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Silenciamiento de genes mediante
       RNA de interferencia
                 17 | 06 | 2011



         Nicole Salgado | Silvia Lazzarino
CONTENIDOS
       .1.
   Introducción
       .2.
   Mecanismo
       .3.
     Función
       .4.
    Aplicación
       .5.
     Análisis
Un poco de historia sobre los RNA de interferencia..
INTRODUCCIÓN
                           Trabajo de botánicos con petunias. Se descubre un fenómeno
                 1990      de silenciamiento que fue llamado “co-supresión”.


                           Trabajos el hongo Neurospora crassa. Se descubre un
                 1992      fenómeno equivalente al de co-supresion que fue llamado
                           “quelling”.


                           Andrew Fire y Craig Mello trabajaron el silenciamiento de
                 1998      genes en C.elegans, definiendo el rol del RNA de interferencia
                           (iRNA).


                           Tomas Tuschl descubre el uso directo de los siRNA, lo que
                 2000      permite su aplicación en mamíferos.


                           Andrew Fire y Craig Mello ganan el premio Nobel de medicina
                 2006      por descubrir el silenciamiento de genes por iRNA.
INTRODUCCIÓN
                                              Este mecanismo fue
               Caenorhabditis elegans
                                                 observado por
                                             primera vez en 1990,
                                             en plantas (Petunias).

                                            Más tarde se observó en:
                                            - Caenorhabditis elegans
                                               -Neurospora crassa
                                          -- Drosophila Melanogaster
               Drosophila Melanogaster


                                         Luego se observó en mamíferos




               Neurospora crassa
MECANISMO
MECANISMO   ¿Qué es el RNA de interferencia y cuál es su mecanismo de acción?




                       Video Nature Reviews:
                       http://www.nature.com/focus/rnai/animations/index.html
MECANISMO        RNA de interferencia


                                          A                  B                 C            D




               A                      B                                  C                      D
              siRNA se       siRNA se acopla RISC                iRNA se une al RNAm           Se evita
             introduce     (RNA induced silencing complex)        Slicer Ago 2 corta el   traducción y se
            en la célula   y se le remueve la hebra                       RNAm             silencia el gen
                                     sentido
¿Cuál es el rol natural del iRNA en la célula?



                             Este mecanismo actúa como un sistema inmune
           PROTECCIÓN
FUNCIÓN
                             a nivel celular.




                             Este sistema regula la expresión de genes,
           REGULACIÓN        especialmente en el desarrollo.
Usos del iRNA como metodología experimental…
APLICACIÓN
Usos del iRNA como metodología experimental…
APLICACIÓN




                        FIGURA 1                             FIGURA 2
              Análisis de la expresión de b-   Efecto de la supresión de niveles de
              arrestina en células HEK293      B-arrestina mediada por siRNA en la
               transfectadas con siRNA.         internalización del receptor 7MS.
Aspectos a considerar sobre la metodología experimental…



                           Técnica de fácil uso.
             VENTAJAS      Gran variedad de mecanismos efectores.
ANÁLISIS

                           Existen programas gratuitos para el diseño de iRNA.
                           Producción de siRNA ampliamente extendida.
             DESVENTAJAS




                           El silenciamiento no es 100% completo.
                           Puede haber silenciamiento inespecífico.
                           Es necesario utilizar un mecanismo para que el iRNA
                           ingrese a la célula blanco.
Otras proyecciones al uso de los iRNA…
APLICACIÓN




             Eliminar de la célula   Anular la función    Interferir en la
                los elementos         de proteínas que     expresión de
             esenciales para un      estén involucradas       genes
                  patógeno.          en enfermedades.       patógenos.
FIN
BIBLIOGRAFÍA
               • Maria Fernanda Correa, Haroution Adjounian, Sarkis Horacio,
               “Silenciamiento de genes mediante RNA de interferencia,
               consideraciones del mecanismo y diseño de los sistemas efectores”,
               Archivos de farmacología y terapéutica, 2007.

               • www.nature.com - RNA interference

               • “Biotecnología, RNA de interferencia: el silencio de los genes”,
               Tomás López, Daniela Silva, Susana López y Carlos Arias.

