Información, informática y cienciometría para envejecimiento
1. Información, informática y
ciencimetría para el estudio del
envejecimiento:
enfoques, retos y perspectivas
Seminario de Investigación, INGER
México, D.F. 5 de abril del 2011
Layla Michán
Laboratorio de Ciencimetría, Información e
Informática en Ciencias Biológicas
2. Índice
• Laboratorio de Ciencimetría, Información e Informática
en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, UNAM.
–Objetivo
–Líneas y proyectos
• Información, informática y ciencimetría para el estudio
del envejecimiento:
–Enfoques: Información, informática y cienciometría.
–Retos
•Propuesta para el INGER
–Perspectivas
3. Laboratorio de Ciencimetría, Información e Informática
en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, UNAM.
INTRODUCCIÓN
4. Laboratorio de Ciencimetría, Información e Informática en Ciencias Biológicas
Facultad de Ciencias, UNAM
PROBLEMAS
1. (R)evolución digital en las ciencias biológicas
2. Características de la E-biología
3. Dinámica, estructura y relaciones de la biología reciente
4. Publicación científica en la Web
5. Recursos web y ciberinfraestructura para biología
6. Colecciones de datos
7. Meta-análisis de literatura: bibliometría, análisis de redes, minería de textos,
semántica
TIPOS
1.Biológica ENFOQUE MULTIDISCIPLINARIO
2.Bibliográfica 1.Biología
3.Institucional INFORMACIÓN 2. Ciencias de la información y
BIOLÓGICA documentación
3. Tecnologías de la Información y
ÁREAS comunicación
1.Biodiversidad 4.Ciencias de la computación e informática
2.Biomedicina 5.Historia, sociología y filosofía de la ciencia.
APLICACIONES
1.Análisis de la ciencias biológicas actuales: desarrollo, estructura, relaciones y tendencias
2.Información e informática en ciencias biológicas, relacionadas y afines
3.Obtención de nuevo conocimiento biológico
4.Planeación, evaluación, gestión y política científica
5. Objetivos
• Realizar investigación sobre ciencimetría,
información e informática en Ciencias Biológicas
relacionadas y afines.
• Formar especialistas en el área.
• Colaborar y asesorar a los especialistas en
Biomedicina y Biodiversidad respecto a temas de
información e informática para la investigación,
planeación, evaluación, gestión y política científica.
• Difundir las herramientas más novedosas para el
uso de la Web en investigación biológica.
6. Líneas de investigación
• I. Análisis de las Ciencias Biológicas 1980-2010
– Estructura, desarrollo, tendencias, patrones y relaciones de la investigación biológica
reciente Ciencimetría, historia y sociología de la ciencia.
– (R)evolución digital de la información en ciencias biológicas.
– Impacto de las TICs en la práctica biológica.
• II. Información e informática en ciencias biológicas relacionadas y afines
– Caracterización, manejo, sistematización, aplicaciones y meta-ánalisis de la información,
en especial la literatura en ciencias biológicas (Bioinformación).
– Tipos de información en ciencias biológicas: biológica, bibliográfica e institucional.
– E-ciencia y la e-biología (ciberinfraestructura) disponible para investigación.
– Recursos Web (Web 2.0 y 3.0) para Biología relacionadas y afines.
– Recuperación, manejo y meta-análisis de información digital especializada en biología.
– Colecciones (índices y catálogos, repositorios) de literatura en biomedicina y biodiversidad.
– Producción y comunicación de información en las ciencias biológicas.
– Bioética de la publicación científica.
– El flujo de la información biológica.
– La Publicación académica en la era digital.
– Tendencias actuales en bioinformación e informática biológica.
7. Proyectos actuales
• Recursos de la Web para el manejo de literatura en biología DGAPA, UNAM.
Proyecto PAPIME PE 201509 2009-2011.
• Análisis de las ciencias biológicas en la actualidad: el impacto de las TICs.1980-
2010 CONACYT, Ciencia Básica Proyecto 13276 2011-2014.
• Repositorio Institucional de la Facultad de Ciencias UNAM, Atenea.
• Análisis bibliométrico y de redes de Biblat: Clase y Periódica, DGB UNAM.
