Diese Präsentation wurde erfolgreich gemeldet.
Wir verwenden Ihre LinkedIn Profilangaben und Informationen zu Ihren Aktivitäten, um Anzeigen zu personalisieren und Ihnen relevantere Inhalte anzuzeigen. Sie können Ihre Anzeigeneinstellungen jederzeit ändern.
Proteomics Entwicklungen  in der Massenspektrometrie
Proteomanalytik <ul><li>Extraktion aller Proteine </li></ul><ul><li>Fraktionierung </li></ul><ul><li>strukturelle Aufkläru...
Genom - Proteom Genom Nukleotidsequenz <ul><li>Proteom </li></ul><ul><li>Primärstruktur </li></ul><ul><li>übergeordnete St...
Probenvorbereitung <ul><li>Cell-Map Proteomics </li></ul><ul><li>Miniaturisierung: on-chip CE </li></ul><ul><li>Automatisi...
cell-map proteomics
Automatisierung der Probenvorb. <ul><li>Roboter schneiden Gelspots aus </li></ul><ul><li>automatischer enzymatischer Verda...
Miniaturisierung: on-chip CE
MS Kombinationen und Techniken <ul><li>Direkte Desorption </li></ul><ul><li>MALDI-TOF-TOF Leu/Ile Unterscheidung, m/z 4 Se...
IR-MPD Matthew C. Crowe and Jennifer S. Brodbelt, Journal of the American Society for Mass SpectrometryVolume 15, Issue 11...
FT-ICR-MS http://www.ivv.fraunhofer.de/ms/ms-analyzers.html
Datenbankabgleich <ul><li>Probleme </li></ul><ul><li>Geringe Spektrenqualität </li></ul><ul><li>Protein fehlt in der Daten...
Einschränkungen durch Proteineigenschaften <ul><li>Kurze Proteine/Peptide </li></ul><ul><li>Hydrophobe Proteine  </li></ul...
Literatur <ul><li>Lubec, G.; Afjehi-Sadat, L.  Chem. Rev.   2007 , 107, 3568 </li></ul><ul><li>Chalmers, J. C.; Gaskell, S...
Nächste SlideShare
Wird geladen in …5
×

Proteomics and Mass Spectrometry

1.062 Aufrufe

Veröffentlicht am

Veröffentlicht in: Technologie
  • Als Erste(r) kommentieren

  • Gehören Sie zu den Ersten, denen das gefällt!

Proteomics and Mass Spectrometry

  1. 1. Proteomics Entwicklungen in der Massenspektrometrie
  2. 2. Proteomanalytik <ul><li>Extraktion aller Proteine </li></ul><ul><li>Fraktionierung </li></ul><ul><li>strukturelle Aufklärung aller Proteine </li></ul><ul><li>Abgleich mit einer Datenbank </li></ul>
  3. 3. Genom - Proteom Genom Nukleotidsequenz <ul><li>Proteom </li></ul><ul><li>Primärstruktur </li></ul><ul><li>übergeordnete Strukturen </li></ul><ul><li>Wechselwirkungen </li></ul>
  4. 4. Probenvorbereitung <ul><li>Cell-Map Proteomics </li></ul><ul><li>Miniaturisierung: on-chip CE </li></ul><ul><li>Automatisierung: Roboter </li></ul>
  5. 5. cell-map proteomics
  6. 6. Automatisierung der Probenvorb. <ul><li>Roboter schneiden Gelspots aus </li></ul><ul><li>automatischer enzymatischer Verdau </li></ul><ul><li>Beladung in Mikrofläschchen </li></ul><ul><li>MALDI-TOF </li></ul><ul><li>⇒ 100 Proben in 3.5 Stunden </li></ul>
  7. 7. Miniaturisierung: on-chip CE
  8. 8. MS Kombinationen und Techniken <ul><li>Direkte Desorption </li></ul><ul><li>MALDI-TOF-TOF Leu/Ile Unterscheidung, m/z 4 Selektor </li></ul><ul><li>CE-TOF MS System 12.5 ms/Spektrum </li></ul><ul><li>ESI-Quadrupol-TOF 100 x empfindlicher ESI Qq </li></ul><ul><li>IR-MPD </li></ul>
  9. 9. IR-MPD Matthew C. Crowe and Jennifer S. Brodbelt, Journal of the American Society for Mass SpectrometryVolume 15, Issue 11, November 2004, Pages 1581-1592
  10. 10. FT-ICR-MS http://www.ivv.fraunhofer.de/ms/ms-analyzers.html
  11. 11. Datenbankabgleich <ul><li>Probleme </li></ul><ul><li>Geringe Spektrenqualität </li></ul><ul><li>Protein fehlt in der Datenbank </li></ul><ul><li>Datenbanken ändern sich täglich </li></ul><ul><li>Lösungsansatz </li></ul><ul><li>Randomized Databases </li></ul>
  12. 12. Einschränkungen durch Proteineigenschaften <ul><li>Kurze Proteine/Peptide </li></ul><ul><li>Hydrophobe Proteine </li></ul><ul><li>Isobare Aminosäuren </li></ul><ul><li>Homopolymere Bereiche </li></ul><ul><li>Hypothetische Proteine (HPs) </li></ul>
  13. 13. Literatur <ul><li>Lubec, G.; Afjehi-Sadat, L. Chem. Rev. 2007 , 107, 3568 </li></ul><ul><li>Chalmers, J. C.; Gaskell, S. J. Curr. Opin. Biotechnol. 2000 , 11, 384 </li></ul><ul><li>Witze, E. S.; Old, W. M; Resing, K. A.; Ahn, N. G. Nat. Methods 2007 , 10, 798 </li></ul>

×