O documento compara a detecção do genoma do HPV em pacientes com câncer de laringe usando PCR convencional e em tempo real. A PCR em tempo real detectou o genoma do HPV em 46,7% das amostras, enquanto a PCR convencional detectou em 30%, mostrando que a PCR em tempo real é mais sensível na detecção do HPV. O estudo contribui para o entendimento do papel do HPV na carcinogênese de tumores de laringe.

1. Detecção do genoma de HPV em pacientes com carci-
noma espino-celular da laringe: Comparação entre os
ensaios de PCR convencional e em tempo real
Detection of HPV genome in patients with squamous cell carcinoma of the larynx: Comparison
between conventional and real time PCR assays
Cunha DMC1; Silva AMTC2; Curado MP3; da Silva CC4 & da Cruz AD5
RESUMO - A interação do genoma do HPV com o genoma da célula hospedeira ou de proteínas virais com proteínas celulares neces-
sárias ao controle do ciclo celular desencadeia a morte celular ou age como fator de iniciação e progressão de processos malignos. Di-
versos trabalhos têm sido desenvolvidos no sentido de associar a infecção de HPV aos cânceres de cabeça e pescoço. O objetivo do
presente estudo foi comparar a detecção do genoma de HPV em pacientes com CEC da laringe, considerando os ensaios de PCR con-
vencional e em tempo real. O grupo amostral foi constituído de 15 pacientes do Registro de Câncer de Base Populacional da ACCG.
Das peças cirúrgicas, foi obtido DNA total, usado na investigação molecular, para detecção do genoma de HPV, utilizando os primers
genéricos GP05/06, que detectam todos os tipos de HPV. O genoma de HPV foi amplificado em 30% dos casos por PCR convencional
e no ensaio de PCR em tempo real apresentaram amplificação em 46,7% das amostras, evidenciando uma diferença em 40%. Os es-
tudos de associação entre o HPV e os cânceres da laringe são importantes no sentido de ampliar o conhecimento acerca dos mecanis-
mos de infecção, iniciação e promoção tumoral potencializada por estes vírus.
PALAVRAS-CHAVE - HPV, PCR e PCR em tempo real
SUMMARY - The random integration of HPV DNA into the cell genome causes the interaction of viral proteins with cell cycling pro-
teins, which will eventually lead to apoptosis or to initiation or progressions of carcinomas. Several studies have been designed to in-
vestigate the potential association of HPV infection and tumorigenesis of the head and neck. The objective of the current study was
to compare the sensitivity of detection of HPV DNA using total DNA of SCC of the larynx trough classical and real-time PCR essays.
The study group was comprised of 15 patients who agreed to voluntarily participate in this study. Total DNA was extracted from tu-
mor tissue samples and PCR was carried out using GP05/06 primer set. HPV genome detection was observed in 30% (5/15) and 46.7%
(7/15) of samples amplified with classical and real-time PCR, respectively. The results of this study indicated that real-time PCR is 40%
more sensitive to detect HPV genome in total human DNA than classical PCR essay. Thus, real-time PCR strategy is a powerful tool
to detect HPV genome integrated into host cells and, consequently, could be use to further our knowledge regarding the role of HPV
infection on laryngeal carcinomas.
KEYWORDS - HPV, PCR and Real Time PCR
INTRODUÇÃO mem, pênis, uretra, saco escrotal e região anal (Almadori et
al., 2002). Além da região geniturinária, o HPV também
pode ser encontrado nas células epiteliais das vias aéreas
O s HPVs são pertencentes à família Papillomaviridae,
gênero Papilomavírus (Santos et al., 2002). São vírus
não-envelopados, simétricos, apresentando 72 capsômeros
superiores e o seu papel na oncogênese dos tumores da ca-
beça e pescoço tem sido freqüentemente investigado
e um genoma de DNA de fita dupla circular, medindo (Einstein & Goldberg, 2002). Neste sentido, diversos auto-
aproximadamente 8000pb (Souto et al., 2005). A infecção res evidenciam uma correlação positiva do parasitismo
viral promove modificações bioquímicas e moleculares em provocado pelo HPV com tumores benignos como papilo-
seus hospedeiros, necessárias para o desenvolvimento e mas, verrugas comuns e condilomas (Garcia-Garrancá &
reprodução viral, alterando significativamente a população Garriglio, 1993) e malignos, sobretudo nas células da re-
dos hospedeiros ou a população de células por eles parasi- gião cervical (Bibbo & Filho, 1998). Lin e colaboradores
tadas, através da interação do genoma viral com o genoma (1998) realizaram estudos de tipagem de HPVs associando
da célula hospedeira ou de proteínas virais com proteínas alguns tipos virais com cânceres de cabeça e pescoço.