• REPRODCYT: Red Iberoamericana para el Estudio integral de la Producción
Científica y sus Indicadores de Relevancia y Excelencia, como criterios para
evaluar el potencial en Ciencia, Tecnología e Innovación en Universidades de la
región.
• WP5: Building and Exchanging Knowledges on Natural Resources. European
Union & IRD - Institut de recherche pour le développement.
11. (Re)evolución de la información
• Diseño de las computadoras, aparición del Internet masificación de
la web.
• Formato digital: bajo costo, poco espacio.
• Explosión de la información.
• Desapareció la distinción entre escribir y publicar, se volvió un
proceso simultáneo.
• Gran cantidad de colecciones de datos .
• Dinámica: cambia, está en modificación constante, tanto el
contenido como los formatos.
• Masiva
• Democrática: Cualquiera puede publicar información sin revisión o
edición
12.
13. (Re)evolución de la información
(científica)
• Modificación en la forma de producir, evaluar, consultar y
difundir el nuevo conocimiento científico.
– Revistas electrónicas
– Procedimiento electrónico
– Evaluación libre
– Preprints
– Inmediatez
• Se han producido nuevas disciplinas científicas
– Bioinformática
– Informática Médica
14.
15. About the Journal
The founding principle of the Journal of Universal Rejection (JofUR) is
rejection. Universal rejection. That is to say, all submissions, regardless of
quality, will be rejected. Despite that apparent drawback, here are a number
of reasons you may choose to submit to the JofUR:
•You can send your manuscript here without suffering waves of anxiety
regarding the eventual fate of your submission. You know with 100%
certainty that it will not be accepted for publication.
•There are no page-fees.
•You may claim to have submitted to the most prestigious journal (judged
by acceptance rate).
•The JofUR is one-of-a-kind. Merely submitting work to it may be
considered a badge of honor.
•You retain complete rights to your work, and are free to resubmit to other
journals even before our review process is complete.
•Decisions are often (though not always) rendered within hours of
submission.Editorial Board
Founder and Editor-in-Chief
Caleb Emmons, Pacific University, USA (Mathematics and Poetry).
16. Instructions for Authors
The JofUR solicits any and all types of manuscript: poetry, prose,
visual art, and research articles. You name it, we take it, and reject
it. Your manuscript may be formatted however you wish. Frankly, we
don't care.
After submitting your work, the decision process varies. Often the
Editor-in-Chief will reject your work out-of-hand, without even
reading it! However, he might read it. Probably he'll skim. At other
times your manuscript may be sent to anonymous referees. Unless
they are the Editor-in-Chief's wife or graduate school buddies, it is
unlikely that the referees will even understand what is going on.
Rejection will follow as swiftly as a bird dropping from a great height
after being struck by a stone. At other times, rejection may languish
like your email buried in the Editor-in-Chief's inbox. But it will come,
swift or slow, as surely as death. Rejection.
Submissions should be emailed
to editor@universalrejection.org (We have recently become aware
that this email address is acting up sometimes, so as a backup you
may also use our old addressj.universal.rejection@gmail.com.).
Small files only, please. Why not just send the first couple pages if it
is long? If you are lucky, your eventual rejection letter will appear on
the Journal's blog. Please let us know in your cover letter if you
would not mind being identified, otherwise most identifying
information will be redacted.
SubscriptionsAn individual subscription may be secured for £120
per year (four issues). Institutional and library subscriptions are also
available; prices will be provided upon enquiry. It is unknown
whether the subscription will be delivered in print or as electronic
content, because no one has yet ordered one.
17.
18.
19. La Web 2.0 (Social)
• Se centra en la capacidad de las personas para colaborar y compartir información en
línea.
• Transición de la Web estática a una dinámica, que es más organizada.
• Comunicación abierta con un énfasis en comunidades de usuarios e intercambio de
información.
• Ya no sólo se trata de ofrecer la posibilidad de encontrar información, sino de lograr
objetivos específicos, pues es factible, crear, etiquetar jerarquizar y compartir datos.
• Lenguaje HTLM
Web 3.0 (Semántica)
• Basada en la idea de añadir metadatos semánticos e información (a través de mapas
• cognitivos).
• Desarrollar nuevos sistemas de interoperabilidad que permitan interpretar
• metadatos para adaptarse a las acciones de los usuarios .
