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Altagracia Jiménez Díaz
Ecología microbiana
Ecología microbiana
Definiciones
La 'ecología microbiana' es la rama de la
ecología que estudia a los microorganismos
en su ambiente natural, los cuales
mantienen una actividad continua
imprescindible para la vida en la Tierra. ...
http://es.wikipedia.org/wiki/Ecologia_microbiana
Los mecanismos que
mantienen la
diversidad
microbiana de la
biosfera son la base
de la dinámica de los
ecosistemas
terrestres, acuáticos
y aéreos.
Es decir, la base de la
existencia de las
selvas y de los
sistemas agrícolas,
entre otros. Por otra
parte, la diversidad
microbiana del suelo
es la causa de la
fertilidad del mismo.
, agua,
La ecología estudia la
interrelación entre los
microorganismos y su
entorno biótico y Abiótico
Abiótico
PH, humedad, temperatura
Suelo, roca, agua, minerales…
Relaciones negativa.
Depredación
Antibiosis
Parasitismo
Relaciones positivas.
Comensalismo
Mutualismo
Simbiosis
Protistas superiores o
eucariotas , corresponden a
hongos, protozoos y casi
todas las algas que poseen
celulas eucariotas ( nucleo
verdadero con membrana
nuclear y mitocondria)
Protistas inferiores
Que incluyen las bacterias
y el grupo de algas
cianoficeas. No poseen
membrana nuclear ni
mitocondria.
 Organismos que transformar
sustancias inorgánicas en orgánicas
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como las plantas.
 Productores primarios: muchos
arboles, arbustos, helechos, los
cuales se alimentan de los
nutrientes, reciclados del suelo.
 Consumidores primarios: los
herbivoros que se alimentan solo de
vegetales.
 Por ejemplo aves, insectos,y
pequeños mamiferos
 Consumidores secundarios:los
depredadores mas pequeños que se
alimentan de la carne el pescado.
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mayores carnivoros, se alimentan
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secundarios menores.
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descomponedores o
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TRANSFORMAR SUSTANCIAS
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biológica en la que uno de los intervinientes
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por parte de un segundo animal, como los
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 con membrana nuclear y mitocondria.
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del cieno.
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que estos, dependen de la célula huésped para realizar las
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Generalidades
Microrganismos en sus ambientes
 Ambiente: lo que rodea a un organismo
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Ecosistemas: comunidades de
organismos transforman y modifican el
ambiente
Generalidades
Todos los organismos de un ecosistema
interaccionan con su medio y en algunos
casos modifican enormemente, durante el
proceso, las características del propio
ecosistema.
En un ecosistema microbiano las células
individuales forman poblaciones. Las
poblaciones relacionadas metabólicamente
constituyen gremios y los conjuntos de
gremios que llevan a cabo procesos
fisiológicos complementarios interaccionan
para formar comunidades microbianas.
Estas comunidades interaccionan a su vez,
con comunidades de macroorganismos y
definen el conjunto de ecosistema.
Diferentes microorganismos pueden
convivir en una comunidad microbiana de
una biopelícula, se observan formas de
bastón corto, largo, curvo, cocos y sarcinas
Generalidades
 Superficies y biofilmes
 Niveles de Nutrientes y velocidad de crecimiento
 Competencia microbiana y cooperación
 Métodos de enriquecimiento y aislamiento
Ciclos Biogeoquímicos
Cambios que experimenta un elemento químico a
medida que se mueve en un ecosistema.
 
La ecología microbiana tiene dos grandes
objetivos:
- Apreciar la biodiversidad de los M.O. y entender
la interacción entre los diferentes grupos que
componen la comunidad.
- Medir la actividad de los M.O. en la naturaleza y
controlar sus efectos en el ecosistema.
 
Ecología es el estudio de los
organismos en su ambiente
El crecimiento de los M.O. en la naturaleza depende de los recursos
disponibles (nutrientes) y de las condiciones de crecimiento (pH, T,
humedad, luz, O2, etc.
Los M.O. son muy pequeños por lo que sus hábitat también lo son.
La teoría ecológica dice que para cada organismo existe al menos un nicho,
que es el principal, aquel en el que crece mejor, pero también puede
crecer en otros con menos éxito.
El Microorganismo y su
Microambiente
Niveles nutritivos y velocidades de
crecimiento
 
Superficie y biofilm
  biofilm → adherencia a sólidos
Los biofilmes son microcolonias de
células bacterianas revestidas de
células bacterianas adheridas a una
superficie por medio de polisacáridos
adhesivos excretados por las mismas
células.
