Gens no mesmo cromossomo tendem a permanecer juntos entre gerações, separando-se apenas pelo processo de permuta. A porcentagem de recombinação entre genes em locos diferentes no mesmo par de homólogos indica a taxa de permuta. Nos cruzamentos, as menores porcentagens indicam permuta e as maiores indicam não permuta, com a soma das taxas de recombinantes indicando a taxa total de permuta.