• Minería de textos y ontologías
• Lenguajes: XML (etiquetas) y RDF (metadatos)
20. Web 1.0
2000
• Páginas electrónicas
• Portales (sitios web)
• Motores de bùsqueda
•Consumidores
• Metabuscadores (contenido)
• Correo electrónico
• Chats
• Alertas Diferencias
• Listas de discusión •Tecnológicas
Web 2.0 •Estructurales
2003 •Filosóficas
•Comunidades (conexiones •Sociológicas
entre usuarios)
•Actualización constante
• Blogs •Intercambiar contenido
• Redes sociales •Compartir
• Wikis •Cargar
• Folksonomias (social bookmarking) •Creadores (contenido)
•Democrático
• Weminarios
•Se combina información de
• Web feed diferentes bases de datos
•Etiquetas
•Ratings
24. Browse I Web Apps II Bibliographic data
Web Metabrowser web browsers Collections
Librarie
Browsers s specialized
Editors s
Suppliers
Search
Information systems
Bookmark Indexes and catalogs
Manage
Share
III Meta-analysis
• Scientometrics
• Network Analysis
• Text mining
Repositories
• Semantics
25.
26. Delicious Visualizeus
Mendeley
CiteUlike
Barra de herramientas de Google
Vista Previa Interclue
Zotero
Interclue
Xmarks
Delicious
33. Tim Berners-Lee, el creador de la
idea, la expresó de la siguiente
manera:
"Mi sueño es una Web en la que las
máquinas sean capaces de analizar
todos los datos –contenido, enlaces
y transacciones entre la gente y los
ordenadores–. La 'Web Semántica',
que haría esto posible, está todavía
por llegar, pero cuando llegue, la
rutina de nuestras compras,
burocracia y vida diaria será
gestionada por máquinas hablando
con máquinas. Los 'Agentes
Inteligentes' que han sido
anunciados durante décadas se
harán por fin realidad".
34. Protocolo
Web
semántica
Dietze and Schroeder BMC
Bioinformatics 2009 10(Suppl
10):S7 doi:10.1186/1471-2105-10-
S10-S7
36. Automatización, Actualización e
Inmediatez
• Importancia de la actualización e inmediatez
en el área Biomédica.
• La herramienta de la web 2.0 para la
actualización: los feeds
• i-google y Google Reader
• Creación de feeds
– De revistas (Cell, Nature, Science, Plosone)
– De blogs (ciberinfraestructura)
– De noticias
– De google
37. Torres-Salinas, D. and E. Delgado-López-Cózar (2009, September). Estrategia para mejorar la difusión de los resultados de
investigación con la web 2.0. El Profesional de la Informacion 18 (5), 534-539.
38. (Hull, D. et al., 2008)
Figure 1. A mind map [207] summarizing the contents of this article in a convenient manner.
doi:10.1371/journal.pcbi.1000204.g001
40. Meta-análisis
• Simultáneo al desarrollo de ciencias de la
información (CI) y las tecnologías la información y
la comunicación (TICS), en especial con el
desarrollo de las bases de datos y la Internet, se
han producido formas sistémicas de análisis de
cantidades colosales de información (terabites).
• Técnica cuantitativa que usa mediciones
específicas para indicar la fuerza (tendencias) de
relaciones variables en los estudios incluidos en el
análisis. La técnica enfatiza los resultados entre
múltiples estudios en oposición a los resultados
obtenidos de una sola investigación.
41. Caracteríticas
Se pueden hacer debido a que existen
grandes colecciones de datos de registros
bibliográficos (repositorios o bases de
datos).
Hemos reconocido tres tipos:
• Análisis bibliométricos (Bibliometría)
• Análisis de redes
• Descubrimiento basado en literatura
(Minería de textos, minería de datos).
