f

1. Inzicht in waterkwaliteit:
Een ‘wereld’ te ontdekken
Jan Hardeman
Sr. Account Manager Horticulture
Frank Hoeberichts
Product Manager Horticulture

2. Eurofins Horti
2
– Laboratorium in Wageningen
– Ongeveer 700.000 monsters per jaar
– Circa 250 werknemers
– 4 business units:
• Agro
• Manure
• Horti
• Field Services

3. Monitoring in uw kas
3
1. Uitgangswater
2. Water oplosbare meststoffen
3. Druppelwater
4. Gewasonderzoek
5. Substraatonderzoek
6. Drainwater
7. Waterzuivering  residu/pesticiden
8. Ontsmetter  microbiologie

4. Hoe is het microleven te bepalen in water?
4
– Uitplaten (kolonie-vormende eenheden): goede indicator van de
microbiologische activiteit met gebruik van voedingsbodems
– BodemlevenMonitor dmv gaschromatografie:
PLFA-analyse met behulp van GCMS techniek
– DNA Multiscan: monitoren van vooraf gedefinieerde
ziekteverwekkers
– DNA Microbioom analyses: al het leven op naam brengen

5. Uitplaten
5

6. BodemlevenMonitor
6
Proef: van der Knaap
0
1000
2000
3000
4000
mei juni juli augustus
mg
C/kg
Microbiële biomassa in kokos
mineraal organisch
‒ Absolute microbiële biomassa
‒ PLFA methode
‒ Meting bodemleven in categorieën:
• Gram-positief
• Actinomyceten
• Gram-negatief
• Saprofyten
• Mycorrhizae
• Protozoa

7. DNA analyses: Wat is het microbioom?
7
‒ Alle DNA van één organisme samen noemt
men het genoom
• Eén organisme
• Bijv. het menselijke genoom, het
tomaten-genoom
‒ Microbioom = het geheel aan soorten
micro-organismen in een bepaalde
levensgemeenschap, bijv:
• Darm-microbioom, bodem-microbioom
‒ Eén gram aarde bevat >1 miljard bacteriële
cellen
‒ Het belang van een “gezond” microbioom
wordt steeds meer erkend

8. Het meten van DNA kan op verschillende
manieren
8
‒ Polymerase chain reaction (PCR)
‒ Quantitative PCR (Q-PCR)
‒ Blotten (= DNA Multiscan)
‒ Sequencing (DNA volgorde bepalen)
• Sanger sequencing
• Next Generation Sequencing
(= Microbioom analyse)

9. DNA Multiscan
9
‒ DNA meting m.b.v. PCR + blot
‒ DNA van verschillende plant pathogenen is
aanwezig op membraan (blot)
‒ Indien plant pathogeen-DNA aanwezig in monster:
positief signaal = zwarte stip op blot
‒ Semi-kwantitatief: intensiteit spot wordt omgezet
naar score tussen 0 en 6
‒ Alleen detectie van vooraf geselecteerde
pathogenen

10. DNA Multiscan paketten
10
code naam
151 Paprika
152 Tomaat
153 Komkommer
154 Roos
155 Gerbera
159 Aardbei
160 DNA Previscan
161 Trichoderma
162 Glasgroente
163 Siergewassen
170 Glastuinbouw uitgebreid
171 Houtige gewassen
172 Gras- en sportvelden
174 Vollegrondsgewassen
183 Bacteriën
Zie voor de volledige lijst: www.eurofins-horti.com/nl-nl/dna-multiscan

11. Nieuw! - Microbioom analyse
11
Biologisch monster
DNA DNA fragmenten
DNA sequenties
Determinatie soort(en)
GTCTAGTAGCTAGCCGTG
AAGTGACACGATGCACGATTCGATG
CTTAACGTACGGATTCTATGAGTCAG
CTAGCTAGCTGTTACGTATCGT
TCATAGTTACGTATCGT
ACCATGATGCTATGTAGTAAGCCT
ACTCCGAGATTAATAGAATGGCCAG

12. Voorbeeld: gietwater vs. mat
12
‒ Overzicht samenstelling
microbioom
‒ Schimmels en bacteriën
‒ Genus- of soortniveau
‒ Relatief: % van het DNA dat
toebehoort aan organisme

13. Grip krijgen met analyses
13
Eurofins ontwikkelt:
– Meststoffen en biostimulanten analyses
(inhoudstoffen, nutriënten etc.)
– Pyrolyse methode (kwaliteit organische stof)
– DNA Microbioom analyses
Kunnen we microleven voeden met
specifieke (koolstof)bronnen uit substraat of
meststoffen/biostimulanten?
Wat zijn de relaties met weerbaarheid tegen
ziekteverwekkers?

14. Een ‘wereld’ te ontdekken
• Meer grip krijgen op samenspel van
chemische, fysische en biologische
processen rondom de wortel

15. Hartelijk dank voor uw aandacht
15
Jan Hardeman
Sr. Account Manager Horticulture
E: JanHardeman@eurofins.com
M: +31 (0)6 52002168
Frank Hoeberichts
Product Manager Horticulture
E: FrankHoeberichts@eurofins.com
M: +31 (0)6 153 412 38