados na natureza.


Misérias
      Ela é simples demais.
      Muito da dinâmica que se observa não é compatível com ela..


Por que eu devo gostar da Equação Logística
Ela é um modelo mínimo o qual pode servir de base a generalizações e modificações.
Generalizações



   Uma forma de ir além da equação logística é tomar:

                              dN(t)
                                      = F (N)
                                dt
   onde F é uma função dada de N.
   Alguns exemplos seriam:
                                      2
                                BN
       F (N) = rN(1 − N/K) − (A2 +N2 )
       F (N) = −aN + bN2 − cN3
                             q
       F (N) = L − rN + s mqN q
                            +N
Generalizações




   De uma forma geral, para estudar estas generalizações, não
   necessariamente resolvemos a equação diferencial.
   Recorremos antes a uma análise qualitativa:
       Procuramos os pontos fixos, N ∗ , dados por F(N ∗ ) = 0.
       Em posse de N ∗ determinamos a sua estabilidade.
       Tente fazer este exercício para as funções da transparência anterior.
   Desta forma podemos ter uma visão qualitativa da dinâmica.
Comentários I



   A equação malthusiana introduziu uma parâmetro r, que tem dimensões
   de tempo−1 .
       Ou seja, r−1 define uma escala de tempo.
   A equação logística utiliza igualmente um parâmetro adicional, K.
       K define uma escala para o tamanho das populações.
   Escalas de tempo e espaço são importantes.
   Devemos ter sempre em mente que a modelagem de uma situação é
   válida em certas escalas.
   Vejamos um exemplo.
Comentários I:População humana




           Figure: População da Europa entre 1000 e 1700
Comentários I:População humana




            Figure: População da Terra entre 500 e 2000
Comentários I:População humana




  Figure: População da Terra entre 500 e 2000, com indicação da peste bubônica.
Comentários I:População humana




         Figure: População da Terra estimada entre -4000 e 2000
Comentários I:População humana




   Conforme olhemos a população humana em certas escalas de tempo e
   espaço, veremos diferentes feições dominantes.
   Modelagem matemática sempre é válida em dadas escalas.
O que ficou de fora I


Modelos discretos no tempo
    Nos modelos que consideramos, o tempo é contínuo. Natural!
    Isso pressupõe que o crescimento ou descrescimento se dêem a todo momento.
    Continuamente.
    Mas isso não é verdade para todas as espécies.
    Algumas delas tem gerações bem definidas.em geral, reguladas por estações.
    Flores, por exemplo. Faz pouco sentido falarmos de flores em tempo contínuo. Muito
    melhor falar de floradas anuais.
    Assim é mais interessante escrever:

                             Nt+1 = αNt                ou   Nt+1 = F (Nt )
                             |    {z    }
                  Equivalente da equação malthusiana
O que ficou de fora III




Muitas outras coisas....
    Entre elas.....
    Espécies interagentes
    A distribuição espacial das populações.
    Vamos estudá-las nas próximas aulas.
Bibliografia



Bibliografia para este capítulo
    Mathematical Biology I, por J.D. Murray ( Springer, Berlin, 2002).
    Essential Mathematical Biology, por N.F. Britton (Springer, Berlin,
    2003).
    Mathematical Models in Population Biology and Epidemiology, por F.
    Brauer e C. Castillo-Chavez ( Springer, Berlin, 2001).
    An Illustrated Guide to Theoretical Ecology, pot T.J. Case ( Oxford,
    2001).

                          obrigado pela atenção

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Tópicos em Biologia Matemática I

