1. 130120 ver 1.0
Coot on Mac OS X 10.6
Presented by Satoshi Kume, Osaka Prefecture University
1. Coot のダウンロード
http://www.ccp4.ac.uk/index.php
Mac版を選択
※ ダウンロード出来ない場合には、右クリック → 別名で保存
3. 4. パレットの活用 (Model/Fit/Refine...)
(Real Space Refine Zone)
主鎖、および側鎖の自動最適化。
Cαを選択する。Manualでも可能。近くの
電子密度に合わせる
(Regid Body Fit Zone)
側鎖固定で最適化
(Auto Fit Rotamer & Rotamers... & Edit
Chi Angles)
側鎖の分子内回転、プリップを設定可能。
(Simple Mutate)
残基を他のアミノ酸に変更する。
Real Space Refine Zone との組み合わせ
で、S-S結合も導入可能。
(Add Alt Conf...)
Multi-formの設定が出来る。
Occupancyの設定。