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4 ANTIBIOGUIDE
Interprétation des
résultats d’examens
Examensbactériologiques
Prélèvementsrespiratoires....................................................p106
Hémocultures.........................................................................p107
ECBU......................................................................................p109
LCR.........................................................................................p111
Sérologiesdetoxoplasmose
encoursdegrossesse...........................................................p113
44
107
Critères de pathogénicité :
- plusieurshémoculturespositivesavecunemêmeespècebactérienne,quelquesoit
le contexte clinique
- une seule ou plusieurs hémoculture(s) positive(s) avec des bacté-
ries pathogènes spécifiques (quels que soient le nombre de flacon(s)
positif(s), le nombre d’hémoculture(s) réalisée(s) et le contexte clinique) :
S. aureus, S. pneumoniae, Streptocoques b-hémolytiques, Enterococcus spp., enté-
robactéries, P. aeruginosa, autres bactéries aérobies strictes, N. meningitidis,
Haemophilus spp., bactéries du groupe HACCEK, Brucella spp., Campylobacter spp.,
Pasteurellaspp., Listeriamonocytogenes, champignons...
Contamination probable :
Si une seule hémoculture positive à Staphylocoques à coagulase négative,
Corynébactérie, Bacillus, Propionibacterium acnes (à interpréter néanmoins en
fonction du contexte clinique).
4
INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS DES
PRINCIPAUX EXAMENS BACTÉRIOLOGIQUES -1-
Interpretation des resultats d’examens
Prélèvements respiratoires
(hors mucoviscidose, tuberculose et situations particulières)
Examenmicroscopique/Expectorations
Culture / Seuil de pathogénicité :
• Expectoration : ≥ 107 UFC /ml
• Aspiration trachéale : ≥ 105 UFC /ml
• Lavage bronchoalvéolaire : ≥ 104 UFC /ml
• Brossage bronchique - Prélèvement distal protégé : ≥ 103 UFC /ml
Une identification et un antibiogramme seront réalisés sur toute bactérie considérée
comme pathogène et dont le nombre est supérieur ou égal au seuil de pathogénicité
Ces seuils peuvent être abaissés en fonction du contexte clinique
(antibiothérapie préalable, immunodépression…) ou si la bactérie est présente en
grande quantité à l’examen microscopique
 25	  25
 25	  25
10-25 	  25
 10 	  25
(Nbdecellules/champmicroscopique)
Cépithéliales Leucocytes
Contamination salivaire
prélèvement rejeté
Réaction inflammatoire
contamination salivaire
Prélèvement acceptable
Prélèvement adapté
Interprétation
(selon les critères de Bartlett)
HEMOCULTURES
1094 Interpretation des resultats d’examens
INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS DES
PRINCIPAUX EXAMENS BACTÉRIOLOGIQUES -2-
ECBU (patient non sondé)
LEUCOCYTURIE
/ml
BACTÉRIURIE
(UFC/ml)
CULTURE
/ Nb d'espèces
INTERPRÉTATION
Groupe
bactérien*
Niveaudepathogénicitéselonlesgroupesbactériens:
•groupe1:bactériesconsidéréespathogènesmêmeencasdebactériuriefaible(≥103UFC/ml)
-Escherichiacoli -Staphylococcussaprophyticus(femmejeune) -Salmonella(rare)	
•groupe2:bactériessouventimpliquées(notammentdanslesinfectonsnosocomiales)
-EntérobactériesautresqueEscherichiacoli	 -Enterococccusspp.
-Staphylococcusaureus	-Pseudomonasaeruginosa	 -Corynebacteriumurealyticum
•groupe3:bactériesdontl’implicationestpeuprobableetexigeunebactériurieélevée(≥105UFC/ml)
-StaphylocoquesàcoagulasenégativeautresqueS.saprophyticus
-Streptococcusspp	 -Aerococcusurinae
-Oligellaurethralis	 -PseudomonaceaeautresqueP.aeruginosa
-Acinetobacterbaumannii	 -Stenotrophomonasmaltophilia
-Burkholderiacepacia
•groupe4:bactériesappartenantauxfloresuréthralesetgénitales,
àconsidérerengénéralcommedescontaminants
(streptocoquesapha-hémolytiques,Gardnerellavaginalis,
Lactobacillusspp.,bacillescorynéformessaufC.urealyticum)
104 103 Négative Pasd'infectionurinaire
≥104
103à104
Positive/1espèce 1ou2 Infectionurinaireprobable
Positive≥2espèces 1=espèceprédominante
Infectionurinaireprobable
Antibiogrammesuruneespècedegroupe1
Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable
≥105
Positive/1espèce
1ou2ou3 Infectionurinaireprobable
4 ECBUdecontrôlesouhaitable
Positive≥2espèces
1et/ou2espèce(s)
prédominante(s)
Ainterpréterenfonctionducontexteclinique;
ilpeuts’agird’uneinfectionàplusieursgermes
oud'unecontaminationaumomentduprélèvement
Antibiogrammesurespècesdesgroupes1et2isolées.
Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable
103 Négative
Ilpeuts'agird'une:
-infectionurinaireàMycobactéries
-infectiondébutanteoutraitéepardesantibiotiques
-étiologienonbactérienne
≥104
≥105
Positive/1espèce
Infectionprobablesurterrainparticulier(immuno-
déprimé,sujetâgé,femmeenceinte).
Danslesautrescas,unECBUdecontrôleest
souhaitable.
Positive/≥2espèces
1et/ou2espèce(s)
prédominante(s)
Infectionprobablesurterrainparticulier
(immunodéprimé)
Antibiogrammesurespècedesgroupes1et2
Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable
104 Positive/≥1espèce
1et/ou2espèce(s)
prédominante(s)
Infectionprobablesurterrainparticulier
(immunodéprimé)
Antibiogrammesurespècedesgroupes1et2
Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable
L’interprétations’effectueenprenantencompteplusieursparamètres:terrainet 			 symptomatologieclinique,leucocyturie,bactériurie,nombreettypesd’espècesisolées.
1114 Interpretation des resultats d’examens
INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS DES
PRINCIPAUX EXAMENS BACTÉRIOLOGIQUES -3-
L C R 
MÉNINGITE
À LIQUIDE
CLAIR
ASPECT CELLULES / mm3
 2
(nouveau-né :
10-30)
TYPE DE CELLULES
MÉNINGITE
PURULENTE
NORMAL eau de roche mononucléées 0,30 - 0,50 négatif
trouble
clair
 10
souvent 1000
majoritépolynucléaires 0,5 en général
 5
bactérienne à
germes
pyogènes
subnormale ou
légèrement
augmentée
0,5 (1-3)
normale
majoritémononucléées
(lymphocytes,
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majorité lymphocytes ou
panaché
panaché
10-200
10-300
10-100
normale
normale
négatif
généralement négatif
généralement négatif
GLYCORACHIE
2/3 glycémie
(0,50 g/l
2,5 mmol / l)
ETIOLOGIE
PROBABLE
EXAMENMICROSCOPIQUE
D’ORIENTATION
si positif
diplocoques à Gram - :
Méningocoques
bacilles à Gram - :
Haemophilus,E. coli,
Pyocyanique
diplocoques à Gram +
Pneumocoque
cocci à Gram + en chaînettes
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Streptocoque B
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cocci à Gram + en amas :
Staphylocoque
PROTEINORACHIE g/l
virale
tuberculose,
(diminutiondela
chlorurorachie),
Listeria
Listeriaméningitepuru-
lente (ou
viraledébutante)
1134 Interpretation des resultats d’examens
INTERPRÉTATION DES SÉROLOGIES DE
TOXOPLASMOSE EN COURS DE GROSSESSE -4-
SITUATION
AVANT 
LA GROSSESSE
DURANT
LA GROSSESSE
lg G
positif
négatif ou inconnu
négatif
négatif
positif
positif
lg M
négatif
positif
négatif
positif
INTERPRÉTATION
Immunité assurée : pas de suivi nécessaire
Sérologie toxoplasmose obligatoire dès le début de grossesse
Sérologies mensuelles, conseils hygiéno-diététiques
Traiter immédiatement (Spiramycine 9 MU/j)
Recherche d’une contamination foetale
Si immunité antérieure assurée, ni traitement, ni exploration foetale
Absence de preuve d’immunité antérieure :
nouvelle sérologie 3 semaines plus tard :
	 • même résultat, ni traitement, ni exploration fœtale
	 • sinon, cf. IgM positif
Si immunité antérieure assurée, ni traitement, ni exploration foetale
Absence d’immunité antérieure ou aucune anamnèse sérologique : 		
• recherche d’IgA ou étude de l’affinité des IgG, 			 •
traiter immédiatement (Spiramycine 9 MU/j),
• confirmation cinétique et datation de la séroconversion
Nouveau sérum prélevé de 1 à 3 sem. après, selon le titre en IgG
Si séroconversion postérieure à la fécondation : prévoir un diagnostic
anténatal de toxoplasmose congénitale (PCR sur liquide amniotique).