42. Análisis bibliométrico
Elección de fuentes y recursos Elección de fuentes y recursos Bases de datos
Recuperación Búsqueda Búsqueda Registros y campos
Selección
Extracción
Migración Traducción
Normalización y Depuración
Aplicación Web
carga
Pruebas
Diseño de la base de datos
relacional: tablas, relaciones y Relaciones lógicas
formularios Validación
Consultas
Análisis Frecuencia de variables y
tablas de contingencia
Tratamiento cuantitativo: Indicadores
ciencimétricos y biliométricos, Bibliometría
métodos y modelos matemáticos, y
técnicas estadísticas (univariante,
bivariante y multivariante) Regularidades
Indicadores y
Visualización Determinación, identificación y
visualización
parámetros
Explicaciones
Interpretación Interpretación: descripción,
comparación, contextualización Interpretación
64. Temas actuales
• Rescatar la literatura gris: Reservorios
• Plagio
• Redes sociales: facebook vs Twitter
• Microbloging
• Preservación de la información digital
• Dispositivos móviles
• Uso de libros electrónicos en la académica
• Open Access
• Web Semántica (Web 3.0)
• Ontologías
• Dispositivos móviles
65. (Hull, D. et al., 2008)
Figure 1. A mind map [207] summarizing the contents of this article in a convenient manner.
doi:10.1371/journal.pcbi.1000204.g001
68. Los estudios métricos de la información científica
Consisten en la aplicación de métodos cuantitativos
a la investigación sobre el desarrollo, la estructura y
las relaciones de la ciencia:
• Infometría, (información)
• Ciencimetría 1963 (ciencia)
• Bibliometría 1969 (Documentos)
• Cibermetría 2003 (páginas web o blogs)
• Alt-metría 2010 (Web social con fines académicos)
En este caso se usarán para referirnos a todas las
anteriores indistintamente ciencimetría o bibliometría
69. Ciencimetría/Bibliometría
• Se encarga de estudiar los aspectos cuantitativos de la información, de la
ciencia, de los documentos y las páginas electrónicas producto de la
investigación sobre el desarrollo de la ciencia, por lo que desempeña un
papel importante como instrumento de análisis y prognosis de las políticas
de investigación.
• Implica el manejo de cantidades de datos inmensas (cientos y miles de
documentos) y la aplicación de análisis estadísticos e indicadores
matemáticos para reconocer las regularidades de la producción y la difusión
de la ciencia con respecto a diversas variables con las distintas unidades de
análisis.
• Sintetiza en unos pocos parámetros, las características de distintos grupos
de datos, así como en la posibilidad que brinda para establecer pronósticos
sobre tendencias futuras y determinar el efecto de diferentes factores en
variables de interés.
• Ofrece una base sólida para la toma de decisiones prácticas.
70. Los análisis bibliométrico han atraído mucha
atención en los últimos años por varias razones:
• El diseño de bases de datos de literatura científica con
acceso electrónico en todo el mundo
(SCI, PubMed, Scopus, Google Scholar, etc);
• La disponibilidad de herramientas eficaces para llevar a
cabo análisis automáticos.
• Representan sustento con los datos empíricos a la historia, la
filosofía y sociología de la ciencia.
• Permite describir:
• Las tendencias recientes de la investigación,
• Los resultados del esfuerzo de la posición
nacional en relación a los demás,
• Evaluar las políticas nacionales y los laboratorios,etc
• Es un método ideal para investigar el desarrollo, la
estructura, la dinámica y las relaciones de las ciencias
Bansard, et al. 2007
(
71.
72. Características
1. Es un método objetivo que permite conocer las condiciones que se
quieren estudiar, utiliza el análisis de dos evidencias esenciales
para ilustrar el desarrollo de la ciencia:
• Los científicos
• Las publicaciones científicas
2. Permite analizar y evaluar el estado de la ciencia y la tecnología
en varias naciones, pues se comparan los resultados obtenidos y
se elaboran las tendencias en el tiempo.
3. Instrumento de evaluación para fomentar y/o estudiar la praxis de
la ciencia, definir estrategias y políticas de desarrollo científico
nacionales e internacionales.
4. Este método suele ser anacrónico y dificulta delimitar los aportes
científicos en un contexto histórico y espacial, es deseable
combinarlo con otros métodos y contextualizar usando la historia,
sociología y etnografía, por ejemplo.
73. Leydesdorff, L. (2001). The Challenge of Scientometrics: The Development, Measurement, and Self-
Organization of Scientific Communications . Universal Publishers, 2nd ed.
URL http://www.worldcat.org/isbn/1581126816
74. Aplicaciones
• Recuperación de información.
• Administración de bibliotecas.
• Historia de las ciencias y las políticas científicas de una
institución o gobierno.
