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 Son polímeros formados por monómeros
llamados aminoácidos.
 Hay 20 aminoácidos en la naturaleza, que se
combinan para formar miles de
proteínas (muchos grupos funcionales:
alcoholes, tioles, carboxiamidas, etc.)
 Son las macromoléculas más versátiles de los
seres vivos.
Cada proteína tiene:
• Una estructura funcional lógica y propia.
• Ciertas características comunes a las demás
proteínas.
Rompiendo los enlaces
peptídicos que ligan los
aminoácidos ingeridos,
éstos pueden ser
absorbidos por el intestino
hasta la sangre y
reconvertidos en tejido.
Existen en la naturaleza aproximadamente unos
300 aminoácidos diferentes, pero solo 20 de ellos
son de importancia al encontrarse en la formación
de las moléculas de proteína de todas las formas
de vida: vegetal, animal o microbiana. Estos son
sintetizados a partir de precursores más sencillos
o absorbidos como nutrientes.
 De los 20 aminoácidos que
componen las proteínas, ocho se
consideran esenciales es decir:
como el cuerpo no puede
sintetizarlos, deben ser tomados
ya listos a través de los alimentos.
Si estos aminoácidos esenciales
no están presentes al mismo
tiempo y en proporciones
específicas, los otros aa, no
pueden utilizarse para construir
las proteínas.
ESTEREOQUÍMICA DE LOS AMINOÁCIDOS
ISÓMEROS “Bioquímica” Stryer, Berg y Tymocz
Ed. Reverté, S.A. 2003
Los aa son estructuras
tetraédricas
La estructura tridimensional es de crucial importancia para la función
b) En perspectiva
Representación:
a) Tridimensional
“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
11
12
aa
NO POLARES
CON N BÁSICO
ALIFÁTICOS
AROMÁTICOS
POLARES SIN CARGA
CON GRUPOS ÁCIDOS
POLARES CON CARGA
CADENAS LATERALES DE LOS AA
ALIFÁTICOS (Gli, Ala, Val, Leu, Ileu, Pro)
AROMÁTICOS (Phe, Tyr, Trp)
GRUPOS OH, S (Ser, Treo, Cys, Met)
BÁSICOS (His, Arg, Lys)
ÁCIDOS Y SUS AMIDAS (Asp, Glu, Apn, Gln)
AA MODIFICADOS
4-hidroxiprolina
d-hidroxilisina
AA NO PROTEICOS
Ac. g-aminobutírico
D-Ala, D-Glu
El más pequeño
Flexibilidad estr.
Hidrofobicidad
(interior de prot.)
Dificulta el plegamiento
AMINOÁCIDOS ALIFÁTICOS
“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS
Hidrófobo
Ligeramente hidrófobos
Interacciones hidrofóbicas
Puentes de Hidrógeno
Actividad Enzimática
Absorben la luz en el UV (280 nm)
“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
AMINOÁCIDOS CON OH O S
Cadenas débilmente polares (algo hidrófilos)
Pueden formar puentes de H con el agua
Dos cys pueden formar un puente o enlace disulfuro
“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
AMINOÁCIDOS BÁSICOS
El menos básico
Cat. Enzimát. (H+)
Carga + a pH fisiológico
Muy polares, en la superficie de proteínas
AMINOÁCIDOS ÁCIDOS Y SUS AMIDAS
Carga - a pH fisiológico Polares, cadena lateral sin carga
Hidrófilos, en la superficie de proteínas
“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
AA NO PROTEICOS
D-Ala, D-Glu
H3N-CH2-CH2-CH2-COO-
+
Ac. g-aminobutírico
( )2
L-Homoserina
L-Ornitina“Bioquímica” Mathews, van Holde y
Ahern. Addison Wesley 2002
AA MODIFICADOS
OH
4-OH prolina
OH
d-hidroxilisina
 Valina (Val)
 Leucina (Leu)
 Treonina (Thr)
 Lisina (Lys)
 Triptófano(Trp)
 Histidina (His)
 Fenilalanina (Phe)
 Isoleucina (Ile)
 Arginina (Arg) (Requerida en niños y tal vez
ancianos)
 Metionina (Met)
 Alanina (Ala)
 Prolina (Pro)
 Glicina (Gly)
 Serina (Ser)
 Cisteína (Cys)
 Asparagina (Asn)
 Glutamina (Gln)
 Tirosina (Tyr)
 Ácido aspártico (Asp)
 Ácido glutámico (Glu)
22
Características Ácido-Base de los Aminoácidos
Los grupos α-COOH y α-NH2 de los aminoácidos son
capaces de ionizarse (al igual que los grupos-R ácidos y
básicos de los aminoácidos). Como resultado de su capacidad
de ionización las siguientes reacciones de equilibrio iónico
pueden ser escritas:
pK1
R-COOH <——> R-COO– + H+
Ácido
pK2
R-NH3
+ <——> R-NH2 + H+
Básico
 Las reacciones de equilibrio, según lo escrito
arriba, demuestran que los aminoácidos contienen
por lo menos dos grupos ácidos débiles. Sin
embargo, el grupo carboxilo es un ácido más
fuerte que el grupo amino.
