As principais causas de poluição dos rios são descargas de poluentes tóxicos, despejo de lixos e esgotos, e descargas de produtos químicos industriais. Os principais poluidores são a agricultura, as fábricas e fertilizantes. O Rio Mondego é afetado por descargas industriais que substituíram as plantas estuarinas por algas. Devemos proteger os rios para fornecer água, alimento e energia.