1. Биология за 1 пару
Николай Вяххи
vyahhi@bioinf.spbau.ru
Computer Science клуб
Екатеринбург, 2012
пятница, 5 октября 12 г.

2. Геном Человека
3,000,000,000 букв
13 лет (1990 - 2003)
3,000,000,000 $
пятница, 5 октября 12 г.

3. Геном Человека
3,000,000,000 букв
13 лет (1990 - 2003)
3,000,000,000 $
пятница, 5 октября 12 г.

4. Геном Человека
3,000,000,000 букв
2 недели
5,000 $
пятница, 5 октября 12 г.

5. пятница, 5 октября 12 г.

6. ДНК
пятница, 5 октября 12 г.

7. ДНК
Двойная спираль
Нуклеотиды:
А—Т
С—G
bp = Base Pairs
пятница, 5 октября 12 г.

8. Направление ДНК
пятница, 5 октября 12 г.

9. Направление ДНК
пятница, 5 октября 12 г.

10. Комплементарность
пятница, 5 октября 12 г.

11. Комплементарность
1. CCCAGAACUGAGAUCAAU
2. AGUACCCGUAUUAACGGG
пятница, 5 октября 12 г.

12. ДНК → 2 x ДНК
Репликация
пятница, 5 октября 12 г.

13. РНК
Одна цепочка
Рибонуклеотиды:
А—U
С—G
пятница, 5 октября 12 г.

14. ДНК → РНК
Транскрипция
T→U
пятница, 5 октября 12 г.

15. Белки / Протеины
Аминокислоты (20):
ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY
Функции: структурная,
ферментативная, рецепторная,
гормональная, транспортная,
сократительная, защитная.
пятница, 5 октября 12 г.

16. Структура Белка
Последовательность
α-спираль / β-лист
Трёхмерная структура
Комплекс
пятница, 5 октября 12 г.

17. РНК → Белок
Трансляция
Кодон (3 нуклеотида) → 1 аминокислота
пятница, 5 октября 12 г.

18. РНК → Белок
1. CCCAGAACUGAGAUCAAU
2. AGUACCCGUAUUAACGGG
пятница, 5 октября 12 г.

19. Центральная Догма
пятница, 5 октября 12 г.

20. Гены
пятница, 5 октября 12 г.

21. Омики
пятница, 5 октября 12 г.

22. Геномика
AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGAT
AGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAA
TACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATG
AAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGAC
GCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGG
TAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGT
TTTCTGCGTGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCT
CTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCACCTGGTGGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGCCAGGA
TGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTTTGACGGGACTCGCCGCC
GCCCAGCCGGGGTTCCCGCTGGCGCAATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAATAA
AACATGTCCTGCATGGCATTAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGAT
TTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTATGGCCGGCGTATTAGAAGCGCGCGGTCACAAC
GTTACTGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCG
ATATTGCTGAGTCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGATCACATGGTGCTGAT
GGCAGGTTTCACCGCCGGTAATGAAAAAGGCGAACTGGTGGTGCTTGGACGCAACGGTTCCGAC
TACTCTGCTGCGGTGCTGGCTGCCTGTTTACGCGCCGATTGTTGCGAGATTTGGACGGACGTTG
ACGGGGTCTATACCTGCGACCCGCGTCAGGTGCCCGATGCGAGGTTGTTGAAGTCGATGTCCTA
CCAGGAAGCGATGGAGCTTTCCTACTTCGGCGCTAAAGTTCTTCACCCCCGCACCATTACCCCC
ATCGCCCAGTTCCAGATCCCTTGCCTGATTAAAAATACCGGAAATCCTCAAGCACCAGGTACGC
пятница, 5 октября 12 г.

23. Геномика
пятница, 5 октября 12 г.

24. Геномы
пятница, 5 октября 12 г.

25. Сборка Генома
пятница, 5 октября 12 г.

26. Comparative Genomics
пятница, 5 октября 12 г.

27. Протеомика
пятница, 5 октября 12 г.

28. Протеомика
пятница, 5 октября 12 г.

29. Домашнее задание
http://rosalind.info
• DNA
• RNA
• REVC
• PROT
• HAMM
http://rosalind.info/classes/enroll/
171da3d314a0b07e00883287cd2b6ddeeeba225b/
пятница, 5 октября 12 г.