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LAS RIBOZIMAS
Las ribozimas son ARN con actividad catalítica. El término "ribozima" es una contracción de las
palabras "ácido ribonucleico" y "enzima". Los sustratos de las ribozimas son con frecuencia ARN. La
actividad de las ribozimas combina transesterificación e hidrólisis de un enlace fosfodiéster. Muchas
ribozimas naturales catalizan la hidrólisis de uno de sus propios enlaces fosfodiéster
(ribozimasautocatalíticas) o de enlaces de otros ARN. Se han descrito ribozimas en virus, en
procariotas y en eucariotas.

Utilidad de las ribozimas

El descubrimiento de las ribozimas ha supuesto una revolución en biología molecular con profundas
implicaciones funcionales y evolutivas. Es posible modificar esta moléculas, por lo que representan
una potente herramienta biotecnológica para degradar RNA específicos (silenciamiento génico).
Las ribozimas, al actuar como "tijeras moleculares", permitirán manipular el RNA fácilmente. Por
ejemplo, se podría proteger contra virus, bacterias o hongos patógenos eliminando
específicamente su RNA. Se está estudiando la posibilidad de utilizar las ribozimas contra el virus del
VIH, los virus herpéticos y el virus del mosaico del tabaco.

Las ribozimas y el origen de la vida

Las ribozimas pueden aportar luz sobre el origen de la vida; según la hipótesis del mundo de ARN, las
moléculas precursoras de la vida fueron moléculas de ARN, o similares, con capacidad de
autoduplicarse; estas hipotéticas replicasas de ARN habrían evolucionado hasta originar la célula.



NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
Muchas enzimas han sido designadas añadiendo el sufijo -asa al nombre del sustrato, es decir, la
molécula sobre la cuál ejerce su actividad catalítica. Por ejemplo la ureasa cataliza la hidrólisis de la
urea, y la arginasa cataliza la hidrólisis de la arginina. Otras enzimas han recibido su nombre en
función del tipo de reacción que catalizan; así la Gliceraldehído-3-fosfato-deshidrogenasa cataliza
la deshidrogenación (oxidación) del Gliceraldehído-3-fosfato a 3-fosfoglicerato. Incluso algunas se
conocen de hace mucho tiempo y mantienen su nombre, sin dar información alguna del sustrato o
la reacción que catalizan (tripsina).

No obstante, existe una clasificación sistemática de las enzimas que las divide en 6 grandes grupos,
cada uno de los cuales se divide a su vez en subclases:

             1: Oxido-reductasas (reacciones de oxido-reducción)
             2: Transferasas (transfieren grupos funcionales)
             3: Hidrolasas (reacciones de hidrólisis),
             4: Liasas (reacciones de adición a los dobles enlaces)
             5: Isomerasas (reacciones de isomerización)
             6: Ligasas (formación de enlaces con consumo de ATP).
A cada enzima se le asigna un número con cuatro dígitos. Los tres primeros indican la clase,
subclase y sub-subclase, respectivamente, y el último es un número de orden.
HOLOENZIMA
Una holoenzima es una enzima que está formada por una proteína (apoenzima) y un cofactor, que
puede ser un ion o una molécula orgánica compleja unida (grupo prostético) o no (una coenzima).
En resumidas cuentas, es una enzima completa y activada catalíticamente.

Las holoenzimas son enzimas que carecen de los componentes químicos apropiados para realizar la
actividad catalítica, por ello, se ayudan de otras sustancias no proteicas, denominadas cofactores
que, fijadas en su superficie mediante enlaces covalentes o débiles, le aportan a la enzima los
grupos y funciones químicas que necesita. En estos casos, la parte proteica de la enzima de
denomina apoenzima y la fracción no proteica es el cofactor.

HOLOENZIMA = APOENZIMA + COFACTOR



APOENZIMA
La apoenzima es la parte proteica de una holoenzima, es decir, una enzima que no puede llevar a
cabo su acción catalítica desprovista de los cofactores necesarios, ya sean iones metálicos (Fe, Cu,
Mg, etc.) u orgánicos, que a su vez puede ser una coenzima o un grupo prostético, dependiendo
de la fuerza de sus enlaces con la apoenzima. La apoenzima, es por tanto, catalíticamente inactiva,
hasta que se le une el cofactor adecuado.

ISOENZIMA
Las isoenzimas o isozimas son enzimas que difieren en la secuencia de aminoácidos, pero que
catalizan la misma reacción química. Estas enzimas suelen mostrar diferentes parámetros cinéticos
(i.e. diferentes valores de KM), o propiedades de regulación diferentes. La existencia de las
isoenzimas permite el ajuste del metabolismo para satisfacer las necesidades particulares de un
determinado tejido o etapa del desarrollo. En bioquímica, las isoenzimas son isoformas (variantes
estrechamente relacionadas) de las enzimas. En muchos casos, son codificadas por genes
homólogos que han divergido con el tiempo. Aunque de forma estricta, las aloenzimas representan
enzimas de diferentes alelos de un mismo gen y las isoenzimas representan enzimas de diferentes
genes cuyos productos catalizan la misma reacción, los dos términos se suelen usar indistintamente.