 
Ejemplos:
En minerales en biolixiviacion,
formación de la placa dental, corrosion
de los barcos.
Esta mucosidad de color marrón
verdoso que se encuentra en
adoquines del cauce en High Mineral
Creek, Montana, es un biofilm.
Relaciones de los Microrganismos
en un microambiente
Competencia entre M.O. en un ambiente natural
Colaboración metabólica (sintrofía)
Ejemplo
NH3
+ O2
→ NO2
-
Nitrosomonas
NO2
-
+ O2
→ NO3
-
Nitrobacter
Métodos de la Ecología
Microbiana
La biodiversidad que
incluye aislamiento,
identificación y
cuantificación de los
M.O. en diferentes
hábitats. La actividad
microbiana, lo que los
M.O. hacen en su
hábitat.
mutualismo
1.
Conjunto de asociaciones basadas en el régimen de la
mutualidad.
2.
biol
Asociación de dos o más organismos de especies diferentes
que supone beneficio para ambos.
Mutualismo puede designar:
En biología, el mutualismo es
una interacción biológica o
relación interespecífica temporal
en que ambos organismos
obtienen algún grado de
beneficio;
Relación Huésped-
Microorganismo
Modelos de Relación: Entre
el huésped y el
microorganismo puede
darse una relación
simbiótica.
Simbiosis es cualquier
relación o asociación íntima,
a largo plazo, entre dos o
más especies. Los miembros
de la relación se denominan
simbiontes. Existen tres
tipos de simbiosis:
Mutualismo: ambas partes se
benefician. El ejemplo: el
ser humano y las bacterias
de la flora intestinal
normal.
Comensalismo: un organismo
se beneficia y el otro no es
perjudicado ni beneficiado.
Parasitismo: uno de los
miembros (el parásito), se
beneficia, el otro (el
huésped), se perjudica.
Microambiente Natural
La producción de células en el ambiente es mucho
menor que en el laboratorio, debido a algunas
características del medio natural:
Disponibilidad de nutrientes, suele ser baja.
La distribución de dichos nutrientes a lo largo del
hábitat microbiano no suele ser uniforme.
Salvo raras excepciones los microorganismos no se
encuentran en cultivos axénicos en los medios naturales,
por lo que deben competir por los nutrientes.
Métodos de Enriquecimiento y
Aislamiento
 Se requiere un inóculo adecuado
 Dar condiciones selectivas
(inhibidores de algunos)
 Existen numerosos métodos
desarrollados para los diferentes
tipos de M.O.
 Métodos de cultivos líquidos y
sólidos (agar)
 Se ha demostrado que no todos
los M.O. de un ecosistema son
cultivables
Columna de Widnogradsky
Se diseñó en 1880 para
estudiar M.O. anaeróbicos del
suelo, pero representa un
sistema útil para tener una
reserva de diversos
procariotas a largo plazo.
Cultivo Axénico
El objetivo del estudio de un cultivo de enriquecimiento es la
obtención de un cultivo axénico (que contiene un único tipo de
M.O.)
Los métodos mas empleados son:
Siembra por estrías*
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Métodos por dilución
*De una colonia bien aislada, y repitiendo el proceso varias
veces, se puede traspasar a un medio líquido.
Posteriormente se requiere hacer pruebas microscópicas y
metabólicas para verificar pureza del cultivo.
Identificación y Cuantificación
de Microorganismos
Los métodos de cultivo y cuantificación de células
viables sólo medirán una fracción de la comunidad
microbiana.
Puede ser que los M.O. que se desea cuantificar sean no
cultivables, en ese caso se requiere alguna técnica que
pueda al menos detectar su presencia.
Se han desarrollado métodos que se basan en la
especificidad de los anticuerpos y otros en la secuencia
de ácidos nucleicos.
Tinción y anticuerpos
fluorescentes. El uso de
anticuerpos fluorescentes permite la
identificación de un determinado M.O.
los cuales se unen específicamente a
constituyentes de la superficie celular.
Se utilizan dos técnicas de tinción
distintas de anticuerpos fluorescentes,
la directa y la indirecta. En la directa es
el propio anticuerpo contra el M.O. que
es fluorescente.
Identificación y Cuantificación de
Microorganismos
 Sondas de ácidos nucleicos: una sonda es un pequeño
fragmento de DNA o RNA complementario, en
secuencia de bases, a la parte de un gen con el cual
puede hibridarse.
