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1.
第27回統合DBミーティング Integrated MTG in
NIBIO 2013/12/20
2.
本日の予定 • Sagace ‒ ‒ ‒ ‒ アクセス解析 進捗報告 Sagaceに追加するDBについて 検索結果画面のDB毎の表記について ・医薬基盤研内のデータのRDF化 ‒ 進捗報告 •
厚生労働科学研究成果データベース ‒ 調査報告と分担について • 分子生物学会年会 ‒ 反省と今後の対策について • 今後の予定 2
3.
アクセス解析(11月) Google Update? MEDALS メンテナンス 3
4.
データベース順位 (11月) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 特許 17600 医学・薬学予稿集全文データベース 2900 メルクマニュアル 2900 ゲノムネット医薬品データベース 2900 お薬110番(ハイパー薬辞典) 2400 医療情報サービスMINDS 2300 ここカラダ
お薬辞典 2100 メルクマニュアル家庭版 1700 「健康食品」の素材情報データベース 1500 動物用医薬品データベース 1400 4
5.
進捗報告(開発版にて) • 追加予定のデータベースのインデックス作成完了 ‒ ‒ ‒ ‒ ‒ ‒ ‒ ‒ ‒ ‒ 感染症の情報 感染症流行予測調査 感染症発生動向調査 週報 (IDWR) 病原体検出マニュアル 生物学的製剤基準 国際化学物質安全性カード 薬剤分類情報閲覧システム PRIGEN 薬事法 医師法 5
6.
進捗報告 • メタデータの対応 ‒ 文献と組織
(Organization) • クローリングの自動化 6
7.
検索結果画面のDB毎の表記について • 現状のHyperEstraierだとDB毎の表 記は可能だが,DB内のトップの一件 しか抽出することが出来ない。 • 目的の機能の実装を試みると速度の 大幅な低下が見込まれる •
Apache Solrで可能かどうか調査中 7
8.
一件ずつ表記 8
9.
現状 9
10.
Sagaceに追加するDBについて ファセット分類/ データベース名 CELLPEDIA (Repository database for
current knowledge about human cells) データベースの種類 その他のデータベース 生物種 ヒト 生体の階層 細胞・組織 分類 B 10
11.
Sagaceに独自に追加するDB について • JAPIC ‒ 添付文書検索 ‒
臨床試験情報検索 11
12.
医薬基盤研内のデータのRDF化 • 実験動物資源研究バンク ‒ 松田さんとMTG ‒
RDF化開始 12
13.
厚生労働科学研究成果データ ベースの調査について • 1エントリ1人調査 ‒ 1人55件程度 •
1エントリ2人調査 ‒ 1人120件程度 13
14.
分子生物学会の反省 ブースについて • 事前準備の不足点 ‒ 各システムについての概要と背景の共有 ‒
ひと通りの操作やUse Caseの共有 • 当日対応について ‒ どのような点が難しいかを詳しく聞くこと で機能の改良に活かせるのではないか • シフトについて 14
15.
今後の予定 • 1月 ‒ 実験動物バンクのRDF化 ‒
外部データベースとの連携 ‒ BioHackathon 国内版(1月27日∼31日)
16.
次回 • 1月23日(木)? 16
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