 A pH fisiológico (alrededor 7.4) el grupo
carboxilo no estará protonado y el grupo amino
protonado. Un aminoácido con un grupo-R no
ionizable sería eléctricamente neutro a este pH.
Esta especie se llama un zwitterion.
 Como los ácidos orgánicos típicos, la fuerza ácida de los grupos
carboxilos, amino y grupos-R ionizables en los aminoácidos se
pueden definir por la constante de disociación, Ka o más comúnmente
el logaritmo negativo de Ka, la pKa.
 La carga neta (la suma algebraica de todos los grupos con carga
presentes) de cualquier aminoácido, péptido o proteína, dependerá
del pH del ambiente acuoso circundante.
 Cuando el pH de una solución de aminoácido o proteínas cambia la
carga neta de los aminoácidos también cambiará. Este fenómeno se
puede observar durante la titulación de cualquier aminoácido o
proteína. Cuando la carga neta de un aminoácido o de una proteína es
cero el pH será equivalente al punto isoeléctrico:pi.
 A pH ácido: prevalece la especie con carga +
 A pH básico: prevalece la especie con carga –
 Hay un valor de pH para el cuál la carga de la
especie es cero. (zwitterión)
pI = pK1 + pK2 para un aa neutro
2
 Punto isoeléctrico: valor de pH al cuál la carga
neta del aminoácido es cero.
27
 Polímeros de
aminoácidos de PM
menor a 6000
daltons ( <50 aa)
 Dipéptido: 2 aa
 Tripéptido: 3 aa
 Tetrapéptido: 4 aa
 Pentapéptido: 5 aa
Extremo N-terminal: comienzo de la cadena
Extremo C-terminal: fin de la cadena
 Se nombran desde el extremo N-terminal al
C-terminal, usando la terminación il, excepto
para el último aa.
 Ej: ser-asp-tyr-lis-ala-cys
seril-aspartil-tirosil-lisil-alanil-cysteína
 EJEMPLOS:
◦ OCITOCINA: hormona que estimula la contracción
del útero.
◦ GLUCAGÓN: hormona que tiene acciones contrarias
a la Insulina.
◦ ANTIBIÓTICOS
◦ GLUTATIÓN: glu-cys-gli, participa en reacciones
Redox de la célula.
 DEFINICIÓN
Biopolímeros de aminoácidos de mas de 6000
daltons, indispensables para la procesos vitales
de los seres vivos.
Están formadas por C, H, O, N y S.
Por su naturaleza química
SIMPLES
CONJUGADAS
CLASIFICACIÓN DE LAS
PROTEINAS
Por la forma que adopta
FIBROSA
GLOBULAR
Por su función Biológica
ENZIMAS
PROTEÍNAS DE
TRANSPORTE
CONTRÁCTILES Y
MÓTILES
DE DEFENSA
REGULADORAS
NUTRIENTES
HORMONAS
 PROPIEDADES ÁCIDOS-BASE: punto
isoeléctrico.