 Algunas sondas emplean secuencias rRNA 16S como
herramientas para diferenciar M.O. en ambientes
naturales.
 Actualmente se cuenta con una gran cantidad de
secuencias de rRNA 16S por lo que es posible construir
sondas muy específicas, capaces de diferenciar
organismos dentro de un mismo dominio y también
diferenciar entre especies en una misma muestra.
Sondas de ácidos nucleicos para identificación de
microorganismos: contraste de fase teñidas con
sonda universal (RNAr) y teñidas con sonda
eucariótica
Uso de radioisotopos
Se utilizan compuestos que contienen (C14
)  
autótrofos 14
CO2
→ células
reductores SO4
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→ H2
S35
metanogénicos 14
CO2
→ 14
CH4
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glucosa 14
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AA 14
C → incorp. C org.
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Mediciones de Actividad
Microbiana
Recordemos:
 
Cadena Respiratoria:
Conjunto de reacciones que transfieren al
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cofactores reducidos, produciendo agua en el
proceso y liberando energia que es usada para la
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Ecología microbiana: interacciones y funciones clave

  • 2. Ecología microbiana Definiciones La 'ecología microbiana' es la rama de la ecología que estudia a los microorganismos en su ambiente natural, los cuales mantienen una actividad continua imprescindible para la vida en la Tierra. ... http://es.wikipedia.org/wiki/Ecologia_microbiana
  • 3. Los mecanismos que mantienen la diversidad microbiana de la biosfera son la base de la dinámica de los ecosistemas terrestres, acuáticos y aéreos. Es decir, la base de la existencia de las selvas y de los sistemas agrícolas, entre otros. Por otra parte, la diversidad microbiana del suelo es la causa de la fertilidad del mismo.
  • 4. , agua, La ecología estudia la interrelación entre los microorganismos y su entorno biótico y Abiótico Abiótico PH, humedad, temperatura Suelo, roca, agua, minerales… Relaciones negativa. Depredación Antibiosis Parasitismo Relaciones positivas. Comensalismo Mutualismo Simbiosis
  • 5. Protistas superiores o eucariotas , corresponden a hongos, protozoos y casi todas las algas que poseen celulas eucariotas ( nucleo verdadero con membrana nuclear y mitocondria) Protistas inferiores Que incluyen las bacterias y el grupo de algas cianoficeas. No poseen membrana nuclear ni mitocondria.
  • 6.  Organismos que transformar sustancias inorgánicas en orgánicas  Lo hacen mediante la clorofila como las plantas.  Productores primarios: muchos arboles, arbustos, helechos, los cuales se alimentan de los nutrientes, reciclados del suelo.  Consumidores primarios: los herbivoros que se alimentan solo de vegetales.  Por ejemplo aves, insectos,y pequeños mamiferos  Consumidores secundarios:los depredadores mas pequeños que se alimentan de la carne el pescado.  Consumidores terciarios los mayores carnivoros, se alimentan de los consumidores primarios y secundarios menores.  Hongos y bacterias son descomponedores o desintegradores
  • 7. Luz Materia Heterótrofos consumidores Microorganismos Animales herbívoros Animales carnívoros Energia calor Materia autótrofos Productores Bacterias fotosinteticas Bacterias quimiolitotrofas Protistas fotosinteticos Plantas superiores Descomponedores Bacterias Hongos protistas
  • 8.
  • 9. EN LOS SISTEMAS NATURALES LOS MICROORGANISMOS OCUPAN UNA POSICIÓN CLAVE EN RELACIÓN CON EL FLUJO DE MATERIA Y ENERGÍA DEBIDO A SUS CAPACIDADES METABÓLICAS PARA TRANSFORMAR SUSTANCIAS METABÓLICAS ORGÁNICAS E INORGÁNICAS
  • 10. EL MUNDO MICROBIANO SE CARACTERIZA POR
  • 11. El parasitismo es un tipo de simbiosis y tiene una estrecha relación en la cual uno de los participantes, (el parásito o huésped) depende del otro (hospedador o anfitrión) y obtiene algún beneficio  lo cual implica daño para el anfitrión.  El parasitismo puede ser considerado un caso particular de depredación.