Ejemplo de isoenzima

Un ejemplo de una isoenzima es la glucoquinasa, una variante de hexoquinasa que no es inhibida
por la glucosa-6-fosfato. Sus diferentes funciones de regulación y su menor afinidad por la glucosa
(en comparación con otros hexoquinasas), le permiten tener diferentes funciones en las células de
determinados órganos, como el control de la liberación de insulina por las células beta del
páncreas, o la iniciación de la síntesis de glucógeno por las células del hígado. Ambos procesos
deben ocurrir solamente cuando la glucosa es abundante, o ocurre algún problema.
Distinguiendo isoenzimas

Isoenzimas (y aloenzimas) son variantes de la misma enzima. A menos que sean idénticas en cuanto
a sus propiedades bioquímicas, por ejemplo, sus sustratos y cinética enzimática, pueden ser
diferenciados por ensayos bioquímicos. Sin embargo, estas diferencias suelen ser sutiles
(particularmente entre las aloenzimas que a menudo son variantes neutrales). Esta sutileza es de
esperar, debido a que dos enzimas que difieran considerablemente en sus funciones no es probable
que sean identificadas como isoenzimas.


Mientras que las isoenzimas pueden ser casi idénticas en cuanto a su funcionamiento, pueden diferir
en otros aspectos. En particular, las sustituciones de aminoácidos que cambian la carga eléctrica
de la enzima (por ejemplo, la sustitución de ácido aspártico con ácido glutámico) son fáciles de
identificar por electroforesis en gel, y esto constituye la base para el uso de las isoenzimas como
marcadores moleculares.

Isoenzimas y aloenzimas como marcadores moleculares

En genética de poblaciones es esencial un estudio de las causas y los efectos de la variación
genética dentro y entre las poblaciones, y en el pasado han sido las isoenzimas los marcadores
moleculares más ampliamente utilizados con este fin. A pesar de que ya han sido ampliamente
superados por otros enfoques más informativos basados en el ADN (como la secuenciación directa
del ADN, polimorfismos de un solo nucleótido y microsatélites), aún están entre los sistemas de
marcadores más rápidos y más baratos de desarrollar, y son una excelente elección para proyectos
que sólo necesitan identificar bajos niveles de variación genética, e.g cuantificación de los sistemas
de apareamiento.