 SOLUBILIDAD:
◦ Forman dispersiones en agua
◦ Efecto del pH: hace variar la carga.
◦ Efecto de las sales:
 Baja [ ]: aumenta la solubilidad
 Alta [ ]: disminuye la solubilidad
◦ Efecto de solventes poco polares: disminuye la
solubilidad.
 Las proteínas tienen 4 niveles de
organización:
 ESTRUCTURA PRIMARIA
 ESTRUCTURA SECUNDARIA
 ESTRUCTURA TERCIARIA
 ESTRUCTURA CUATERNARIA
•Hace referencia a:
•La identidad de aminoácidos.
•La secuencia de aminoácidos.
•La cantidad de aminoácidos.
•La variación en un solo aa hace que cambie su función
biológica.
•Los aa se unen por UNIONES PEPTÍDICAS.
 Interacciónes entre aa que se encuentran
próximos en la cadena.
 La cadena no es lineal, adopta formas en el
espacio.
 Los aa interaccionan por puentes H.
 Tipos de estructuras secundarias:
 HÉLICE ALFA
 HOJA PLEGADA BETA
 AL AZAR.
 Los grupos R de los
aa se orientan hacia
el exterior.
 Se forman puentes
de H entre el C=O de
un aa y el NH- de
otro que se
encuentra a 4
lugares.
 Hay 3.6 aa por
vuelta.
 Ej: queratina.
 Los grupos R se
orientan hacia arriba
y abajo
alternativamente.
 Se establecen
puentes H entre C=O
y NH- de aa que se
encuentran en
segmentos diferentes
de la cadena.
 Ej. Fibroína (seda)
 Una cadena con
estructura secundaria
adquiere una
determinada dispoción
en el espacio por
interacciones entre aa
que se encuentran en
sitios alejados de la
cadena.
 Proteínas globulares: se
pliegan como un ovillo.
 Proteínas fibrosas: tiene
aspecto alargado.
 Ej: mioglobina
 Surge de la
asociación de varias
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estructuras
terciarias.
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en la estructura
terciaria.

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Bioquimica de las proteinas

  • 1.
  • 2.  Son polímeros formados por monómeros llamados aminoácidos.  Hay 20 aminoácidos en la naturaleza, que se combinan para formar miles de proteínas (muchos grupos funcionales: alcoholes, tioles, carboxiamidas, etc.)  Son las macromoléculas más versátiles de los seres vivos.
  • 3.
  • 4. Cada proteína tiene: • Una estructura funcional lógica y propia. • Ciertas características comunes a las demás proteínas.
  • 5. Rompiendo los enlaces peptídicos que ligan los aminoácidos ingeridos, éstos pueden ser absorbidos por el intestino hasta la sangre y reconvertidos en tejido.
  • 6. Existen en la naturaleza aproximadamente unos 300 aminoácidos diferentes, pero solo 20 de ellos son de importancia al encontrarse en la formación de las moléculas de proteína de todas las formas de vida: vegetal, animal o microbiana. Estos son sintetizados a partir de precursores más sencillos o absorbidos como nutrientes.
  • 7.  De los 20 aminoácidos que componen las proteínas, ocho se consideran esenciales es decir: como el cuerpo no puede sintetizarlos, deben ser tomados ya listos a través de los alimentos. Si estos aminoácidos esenciales no están presentes al mismo tiempo y en proporciones específicas, los otros aa, no pueden utilizarse para construir las proteínas.
  • 8.
