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TaiBIF IPT操作說明 2023 v2.6.3.pdf
- 1. 資料上傳至IPT TaiBIF 內容經理 劉璟儀 除所引第三方素材皆隨頁標註另有宣告者外，本簡報採 CC0-1.0 公眾領域貢獻宣告 發布釋出。
- 3. 2 2 清理 原始資料 檢核資料錯誤 及空值 新增資料集 填寫詮釋資料 可於 IPT上先做 對應 欄位名稱 參照Darwin Core 確認 資料類型 名錄、出現紀 錄、調查活動 資料上傳流程 公開 資料集 也可先在IPT上建立 好，但不公開 上傳至 IPT 註冊至 GBIF 可延後註冊 分 core 和 extension 至少要有 必填欄位 1 2 3 4 5 6 7 8
- 4. 3 3 What is 可以上傳的資料？ 案例參考 Occurrence_case1 1 1 2 2 3 4 5 6 7 8 9 3 4 5 6 7 8 9 8+9 要自行新增， Occurrence 必填欄位
- 5. 資料上傳 在上傳前….. 注意： 1. occurrenceID| eventID| taxonID 不能有重複 2. Occurrence core 中的 basisOfRecord 要⽤ DwC 提供的控制詞彙 3. DwC 欄位英⽂千萬不要寫錯，否則系統對不到 4. 每種 DwC 欄位在⼀份資料集中只能出現⼀次 5. 不要用合併儲存格! 4
- 7. 1. 申請新帳號 2. 等待審核通過後收取email 密碼 3. 按 Login 登入 7
- 9. 輸入資料集短名稱 (作為URL辨識用) 注意不能有空格，不能用中文， 只能用英文字母 or 數字 or底線(_) or 連字符號(-) 9 點選進入新增資料集頁面 1 2 3
- 12. 1. 點選File 2. 按[選擇檔案] 匯入整理好的raw data excel檔案 3. 按[Add] 12 上傳 raw data 1
- 13. 記得改成 1 （請不要有合併儲存格） 若以CSV純文字檔案上傳，需 輸入分隔欄位之符號（e.g. 分 號、逗號 ) 若檔案有分頁，則確認是否為所選之工作表 1 2 按Analyze & Preview檢視預覽 畫面，確認是否正確匯入資料 填完點選進入下一頁面 4 3 13
- 17. 17 點選 [Edit] 以填寫詮釋資料，盡量寫英文 此部分請填寫詳細，內容將會直接顯示於 GBIF頁面上， 所以越詳細越容易讓人搜尋到關鍵字， 或是讓人比較能夠快速了解這份資料集是否適合再利用 詮釋資料 3
- 18. 發布的組織 此選項為已於 GBIF 註冊成為資料發布者之單位， 若您的所屬單位不在此列，可選擇至GBIF註冊， 或選擇 TaiBIF （您依然可以在他處留下您的單位名稱） 資料集授權方式（請參考創用 CC 授權） 18 *者皆為必填 資料集詳細名稱，不要使用太過精簡之文字， 應讓人容易了解此資料集在提供什麼資料
- 19. 點選以新增資料集描述 （e.g. 可貼上發表的paper摘要） *者皆為必填 看不懂就點每 個欄位右邊綠 色小 i 若有 ORCID 或 LinkedIn 等 個人資料頁面，可選擇並附上 URL 資料集聯絡者 （建議填計畫主持人，資訊越詳細越佳） 19 資料集產生者 （建議填計畫主持人） 詮釋資料提供者 （應填登入帳號管理 這個資料集的人） 可點選直接複製資料集聯絡者資訊 填完點選進入下一頁面 (Geographic Coverage)
- 23. 關鍵字 你希望資料使用者容易找到的關鍵字， 或是寫資料類型 e.g. Occurrence 23 此部分為選填， 可點此移除 最好能引用線上詞庫，預設為 GBIF 的DwC 詞彙 填完點選進入下一頁面
- 25. 計畫相關資訊 所屬的計畫名稱 所屬的計畫代碼 or 主題關鍵字 e.g. 生態檢核/ LTSER 所屬的計畫經費提供者（e.g. 國科會） 25 填完點選進入下一頁面
