LA INFORMÁTICA EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA. RECURSOS INFORMÁTICOS PARA LA ORGANIZACIÓN DEL LABORATORIO CLÍNICO Y EMISIÓN DE RESULTADOS.

1. Asignatura:
Laboratorio Clínico en Microbiología (Curso 2007 – 2008)
Facultad de Biología (Licenciatura en Bioquímica)
LA INFORMÁTICA EN EL
LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA.
RECURSOS INFORMÁTICOS PARA LA
ORGANIZACIÓN DEL LABORATORIO
Y EMISIÓN DE RESULTADOS
TEMA 15 2ª parte

2. Microbiología e Informática:
RECURSOS
► Aplicaciones informáticas de uso general
► Redes de comunicación. Internet y sus
aplicaciones
► Aplicaciones específicas en microbiología
clínica: Gestión de la información
► Otros recursos de interés

3. RED DE COMUNICACIÓN
Una red es un conjunto de ordenadores autónomos conectados
entre sí, que pueden comunicarse compartiendo datos y recursos
sin importar la localización física de los distintos dispositivos.
A través de una red se pueden ejecutar procesos en otro orde-
nador o acceder a sus ficheros, enviar mensajes, compartir
programas...
Los ordenadores suelen estar conectados entre sí, por cables, en
diferentes formas (topologías). Pero si la red abarca una región
extensa, las conexiones pueden realizarse a través de líneas
telefónicas, microondas, líneas de fibra óptica e incluso satélites.

4. Nacional
Internacional
CLASIFICACIÓN DE LAS REDES DE
COMUNICACIÓN SEGÚN ESCALA DE
COBERTURA
► LAN (Local Area Networks)
► MAN (Metropolitan Area Networks)
► WAN (Wide Area Networks)

5. TRANSMISIÓN DE DATOS Y TOPOLOGÍA DE
REDES EN INTERNET
• Se realiza a través de nodos.
• Nodo: Dispositivo activo o que interviene en la comunicación de
forma autónoma y que está conectado a una red, conectándose
desde el más próximo al más remoto.
TRANSMISIÓN DE DATOS
TOPOLOGÍA DE REDES
Anillo Estrella BUS (Lineal)
Híbrida

6. Microbiología e Informática:
RECURSOS
► Aplicaciones informáticas de uso general
► Redes de comunicación. Internet y sus
aplicaciones
► Aplicaciones específicas en microbiología
clínica: Gestión de la información
► Otros recursos de interés

7. APLICACIONES DE INTERNET
• WWW (World Wide Web)
• Correo electrónico “e-mail”
• Conexión remota a otro ordenador (Telnet)
• Protocolo de transferencia de ficheros (FTP)
• Archie o FTPsearch
• Conversaciones en tiempo real
• Otras aplicaciones en internet

8. WWW (World Wide Web)
• Utilizan el sistema de HIPERTEXTO, que funciona a través de internet,
extrayendo información de los servidores para verla en pantalla.
• Para ver la información se utilizan navegadores web (Internet Explorer,
Netscape, Opera, Mozilla, etc.).
• Para encontrar la información se utilizan buscadores (Google, Yahoo,
Altavista, Lycos, etc. ).
• Los servidores contienen elementos de información, páginas web, de
contenido muy variable.
• En las páginas web hay hiperenlaces que pueden seguirse y enviarnos
a otro documentos y enviar información al servidor.
• Navegar es seguir hiperenlaces.
• Su funcionalidad se basa en tres recursos: URL (Localizador Uniforme
de Recursos); HTTP (Protocolo de Transferencia de HiperTexto) y HTML
(Lenguaje de Marcación de HiperTexto).

9. Correo electrónico “e-mail”
• Servicio de red que permite intercambiar mensajes, a largas distancias,
incluso con acuse de recibo, entre usuarios así como ficheros en forma
de paquetes adjuntos.
• Intermediados por servidores que hacen de “buzones” y recojen los
mensajes que se les envían.
• Se requiere conexión con un servidor o proveedor de servicios.
• Proveedores de servicios: Redes de entidades privadas y/o públicas,
Gmail, Hotmail, Yahoo, etc.
• Tipos: Webmail (acceso a través de WWW por navegador) y POP3
(mediante programas clientes de correo).
• Programas clientes de correo: Outlook, Eudora, Incredimail, Pegasus; y
constan de: procesador de textos, base de datos, administrador de
archivos y módulo de comunicaciones.
• Desventajas: Inseguridad, lentitud para mensajes largos.

10. Conexión remota a otro ordenador
(Telnet)
• Programa intermediario para conectarse directa-
mente con nuestro ordenador (terminal local) a otro
ordenador (terminal remoto), servidor o no, a través
de internet.
• Podremos utilizar todos los servicios que ofrezca el
terminal remoto.
• Debemos identificarnos en el terminal remoto
(usuario y contraseña).

11. Protocolo de transferencia de ficheros
(FTP)

12. Archie o FTPsearch
• Sistema para la localización de información sobre archivos
y directorios, muy unido al servicio FTP.
• Es como una gran base de datos donde se encuentran
registrados una gran cantidad de nombres de archivos y
sus servidores FTP.
• Estos localizadores (Veronica, otro FTP Search) han sido ya
reemplazados por la WWW.

