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RETI COMPLESSE
PER L’ANALISI DI DATI ECONOMICI E BIOMEDICI
Roberto Bellotti
Dipartimento Interateneo di Fisica “M. Merlin”
Università degli Studi di Bari Aldo Moro & Politecnico di Bari
Istituto Nazionale di Fisica Nucleare
14 Novembre 2016
Indice
 Cosa sono i Big Data?
 Numeri ed Esempi
 Le 3 V
 Definizioni
 Popolazione vs Dispositivi
 Chi produce e raccoglie i Big Data?
 Cosa sono le Reti Complesse
 Casi di Studio
 Applicazioni ai Dati Economici
 Neuroscienze Computazionali
 Global Pulse e Sviluppo Sostenibile
 Big Data: serve il ferro!
 Conclusioni
2
1 bit = 0/1  Una lettera = 1 byte.
Un libro = una foto di buona qualità = circa 1 Megabyte.
1 Gibabyte = 1.000 libri
1 Terabyte = 1.000.000 di libri
Facebook:
500 Terabyte di dati al giorno, fanno parte di questi Terabyte circa 3 miliardi di “like”
e 300 milioni di foto.
Stima dei dati posseduti da FB: 100.000 Terabyte.
Google e Amazon  oltre un milione di Terabyte.
3
Numeri ed Esempi
Walmart registra più di 1 milione di
“operazioni” all’ora!
4
Generatori di Big Data
Un Boeing 737 genera, in un
viaggio attraverso gli Stati Uniti
circa 240 Terabytes di dati.
Il 90% dei dati registrati oggigiorno sono stati “generati” negli
ultimi due anni.
Cosa sono i Big Data?
Le tre V:
 Volume
 Varietà
 Velocità
 Glossario Gartner:
“Big data is high-Volume, high-Velocity and/or high-Variety information assets
that demand cost-effective, innovative forms of information processing that
enable enhanced insight, decision making, and process automation”.
 Big Data:
 Introdotto nel 2013 nell’Oxford English Dictionary
 Introdotto nel 2014 Merriam-Webster’s Collegiate
5
Definizioni
 Big Data is the result of collecting information at its most granular level — it’s
what you get when you instrument a system and keep all of the data that
your instrumentation is able to gather.
 Big data, which started as a technological innovation in distributed
computing, is now a cultural movement by which we continue to discover
how humanity interacts with the world — and each other — at large-scale.
 Big data is when your business wants to use data to solve a problem, answer
a question, produce a product, etc
 Historically, most decisions — political, military, business, and personal —
have been made by brains [that] have unpredictable logic and operate on
subjective experiential evidence. “Big data” represents a cultural shift in
which more and more decisions are made by algorithms with transparent
logic, operating on documented immutable evidence. I think “big” refers
more to the pervasive nature of this change than to any particular amount of
data.
[datascience.berkeley.edu/what-is-big-data/]6
Popolazione vs Dispositivi
7
Il McKinsey Global
Institute estimates
stima una crescita
del volume dei dati
prodotti pari al 40%
per anno e con un
fattore
moltiplicativo di 44
nel periodo 2009-
2020.
Quanti dispositivi
“connessi” possiede
ognuno di voi?
Terremoto e Colera ad Haiti nel 2010
Dopo il terremoto del gennaio 2010, ricercatori della Columbia University hanno
ricostruito il flusso di due milioni di rifugiati attraverso il “movimento” delle SIM dei
telefoni cellulari. La tecnica si è rivelato precisa ed utile per mitigare i rischi sanitari
(ottobre 2010, colera).
9
[L. Bengtsson et al.(2011) Improved Response to Disasters and Outbreaks by Tracking Population Movements
with Mobile Phone Network Data: A Post-Earthquake Geospatial Study in Haiti. PLoS Med 8(8)
I ricercatori hanno analizzato i dati di circa 2 milioni di SIM ad Haiti, da 42 giorni prima
del terremoto sino a 158 giorni dopo.
Durante l’epidemia di Colera sono state tracciate 140.000 SIM durante i primi 8 giorni
subito dopo lo scoppio dell’epidemia in modo da tracciare i flussi e i movimenti della
popolazione.
