1. Plate-forme de Recherche Clinique
en CYTOMIQUE
Biomarqueurs cellulaires innovants
CPER: Innovations thérapeutiques et Technologies de
la Santé (ITTS-CIC-B)
Plateau technique au sein du Pôle Laboratoires
du CHUN (Pr F Plenat) dédié à la recherche
clinique et translationnelle
Mutualisation des compétences
Complémentarités humaines et technologiques
Ouverture régionale et interrégionale
Ensemble type « Flow cytometry core
facility »
Cytométrie en flux multiparamétrique
Cell Search Veridex
Image Stream System (Amnis)
Charte et soumission IBiSA
2. Cytométrie de flux multiparamétrique
Navios (Beckman Coulter)
Software Kaluza
CMF 3 lasers 10 couleurs
Laboratoire d’Immunologie (Pr GC FAURE, Pr MC BENE, Dr M de
CARVALHO)
Service d’Hématologie biologique (Pr T LECOMPTE, Dr V
LATGER)
Unité de thérapie cellulaire et tissulaire (Pr JF STOLTZ, Pr A
DALLOUL)
Anatomopathologie (Pr F PLENAT, Dr K MONTAGNE)
3. Cancéropole
Cytométrie de flux multiparamétrique
Evénements rares et populations discrètes
Onco-Hématologie
NoE European Leukemia Net
STIC DHOS Maladie résiduelle (LAL, LAM)
Maladie Résiduelle LLC
Myélodysplasies
Projet INCA SIGLAM
Phase périphérique des LMNH
Réponse immunitaire anti-tumorale et thérapie
cellulaire
Tregs, cellules dendritiques, cellules NK
Microparticules et cellules endothéliales
4. Cytométrie de flux multiparamétrique (2)
MC Béné, au nom du GEIL, GTLLF, GOELAMS
Moelle normale
Maladie résiduelle
valorisation démarche détection et quantification
d’événements rares
au sein des « bermudes »
CD34 CD45
CD13 SSC
5.
6. Cytométrie de flux
multparamétrique (2)
Réponse immunitaire anti-
tumorale spécifique (M de
Carvalho, P Eschwege + …)
Antigènes candidats (cancer
prostate)
Problématique: événements rares
+ caractérisation
multiparamétrique phénotypique
et fonctionnelle de sous
populations cellulaires
Signatures cytokiniques
Transfert de l’expérience
acquise dans la réponse
spécifique anti-mycobacterium
tuberculosis et anti-adenovirus
7. Cytométrie de flux
multiparamétrique (3)
Microparticules, thrombose et cancer (V Latger-
Cannard, Th Lecompte)
Standardization of platelet-derived
microparticle counting using calibrated beads
and a Cytomics FC500 routine flow cytometer
: a first step towards multicenter studies?
Robert S, Poncelet P, Lacroix R, Arnaud L,
Giraudo L, Hauchard A, Sampol J, Dignat-
George F.
J Thromb Haemost. 2009 Jan;7(1):190-7. Epub
2008 Oct 18.
8. Cell Search Veridex®
Combinaison de méthodes
Immunologiques spécifiques
Séparation immunomagnétique
Quantification en imagerie photonique automatisée
Standardisation et automatisation de la phase
préparative
Très grande sensibilité (5 évts/tube de 7,5mL)
soit #10-7
outil de choix pour l'étude des cellules
endothéliales circulantes en recherche clinique.
Validation antérieure en recherche clinique
pour les cellules tumorales circulantes pour des
études pronostiques.
Capacités d’isolement des cellules en vue
d’études moléculaires complémentaires
9. Projets Cell Search
Cancéropole et au-delà…
Cellules Tumorales Circulantes (CTCs)
Sein (CIC Cancérologie CHU-CLCC E Luporsi –
GSK/NOVARTIS – INCA?)
Poumon
AO Cancer 2009 Région Lorraine, Nancy Y Martinet,
JM Vignaud comparaison ISET STIC Nice, Strasbourg P
Oudet, M Beau-Faller
Prostate (Nancy Urologie: J Hubert, P Eschwege; Paris: S
Loric LIBM)
Validation clinique en réseau interrégional, national, voire
européen (IMI?)