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Tipos de Enzimas

  • 1. LAS RIBOZIMAS Las ribozimas son ARN con actividad catalítica. El término "ribozima" es una contracción de las palabras "ácido ribonucleico" y "enzima". Los sustratos de las ribozimas son con frecuencia ARN. La actividad de las ribozimas combina transesterificación e hidrólisis de un enlace fosfodiéster. Muchas ribozimas naturales catalizan la hidrólisis de uno de sus propios enlaces fosfodiéster (ribozimasautocatalíticas) o de enlaces de otros ARN. Se han descrito ribozimas en virus, en procariotas y en eucariotas. Utilidad de las ribozimas El descubrimiento de las ribozimas ha supuesto una revolución en biología molecular con profundas implicaciones funcionales y evolutivas. Es posible modificar esta moléculas, por lo que representan una potente herramienta biotecnológica para degradar RNA específicos (silenciamiento génico). Las ribozimas, al actuar como "tijeras moleculares", permitirán manipular el RNA fácilmente. Por ejemplo, se podría proteger contra virus, bacterias o hongos patógenos eliminando específicamente su RNA. Se está estudiando la posibilidad de utilizar las ribozimas contra el virus del VIH, los virus herpéticos y el virus del mosaico del tabaco. Las ribozimas y el origen de la vida Las ribozimas pueden aportar luz sobre el origen de la vida; según la hipótesis del mundo de ARN, las moléculas precursoras de la vida fueron moléculas de ARN, o similares, con capacidad de autoduplicarse; estas hipotéticas replicasas de ARN habrían evolucionado hasta originar la célula. NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS Muchas enzimas han sido designadas añadiendo el sufijo -asa al nombre del sustrato, es decir, la molécula sobre la cuál ejerce su actividad catalítica. Por ejemplo la ureasa cataliza la hidrólisis de la urea, y la arginasa cataliza la hidrólisis de la arginina. Otras enzimas han recibido su nombre en función del tipo de reacción que catalizan; así la Gliceraldehído-3-fosfato-deshidrogenasa cataliza la deshidrogenación (oxidación) del Gliceraldehído-3-fosfato a 3-fosfoglicerato. Incluso algunas se conocen de hace mucho tiempo y mantienen su nombre, sin dar información alguna del sustrato o la reacción que catalizan (tripsina). No obstante, existe una clasificación sistemática de las enzimas que las divide en 6 grandes grupos, cada uno de los cuales se divide a su vez en subclases: 1: Oxido-reductasas (reacciones de oxido-reducción) 2: Transferasas (transfieren grupos funcionales) 3: Hidrolasas (reacciones de hidrólisis), 4: Liasas (reacciones de adición a los dobles enlaces) 5: Isomerasas (reacciones de isomerización) 6: Ligasas (formación de enlaces con consumo de ATP). A cada enzima se le asigna un número con cuatro dígitos. Los tres primeros indican la clase, subclase y sub-subclase, respectivamente, y el último es un número de orden.
  • 2. HOLOENZIMA Una holoenzima es una enzima que está formada por una proteína (apoenzima) y un cofactor, que puede ser un ion o una molécula orgánica compleja unida (grupo prostético) o no (una coenzima). En resumidas cuentas, es una enzima completa y activada catalíticamente. Las holoenzimas son enzimas que carecen de los componentes químicos apropiados para realizar la actividad catalítica, por ello, se ayudan de otras sustancias no proteicas, denominadas cofactores que, fijadas en su superficie mediante enlaces covalentes o débiles, le aportan a la enzima los grupos y funciones químicas que necesita. En estos casos, la parte proteica de la enzima de denomina apoenzima y la fracción no proteica es el cofactor. HOLOENZIMA = APOENZIMA + COFACTOR APOENZIMA La apoenzima es la parte proteica de una holoenzima, es decir, una enzima que no puede llevar a cabo su acción catalítica desprovista de los cofactores necesarios, ya sean iones metálicos (Fe, Cu, Mg, etc.) u orgánicos, que a su vez puede ser una coenzima o un grupo prostético, dependiendo de la fuerza de sus enlaces con la apoenzima. La apoenzima, es por tanto, catalíticamente inactiva, hasta que se le une el cofactor adecuado. ISOENZIMA Las isoenzimas o isozimas son enzimas que difieren en la secuencia de aminoácidos, pero que catalizan la misma reacción química. Estas enzimas suelen mostrar diferentes parámetros cinéticos (i.e. diferentes valores de KM), o propiedades de regulación diferentes. La existencia de las isoenzimas permite el ajuste del metabolismo para satisfacer las necesidades particulares de un determinado tejido o etapa del desarrollo. En bioquímica, las isoenzimas son isoformas (variantes estrechamente relacionadas) de las enzimas. En muchos casos, son codificadas por genes homólogos que han divergido con el tiempo. Aunque de forma estricta, las aloenzimas representan enzimas de diferentes alelos de un mismo gen y las isoenzimas representan enzimas de diferentes genes cuyos productos catalizan la misma reacción, los dos términos se suelen usar indistintamente. Ejemplo de isoenzima Un ejemplo de una isoenzima es la glucoquinasa, una variante de hexoquinasa que no es inhibida por la glucosa-6-fosfato. Sus diferentes funciones de regulación y su menor afinidad por la glucosa (en comparación con otros hexoquinasas), le permiten tener diferentes funciones en las células de determinados órganos, como el control de la liberación de insulina por las células beta del páncreas, o la iniciación de la síntesis de glucógeno por las células del hígado. Ambos procesos deben ocurrir solamente cuando la glucosa es abundante, o ocurre algún problema.
  • 3. Distinguiendo isoenzimas Isoenzimas (y aloenzimas) son variantes de la misma enzima. A menos que sean idénticas en cuanto a sus propiedades bioquímicas, por ejemplo, sus sustratos y cinética enzimática, pueden ser diferenciados por ensayos bioquímicos. Sin embargo, estas diferencias suelen ser sutiles (particularmente entre las aloenzimas que a menudo son variantes neutrales). Esta sutileza es de esperar, debido a que dos enzimas que difieran considerablemente en sus funciones no es probable que sean identificadas como isoenzimas. Mientras que las isoenzimas pueden ser casi idénticas en cuanto a su funcionamiento, pueden diferir en otros aspectos. En particular, las sustituciones de aminoácidos que cambian la carga eléctrica de la enzima (por ejemplo, la sustitución de ácido aspártico con ácido glutámico) son fáciles de identificar por electroforesis en gel, y esto constituye la base para el uso de las isoenzimas como marcadores moleculares. Isoenzimas y aloenzimas como marcadores moleculares En genética de poblaciones es esencial un estudio de las causas y los efectos de la variación genética dentro y entre las poblaciones, y en el pasado han sido las isoenzimas los marcadores moleculares más ampliamente utilizados con este fin. A pesar de que ya han sido ampliamente superados por otros enfoques más informativos basados en el ADN (como la secuenciación directa del ADN, polimorfismos de un solo nucleótido y microsatélites), aún están entre los sistemas de marcadores más rápidos y más baratos de desarrollar, y son una excelente elección para proyectos que sólo necesitan identificar bajos niveles de variación genética, e.g cuantificación de los sistemas de apareamiento.