  • 12. El comensalismo es una forma de interacción biológica en la que uno de los intervinientes obtiene un beneficio, mientras que el otro no se perjudica ni se beneficia. El término proviene del latín cum mensa, que significa ‘compartiendo la mesa’. Originalmente fue usado para describir el uso de comida de desecho por parte de un segundo animal, como los carroñeros que siguen a los animales de caza, pero esperan hasta que el primero termine de comer. Los individuos de una población aprovechan los recursos que les sobran a los de otra población. La especie que se beneficia es el comensal.
  • 13. Células eucariotas posen núcleo.  con membrana nuclear y mitocondria. Ejemplo: algas, los protozoarios, los hongos, y los mohos del cieno. Los virus no están ubicados ni en procariotas ni eucariotas ya que estos, dependen de la célula huésped para realizar las funciones vitales. Son parásitos intracelular obligados. Una partícula viral consiste en una molécula de ADN o RNA nunca las dos dentro de una cubierta proteínica o cápside.
  • 14. Priones es una proteína diferentes a viroides y virus Agente transmisible que causa Scrapie, una enfermedad degenerativa del sistema nervioso central de las ovejas
  • 15. Generalidades Microrganismos en sus ambientes  Ambiente: lo que rodea a un organismo viviente →  Factores físicos, químicos y biológicos.   Ecosistemas: comunidades de organismos transforman y modifican el ambiente
  • 16. Generalidades Todos los organismos de un ecosistema interaccionan con su medio y en algunos casos modifican enormemente, durante el proceso, las características del propio ecosistema. En un ecosistema microbiano las células individuales forman poblaciones. Las poblaciones relacionadas metabólicamente constituyen gremios y los conjuntos de gremios que llevan a cabo procesos fisiológicos complementarios interaccionan para formar comunidades microbianas. Estas comunidades interaccionan a su vez, con comunidades de macroorganismos y definen el conjunto de ecosistema. Diferentes microorganismos pueden convivir en una comunidad microbiana de una biopelícula, se observan formas de bastón corto, largo, curvo, cocos y sarcinas
  • 17.
  • 18. Generalidades  Superficies y biofilmes  Niveles de Nutrientes y velocidad de crecimiento  Competencia microbiana y cooperación  Métodos de enriquecimiento y aislamiento
  • 19. Ciclos Biogeoquímicos Cambios que experimenta un elemento químico a medida que se mueve en un ecosistema.   La ecología microbiana tiene dos grandes objetivos: - Apreciar la biodiversidad de los M.O. y entender la interacción entre los diferentes grupos que componen la comunidad. - Medir la actividad de los M.O. en la naturaleza y controlar sus efectos en el ecosistema.  
  • 20. Ecología es el estudio de los organismos en su ambiente El crecimiento de los M.O. en la naturaleza depende de los recursos disponibles (nutrientes) y de las condiciones de crecimiento (pH, T, humedad, luz, O2, etc. Los M.O. son muy pequeños por lo que sus hábitat también lo son. La teoría ecológica dice que para cada organismo existe al menos un nicho, que es el principal, aquel en el que crece mejor, pero también puede crecer en otros con menos éxito.
  • 21. El Microorganismo y su Microambiente Niveles nutritivos y velocidades de crecimiento   Superficie y biofilm   biofilm → adherencia a sólidos Los biofilmes son microcolonias de células bacterianas revestidas de células bacterianas adheridas a una superficie por medio de polisacáridos adhesivos excretados por las mismas células.   Ejemplos: En minerales en biolixiviacion, formación de la placa dental, corrosion de los barcos. Esta mucosidad de color marrón verdoso que se encuentra en adoquines del cauce en High Mineral Creek, Montana, es un biofilm.
  • 22. Relaciones de los Microrganismos en un microambiente Competencia entre M.O. en un ambiente natural Colaboración metabólica (sintrofía) Ejemplo NH3 + O2 → NO2 - Nitrosomonas NO2 - + O2 → NO3 - Nitrobacter
  • 23. Métodos de la Ecología Microbiana La biodiversidad que incluye aislamiento, identificación y cuantificación de los M.O. en diferentes hábitats. La actividad microbiana, lo que los M.O. hacen en su hábitat.
  • 24. mutualismo 1. Conjunto de asociaciones basadas en el régimen de la mutualidad. 2. biol Asociación de dos o más organismos de especies diferentes que supone beneficio para ambos.
  • 25.