La precisione è funzione della diffusione delle antenne di ricezione ( 1–100 km2)
10
RETI COMPLESSE PER L’ECONOMIA
Dati, Progetti e Relazioni: il caso PON 2007 – 2013
Reti Complesse
Molti sistemi fisici, biologici e sociali sono strutturati come Reti Complesse e le loro
proprietà sono in moliti casi abbastanza ben comprese.
Le Reti Complesse sono un insieme di nodi, collegati da links
Ad esempio, lo Stato A è collegato allo Stato B se A importa prodotti da B
A
B
Esempi
12
• Reti dei trasporti
• Sistema climatico
• Reti di distribuzione
dell’energia
• Cervello
• Sistema economico
• Reti sociali
• …
Reti Complesse
13
Cosa possiamo imparare dalla analisi delle Reti Complesse?
Le dieci stazioni più
“attraversate” della
metropolitana londinese,
seguendo i “minimi
percorsi”.
Utilizzate per conoscere le persone più
influenti nelle reti sociali.
 Studio del profilo degli elettori e previsioni
dei risultati delle elezioni politiche
 Studio del profilo dei consumatori e del
modo in cui le informazioni sui nuovi
prodotti ed eventi si diffondono.
14
 Italian Program for the Convergence objective regions (less developed
regions in Southern Italy)
 (Program: National Operative Program (PON) for Project in research &
development)
 Goal: Evaluate the impact of public funding at regional level
Total cost of the PON Projects  2500 Million of Euros
About 300 Different R&D Projects 769 distinct partners
• Available information: Calls and funding measures, projects, proponents and
participants, funding, geographical information, etc.
• Data format: open data (xls, XLM, CSV)
• Source: : http://www.dati.puglia.it, http://opencoesione.gov.it
The Italian Public Funding Program (2007-2013)
8%#
12%#
12%#
16%#
12%#
7%#
21%#
12%#
Smart#Ci/ es#
Cultural#Heritage#&#Ac/ vi/ es#
Transporta/ on#&#Logis/ c#
Environment##
Energy#
Nutri/ on#
Healthcare#
N.C.#
28%#
7%#
2%#13%#12%#
19%#
13%#
6%#
Large#Enterprise#
noFPublic#Research#Ins/ tute#
N.C.#
Small#Enterprise#
Public#Research#Ins/ tute#
University#
Micro#Enterprise#
Medium#Enterprise#
(a)# (b)#
Analysis Workflow
15
Structured data
Data analysis
Results
Model
16
2007-2013 Italian Public Funding Program:
from dataset to data models.
769 Nodes  Enterprises, Universities,
research institutions.
4868 Links  Participation in the same
project.
Projects  10104 entries with 52
attributes describing project
information about program
references, activities, textual
description of project scope and
objectives, detail about partners
and so on.
Locations  11390 entries with
8 attributes describing details
about geographical localization of
project partners.
Budgets  5670 entries with 13
attributes describing details
about amount and state of
project funding.
17
We found 15 main Communities 
• provides a deep understanding of how the fund
allocation criteria are able to influence the
economic development of a Region;
• discovering the existence of groups within a
certain network of relationships;
• highlighting such groups can be very important
for the analysis of a productive system;
• The PON R&D network shows strongly
heterogeneous communities, with hugely
populated groups and very small ones.
• when communities grow in size, they tend to
include important nodes. For example, the
largest community includes the National
Research Council (CNR, next slide)
The community structure of the
(giant component of the) PON R&D
network. 15 communities are
highlighted, found with the Newman-
Girvan algorithm.
Result #1: community detection
18
Result #2: it is a network with Hubs
Scale free network 
• Inhomogeneous degree
distribution, with many nodes
having more connections than
the average (hubs)
• Resistance to “random failures”,
indeed the removal of a random
node would not systematically
affect the main hubs
• Policymakers are interested in
generating a solid network of
relationships between
productive actors on the
territory
Result #3: who are the hubs?
19
Centrality of nodes 
identifies the most important nodes
within a network
• Dominant role of public research
• Universities and research centers
play the role of the “glue” i.e. they
are responsible of the
connectedness of the network
• Ex-post indicator. The fifteen largest values of each vertex centrality
for the (giant component of the) PON R&D
network. The highest positions are occupied by
public research institutions.