  • 9. ESTEREOQUÍMICA DE LOS AMINOÁCIDOS ISÓMEROS “Bioquímica” Stryer, Berg y Tymocz Ed. Reverté, S.A. 2003 Los aa son estructuras tetraédricas
  • 10. La estructura tridimensional es de crucial importancia para la función b) En perspectiva Representación: a) Tridimensional “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
  • 11. 11
  • 12. 12 aa NO POLARES CON N BÁSICO ALIFÁTICOS AROMÁTICOS POLARES SIN CARGA CON GRUPOS ÁCIDOS POLARES CON CARGA
  • 13. CADENAS LATERALES DE LOS AA ALIFÁTICOS (Gli, Ala, Val, Leu, Ileu, Pro) AROMÁTICOS (Phe, Tyr, Trp) GRUPOS OH, S (Ser, Treo, Cys, Met) BÁSICOS (His, Arg, Lys) ÁCIDOS Y SUS AMIDAS (Asp, Glu, Apn, Gln) AA MODIFICADOS 4-hidroxiprolina d-hidroxilisina AA NO PROTEICOS Ac. g-aminobutírico D-Ala, D-Glu
  • 14. El más pequeño Flexibilidad estr. Hidrofobicidad (interior de prot.) Dificulta el plegamiento AMINOÁCIDOS ALIFÁTICOS “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
  • 15. AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS Hidrófobo Ligeramente hidrófobos Interacciones hidrofóbicas Puentes de Hidrógeno Actividad Enzimática Absorben la luz en el UV (280 nm) “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
  • 16. AMINOÁCIDOS CON OH O S Cadenas débilmente polares (algo hidrófilos) Pueden formar puentes de H con el agua Dos cys pueden formar un puente o enlace disulfuro “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
  • 17. AMINOÁCIDOS BÁSICOS El menos básico Cat. Enzimát. (H+) Carga + a pH fisiológico Muy polares, en la superficie de proteínas
  • 18. AMINOÁCIDOS ÁCIDOS Y SUS AMIDAS Carga - a pH fisiológico Polares, cadena lateral sin carga Hidrófilos, en la superficie de proteínas “Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern Addison Wesley 2002
  • 19. AA NO PROTEICOS D-Ala, D-Glu H3N-CH2-CH2-CH2-COO- + Ac. g-aminobutírico ( )2 L-Homoserina L-Ornitina“Bioquímica” Mathews, van Holde y Ahern. Addison Wesley 2002 AA MODIFICADOS OH 4-OH prolina OH d-hidroxilisina
  • 20.  Valina (Val)  Leucina (Leu)  Treonina (Thr)  Lisina (Lys)  Triptófano(Trp)  Histidina (His)  Fenilalanina (Phe)  Isoleucina (Ile)  Arginina (Arg) (Requerida en niños y tal vez ancianos)  Metionina (Met)
  • 21.  Alanina (Ala)  Prolina (Pro)  Glicina (Gly)  Serina (Ser)  Cisteína (Cys)  Asparagina (Asn)  Glutamina (Gln)  Tirosina (Tyr)  Ácido aspártico (Asp)  Ácido glutámico (Glu)
  • 22. 22
  • 23. Características Ácido-Base de los Aminoácidos Los grupos α-COOH y α-NH2 de los aminoácidos son capaces de ionizarse (al igual que los grupos-R ácidos y básicos de los aminoácidos). Como resultado de su capacidad de ionización las siguientes reacciones de equilibrio iónico pueden ser escritas: pK1 R-COOH <——> R-COO– + H+ Ácido pK2 R-NH3 + <——> R-NH2 + H+ Básico
  • 24.  Las reacciones de equilibrio, según lo escrito arriba, demuestran que los aminoácidos contienen por lo menos dos grupos ácidos débiles. Sin embargo, el grupo carboxilo es un ácido más fuerte que el grupo amino.  A pH fisiológico (alrededor 7.4) el grupo carboxilo no estará protonado y el grupo amino protonado. Un aminoácido con un grupo-R no ionizable sería eléctricamente neutro a este pH. Esta especie se llama un zwitterion.
  • 25.
  • 26.  Como los ácidos orgánicos típicos, la fuerza ácida de los grupos carboxilos, amino y grupos-R ionizables en los aminoácidos se pueden definir por la constante de disociación, Ka o más comúnmente el logaritmo negativo de Ka, la pKa.  La carga neta (la suma algebraica de todos los grupos con carga presentes) de cualquier aminoácido, péptido o proteína, dependerá del pH del ambiente acuoso circundante.  Cuando el pH de una solución de aminoácido o proteínas cambia la carga neta de los aminoácidos también cambiará. Este fenómeno se puede observar durante la titulación de cualquier aminoácido o proteína. Cuando la carga neta de un aminoácido o de una proteína es cero el pH será equivalente al punto isoeléctrico:pi.