13. Conversaciones en tiempo real IRC
(Chat)
• La abreviatura IRC responde al término Internet Relay Chat,
un sistema de comunicación en vivo que te permite
mantener conversaciones, casi en tiempo real, con otros
usuarios.
• IRC ofrece diferentes canales (generalmente varios miles) y
cada canal trata un determinado tema o está compuesto por
un determinado círculo de participantes.
• Hoy existen más de 150 servidores IRC, todos conectados
entre sí, a los que se conectan en todo mundo muchos
miles de usuarios.
• Para acceder a este servicio hemos de utilizar: Comic Chat
o NetChat , Netmeeting, Cuseeme, Messenger, etc.
• De este servicio derivan la Audioconferencia y la Videocon-
ferencia.

14. Otras aplicaciones en internet
• Grupos de noticias o Newsgroups
 Intercambios de opiniones entre usuarios
 Envío de noticias al buzón por e-mail
 Configurar cuenta para conexión con servidor News
• Listas de distribución
 Sin conexión a servidor News
 Servicio tras envío de petición por e-mail
• Foros de debate o tablones de anuncios virtuales
 Se depositan ideas en un servidor web a donde hay que
acudir para leerlas.

15. Microbiología e Informática:
RECURSOS
► Aplicaciones informáticas de uso general
► Redes de comunicación. Internet y sus
aplicaciones
► Aplicaciones específicas en microbiología
clínica: Gestión de la información
► Otros recursos de interés

16. Gestión de la información:
REQUISITOS
• ¿Qué espera el médico del microbiólogo clínico?
 Una información apropiada en cada caso
 Un resultado para ayuda a su decisión clínica
 Una respuesta rápida
 Un acceso fácil a los resultados preliminares y/o definitivos
 Una interpretación de los resultados:
 Si la flora es normal o patológica
 Si la muestra es representativa de la lesión
 Si la sensibilidad bacteriana tiene características epidemiológicas
especiales
 Si los valores de antígenos y/o anticuerpos son indicativos de
enfermedad
 Si son necesarios estudios complementarios
 Una información completa sobre nuevas técnicas de diagnóstico
y de datos epidemiológicas que puedan afectar a sus decisiones
terapéuticas

17. • ¿Qué espera el microbiólogo clínico del médico?
 Conocer los datos identificativos del paciente
 Conocer los datos identificativos del peticionario
 Conocer, con precisión, el origen de la muestra
 Conocer, con precisión, el tipo de muestra
 Conocer el diagnóstico clínico de sospecha
 Conocer los síntomas y signos
 Conocer la terapia antibiótica previa
Gestión de la información:
REQUISITOS

18. Preanalítica
Analítica
Postanalítica
Otras
FASES de los procesos desarrollados en un
Laboratorio Clínico de Microbiología.

19. Preanalítica
Analítica
Postanalítica
Otras
FASES de los procesos desarrollados en un
Laboratorio Clínico de Microbiología.

20. Requisitos de la fase preanalítica
• Fase preanalítica:
 Catálogo de estudios o pruebas (Cartera de servicios) con
una relación y descripción de los estudios y pruebas que
pueden practicarse a cada muestra
 Normas de selección recogida y transporte de cada
muestra
 Formularios de petición de pruebas: Diferentes tipos
 Emisión del identificador de muestra y formulario
 Identificación de muestra, formulario
 Emisión de identificador de pruebas y determinaciones
 Lectura automatizada de los identificadores

21. Relación y descripción de los estudios y pruebas
que pueden practicarse a cada muestra
 Definición
 Sinónimos
 Técnica que se aplica
 Indicaciones
 Valores de referencia
 Interpretación de los resultados
 Sección responsable
 Plazos de entrega de resultados
 Coste
 Código de identificación

22. Selección, recogida y transporte de la muestra
 Características de la muestra
 Recogida de la muestra:
► Técnicas de recogida:
 Momento adecuado de la recogida
 Envase o recipiente
 Nº de muestras necesarias e intervalo entre las mismas
 Calidad de la muestra
 Cantidad máxima y mínima
 Instrucciones para el paciente
► Transporte y conservación:
 Plazos entre recogida y entrega
 Temperatura de conservación
 Sistema de transporte
 Adición de conservantes

23. Formularios de petición de pruebas
• Datos mínimos demográficos
• Médico solicitante
• Información clínica relevante
• Descripción de la muestra
• Pruebas que se solicitan
• Fecha y hora de recogida de la muestra

32. Preanalítica
Analítica
Postanalítica
Otras
FASES de los procesos desarrollados en un
Laboratorio Clínico de Microbiología.

33. Fase analítica.
Procedimientos o determinaciones
 Examen directo de la muestra
 Cultivo e identificación de microorganismos
 Pruebas de sensibilidad a antimicrobianos
 Detección de antígenos microbianos en muestras clínicas
 Detección de anticuerpos
 Microbiología molecular
 Envío de muestras o microorganismos a centros de referencia
 Archivo y custodia de microorganismos
 Validación de resultados

39. Preanalítica
Analítica
Postanalítica
Otras
FASES de los procesos desarrollados en un
Laboratorio Clínico de Microbiología.

40. Fase postanalítica.
Informe de los resultados
 Datos del informe:
 Identificación del paciente
 Destino del informe
 Muestra analizada con el número de registro
 Fecha y hora de recepción de la muestra
 Prueba solicitada
 Procedimiento, método o técnica aplicada
 Fecha y hora de emisión del informe
 Categoría del informe: urgente, provisional, …..
 Firma electrónica
 Elementos del informe:
 Examen directo de la muestra
 Identificación y cuantificación de microorganismos
 Pruebas de sensibilidad a antimicrobianos
 Detección de antígenos microbianos
 Pruebas de microbiología molecular
 Detección de anticuerpos
 Comentarios

42. CONSULTA “on line” VÍA WEB