Strong indication that the network of funded
project gravitates around large poles involving
research centers
20
• Low tendency to form “groups of interest" or “lobbies” among important actors.
• Hubs are strongly connected to smaller and less connected enterprises/institutions.
• It is an interesting result, since most social networks show assortative behavior.
• Anti-assortative networks are more sensitive to the removal of high-degree nodes,
which is an indication for the policymaker of the importance that public research
has in the productive system.
Result #4: the network is anti-assortative
Public
Research
Institute
Large
Enterprise
Small-Medium
Enterprise
21
Analisi di immagini cerebrali per la caratterizzazione
precoce di malattie neurodegenerative
Questi studi hanno messo in
evidenza alterazioni delle
proprietà topologiche locali e
globali della rete cerebrale
nei pazienti affetti da
Alzheimer.
 In che misura le Reti Complesse riescono rivelare e descrivere alterazioni
strutturali in immagini MRI?
 Le alterazioni trovate possono essere indicatori di una malattia
neurodegenerativa come l’Alzheimer?
 Possono coinvolgere regioni anatomiche tipicamente connesse alla malattia
di Alzheimer?
22
Nel 2015 UN ha definito e congelato i 17
Sustainable Development Goals (SDG) da
traguardare entro il 2030.
Il monitoraggio e l’analisi dei dati prodotti dagli
Stati membri per l’implementazione degli SDG
così come lo sviluppo di nuove tecnologie
connesse a tali obiettivi costituisce
un’eccezionale terreno di “sperimentazione”
dei Big Data e delle Reti Complesse.
unglobalpulse.org
[www.unglobalpulse.org/blog/big-data-development-action-global-pulse-project-series]
Global Pulse è un Laboratorio delle Nazioni Unite dedicato ai Big Data finalizzato
a generare una comprensione ed un miglioramento del benessere umano.
La visione sottesa è che i Big Data devono essere sfruttati come Bene Pubblico
23
The Sustainable Development Goals Proposal
Three main pillars of sustainable development
24
 Costo Complessivo del
Progetto: 13.7 milioni di euro
 Durata del Progetto: ottobre
2011 – dicembre 2015
ReCaS: 4 Data Center nelle sedi di:
Bari, Catania, Cosenza e Napoli
9 luglio 2015
Il Data Center ReCaS @ Bari
Il vento da ILVA verso il quartiere Tamburi (ARPA Puglia)
CONVENZIONE (2014 - 2017)
Area Portuale
ENI
CEMENTIR
Obiettivo primario: Identificazione con 72
ore di anticipo dei wind days (giorni con
condizione meteo favorevoli ad accumulo di
inquinanti - area di Taranto) ai sensi del
D.G.R. 1774 del Luglio 2012.
Con 64 processori la simulazione delle
condizioni fisiche necessarie all’identificazione
del wind day con 72 ore di anticipo richiede 4
ore di elaborazione. Si memorizzano circa 9
Terabyte all’anno.
Sfruttare la potenza di calcolo e di storage per
l’implementazione di complessi modelli di
fisica dell’atmosfera in modalità di calcolo
parallelo.
Gli output sono grandi volumi di dati
georeferenziati (serie spazio - temporali) 
complessa analisi finalizzata all’individuazione
del miglior setup dei modelli in una determinata
area.
.
26
Conclusioni
 I Big Data non sono il futuro ma il presente (o forse il passato).
 Prodotti & Servizi sono ormai “erogati” in stretta connessione con i “dati” che ne
permettono la successiva analisi: nessun contesto applicativo ne è escluso.
 Le Reti Complesse emergono come “tecnologia privilegiata” per la studio dei Big
Data, per loro natura altamente interconnessi e correlati.
 Molte sono le opportunità offerte dai Big Data, anche rispetto ai SDGs.
 Il Segretario Generale delle Nazioni Unite ha costituito nell’agosto 2014 un
Independent Expert Advisory Group per fornire raccomandazioni concrete sulla
“data revolution” rispetto allo Sviluppo Sostenibile.
 L’ecosistema nazionale - Imprese, Università, Enti Pubblici di Ricerca, Distretti, PA -
esprimono le competenze e l’organizzazione necessarie per partecipare con successo
alla “data revolution”?