• Desarrollo de modelos matemáticos y obtención de medidas
para los diferentes fenómenos de la práctica científica.
• Los aspectos estadísticos del lenguaje y la frecuencia del uso
de las palabras y frases.
• Las características de la productividad de los autores y su
colaboración.
• Las características de las fuentes donde se publican los
documentos, incluida su distribución por disciplinas.
• Demanda y circulación.
• Modelo de comunicación científica (enfoques de sistemas,
modelos matemáticos, etc.).
75. • Patrones de comunicación, colaboración, flujo de información
en ciencia y tecnología, migración (análisis de citas, factores de
impacto de revista, flujos nacionales, internacionales, etc.).
• Producción científica (disciplinas, estudios de género,
departamentos de investigación, institucionales, países, etc.).
• Indicadores de apoyo para toma de decisiones en política
científica (economía, organización y administración,
tecnologías de información y comunicación, gestión de
recursos, pronósticos, impacto, evaluación).
• Aspectos teóricos de los estudios cuantitativos y cualitativos de
la ciencia y la tecnología.
• Técnicas de minería de datos y textos aplicados a la obtención
de indicadores.
• Análisis documental
• Creación y distribución de bases de datos
• Dinámica de la literatura (historia, crecimiento, obsolescencia,
dispersión, relación ciencia-tecnología, etc.).
76. Algunas preguntas bibliométricas
• Las características de la productividad de los autores, medida
por la cantidad de documentos publicados en un tiempo
determinado o por su grado de colaboración.
• Las características de las fuentes donde se publican los
documentos, incluida su distribución por disciplinas.
• Los análisis de citas, según distribución por autores, tipo de
documento, instituciones o países.
• El uso de la información registrada a partir de su demanda y
circulación.
• La obsolescencia de la literatura mediante la medición de su
uso y de la frecuencia con que se cita.
• El incremento de la literatura por temas.
• La distribución idiomática según la disciplina o el área
estudiada.
77. Indicadores bibliométricos
• Producción (Bradford)
• Autoría (Lotka)
• Palabras (Zipf)
• Obsolescencia
• Vida media
• Colaboración
• Factor de impacto
• Sensibilidad
• Impacto
• Citas
• Índice H
78. CITAS
• Una cita es una forma de referencia breve colocada entre
paréntesis dentro de un texto o añadida a un texto como nota a
pie de página, al final de un capítulo, o al final de la obra
completa.
• La citación permite identificar la publicación de la que se extrae
la idea parafraseada.
• Ejemplo: (Umberto Eco, 1993, p.240-245)
• La norma ISO-690 define en su capítulo 9 las relaciones entre las
referencias y las citaciones bibliográficas, y los diferentes
métodos de citas.
• Cuando uno cita un documento o elige hacerlo es porque
considera la información relevante, de entre muchas otras.
79. Citas
industria críticas y sugerencias
leídos y certificados (1)
administración de los colegas
disciplinas afines leídos y aceptados (9)
Ignorados (90)
temas de trabajo artículos publicados (100)
proyectos producción de
argumentaciones
conocimientos interpretaciones
solicitudes
de subvención
científicos
Lectura
financiera
de los artículos
escritos por
notas de
contratación los colegas
labora torio
de personal investigadores
equipos
compras Coloquios, seminarios
grupos de trabajo
Herve, P., Jean-Pierre, C., & Michel, C. (1995). Cienciometría: el estudio cuantitativo de la actividad científica. de la bibliometría a la
vigilancia tecnológica. (p. 110).
80.
81. Bibliometría
para
palabras
Fig. 2. Co-word space of the top 50 highly frequent and bursty words used in the top
10% most highly cited PNAS publications in 1982-2001.
93. Indicadores bibliométricos en el siglo
XXI
• De uso generalizado
• Internet
• Aplicaciones novedosas
• Datos actualizados
• Dinámicos
• Aplicaciones relevantes
• Evaluación, gestión y política científica
• Análisis de la ciencia actual: desarrollo, estructura,
dinámica y relaciones.
• Recuperación de literatura (búsqueda y selección).