Cellules Endothéliales Circulantes (CECs)
Thérapies antiangiogéniques
Inflammations: sepsis (CPRC S Gibot)
Neuroectodermoses: Sclérose tubéreuse de Bourneville (J
Hubert, Necker)
10. Cell search CTCs (1)
CERONC – Poumon (Y Martinet, E Quoix,
M Beau-Faller, P Oudet)
Evaluation de l’intérêt clinique de la détection
des cellules tumorales circulantes dans le
cancer bronchique métastatique
Avec ajout de marqueurs d’intérêt (X)
Isolement des cellules en vue d’études
moléculaires
CERONC – Prostate (P Eschwege, J
Hubert, D Peiffert)
Evaluation préthérapeutique
11. Cell Search CECs (2)
Projet Sepsis
CPRC CHU Nancy (Pr S Gibot, GCF)
Quantification des CEC
Isolement des CECs pour études
moléculaires
Projet STB (Sclérose Tubéreuse de Bourneville)
Evaluation des CECs comme biomarqueurs
d’angiogénèse pour l’évaluation et le suivi des
tumeurs vasculaires rénales
Demande en cours ASTB, PHRC maladies rares
(GCF, Pr J Hubert, Necker – D Joly, Lyon – O
Rouvière)
12. Imagerie en flux
Image stream X AMNIS®
Le système AMNIS®, système d’imagerie en flux
combinant cytométrie en flux et imagerie photonique
Observation directe, de la localisation
précise, cellule par cellule, des marqueurs
fluorescents utilisés pour identifier:
membrane, organites intracellulaires, noyau.
Parmi les applications réalisables en simultané
Marquages membranaires multiples et colocalisation de
marqueurs de surface
Marquages nucléaires (FISH en suspension)
Translocation nucléaire, apoptose
Etudes fonctionnelles
Coopérations cellulaires (synapse immunologique)
13. Image stream X AMNIS
Applications…. etc
Biologie cellulaire – Immunologie
Cancérologie
Cycle Cellulaire
Signalisation Cellulaire Analyse Morphologique
Mort cellulaire
Dommage de l’ADN
Interactions cellulaires
14. Plate-forme de recherche clinique
en CYTOMIQUE
Biomarqueurs cellulaires innovants
CPER: Innovations thérapeutiques et Technologies de
la Santé (ITTS-CIC-B)
Plateau technique au sein du Pôle Laboratoires
du CHUN (Pr F Plenat; REDIF: Pr Th Lecompte;
CIC-B Pr GC Faure) dédié à la recherche clinique
Mutualisation des compétences
Complémentarités humaines et technologiques
Ouverture régionale et interrégionale
Ensemble type « Flow cytometry core
facility »
Cytométrie en flux multiparamétrique
Cell Search Veridex
Image Stream System (Amnis)
Charte et soumission IBiSA
Human Whole Blood Translocation experiment
O:\2009 Data\050209 G2A1 whole blood DM NFkB 6color
050209 G2A1 whole blood DM + LPS 6C 60X_17_48nofs_1.daf
050209 G2A1 whole blood DM 6C 60X_17_48nofs_1.daf
Background and purpose
NFkB translocation is an important indicator of blood cell activation, and is an important therapeutic target for the treatment of autoimmunity, cancer, and infectious diseases. To date, it has not been possible to robustly measure NFkB translocation directly in whole blood leukocytes. Here we show a simple method of quantifying NFkB activation in immunophenotypically-defined whole blood leukocytes using the ImageStream
Method
1 – stimulate whole blood with 100 ng/mL LPS
2 – stain for surface markers on ice
PE-CD14, PE-TR-CD45, AF647-CD16, APCAF750-CD3
3 – Fix/lyse/perm and stain for NFkB (FITC) and DAPI
4 – ImageStream: collect 20,000 events at 60X
5 – Analyze leukocyte subsets for NFkB translocation
How many cells are needed – this slide illustrates the confidence in interpreting the extent of nuclear translocation in a sample exhibiting incomplete activation.
These are LPS stimulated human monocyte line THP-1 stained with FITC NFkB (green) and 7-AAD (nuclear dye, red). Histogram plots the per cell ‘degree of translocation’ score for the sample. As described in detail later, this is the ‘Similarity’ score for the NFkB / 7-AAD image pair.