Grazie per l’attenzione
roberto.bellotti@uniba.it
3386564596

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R. Bellotti, Reti complesse per l'analisi di dati economici e biomedici

  • 1. RETI COMPLESSE PER L’ANALISI DI DATI ECONOMICI E BIOMEDICI Roberto Bellotti Dipartimento Interateneo di Fisica “M. Merlin” Università degli Studi di Bari Aldo Moro & Politecnico di Bari Istituto Nazionale di Fisica Nucleare 14 Novembre 2016
  • 2. Indice  Cosa sono i Big Data?  Numeri ed Esempi  Le 3 V  Definizioni  Popolazione vs Dispositivi  Chi produce e raccoglie i Big Data?  Cosa sono le Reti Complesse  Casi di Studio  Applicazioni ai Dati Economici  Neuroscienze Computazionali  Global Pulse e Sviluppo Sostenibile  Big Data: serve il ferro!  Conclusioni 2
  • 3. 1 bit = 0/1  Una lettera = 1 byte. Un libro = una foto di buona qualità = circa 1 Megabyte. 1 Gibabyte = 1.000 libri 1 Terabyte = 1.000.000 di libri Facebook: 500 Terabyte di dati al giorno, fanno parte di questi Terabyte circa 3 miliardi di “like” e 300 milioni di foto. Stima dei dati posseduti da FB: 100.000 Terabyte. Google e Amazon  oltre un milione di Terabyte. 3 Numeri ed Esempi
  • 4. Walmart registra più di 1 milione di “operazioni” all’ora! 4 Generatori di Big Data Un Boeing 737 genera, in un viaggio attraverso gli Stati Uniti circa 240 Terabytes di dati. Il 90% dei dati registrati oggigiorno sono stati “generati” negli ultimi due anni.
  • 5. Cosa sono i Big Data? Le tre V:  Volume  Varietà  Velocità  Glossario Gartner: “Big data is high-Volume, high-Velocity and/or high-Variety information assets that demand cost-effective, innovative forms of information processing that enable enhanced insight, decision making, and process automation”.  Big Data:  Introdotto nel 2013 nell’Oxford English Dictionary  Introdotto nel 2014 Merriam-Webster’s Collegiate 5
  • 6. Definizioni  Big Data is the result of collecting information at its most granular level — it’s what you get when you instrument a system and keep all of the data that your instrumentation is able to gather.  Big data, which started as a technological innovation in distributed computing, is now a cultural movement by which we continue to discover how humanity interacts with the world — and each other — at large-scale.  Big data is when your business wants to use data to solve a problem, answer a question, produce a product, etc  Historically, most decisions — political, military, business, and personal — have been made by brains [that] have unpredictable logic and operate on subjective experiential evidence. “Big data” represents a cultural shift in which more and more decisions are made by algorithms with transparent logic, operating on documented immutable evidence. I think “big” refers more to the pervasive nature of this change than to any particular amount of data. [datascience.berkeley.edu/what-is-big-data/]6
  • 7. Popolazione vs Dispositivi 7 Il McKinsey Global Institute estimates stima una crescita del volume dei dati prodotti pari al 40% per anno e con un fattore moltiplicativo di 44 nel periodo 2009- 2020. Quanti dispositivi “connessi” possiede ognuno di voi?
  • 8.