celulares necessárias ao controle do ciclo celular, como as A carcinogênese é um processo de múltiplas etapas que en-
proteínas supressoras de tumor pRb e p53, desencadeando volvem mudanças genéticas e epigenéticas, culminando na
a morte celular ou agindo como um fator de iniciação e ativação de proto-oncogeneses e/ou inativação dos genes
progressão de processos malignos (Silva et al., 2003). supressores de tumor, que modifica o fenótipo celular. Uma
Alguns tipos de papilomavírus humano (HPV), nos últimos célula maligna se difere de uma célula normal principal-
anos, têm sido responsabilizados pelo desenvolvimento de mente pela sua independência no controle do ciclo celular.
malignidade nas regiões que comumente infectam, com- O HPV pode transformar e imortalizar as células hospedei-
preendendo, na mulher, o períneo, vulva, vagina, colo do ras, iniciando assim um processo maligno. Os produtos dos
útero e região anal (Einstein & Goldberg, 2002) e, no ho- genes E6 e E7 são importantes para a transformação e
Recebido em 28/08/2006
Aprovado em 21/09/2007
1
Pós-Graduanda do Programa de Pós-Graduação Lato Senso em Genética / Núcleo de Pesquisas Replicon / Universidade Católica de Goiás / Goiânia – GO;
2
Biomédico Geneticista, Pesquisador do Núcleo de Pesquisas Replicon / Professor de Biologia Molecular do Departamento de Biologia / Universidade Católica de
Goiás / Goiânia – GO; 3Médica do Hospital Araújo Jorge / Registro de Câncer de Base Populacional / Associação de Combate ao Câncer em Goiás / SuLeide –
Superintendência Leide das Neves Ferreira / Secretaria de Estado da Saúde Goiânia – GO; 4Biomédico Geneticista do LaGene - Laboratório de Citogenética e
Genética Humana / SuLeide – Superintendência Leide das Neves Ferreira / Secretaria de Estado da Saúde, Professor de Genética do Departamento de Biologia e
Pesquisador do Núcleo de Pesquisas Replicon / Universidade Católica de Goiás / Goiânia – GO; 5Biomédico Geneticista do LaGene - Laboratório de Citogenética e
Genética Humana / SuLeide – Superintendência Leide das Neves Ferreira / Secretaria de Estado da Saúde, Professor de Biologia Molecular do Departamento de
Biologia, Pesquisador do Núcleo de Pesquisas Replicon / Universidade Católica de Goiás e Pesquisador do Hospital Araújo Jorge / Registro de Câncer de Base
Populacional / Associação de Combate ao Câncer em Goiás / Goiânia – GO
RBAC, vol. 39(4): 255-257, 2007 255

2. imortalização celular. A proteína E6 tem uma grande afini- MATERIAL E MÉTODOS
dade pelo DNA e é encontrada tanto no núcleo como na
membrana plasmática. A proteína E7 é uma fosfoproteína GRUPO AMOSTRAL
encontrada no citoplasma e, provavelmente, no núcleo O grupo amostral foi constituído de 15 pacientes recém di-
(Garcia-Carrancá & Gariglio, 1993). Os produtos dos genes agnosticados com carcinoma da laringe. Os casos foram
supressores de tumores presentes nas células como as pro- obtidos do Registro de Câncer de Base Populacional de
teínas pRb e p53 são alvo da ação dos produtos dos genes Goiânia/GO da Associação de Combate ao Câncer em Goi-
dos virais. Em geral, a atividade da proteína pRb é inibida
ás. Todos os pacientes considerados foram diagnosticados
pela proteína viral E7, enquanto que, a proteína p53 é de-
como carcinomas da laringe (CID-O: C32). A participação
gradada subseqüentemente à ligação com a proteína E6. A
perda das funções de ambas as proteínas celulares respon- foi de caráter voluntário e no ato da coleta da amostra, os
sáveis pela supressão tumoral contribui para a progressão pacientes foram submetidos a uma entrevista e preenche-
de tumores (Vousden, 1993). ram um questionário sobre hábitos de vida para determinar
O gene RB1 é um supressor de tumor (GST) localizado no possíveis associações entre hábitos e os carcinomas larín-
braço longo do cromossomo 13 (13q14), que tem como pro- geos. As amostras biológicas dos tumores foram separadas
duto a proteína celular pRb, de aproximadamente 105 kDa. na ocasião de realização de biópsias e/ou cirurgias. Após a
A proteína pRb tem a função de inibir a progressão do ci- retirada cirúrgica, as biópsias foram transportadas em câ-
clo celular, pois é capaz de seqüestrar o fator de transcrição mara fria, com temperatura média de 10oC, armazenadas
E2F e impedi-lo de promover a transcrição de genes neces- sem conservantes e fixadores em criotubos e acondiciona-
sários para a replicação do DNA na fase S. A associação da das a – 20oC até o momento do uso.