  • 26. Mutualismo puede designar: En biología, el mutualismo es una interacción biológica o relación interespecífica temporal en que ambos organismos obtienen algún grado de beneficio;
  • 27. Relación Huésped- Microorganismo Modelos de Relación: Entre el huésped y el microorganismo puede darse una relación simbiótica. Simbiosis es cualquier relación o asociación íntima, a largo plazo, entre dos o más especies. Los miembros de la relación se denominan simbiontes. Existen tres tipos de simbiosis: Mutualismo: ambas partes se benefician. El ejemplo: el ser humano y las bacterias de la flora intestinal normal. Comensalismo: un organismo se beneficia y el otro no es perjudicado ni beneficiado. Parasitismo: uno de los miembros (el parásito), se beneficia, el otro (el huésped), se perjudica.
  • 28. Microambiente Natural La producción de células en el ambiente es mucho menor que en el laboratorio, debido a algunas características del medio natural: Disponibilidad de nutrientes, suele ser baja. La distribución de dichos nutrientes a lo largo del hábitat microbiano no suele ser uniforme. Salvo raras excepciones los microorganismos no se encuentran en cultivos axénicos en los medios naturales, por lo que deben competir por los nutrientes.
  • 29. Métodos de Enriquecimiento y Aislamiento  Se requiere un inóculo adecuado  Dar condiciones selectivas (inhibidores de algunos)  Existen numerosos métodos desarrollados para los diferentes tipos de M.O.  Métodos de cultivos líquidos y sólidos (agar)  Se ha demostrado que no todos los M.O. de un ecosistema son cultivables
  • 30. Columna de Widnogradsky Se diseñó en 1880 para estudiar M.O. anaeróbicos del suelo, pero representa un sistema útil para tener una reserva de diversos procariotas a largo plazo.
  • 31. Cultivo Axénico El objetivo del estudio de un cultivo de enriquecimiento es la obtención de un cultivo axénico (que contiene un único tipo de M.O.) Los métodos mas empleados son: Siembra por estrías* Tubo de agar Métodos por dilución *De una colonia bien aislada, y repitiendo el proceso varias veces, se puede traspasar a un medio líquido. Posteriormente se requiere hacer pruebas microscópicas y metabólicas para verificar pureza del cultivo.
  • 32. Identificación y Cuantificación de Microorganismos Los métodos de cultivo y cuantificación de células viables sólo medirán una fracción de la comunidad microbiana. Puede ser que los M.O. que se desea cuantificar sean no cultivables, en ese caso se requiere alguna técnica que pueda al menos detectar su presencia. Se han desarrollado métodos que se basan en la especificidad de los anticuerpos y otros en la secuencia de ácidos nucleicos.
  • 33. Tinción y anticuerpos fluorescentes. El uso de anticuerpos fluorescentes permite la identificación de un determinado M.O. los cuales se unen específicamente a constituyentes de la superficie celular. Se utilizan dos técnicas de tinción distintas de anticuerpos fluorescentes, la directa y la indirecta. En la directa es el propio anticuerpo contra el M.O. que es fluorescente.
  • 34. Identificación y Cuantificación de Microorganismos  Sondas de ácidos nucleicos: una sonda es un pequeño fragmento de DNA o RNA complementario, en secuencia de bases, a la parte de un gen con el cual puede hibridarse.  Algunas sondas emplean secuencias rRNA 16S como herramientas para diferenciar M.O. en ambientes naturales.  Actualmente se cuenta con una gran cantidad de secuencias de rRNA 16S por lo que es posible construir sondas muy específicas, capaces de diferenciar organismos dentro de un mismo dominio y también diferenciar entre especies en una misma muestra.
  • 35. Sondas de ácidos nucleicos para identificación de microorganismos: contraste de fase teñidas con sonda universal (RNAr) y teñidas con sonda eucariótica
  • 36. Uso de radioisotopos Se utilizan compuestos que contienen (C14 )   autótrofos 14 CO2 → células reductores SO4 = → H2 S35 metanogénicos 14 CO2 → 14 CH4 Quimiolitotróficos glucosa 14 C → incorp. C org. AA 14 C → incorp. C org. Uso de microelectrodos : pH, Oxigeno, H2S Mediciones de Actividad Microbiana
  • 37. Recordemos:   Cadena Respiratoria: Conjunto de reacciones que transfieren al Oxigeno el Hidrogeno y los electrones de cofactores reducidos, produciendo agua en el proceso y liberando energia que es usada para la sintesis de ATP.   Algunas veces se utilizan indistintamente los terminos Cadena de Transporte Electronico y Fosforilacion Oxidativa para referirse a la Cadena Respiratoria.