Misión y visión en el diagnostic molecular By Óscar Salazar

1. GENÓMICA
Misión y visión en el diagnóstico
molecular.
Dr. Óscar Salazar, Gerente de I+D. Genómica SAU (Grupo Zeltia).

2. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
• Fundada en 1990. Ubicada en Coslada, Madrid.
• Participación del 100% del Grupo Zeltia.
• Actividades:
– Productos de diagnóstico in vitro: I+D, fabricación y
distribución.
– Identificación genética:
• Análisis de Huella Genética.
• Proyectos “llave-en-mano”
• Certificaciones de calidad: ISO 9001:2008, ISO
13485:2003 (IVD), ISO 17025, Marcado CE (IVD).

3. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
MISIÓN DE LA COMPAÑÍA
“Mejorar los métodos actuales
de diagnóstico molecular e identificación genética
con herramientas fiables, automáticas y
de acuerdo a los más altos estándares de calidad”
DIAGNÓSTICO MOLECULAR HUELLA GENÉTICA
Detección e identificación de material Identificación humana y parentesco.
genético microbiano o humano procedente Identificación y trazabilidad de células madre.
de muestras clínicas como marcadores de
patologías.
DNA FINGERPRINTING

4. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
DIAGNÓSTICO IN VITRO : TECNOLOGíA CLART®
(Clinical Array Technology)
TIRA DE 8 POCILLOS PLACA MICROTITER
o
CLART® es una plataforma de diagnóstico molecular consistente en un microarray
impreso en el fondo de un pocillo de placa microtiter (CLART® Strip–CS). El
microarray contiene hasta 195 puntos de hibridación. Cada punto posee sondas
de ADN específicas que hibridan con las secuencias de ADN diana amplificadas a
partir de la muestra clínica.

5. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
CLART®: FLUJO DE TRABAJO
Secuencia del análisis, 4-8 horas.
Extracción y
PCR
Purificación Visualización
Amplificación
Muestras 45 min
Clínicas:
Torundas
Biopsias
CAP
Orina Clinical Arrays Processor
Hemocultivos
Heces
Sangre
Automática
Lavado
nasofaríngeo.
CAR
Clinical Arrays Reader

6. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
EXTRACCION DE MATERIAL GENETICO A PARTIR DE
MUESTRAS CLINICAS. Particularidades técnicas.
El aislamiento y la purificación de material genético a partir de muestras clínicas es
actualmente uno de los mayores desafíos técnicos planteados en el diagnóstico
molecular.
NECESIDADES:
• Optimización de un protocolo de extracción rápido y único para ADN/ARN.
• Proporcionar altos valores de sensibilidad y especificidad.
• Versatilidad para la extracción de diferentes tipos de muestras clínicas.
• Posibilidad de automatización para procesar el mayor número de muestras.
• Uso por personal técnico de laboratorio no altamente cualificado.

7. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
EXTRACCIÓN AUTOMÁTICA DE ÁCIDOS NUCLEÍCOS BASADA EN
EL USO DE PARTÍCULAS MAGNÉTICAS
VENTAJAS:
•Purificación efectiva de ADN y ARN.
•Compatible para su uso en las diferentes modalidades de PCR.
•Alta pureza:
•Rendimientos óptimos a partir de diferentes tipos de muestras clínicas: heces,
sangre, LCR, etc…
•Eliminación de inhibidores de PCR.
•Alta reproducibilidad.
•No degradación de ADN/ARN purificado.
•Flexibilidad en los volúmenes de muestra primaria/elución (input/output).

8. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
TIPOS DE MUESTRA EN DIAGNÓSTICO MOLECULAR
DE VIRUS Y BACTERIAS EN ENFERMEDADES INFECCIOSAS
Plasma/Suero LCR Sangre directa Lavado/exudado nasofaringeo
Hespesvirus Hespesvirus CMV Virus respiratorios:
Enterovirus Enterovirus Bacteria gram + FluA, B, C, PIV, rhinovirus, RSV,
Bacteria gram - ecovirus, coronavirus…
Heces: Hemocultivos Torundas cervicales
Salmonella, E. coli (EP) Bacteria gram + HPV (HR-LR)
Yersinia, Shigella, Clostridium difficile, Bacteria gram -
Aeromonas, Campylobacter jejuni Hongos
Campylobacter coli
Citologías líquidas Biopsias cervicales
HPV (HR-LR) HPV (HR-LR)

9. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
AISLAMIENTO Y PURIFICACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS
MEDIANTE EL USO DE PARTÍCULAS MAGNÉTICAS.

10. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
MULTIPLEX PCR.
DISEÑO
-Amplificación de múltiples dianas de forma simultánea en un solo tubo:
-Optimización:
•Adición de una pareja de primers que amplifique el ADN genómico
humano: Control positivo de extracción.
•Adición de un control interno de amplificación: plásmido recombinante y
dos primers específicos : Control positivo de amplificación.

11. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
MULTIPLEX PCR. OPTIMIZACIÓN
Diana 1 Tubo final
multiplex
-Sensibilidad óptima para
Diana 2 PCR
todas las dianas.
Diana 3 -Especificidad óptima para
todas las dianas.
Diana 4 -Única temperatura de
anillamiento.
-No interacciones entre
primers.
Diana n -Equilibrio de amplificación
entre dianas y control interno.
pGEMT
Control Interno

12. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
TECNOLOGÍA CLART®: PROCESO DE HIBRIDACIÓN
Y VISUALIZACIÓN:
1-Hibridación:
El microarray incluye El ADN amplificado por Los fragmentos de DNA
hasta 195 posiciones PCR se marca con marcado hibridan
de cDNA inmovilizado biotina y se añade al específicamente con
en una superficie microarray las sondas
orgánica que se inmovilizadas en el
hibridan con las microarray.
secuencias específicas
de ADN de la muestra.

13. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
TECNOLOGIA CLART®: PROCESO DE HIBRIDACION
Y VISUALIZACION:
2-Lavado 1: eliminación de amplicones no hibridados.
3-Conjugado
4-Lavado 2: eliminación de restos de conjugado
5-Revelado.
El microarray es incubado En presencia de
con un conjugado tetramethylbenzidina (TMB), la
estreptavidina-peroxidasa el actividad peroxidasa del
cual se une conjugado induce la aparición
específicamente a las de un producto insoluble el cual
cadenas de ADN marcado precipita en los puntos de
con biotina hibridación del microarray.

14. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
TECNOLOGIA CLART®: PROCESAMIENTO DE IMAGEN
Y ANÁLISIS
IMAGEN FINAL SOFTWARE DE
Puntos oscuros indican ANALISIS DE IMAGEN
hibridación
INFORME FINAL
AUTOMATICO

15. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
SOFTWARE DE PROCESAMIENTO Y ANÁLISIS DE
IMÁGENES SAICLART®
•Software de procesamiento de imagen para microarrays desarrollado íntegramente por GENOMICA.
•Sus avanzados algoritmos son capaces de detectar e identificar los spots y obtener medidas cuantitativas de
alta precisión:
•Resultados rápidos y reproducibles.
•Integración de múltiples métodos de normalización y corrección del fondo.
•Interpretación de layouts de cualquier dimensión, con una o más gradillas, una o más muestras por imagen, etc.
•Alineamiento de la cuadrícula avanzado, capaz de procesar microarrays imprimidos en pocillos individuales en cualquier
ángulo de rotación.
•Gestión de la información:
•Conexión a LIMS.
•Informe de resultados disponible para su almacenamiento, exportación e impresión.
•Generación de una carpeta electrónica por muestra y/o paciente.
•Rutas de exportación y back up establecidas por el usuario.
•Generación de tres informes complementarios por muestra.

16. GENOMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
PLATAFORMAS DE PROCESAMIENTO CLART®
CAR-Clinical Array Reader CAP-Clinical Array Processor
•El CAR es un lector diseñado para la lectura e interpretación •Realiza el procesamiento de 96 muestras
automática de los resultados de diagnóstico procesados simultáneamente de forma automática.
con la tecnología CLART®. •Formato arrays. Placa microtiter 96 pocillos (CSP).
•Formato arrays: tiras de 8 pocillos (CS). •Reduce considerablemente el tiempo de trabajo en la
•Permite analizar desde 1 hasta 96 muestras técnica y el posible error debido al factor humano.
simultáneamente.
•Procesamiento automático de imágenes.
•Compatible para todos los productos IVD de GENOMICA.
CSP
CS

17. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
GARANTÍAS DE CALIDAD DE PRODUCTOS CLART ®
Calidad de resultados garantizada al INCORPORAR VARIOS CONTROLES:
•Se asegura la presencia de ADN en el análisis: control de DNA genómico humano incluido.
•Se comprueba que la amplificación se ha realizado correctamente: inclusión de un control interno
de amplificación
•Se incluyen en el array varias sondas diferentes por diana.
•Una misma sonda están al menos impresa por triplicado en el array: para las dianas y controles,
evitando alteraciones locales sobre los puntos que pudieran afectar a los resultados finales,
proporcionando robustez.
•Realización de validaciones internas y externas con significado clínico en hospitales nacionales e
internacionales de referencia, permitiendo el establecimiento de parámetros analíticos y diagnósticos:
•Sensibilidad •Reproducibilidad
•Especificidad •Repetibilidad
•Marcado CE: todos los productos cumplen la directiva 98/79/CE.

18. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
ARRAY DE USO CLÍNICO: VENTAJAS
Diagnóstico rápido y específico que facilita al clínico una toma de decisión a tiempo.
Detección múltiple de varias dianas en un solo análisis de forma sencilla y automática.
• Alta especificidad que facilita la incorporación de gran variabilidad de sondas.
• Gran sensibilidad que permite la detección de microorganismos presentes en un bajo número de
copias.
• Rapidez y reducción de costes al permitir la realización de varias pruebas simultáneamente, de
forma eficaz. Proporciona un diagnóstico rápido en ocho horas máximo.
• Posibilidad de automatización de todo el ensayo, lo cual elimina errores de manipulación.
• Hasta 195 puntos en un array de baja densidad, lo que facilita la incorporación de todos los
controles necesarios para asegurar la fiabilidad del sistema.
• Posibilidad de registro de datos y almacenamiento de imágenes en disco duro. Creación de
historiales de pacientes. Conexión a LIMS en sistemas hospitalarios.
• Interpretación automática de los resultados utilizando un software específico para cada
aplicación. Ausencia de valoraciones subjetivas. Informe final de resultados.
• Codificación de cada prueba mediante etiquetas Data Matrix. Protección de datos.

19. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
PRODUCTOS CLART®DIAGNÓSTICO IN VITRO
CLART® HPV: detección y genotipado de hasta 35 tipos de virus del Papiloma
Humano, incluyendo todos los de alto riesgo de desarrollo de cáncer de cuello de
útero.
CLART® MetaBone: detección de polimorfismos relacionados con la pérdida de
Densidad Mineral Ósea (DMO) y riesgo de fractura. Detección de mutaciones
presentes en los genes colágeno tipo1, receptor de la vitamina D, receptor de
estrógenos y receptor de calcitonina.
CLART® PneumoVir: detección simultánea de los 17 tipos más frecuentes de
virus humanos que causan infecciones respiratorias en un solo test.
Incluye: Adenovirus; Bocavirus; Coronavirus; Enterovirus (Echovirus);
Influenza A (incluyendo la variante pandémica H1N1 2009), B y C;
Metapneumovirus (subtipos A y B); Parainfluenza 1, 2, 3, y 4 (subtipos A y B);
Rhinovirus; Virus Respiratorio Sincitial tipo A (VSR-A); Virus Respiratorio Sincitial
tipo B (VSR-B).

20. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
PRODUCTOS CLART® DIAGNÓSTICO IN VITRO II
CLART® ENTHERPEX: detección de virus Herpes Humanos y Enterovirus
en un solo ensayo. Incluye: HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, HHV-6, HHV-7,
HHV-8; Enterovirus (Poliovirus, Echovirus y Coxsackievirus).
CLART® Septibac+: detección de bacterias gram positivas y hongos
causantes de sepsis a partir de hemocultivos: Staphylococcus spp (S. aureus,
S. hominis, S. haemolyticus, S. epidermidis), Streptococcus spp (S.
pneumoniae. S. pyogenes, S. agalactiae, S. mitis, S. sanguinis, S. millerii),
Clostridium perfringens, Listeria monocytogenes, Enterococcus faecalis,
Entecoccus faecium, Candida spp (C. albicans, C. glabrata, C. krusei, C.
parapsilosis), y marcador de resistencia a metilicina mecA.
CLART® EnteroBac: identificación de patógenos bacterianos causantes de
diarrea infecciosa presentes en muestras fecales mediante la detección de
factores de virulencia y enterotoxinas de Escherichia coli (EP, ET, EH, EI),
Clostridium difficile (toxina B), Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia spp.,
Campylobacter spp. (C. coli y C. jejuni) y Aeromonas spp. (toxina aerolisina).

21. GENÓMICA: misión y visión en el diagnóstico molecular
GRACIAS POR SU ATENCIÓN
GENOMICA S.A.U.
Alcarria 7 | Pol. Ind. Coslada | Coslada
Madrid | 28823
Phone: +34 91 674 89 90 | Fax: +34 91 674 80 91
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