95. Retos actuales
• Una nueva cultura (informática)
• La explosión de la cantidad y diversidad de
herramientas digitales (Web)
• Colaboración
• Estándares
• Colecciones
• Normalización
• Semántica (Ontologías)
• Nube
• Acceso Abierto
• Derechos de Autor (Plagio)
• Nuevas especialidades
96. Retos para México
• Colecciones regionales y locales de vanguardia
(sistemas de información y repositorios).
• Indicadores ciencimétricos regionales y locales.
• Revistas electrónicas innovadoras y dinámicas.
• Incorporar herramientas de la Web 2 y 3.
• Agregar opciones de Meta-análisis de literatura
• Bibliometría, análisis de redes, minería de textos y
semántica.
• Personalizadas
• Automáticas
• Suceptibles al meta-análisis
98. Propuesta
• Crear un grupo interdisciplinario especializado en información e
informática en envejecimiento, relacionadas y afines que colabore
con la enseñanza, investigación y difusión que realiza el instituto a
un alto nivel utilizando herramientas de vanguardia.
• Formar especialistas en información e informática gerontológica
para:
– Mantener los servicios de difusión electrónica del instituto: portal, blog, twitter,
redes sociales académicas, etc.
– Diseñar y actualizar las colecciones generadas en la institución.
– Crear un sistema de información en el que se reúnan todas las herramientas
disponibles para el manejo automatizado, personalizado y actualizado de
literatura en gerontología.
– Realizar ciencimetría sobre lainvestigación geriátrica con énfasis en México.
– Participar en la edición de una revista electrónica.
– Impartir cursos y seminarios de actualización para los investigadores.
– Proveer de información pertinente y actualizada a los académicos del instituto.
– Asesorar a los investigadores respecto a la recuperación, análisis y manejo de
información bibliográfica especializada.
– Colaborar en la implementación de herramientas electrónicas para e-learning.
99. Antecedentes
• Navarro & Lynd (2005). Primer trabajo en el que se realizó un análisis
bibliométrico de la investigación sobre envejecimiento
Analizan los 2,527 artículos de las 42 revistas indizadas en
Science Citation Index y Social Science Citation Index de 2002,
para la categoría de Geriatría y Gerontología
• Michán, L., & Michán, S. (2010). El desarrollo de la biogerontología y
geriatría de inicios del siglo XX a la actualidad , (pp. 137-145). México:
Institutos Nacionales de Salud
Consistió en identificar de manera general el estado del arte
de la investigación sobre envejecimiento utilizando como objeto
de estudio la producción científica primaria:
los artículos especializados registrados en la base
de datos bibliográfica de mayor prestigio
entre la comunidad científica
100. Análisis de la investigación sobre
Geriatría en México
– Estructura, desarrollo, tendencias,
patrones y relaciones de la investigación b
sobre geriatría en México.
– Cienimetría, Análisis de redes, text mining
y semántica.
– México, América Latina, Mundo.
– Indicadores para planeación,
evaluación, gestión y política científica.
– Catálogo de colecciones y documentos
especializados en el tema,
101. Niveles de análisis
• Tipos de análisis:
– General: para todas las regiones y países, indispensable para
contextualizar
– Particular: para México
• Tipos de documentos:
– Investigadores adscritos a alguna institución mexicana
– Sobre la población mexicana
– En revistas mexicanas
• Distintas colecciones:
– WoS
– Biosis
– PubMed
– Periódica
– Scielo
103. Repositorio Institucional INGER
• Programa Dspace
• Un repositorio es una colección bibliográfica que
cumple con el propósito de sistematizar, almacenar,
preservar y difundir los archivos (literatura, vídeo,
imágenes o sonido), producto de la práctica científica,
en especial los artículos de investigación, libros,
capítulos y memorias.
• Se caracteriza por permitir el acceso abierto a los
documentos (e-prints) pre-impresos (pre-prints) y a los
post-impresos (post-prints)
• Preservación a largo plazo
• Difusión de los trabajos
• Publicación de información complementaria
104. Perspectivas
• Uso actualizado de las herramientas
• Colecciones
• Análisis en tiempo real
• Semántica
• Disminución de la brecha
106. • Esta investigación se lleva a cabo
gracias al financiamiento de:
• DGAPA, UNAM. Proyecto PAPIME PE
201509
• CONACYT, Ciencia Básica. Proyecto
13276 2011-2014.