Enzim dikelompokkan berdasarkan reaksi kimia yang dikatalisisnya, tanpa mempertimbangkan mekanisme atau kofaktor. Terdapat 6 kelas enzim yaitu oksidoreduktase, transferase, hidrolase, liase, isomerase dan ligase. Nama enzim menggambarkan substrat dan produk reaksi secara sistematis.
2. Biasanya diberi akhiran –ase pada nama
substrat atau reaksi yang dikatalisis
Contoh:
Alkohol dehidrogenase: oksidasi alkohol
Urease: hidrolisis urea
DNA polimerase: polimerisasi nukleotida
Protease: hidrolisis peptida
Metiltransferase: transfer gugus metil
3. Prinsip Penamaan
Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi
yang dikatalisisnya.
Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang
disebabkan oleh enzim.
Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus
prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.
4. Enzim mempunyai nama sistematis dan nama trivial.
Nama trivial: lebih pendek, mudah dan sering
digunakan
5. Tata Nama
• Menurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi
atas enam kelas tergantung pada reaksi yang
dikatalisis.
• E.C.a.b.c.d
– a. Kelas enzim
– b. subkelas enzim
– c. Sub-sub kelas enzim
– d.Sub-sub-sub kelas enzim
• Pengelompokan tidak berdasarkan urutan asam
amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak
berdasarkan mekanisme reaksi
6. KELAS ENZIM BERDASARKAN REAKSI KIMIA
Kelas Tipe katalisis reaksi kimia contoh
Oksidoreduktase ReduksiOksidasi, melepas/mendapat
O2 dan Hidrogen
Cytochrome
oksidase, laktate
dehydrogenase
Transferase Transfer grup, seperti grup amino, grup
acetyl, grup phosphat
Acetate kinase,
alanin deaminase
Hydrolase Hidrolisis (penambahan air) Lipase, sukrase
Lyase pemindahan grup atom tanpa hidrolisis Oksalat
decarboxylase,
isocitrat lyase
Isomerase Penataan atom menjadi molekul Glikose-phosphate
isomerase
ligase Menyatukan dua molekul (mengambil
energi, dari turunan ATP)
DNA ligase
7. b. Sub Kelas Enzim
• Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron
1. Alkohol
2. Aldehid atau keton
3. CH-CH
4. Amin primer
5. Amin sekunder
6. NADH atau NADPH
c. Sub-Sub Kelas enzim
• Digit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron
1. NAD+
atau NADP+
2. Fe 3+
3. O2
99. Akseptor lain
8. OksidoreduktaseNama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase
EC. 1.1.1
Nama Sistematik: Alkohol:NAD+
oksidoreduktase
Nama Trivial: Alkohol dehidrogenase
(Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase,
untuk transfer H ke akseptor selain O2)
9. Transferase
Mengkatalisis reaksi pemindahan berbagai gugus
fungsi seperti amino, karboksil, karbonil, metil, asil,
glikosil, atau fosforil
A – X + B A + B – X
Nama trivial yang umum seperti aminotransferase
(transaminase), transkarboksilase
10. Hidrolase
Mengkatalisis pemutusan ikatan secara hidrolitik
pada C-C, C-N, C-O dan ikatan lainnya
Nama-nama trivial seperti esterase, peptidase,
amilase, fosfatase, urease, pepsin, tripsin, kimotripsin
11. Liase• Mengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S.
• Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase.
• Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase,
dehidratase (eliminasi CO2, aldehid, dan air).
13. Ligase
Mengkatalisis pengikatan (penggabungan) dua molekul,
disertai dengan hidrolisis senyawa yang mempunyai ΔG
besar untuk hidrolisis
Energi yang diperlukan untuk pembentukan ikatan
tersebut sering berasal dari hidrolisis ATP
Nama trivial : tiokinase dan karboksilase