proteína pRb com a proteína viral E7 causará uma pertur-
bação no controle normal do ciclo celular, resultando em EXTRAÇÃO E PURIFICAÇÃO DO DNA
um estímulo positivo para a proliferação das células infec- Para a extração de DNA, 10-20mg de cada biópsia foram
tadas (Sandal, 2002).
maceradas previamente em nitrogênio líquido. Posterior-
O gene p53 é também considerado como GST, está locali-
mente, o tecido macerado foi submetido à extração do
zado no braço curto do cromossomo 17 (17p13), cujo pro-
duto é a proteína p53. Esse gene apresenta 11 éxons, entre DNA com o kit de purificação do DNA genômico Wizard®
os quais o primeiro deles não é codificante. A proteína p53 (Promega Corporation, EUA), seguindo-se as instruções do
é constituída de 393 aminoácidos na sua extensão, apre- fabricante.
sentando quatro regiões com funções distintas, chamadas
domínios da proteína. Uma vez ativada a proteína p53 é ca- PCR CONVENCIONAL
paz de reprimir a progressão celular e sinaliza para a apop- Todas as amostras foram submetidas a uma primeira PCR
tose. A proteína p53 uma vez ativada por fosforilação ou com os primers genéricos GP05/06 para detecção do geno-
acetilação da extremidade C-terminal passa a se ligar de ma de qualquer HPV. Em seguida, fez-se uma segunda PCR
maneira específica ao DNA, agindo como um fator de com os mesmos primers, utilizando o produto da PCR ante-
transcrição através da ligação em seqüências específicas, rior. Assim, as amostras só foram consideradas negativas
promovendo a transativação downstream de genes alvos. para o HPV após serem submetidas a duas PCRs, com pos-
Para desempenhar tal função as proteínas p53 se associam terior repetição das reações para confirmação do resultado.
entre si formando tetrâmeros, que são complexos protéicos Um conjunto de primers, que amplifica a região D8S135 de
resultantes da associação de quatro monômeros. Após o
8p11, foi utilizado como controle interno da reação. A se-
evento de tetramerização a proteína passa a ser capaz de
qüência de todos os primers e o tamanho esperado dos frag-
impedir a proliferação celular ou induzir a morte da célula
por apoptose. Nesse sentido, a proteína p53 é responsável mentos amplificados encontram-se na Tabela 1.
por monitorar danos ocorridos nas moléculas de DNA. Des-
ta forma, o ciclo celular é impedido de prosseguir até que O protocolo de termociclagem para a amplificação do ge-
o dano no DNA seja restaurado. noma de HPV está descrito na Tabela 2.
A proteína E6 do papiloma vírus humano de alto risco on-
cogênico se associa a proteína p53, que é responsável pela ANÁLISE DOS FRAGMENTOS DE PCR
regulação da passagem da fase G1 para S e da fase G2 pa- Para a análise dos produtos de PCR, o DNA foi submetido
ra M, no ciclo celular. A proteína E6 recruta a proteína ce- à eletroforese em campo elétrico constante de 8V/cm em
lular E6AP, que funciona como uma ubiquitina-ligase para gel de poliacrilamida 6% em TBE 1x. Para a visualização
o complexo tetramérico contendo p53. Este recrutamento do DNA amplificado, o gel foi corado em banho de solução
resulta na ubiquitinação de p53 seguido de sua rápida de- de brometo de etídio (5μg/mL) e as imagens foram captu-
gradação (Stubenrauch & Laimins, 1999). Sem a proteína radas e reveladas pelo sistema de vídeo documentação
p53 a célula perde a capacidade de perceber e reparar pos- ImageMasterVDS® (Amersham Pharmacia Biotech, EUA).
síveis danos no DNA, assim, a divisão celular passa a ocor-
rer sem reparo. Conseqüentemente, aumenta-se a fre-
PCR EM TEMPO REAL
qüência das mutações, dos rearranjos cromossômicos, das
aneuploidias. O acúmulo de eventos mutacionais é a causa As reações de PCR em tempo real foram realizadas no apa-
subjacente ao desenvolvimento de um fenótipo neoplásico relho Rotor-Gene® (Corbertt Research, Austrália) que mos-
e, assim, provavelmente, resultam no câncer (Vogel & Mo- trou resultados similares quando repetidos. Para cada teste,
tulsky, 2000; Griffiths et al.,1998; Vousden, 1993). foram utilizados 0,5uL de DNA, 12,5uL SYBR Green PCR
O objetivo deste estudo foi comparar a eficiência da detecção Master Mix® (Invitrogen,USA), 1,0uL de cada um dos pri-
do genoma de HPV pela reação em cadeia da polimerase mers conforme indicado na Tabela 1 e 10,0uL de água para
(PCR) convencional com a PCR em tempo real, em biopsia de completar o volume final de 25,0uL. As condições de ampli-
laringe de pacientes com carcinoma espino-celular (CEC). ficação foram as mesmas conforme indicadas na Tabela 3.