  • 9. Terremoto e Colera ad Haiti nel 2010 Dopo il terremoto del gennaio 2010, ricercatori della Columbia University hanno ricostruito il flusso di due milioni di rifugiati attraverso il “movimento” delle SIM dei telefoni cellulari. La tecnica si è rivelato precisa ed utile per mitigare i rischi sanitari (ottobre 2010, colera). 9 [L. Bengtsson et al.(2011) Improved Response to Disasters and Outbreaks by Tracking Population Movements with Mobile Phone Network Data: A Post-Earthquake Geospatial Study in Haiti. PLoS Med 8(8) I ricercatori hanno analizzato i dati di circa 2 milioni di SIM ad Haiti, da 42 giorni prima del terremoto sino a 158 giorni dopo. Durante l’epidemia di Colera sono state tracciate 140.000 SIM durante i primi 8 giorni subito dopo lo scoppio dell’epidemia in modo da tracciare i flussi e i movimenti della popolazione. La precisione è funzione della diffusione delle antenne di ricezione ( 1–100 km2)
  • 10. 10 RETI COMPLESSE PER L’ECONOMIA Dati, Progetti e Relazioni: il caso PON 2007 – 2013
  • 11. Reti Complesse Molti sistemi fisici, biologici e sociali sono strutturati come Reti Complesse e le loro proprietà sono in moliti casi abbastanza ben comprese. Le Reti Complesse sono un insieme di nodi, collegati da links Ad esempio, lo Stato A è collegato allo Stato B se A importa prodotti da B A B
  • 12. Esempi 12 • Reti dei trasporti • Sistema climatico • Reti di distribuzione dell’energia • Cervello • Sistema economico • Reti sociali • …
  • 13. Reti Complesse 13 Cosa possiamo imparare dalla analisi delle Reti Complesse? Le dieci stazioni più “attraversate” della metropolitana londinese, seguendo i “minimi percorsi”. Utilizzate per conoscere le persone più influenti nelle reti sociali.  Studio del profilo degli elettori e previsioni dei risultati delle elezioni politiche  Studio del profilo dei consumatori e del modo in cui le informazioni sui nuovi prodotti ed eventi si diffondono.
  • 14. 14  Italian Program for the Convergence objective regions (less developed regions in Southern Italy)  (Program: National Operative Program (PON) for Project in research & development)  Goal: Evaluate the impact of public funding at regional level Total cost of the PON Projects  2500 Million of Euros About 300 Different R&D Projects 769 distinct partners • Available information: Calls and funding measures, projects, proponents and participants, funding, geographical information, etc. • Data format: open data (xls, XLM, CSV) • Source: : http://www.dati.puglia.it, http://opencoesione.gov.it The Italian Public Funding Program (2007-2013) 8%# 12%# 12%# 16%# 12%# 7%# 21%# 12%# Smart#Ci/ es# Cultural#Heritage#&#Ac/ vi/ es# Transporta/ on#&#Logis/ c# Environment## Energy# Nutri/ on# Healthcare# N.C.# 28%# 7%# 2%#13%#12%# 19%# 13%# 6%# Large#Enterprise# noFPublic#Research#Ins/ tute# N.C.# Small#Enterprise# Public#Research#Ins/ tute# University# Micro#Enterprise# Medium#Enterprise# (a)# (b)#
  • 16. 16 2007-2013 Italian Public Funding Program: from dataset to data models. 769 Nodes  Enterprises, Universities, research institutions. 4868 Links  Participation in the same project. Projects  10104 entries with 52 attributes describing project information about program references, activities, textual description of project scope and objectives, detail about partners and so on. Locations  11390 entries with 8 attributes describing details about geographical localization of project partners. Budgets  5670 entries with 13 attributes describing details about amount and state of project funding.
  • 17. 17 We found 15 main Communities  • provides a deep understanding of how the fund allocation criteria are able to influence the economic development of a Region; • discovering the existence of groups within a certain network of relationships; • highlighting such groups can be very important for the analysis of a productive system; • The PON R&D network shows strongly heterogeneous communities, with hugely populated groups and very small ones. • when communities grow in size, they tend to include important nodes. For example, the largest community includes the National Research Council (CNR, next slide) The community structure of the (giant component of the) PON R&D network. 15 communities are highlighted, found with the Newman- Girvan algorithm. Result #1: community detection
  • 18. 18 Result #2: it is a network with Hubs Scale free network  • Inhomogeneous degree distribution, with many nodes having more connections than the average (hubs) • Resistance to “random failures”, indeed the removal of a random node would not systematically affect the main hubs • Policymakers are interested in generating a solid network of relationships between productive actors on the territory
  • 19. Result #3: who are the hubs? 19 Centrality of nodes  identifies the most important nodes within a network • Dominant role of public research • Universities and research centers play the role of the “glue” i.e. they are responsible of the connectedness of the network • Ex-post indicator. The fifteen largest values of each vertex centrality for the (giant component of the) PON R&D network. The highest positions are occupied by public research institutions. Strong indication that the network of funded project gravitates around large poles involving research centers
  • 20. 20 • Low tendency to form “groups of interest" or “lobbies” among important actors. • Hubs are strongly connected to smaller and less connected enterprises/institutions. • It is an interesting result, since most social networks show assortative behavior. • Anti-assortative networks are more sensitive to the removal of high-degree nodes, which is an indication for the policymaker of the importance that public research has in the productive system. Result #4: the network is anti-assortative Public Research Institute Large Enterprise Small-Medium Enterprise
  • 21. 21 Analisi di immagini cerebrali per la caratterizzazione precoce di malattie neurodegenerative Questi studi hanno messo in evidenza alterazioni delle proprietà topologiche locali e globali della rete cerebrale nei pazienti affetti da Alzheimer.  In che misura le Reti Complesse riescono rivelare e descrivere alterazioni strutturali in immagini MRI?  Le alterazioni trovate possono essere indicatori di una malattia neurodegenerativa come l’Alzheimer?  Possono coinvolgere regioni anatomiche tipicamente connesse alla malattia di Alzheimer?