               • Seungkirl Ahn, Christopher D. Nelson, Tiffany Runyan Garrison,
               William E. Miller, and Robert J., “Desensitization, internalization, and
               signaling functions of !-arrestins demonstrated by RNA interference”
               PNAS, 2002.
Sistemas efectores
ANEXO

                             shRNA

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Silenciamiento de genes mediante rna de interferencia

  • 1. Silenciamiento de genes mediante RNA de interferencia 17 | 06 | 2011 Nicole Salgado | Silvia Lazzarino
  • 2. CONTENIDOS .1. Introducción .2. Mecanismo .3. Función .4. Aplicación .5. Análisis
  • 3. Un poco de historia sobre los RNA de interferencia.. INTRODUCCIÓN Trabajo de botánicos con petunias. Se descubre un fenómeno 1990 de silenciamiento que fue llamado “co-supresión”. Trabajos el hongo Neurospora crassa. Se descubre un 1992 fenómeno equivalente al de co-supresion que fue llamado “quelling”. Andrew Fire y Craig Mello trabajaron el silenciamiento de 1998 genes en C.elegans, definiendo el rol del RNA de interferencia (iRNA). Tomas Tuschl descubre el uso directo de los siRNA, lo que 2000 permite su aplicación en mamíferos. Andrew Fire y Craig Mello ganan el premio Nobel de medicina 2006 por descubrir el silenciamiento de genes por iRNA.
  • 4. INTRODUCCIÓN Este mecanismo fue Caenorhabditis elegans observado por primera vez en 1990, en plantas (Petunias). Más tarde se observó en: - Caenorhabditis elegans -Neurospora crassa -- Drosophila Melanogaster Drosophila Melanogaster Luego se observó en mamíferos Neurospora crassa
  • 6. MECANISMO ¿Qué es el RNA de interferencia y cuál es su mecanismo de acción? Video Nature Reviews: http://www.nature.com/focus/rnai/animations/index.html
  • 7. MECANISMO RNA de interferencia A B C D A B C D siRNA se siRNA se acopla RISC iRNA se une al RNAm Se evita introduce (RNA induced silencing complex) Slicer Ago 2 corta el traducción y se en la célula y se le remueve la hebra RNAm silencia el gen sentido
  • 8. ¿Cuál es el rol natural del iRNA en la célula? Este mecanismo actúa como un sistema inmune PROTECCIÓN FUNCIÓN a nivel celular. Este sistema regula la expresión de genes, REGULACIÓN especialmente en el desarrollo.
  • 9. Usos del iRNA como metodología experimental… APLICACIÓN
  • 10. Usos del iRNA como metodología experimental… APLICACIÓN FIGURA 1 FIGURA 2 Análisis de la expresión de b- Efecto de la supresión de niveles de arrestina en células HEK293 B-arrestina mediada por siRNA en la transfectadas con siRNA. internalización del receptor 7MS.
  • 11. Aspectos a considerar sobre la metodología experimental… Técnica de fácil uso. VENTAJAS Gran variedad de mecanismos efectores. ANÁLISIS Existen programas gratuitos para el diseño de iRNA. Producción de siRNA ampliamente extendida. DESVENTAJAS El silenciamiento no es 100% completo. Puede haber silenciamiento inespecífico. Es necesario utilizar un mecanismo para que el iRNA ingrese a la célula blanco.
  • 12. Otras proyecciones al uso de los iRNA… APLICACIÓN Eliminar de la célula Anular la función Interferir en la los elementos de proteínas que expresión de esenciales para un estén involucradas genes patógeno. en enfermedades. patógenos.
  • 13. FIN
  • 14. BIBLIOGRAFÍA • Maria Fernanda Correa, Haroution Adjounian, Sarkis Horacio, “Silenciamiento de genes mediante RNA de interferencia, consideraciones del mecanismo y diseño de los sistemas efectores”, Archivos de farmacología y terapéutica, 2007. • www.nature.com - RNA interference • “Biotecnología, RNA de interferencia: el silencio de los genes”, Tomás López, Daniela Silva, Susana López y Carlos Arias. • Seungkirl Ahn, Christopher D. Nelson, Tiffany Runyan Garrison, William E. Miller, and Robert J., “Desensitization, internalization, and signaling functions of !-arrestins demonstrated by RNA interference” PNAS, 2002.