  • 27.  A pH ácido: prevalece la especie con carga +  A pH básico: prevalece la especie con carga –  Hay un valor de pH para el cuál la carga de la especie es cero. (zwitterión) pI = pK1 + pK2 para un aa neutro 2  Punto isoeléctrico: valor de pH al cuál la carga neta del aminoácido es cero. 27
  • 28.
  • 29.  Polímeros de aminoácidos de PM menor a 6000 daltons ( <50 aa)  Dipéptido: 2 aa  Tripéptido: 3 aa  Tetrapéptido: 4 aa  Pentapéptido: 5 aa Extremo N-terminal: comienzo de la cadena Extremo C-terminal: fin de la cadena
  • 30.  Se nombran desde el extremo N-terminal al C-terminal, usando la terminación il, excepto para el último aa.  Ej: ser-asp-tyr-lis-ala-cys seril-aspartil-tirosil-lisil-alanil-cysteína
  • 31.  EJEMPLOS: ◦ OCITOCINA: hormona que estimula la contracción del útero. ◦ GLUCAGÓN: hormona que tiene acciones contrarias a la Insulina. ◦ ANTIBIÓTICOS ◦ GLUTATIÓN: glu-cys-gli, participa en reacciones Redox de la célula.
  • 32.
  • 33.  DEFINICIÓN Biopolímeros de aminoácidos de mas de 6000 daltons, indispensables para la procesos vitales de los seres vivos. Están formadas por C, H, O, N y S.
  • 34. Por su naturaleza química SIMPLES CONJUGADAS CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEINAS Por la forma que adopta FIBROSA GLOBULAR Por su función Biológica ENZIMAS PROTEÍNAS DE TRANSPORTE CONTRÁCTILES Y MÓTILES DE DEFENSA REGULADORAS NUTRIENTES HORMONAS
  • 35.  PROPIEDADES ÁCIDOS-BASE: punto isoeléctrico.  SOLUBILIDAD: ◦ Forman dispersiones en agua ◦ Efecto del pH: hace variar la carga. ◦ Efecto de las sales:  Baja [ ]: aumenta la solubilidad  Alta [ ]: disminuye la solubilidad ◦ Efecto de solventes poco polares: disminuye la solubilidad.
  • 36.
  • 37.  Las proteínas tienen 4 niveles de organización:  ESTRUCTURA PRIMARIA  ESTRUCTURA SECUNDARIA  ESTRUCTURA TERCIARIA  ESTRUCTURA CUATERNARIA
  • 38. •Hace referencia a: •La identidad de aminoácidos. •La secuencia de aminoácidos. •La cantidad de aminoácidos. •La variación en un solo aa hace que cambie su función biológica. •Los aa se unen por UNIONES PEPTÍDICAS.
  • 39.  Interacciónes entre aa que se encuentran próximos en la cadena.  La cadena no es lineal, adopta formas en el espacio.  Los aa interaccionan por puentes H.  Tipos de estructuras secundarias:  HÉLICE ALFA  HOJA PLEGADA BETA  AL AZAR.
  • 40.  Los grupos R de los aa se orientan hacia el exterior.  Se forman puentes de H entre el C=O de un aa y el NH- de otro que se encuentra a 4 lugares.  Hay 3.6 aa por vuelta.  Ej: queratina.
  • 41.  Los grupos R se orientan hacia arriba y abajo alternativamente.  Se establecen puentes H entre C=O y NH- de aa que se encuentran en segmentos diferentes de la cadena.  Ej. Fibroína (seda)
  • 42.  Una cadena con estructura secundaria adquiere una determinada dispoción en el espacio por interacciones entre aa que se encuentran en sitios alejados de la cadena.  Proteínas globulares: se pliegan como un ovillo.  Proteínas fibrosas: tiene aspecto alargado.  Ej: mioglobina
  • 43.
  • 44.  Surge de la asociación de varias cadenas con estructuras terciarias.  Intervienen las mismas interacciones que en la estructura terciaria.