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3. TABELA I RESULTADOS
Seqüências consenso dos primers utilizados e o tamanho
esperado do fragmento amplificado. Foram observadas a amplificação de DNA humano
(D8S135) em todas as reações. Na PCR convencional, os
Tipos S* Se qüê nc ias 5 ’‡ 3’ Fragm ent o (pb) primers GP05/GP06 foram amplificados em 30% dos casos
F GG G A G G C TT TA T AA T TA T TTA GC
(5/15), evidenciando a presença do genoma de HPV nas
D8S 135
R CTG GGC A AC AG A GT G G GA C
100 células de CEC da laringe. Quando estes mesmos primers
foram utilizados no ensaio de PCR em tempo real, apresen-
GP05 F TT T G TT AC T G TG GT A G AT ACT AC
170 taram amplificação em 46,7% (7/15) das amostras, eviden-
GP06 R GAA AA A TAA AC T G TA AA T CA T A TT C
ciando uma diferença em 40% dos casos. A Tabela 4 apre-
*S: Sentido – F: Forward (Direto) e R: Reverse (Reverso). senta os resultados observados neste estudo.
TABELA II DISCUSSÃO
Protocolo da termociclagem para o ensaio de PCR con-
vencional para a amplificação do genoma de HPV a partir Estudos recentes demonstram que a utilização da reação
de DNA total extraído das células de CEC da laringe. em cadeia da polimerase em tempo real com primers con-
senso é mais eficiente para identificar o genoma de HPV
Passos Temperatura (oC) Te mpo (m in) quando comparada com o ensaio de PCR convencional. O
Desnaturação inicial 95 5
ensaio PCR em tempo real tem sido muito utilizado em ava-
liação retrospectiva, na tentativa de detectar a presença de
Desnaturação 95 1
Ciclos (10)
genomas virais. Adicionalmente, PCR em tempo real é uma
Anelamento 57 1 ferramenta muito útil na quantificação da carga viral e da
Extensão 72 1 genotipagem de HPV, assim como de outros tipos virais.
O aumento na freqüência de detecção da presença do ge-
Ciclos (30)
Desnaturação 95 1
noma viral nas amostras de pacientes com CEC na laringe
Anelamento 50 1
por PCR em tempo real sugere que devemos ter uma
Extensão 72 1 atenção especial nos resultados obtidos pelo método con-
Extensão final 72 5 vencional. Durante anos o ensaio utilizando PCR convenci-
Conservação 4 ∞
onal vem sendo largamente utilizado nos laboratórios para
diagnóstico em diversas rotinas laboratoriais. Apesar de
TABELA III ser confiável, os ensaios que utilizam PCR convencional
Protocolo da termociclagem para o ensaio de PCR em podem não ser completamente satisfatórios. Por outro lado,
tempo real para a amplificação do genoma de HPV a par- os testes utilizando novas metodologias devem ser inseri-
dos na rotina laboratorial de maneira consciente e funda-
tir de DNA total extraído das células de CEC da laringe. mentados. È necessário aumentar investimentos em infra-
estrutura e na aquisição de novos equipamentos, treina-
Passos Temperatura (oC) Tempo (min)
mento pessoal e compreensão pelos clínicos da utilização
Desnaturação inicial 95 10 de novas metodologias.
Desnaturação 94 1
Ciclos (40)
AGRADECIMENTOS
Anelamento 40 1
Extensão 72 1 Nossos agradecimentos aos membros do Hospital Araújo
Conservação 4 ∞ Jorge/ Registro de Câncer de Base Populacional/ Asso-
ciação de Combate ao Câncer de Goiás, do
TABELA IV do LaGene/SES e do NPR/UCG pelo extenso apoio para
Resultados da amplificação das amostras de DNA extraí- com todos os pesquisadores associados.
do de pacientes com CEC da laringe.
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085 -743 + + + ENDEREÇO PARA CORRESPONDÊNCIA:
Núcleo de Pesquisas Replicon
085 -200 + Departamento de Biologia
085 -200 + Universidade Católica de Goiás
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