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  • 1. 4 ANTIBIOGUIDE Interprétation des résultats d’examens Examensbactériologiques Prélèvementsrespiratoires....................................................p106 Hémocultures.........................................................................p107 ECBU......................................................................................p109 LCR.........................................................................................p111 Sérologiesdetoxoplasmose encoursdegrossesse...........................................................p113 44
  • 2. 107 Critères de pathogénicité : - plusieurshémoculturespositivesavecunemêmeespècebactérienne,quelquesoit le contexte clinique - une seule ou plusieurs hémoculture(s) positive(s) avec des bacté- ries pathogènes spécifiques (quels que soient le nombre de flacon(s) positif(s), le nombre d’hémoculture(s) réalisée(s) et le contexte clinique) : S. aureus, S. pneumoniae, Streptocoques b-hémolytiques, Enterococcus spp., enté- robactéries, P. aeruginosa, autres bactéries aérobies strictes, N. meningitidis, Haemophilus spp., bactéries du groupe HACCEK, Brucella spp., Campylobacter spp., Pasteurellaspp., Listeriamonocytogenes, champignons... Contamination probable : Si une seule hémoculture positive à Staphylocoques à coagulase négative, Corynébactérie, Bacillus, Propionibacterium acnes (à interpréter néanmoins en fonction du contexte clinique). 4 INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS DES PRINCIPAUX EXAMENS BACTÉRIOLOGIQUES -1- Interpretation des resultats d’examens Prélèvements respiratoires (hors mucoviscidose, tuberculose et situations particulières) Examenmicroscopique/Expectorations Culture / Seuil de pathogénicité : • Expectoration : ≥ 107 UFC /ml • Aspiration trachéale : ≥ 105 UFC /ml • Lavage bronchoalvéolaire : ≥ 104 UFC /ml • Brossage bronchique - Prélèvement distal protégé : ≥ 103 UFC /ml Une identification et un antibiogramme seront réalisés sur toute bactérie considérée comme pathogène et dont le nombre est supérieur ou égal au seuil de pathogénicité Ces seuils peuvent être abaissés en fonction du contexte clinique (antibiothérapie préalable, immunodépression…) ou si la bactérie est présente en grande quantité à l’examen microscopique 25 25 25 25 10-25 25 10 25 (Nbdecellules/champmicroscopique) Cépithéliales Leucocytes Contamination salivaire prélèvement rejeté Réaction inflammatoire contamination salivaire Prélèvement acceptable Prélèvement adapté Interprétation (selon les critères de Bartlett) HEMOCULTURES
  • 3. 1094 Interpretation des resultats d’examens INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS DES PRINCIPAUX EXAMENS BACTÉRIOLOGIQUES -2- ECBU (patient non sondé) LEUCOCYTURIE /ml BACTÉRIURIE (UFC/ml) CULTURE / Nb d'espèces INTERPRÉTATION Groupe bactérien* Niveaudepathogénicitéselonlesgroupesbactériens: •groupe1:bactériesconsidéréespathogènesmêmeencasdebactériuriefaible(≥103UFC/ml) -Escherichiacoli -Staphylococcussaprophyticus(femmejeune) -Salmonella(rare) •groupe2:bactériessouventimpliquées(notammentdanslesinfectonsnosocomiales) -EntérobactériesautresqueEscherichiacoli -Enterococccusspp. -Staphylococcusaureus -Pseudomonasaeruginosa -Corynebacteriumurealyticum •groupe3:bactériesdontl’implicationestpeuprobableetexigeunebactériurieélevée(≥105UFC/ml) -StaphylocoquesàcoagulasenégativeautresqueS.saprophyticus -Streptococcusspp -Aerococcusurinae -Oligellaurethralis -PseudomonaceaeautresqueP.aeruginosa -Acinetobacterbaumannii -Stenotrophomonasmaltophilia -Burkholderiacepacia •groupe4:bactériesappartenantauxfloresuréthralesetgénitales, àconsidérerengénéralcommedescontaminants (streptocoquesapha-hémolytiques,Gardnerellavaginalis, Lactobacillusspp.,bacillescorynéformessaufC.urealyticum) 104 103 Négative Pasd'infectionurinaire ≥104 103à104 Positive/1espèce 1ou2 Infectionurinaireprobable Positive≥2espèces 1=espèceprédominante Infectionurinaireprobable Antibiogrammesuruneespècedegroupe1 Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable ≥105 Positive/1espèce 1ou2ou3 Infectionurinaireprobable 4 ECBUdecontrôlesouhaitable Positive≥2espèces 1et/ou2espèce(s) prédominante(s) Ainterpréterenfonctionducontexteclinique; ilpeuts’agird’uneinfectionàplusieursgermes oud'unecontaminationaumomentduprélèvement Antibiogrammesurespècesdesgroupes1et2isolées. Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable 103 Négative Ilpeuts'agird'une: -infectionurinaireàMycobactéries -infectiondébutanteoutraitéepardesantibiotiques -étiologienonbactérienne ≥104 ≥105 Positive/1espèce Infectionprobablesurterrainparticulier(immuno- déprimé,sujetâgé,femmeenceinte). Danslesautrescas,unECBUdecontrôleest souhaitable. Positive/≥2espèces 1et/ou2espèce(s) prédominante(s) Infectionprobablesurterrainparticulier (immunodéprimé) Antibiogrammesurespècedesgroupes1et2 Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable 104 Positive/≥1espèce 1et/ou2espèce(s) prédominante(s) Infectionprobablesurterrainparticulier (immunodéprimé) Antibiogrammesurespècedesgroupes1et2 Autressituations ECBUdecontrôlesouhaitable L’interprétations’effectueenprenantencompteplusieursparamètres:terrainet symptomatologieclinique,leucocyturie,bactériurie,nombreettypesd’espècesisolées.
  • 4. 1114 Interpretation des resultats d’examens INTERPRÉTATION DES RÉSULTATS DES PRINCIPAUX EXAMENS BACTÉRIOLOGIQUES -3- L C R  MÉNINGITE À LIQUIDE CLAIR ASPECT CELLULES / mm3 2 (nouveau-né : 10-30) TYPE DE CELLULES MÉNINGITE PURULENTE NORMAL eau de roche mononucléées 0,30 - 0,50 négatif trouble clair 10 souvent 1000 majoritépolynucléaires 0,5 en général 5 bactérienne à germes pyogènes subnormale ou légèrement augmentée 0,5 (1-3) normale majoritémononucléées (lymphocytes, plasmocytes) majorité lymphocytes ou panaché panaché 10-200 10-300 10-100 normale normale négatif généralement négatif généralement négatif GLYCORACHIE 2/3 glycémie (0,50 g/l 2,5 mmol / l) ETIOLOGIE PROBABLE EXAMENMICROSCOPIQUE D’ORIENTATION si positif diplocoques à Gram - : Méningocoques bacilles à Gram - : Haemophilus,E. coli, Pyocyanique diplocoques à Gram + Pneumocoque cocci à Gram + en chaînettes de taille variable : Streptocoque B bacilles à Gram + : Listeria cocci à Gram + en amas : Staphylocoque PROTEINORACHIE g/l virale tuberculose, (diminutiondela chlorurorachie), Listeria Listeriaméningitepuru- lente (ou viraledébutante)
  • 5. 1134 Interpretation des resultats d’examens INTERPRÉTATION DES SÉROLOGIES DE TOXOPLASMOSE EN COURS DE GROSSESSE -4- SITUATION AVANT  LA GROSSESSE DURANT LA GROSSESSE lg G positif négatif ou inconnu négatif négatif positif positif lg M négatif positif négatif positif INTERPRÉTATION Immunité assurée : pas de suivi nécessaire Sérologie toxoplasmose obligatoire dès le début de grossesse Sérologies mensuelles, conseils hygiéno-diététiques Traiter immédiatement (Spiramycine 9 MU/j) Recherche d’une contamination foetale Si immunité antérieure assurée, ni traitement, ni exploration foetale Absence de preuve d’immunité antérieure : nouvelle sérologie 3 semaines plus tard : • même résultat, ni traitement, ni exploration fœtale • sinon, cf. IgM positif Si immunité antérieure assurée, ni traitement, ni exploration foetale Absence d’immunité antérieure ou aucune anamnèse sérologique : • recherche d’IgA ou étude de l’affinité des IgG, • traiter immédiatement (Spiramycine 9 MU/j), • confirmation cinétique et datation de la séroconversion Nouveau sérum prélevé de 1 à 3 sem. après, selon le titre en IgG Si séroconversion postérieure à la fécondation : prévoir un diagnostic anténatal de toxoplasmose congénitale (PCR sur liquide amniotique).