- 26. 調查方法 研究範圍 調查方法描述（可貼上已發表 paper 的 method） 品質控管 詳細步驟描述 26 填完點選進入下一頁面
- 27. 讓其他人引用此資料集的方式 當發布資料集後，系統會自動產生可讓他人引用的 DOI，不需再編輯 此部分為選填 27 點選直接開啟自動產生引用資訊 填完點選進入下一頁面，再 按[Back]回到資料集首頁
- 28. 點選 Public 公開資料集 （若還不想公開，則直接按上方[publish] 上傳只有自己看得到的資料） 點選 Publish 發布目前版本的 資料集至 TaiBIF 沒出現紅色警告表示成功 a b e 恭喜完成！！ 點選 Register 發布到 GBIF 28 公開資料 4 若有更新資料集， 請寫上修改的摘要 c d
- 29. 點選系統提供的 GBIF UUID 可直接連到GBIF 網站檢視 29 確認是否有上傳到GBIF頁面 5 以後更新資料集直接按[Publish]便會自動更新到GBIF上
- 30. 30 進階—如何上傳 extension? 直接再上傳新的extension檔案 (注意：可上傳多個extension，但 core 只能一個) 1 2 此時下拉式選單就會出現 extension 的DwC 對應選項 按照之前的步驟做 DwC mapping 即可～ (記得選對檔案喔！)
- 31. 31 發布資料常見 Q & A
- 32. 32 幾個資料發布的原則 • Extension可以有好幾個，且要跟Core直接關聯。 但Core 只能有一個(就是你在IPT上新增資料集時 所選的資料集類型) • Sampling event 資料集一定要有 occurrence extension • Sampling event 只能當core，不能成為 extension
- 34. 34 我想新增資料，需要重新上傳整個檔案嗎？ 不需要，只需上傳新的資料檔案即可，但 須注意欄位要跟舊的資料一致。 即使整個檔案重新上傳，也盡量不要換掉 超 過 50% 舊 資 料 的 ID(occurrenceID, eventID)，不然GBIF系統會暫停執行此次 更新。
- 36. 36 我已經檢核過資料看起來沒問題， 也在 IPT 成功發布，為什麼在GBIF上 看不到最新的資料筆數？ • 可能性 1: 資料筆數過大，GBIF系統更新需時間，可 過1-2天再確認一次，沒有的話再與TaiBIF聯繫。 • 可能性 2: 若為更新資料集，舊資料ID超過50%被置換， GBIF 系統將暫停執行更新。 • 可能性 3: 若為Sampling event 資料集，可能 occurrenceID 沒有完全對應到eventID
- 37. 37 資料只能選一個授權類型嗎？
- 38. 38 CC-BY 姓名標示 CC-BY-NC 姓名標示-非商業性 1 2 3 資料只能選一個授權類型嗎？ CC0 公眾領域貢獻宣告 不保留權利 資料集 & 每筆 occurrence & 多媒體 授權類型可以是不同的！
- 40. 40 建 議 持 續 更 新 為 一 個 大 的 資 料 集 ， 在 metadata 修改年份範圍，保持資料集是 活的，也能提高能見度。 如果資料用同樣的調查方法，但計畫隨 不同年份有所更改，會建議如何填寫？
- 42. 42 若想將發布過的資料集換一個類型或換 發布單位，新舊資料集要如何轉換？ • 作法 1: 建議將舊資料集的metadata留著（如果 有註冊到GBIF上的話），並於摘要補充新資料集 的連結。 • 作法 2: 若是要更改發布單位，請跟 TaiBIF 聯絡。
- 43. 43 能不能自己安裝IPT?
- 44. 44 不建議自己安裝，要有自己的伺服器＆管理資 料庫的能力，且若要發布資料到GBIF 還需透 過GBIF來設定串連。 TaiBIF 目前是全亞洲唯一一個通過GBIF認證 的資料託管中心(Data hosting center) 能不能自己安裝IPT?
- 45. 課後 QA 討論社群(FB) TaiBIF/GBIF 資料發布問題討論區 只要跟資料發布、管理有關的技術問題，都可以發文討論～