  • 1. Tópicos de Biologia-Matemática Roberto André Kraenkel, IFT http://www.ift.unesp.br/users/kraenkel Aula I Instituto de Física Teórica Julho de 2012
  • 2. A aula de hoje 1 Populações 2 Modelos Simples I: Malthus 3 Modelos Simples II: equação logística 4 Generalizações 5 Comentários Escalas 6 O que ficou de fora Equação a diferenças 7 Bibliografia
  • 3. Populações Nosso conceito primitivo será o de uma população. Trata-se de um grupo de organismos (plantas, animais,..) composto por indivíduos com comportamento dinâmico equivalente. Estes indivíduos vivem agregados e se reproduzem. Note: vamos tratar de populações e não de indivíduos. Populações crescem ou diminuem por ganharem ou perderem indivíduos. O crescimento ou decrescimento pode se dar por nascimento, morte, imigração ou emigração. O curso trata de modelar a dinâmica de populações.Como elas aumentam e diminuem no tempo,como elas se distribuem pelo espaço.
  • 4. Modelos Simples I: Malthus Figure: Thomas Malthus, circa 1830 A lei mais Simples A lei mais simples regendo a evolução temporal de uma população: dN(t) = rN(t) dt onde N(t) é o número de indivíduos na população e r é a taxa de crescimento intrínsico da população, por vezes chamado de parâmetro malthusiano.
  • 5. Crescimento Exponencial A solução A solução da equação malthusiana é: N(t) = N0 ert A equação prevê o crescimento exponencial da população no tempo.
  • 6. Crescimento Exponencial Evidentemente, a previsão de crescimento exponencial não pode ser verdade de forma absoluta, pois teríamos populações enormes depois de um certo tempo ( digamos, ocupando um espaço maior que a Terra...). Mas, nos estágios iniciais de crescimento de uma população podemos ter crescimento exponencial. Em outras palavras: quando a população não é muito grande, a lei malthusiana deve valer. Quando a população aumenta muito, algo deve conter a taxa de crescimento.Já veremos o que mais adiante. Primeiro, alguns exemplos.
  • 7. Exemplos Figure: A população dos E.U.A. Até 1920, o crescimento da população é bem aproximado por uma exponencial. Depois, a taxa de crescimento diminui.
  • 8. Exemplos Figure: A população da Jamaica apresenta uma taxa de crescimento exponencial entre 1860 e 1995l
  • 9. Exemplos Figure: Crescimento de uma população de bactérias (Escherichia coli) em laboratório.
  • 10. Exemplos Vemos que populações podem ter fases de crescimento exponencial, mas que ao atingir níveis elevados este crescimento é atenuado. Ou seja, o crescimento sofre uma saturação.
  • 11. Modelos Simples II: equação logística A forma mais simples de incluir um termo de saturação do crescimento é modificar a equação malthusiana : dN = rN − bN2 ≡ rN(1 − N/K) dt O termo −bN2 é sempre negativo ( assumimos b > 0),⇒ tende a fazer dN dt diminuir. Para N/K 1, podemos fazer 1 − N/K ∼ 1 e recuperamos a equação mathusiana. Qual será a solução desta equação? A propósito, esta equação é chamada de logística, ou de Verhulst.
  • 12. Equação Logística Figure: Pierre-François Verhust, introdutor da equação logística em 1838: “’Notice sur la loi que la population pursuit dans son accroissement”
  • 13. Solução da Equação Logística dN Podemos facilmente resolver a equação logístiica dt = rN(1 − N/K). Basta fazer dt = dN/(rN(1 − n/K)), integrar e obter: N0 Kert N(t) = [K + N0 (ert − 1)] Eis aqui um gráfico da solução para diversos valores de N0 :
  • 14. Figure: Evolução temporal de uma população obedecendo a equação logística. Cada curva corresponde a uma diferente condição inicial. Vê-se que não importa qual condição inicial, para t → ∞, teremos N→K
  • 15. Em outras palavras... A equação dN = rN(1 − N/K) dt tem dois pontos fixos: N =0e N = K, sendo primeiro instável e o segundo estável. Ou ainda: K é um atrator.
  • 16. Mais sobre a equação logística O termo quadrático (rN2 /K) na equação logística dN = rN(1 − N/K), dt modela a competição entre os indivíduos da população por recursos vitais. Exemplo: Espaço, Alimentos . Chamamos esta competição de intra-específica.
  • 17. Equação logística Num lago com vitórias régias, evidentemente teremos competição por espaço quando chegarmos próximos da capacidade de suporte do lago:
  • 18. Equação logística A mesma coisa acontece com a cobertura por flores numa plantação em uma área restrita:
  • 19. Equação logística Árvores de clima temperado dependem essencialmente de nutrientes no solo. A quantidade restrita destes limita a densidade de árvores. Exemplo: Em montanhas altas, a quantidade de água disponível no solo depende da altitude. Próximo de regioes suficientemente altas, a água congela e não está disponível para “consumo”. Abaixo, a linha de árvores nos Alpes: No caso de árvores temos, portanto, uma competição por nutrientes.
  • 20. Equação logística Linha das árvores.
  • 21. Equação logística Acima da linha das árvores.
  • 22. Nomenclatura A constante K que aparece na equação logística, dN = rN(1 − N/K) dt é usualmente conhecida por capacidade de suporte do meio. Como vimos, a população tende ao valor limite K para grandes tempos.
  • 23. Glória e Miséria da Equação Logística Glórias Ela é simples e solúvel. Ela permite introduzir o conceito de capacidade de suporte. ela aproxima bem alguns dos fenômenos observados na natureza. Misérias Ela é simples demais. Muito da dinâmica que se observa não é compatível com ela.. Por que eu devo gostar da Equação Logística Ela é um modelo mínimo o qual pode servir de base a generalizações e modificações.
  • 24. Generalizações Uma forma de ir além da equação logística é tomar: dN(t) = F (N) dt onde F é uma função dada de N. Alguns exemplos seriam: 2 BN F (N) = rN(1 − N/K) − (A2 +N2 ) F (N) = −aN + bN2 − cN3 q F (N) = L − rN + s mqN q +N
  • 25. Generalizações De uma forma geral, para estudar estas generalizações, não necessariamente resolvemos a equação diferencial. Recorremos antes a uma análise qualitativa: Procuramos os pontos fixos, N ∗ , dados por F(N ∗ ) = 0. Em posse de N ∗ determinamos a sua estabilidade. Tente fazer este exercício para as funções da transparência anterior. Desta forma podemos ter uma visão qualitativa da dinâmica.
  • 26. Comentários I A equação malthusiana introduziu uma parâmetro r, que tem dimensões de tempo−1 . Ou seja, r−1 define uma escala de tempo. A equação logística utiliza igualmente um parâmetro adicional, K. K define uma escala para o tamanho das populações. Escalas de tempo e espaço são importantes. Devemos ter sempre em mente que a modelagem de uma situação é válida em certas escalas. Vejamos um exemplo.
  • 27. Comentários I:População humana Figure: População da Europa entre 1000 e 1700
  • 28. Comentários I:População humana Figure: População da Terra entre 500 e 2000
  • 29. Comentários I:População humana Figure: População da Terra entre 500 e 2000, com indicação da peste bubônica.
  • 30. Comentários I:População humana Figure: População da Terra estimada entre -4000 e 2000
  • 31. Comentários I:População humana Conforme olhemos a população humana em certas escalas de tempo e espaço, veremos diferentes feições dominantes. Modelagem matemática sempre é válida em dadas escalas.
  • 32. O que ficou de fora I Modelos discretos no tempo Nos modelos que consideramos, o tempo é contínuo. Natural! Isso pressupõe que o crescimento ou descrescimento se dêem a todo momento. Continuamente. Mas isso não é verdade para todas as espécies. Algumas delas tem gerações bem definidas.em geral, reguladas por estações. Flores, por exemplo. Faz pouco sentido falarmos de flores em tempo contínuo. Muito melhor falar de floradas anuais. Assim é mais interessante escrever: Nt+1 = αNt ou Nt+1 = F (Nt ) | {z } Equivalente da equação malthusiana
  • 33. O que ficou de fora III Muitas outras coisas.... Entre elas..... Espécies interagentes A distribuição espacial das populações. Vamos estudá-las nas próximas aulas.
  • 34. Bibliografia Bibliografia para este capítulo Mathematical Biology I, por J.D. Murray ( Springer, Berlin, 2002). Essential Mathematical Biology, por N.F. Britton (Springer, Berlin, 2003). Mathematical Models in Population Biology and Epidemiology, por F. Brauer e C. Castillo-Chavez ( Springer, Berlin, 2001). An Illustrated Guide to Theoretical Ecology, pot T.J. Case ( Oxford, 2001). obrigado pela atenção