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GOVERNO DO ESTADO DO PIAUÍ
    INSTITUTO DE DOENÇAS TROPICAIS NATAN PORTELLA
    LABORATÓRIO DE PESQUISAS EM LEISHMANIOSE




Estrutura e conteúdo genômico
        de Leishmania


         Lívio Figueirêdo, Dr.

                                                    1
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania

    Tamanho do genoma e número de cromossomos
      −   Leishmania major MHOM/IL/Friedlin (LmjF)
            
              32,8 megabases (Mb) de DNA nuclear
            
              36 cromossomos
      −   L. infantum JPCM5 (MCAN/ES/98/LLM-877) (LinJ)
            
              32,1 megabases (Mb) de DNA nuclear
            
              36 cromossomos
      −   L. (Viannia) braziliensis clone LB2904
          (MHOM/BR/75M2904) (LbrM)
            
              32,0 megabases (Mb) de DNA nuclear
            
              35 cromossomos

                                                          2
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania

    Organização genômica
      −   Organizado em grandes agrupamentos gênicos policistrônicos
          (PGCs)
      −   Os arranjos repetidos de genes de rRNA estão presentes entre
          os PGCs
      −   A maioria dos genes de tRNA são organizados em
          agrupamentos de 2 a 10 genes, localizados nos limites dos
          PGCs
      −   A maioria dos genes não possuem íntrons (cis-splicing
          somente na poli(A) polimerase)




                                                                         3
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania

    Sequências repetitivas
      −   Poucas sequências repetitivas (<10%)
      −   As extremidades dos cromossomos com arranjos repetidos de
          hexâmeros teloméricos múltiplos (ACCCTA)
      −   Regiões subteloméricas compostas por elementos repetitivos
          variáveis (maior parte do polimorfismo)

    Retroelementos
      −   Retroelementos degenerados inativos
      −   L. braziliensis possui de 20-30 elementos transponíveis
          associados a telômero (TATEs) e retroelementos associados a
          spliced leader (SLACs)


                                                                        4
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania




                                              5
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania




                                              6
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania




                                              7
Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania




                                              8
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Estrutura e conteúdo genômico Leishmania

  • 1. GOVERNO DO ESTADO DO PIAUÍ INSTITUTO DE DOENÇAS TROPICAIS NATAN PORTELLA LABORATÓRIO DE PESQUISAS EM LEISHMANIOSE Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania Lívio Figueirêdo, Dr. 1
  • 2. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania  Tamanho do genoma e número de cromossomos − Leishmania major MHOM/IL/Friedlin (LmjF)  32,8 megabases (Mb) de DNA nuclear  36 cromossomos − L. infantum JPCM5 (MCAN/ES/98/LLM-877) (LinJ)  32,1 megabases (Mb) de DNA nuclear  36 cromossomos − L. (Viannia) braziliensis clone LB2904 (MHOM/BR/75M2904) (LbrM)  32,0 megabases (Mb) de DNA nuclear  35 cromossomos 2
  • 3. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania  Organização genômica − Organizado em grandes agrupamentos gênicos policistrônicos (PGCs) − Os arranjos repetidos de genes de rRNA estão presentes entre os PGCs − A maioria dos genes de tRNA são organizados em agrupamentos de 2 a 10 genes, localizados nos limites dos PGCs − A maioria dos genes não possuem íntrons (cis-splicing somente na poli(A) polimerase) 3
  • 4. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania  Sequências repetitivas − Poucas sequências repetitivas (<10%) − As extremidades dos cromossomos com arranjos repetidos de hexâmeros teloméricos múltiplos (ACCCTA) − Regiões subteloméricas compostas por elementos repetitivos variáveis (maior parte do polimorfismo)  Retroelementos − Retroelementos degenerados inativos − L. braziliensis possui de 20-30 elementos transponíveis associados a telômero (TATEs) e retroelementos associados a spliced leader (SLACs) 4
  • 5. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania 5
  • 6. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania 6
  • 7. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania 7
  • 8. Estrutura e conteúdo genômico de Leishmania 8