  • 22. 22 Nel 2015 UN ha definito e congelato i 17 Sustainable Development Goals (SDG) da traguardare entro il 2030. Il monitoraggio e l’analisi dei dati prodotti dagli Stati membri per l’implementazione degli SDG così come lo sviluppo di nuove tecnologie connesse a tali obiettivi costituisce un’eccezionale terreno di “sperimentazione” dei Big Data e delle Reti Complesse. unglobalpulse.org [www.unglobalpulse.org/blog/big-data-development-action-global-pulse-project-series] Global Pulse è un Laboratorio delle Nazioni Unite dedicato ai Big Data finalizzato a generare una comprensione ed un miglioramento del benessere umano. La visione sottesa è che i Big Data devono essere sfruttati come Bene Pubblico
  • 23. 23 The Sustainable Development Goals Proposal Three main pillars of sustainable development
  • 24. 24  Costo Complessivo del Progetto: 13.7 milioni di euro  Durata del Progetto: ottobre 2011 – dicembre 2015 ReCaS: 4 Data Center nelle sedi di: Bari, Catania, Cosenza e Napoli 9 luglio 2015 Il Data Center ReCaS @ Bari
  • 25. Il vento da ILVA verso il quartiere Tamburi (ARPA Puglia) CONVENZIONE (2014 - 2017) Area Portuale ENI CEMENTIR Obiettivo primario: Identificazione con 72 ore di anticipo dei wind days (giorni con condizione meteo favorevoli ad accumulo di inquinanti - area di Taranto) ai sensi del D.G.R. 1774 del Luglio 2012. Con 64 processori la simulazione delle condizioni fisiche necessarie all’identificazione del wind day con 72 ore di anticipo richiede 4 ore di elaborazione. Si memorizzano circa 9 Terabyte all’anno. Sfruttare la potenza di calcolo e di storage per l’implementazione di complessi modelli di fisica dell’atmosfera in modalità di calcolo parallelo. Gli output sono grandi volumi di dati georeferenziati (serie spazio - temporali)  complessa analisi finalizzata all’individuazione del miglior setup dei modelli in una determinata area. .
  • 26. 26 Conclusioni  I Big Data non sono il futuro ma il presente (o forse il passato).  Prodotti & Servizi sono ormai “erogati” in stretta connessione con i “dati” che ne permettono la successiva analisi: nessun contesto applicativo ne è escluso.  Le Reti Complesse emergono come “tecnologia privilegiata” per la studio dei Big Data, per loro natura altamente interconnessi e correlati.  Molte sono le opportunità offerte dai Big Data, anche rispetto ai SDGs.  Il Segretario Generale delle Nazioni Unite ha costituito nell’agosto 2014 un Independent Expert Advisory Group per fornire raccomandazioni concrete sulla “data revolution” rispetto allo Sviluppo Sostenibile.  L’ecosistema nazionale - Imprese, Università, Enti Pubblici di Ricerca, Distretti, PA - esprimono le competenze e l’organizzazione necessarie per partecipare con successo alla “data revolution”? Grazie per l’attenzione roberto.bellotti@uniba.it 3386564596