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TEMAS                                                     DE                            BIOLOGIA
        PROPOSTAS                           PARA              DESENVOLVER                             EM       SALA DE AULA
         NÚMERO 7                                             JANEIRO DE 1998                                     EDITORA MODERNA

                                       TRABALHANDO
                                                 TEMAS FUNDAMENTAIS:
                                  CÓDIGO GENÉTICO E SÍNTESE DE PROTEÍNAS
                                                                                 *
                                                               J. M. Amabis e G . R. Martho




    U
             m dos assuntos que mais desafiam o professor de ensino médio é o mecanismo de fabricação das proteínas sob
             o comando dos genes, ou seja, o sistema de codificação genética e suas implicações. Para entendê-lo, além de
             conhecer as estruturas dos ácidos nucléicos e das proteínas, os estudantes têm de ser capazes de relacionar seqüências
    de bases do DNA com o fenótipo do organismo, o que exige grande esforço de abstração. Pensando nisso, apresentamos duas
    atividades que tornam mais concreto o sistema de codificação genética e que, por seus aspectos lúdicos, motivam os
    estudantes a aprender esse tema, de fundamental importância para a compreensão do fenômeno da vida.


     A decifração do código genético por Nirenberg, Ochoa e                                A maioria dos genes transcreve suas informações para
Khorana, no início de 1960, foi uma das mais espetaculares                           moléculas de RNA mensageiro. Estas, por sua vez, comandam
descobertas científicas do século XX. O código genético é um                         a síntese das proteínas celulares.
sistema de armazenamento de informações hereditárias, as                                   O RNA mensageiro contém suas informações organiza-
quais comandam todo o funcionamento celular. A decifração                            das em trincas de bases, os códons. Cada códon corresponde
do código genético mostrou que o controle do metabolismo                             a um aminoácido, e a seqüência de códons determina a seqüên-
das células é fundamentalmente o mesmo desde as bactérias                            cia de aminoácidos (estrutura primária) que a proteína terá.
até a espécie humana, reforçando as evidências de que todos                                Além de serem constituintes fundamentais da estrutura
os seres vivos atuais tiveram ancestrais em comum.                                   celular, grande número de proteínas atua como enzimas, catali-
     Na maioria dos organismos, as informações que coman-                            sando a maioria das reações químicas vitais. É por meio das
dam o funcionamento celular estão inscritas em moléculas de                          proteínas, portanto, que os genes controlam praticamente to-
DNA. As "letras" do código genético são os quatro tipos de                           das as características fenotípicas dos seres vivos.
bases nitrogenadas: adenina (A), timina (T), citosina (C) e                                Neste folheto apresentamos duas atividades que podem
guanina (G). As unidades de informação do código, compará-                           ajudar os estudantes a compreender melhor os princípios da
veis a palavras, são os genes. Um gene é um segmento de                              codificação genética e da síntese de proteínas. Ambas envolvem
DNA em que a seqüência dos quatro tipos de bases nitrogena-                          a utilização de modelos, que concretizam parte do longo cami-
das (digamos, AAATCGCCT) apresenta determinado signifi-                              nho que há entre a informação codificada pelo gene e o fenótipo
cado funcional. Por exemplo, a presença de pigmentação na                            manifestado por um ser vivo.
pele, no cabelo e nos olhos deve-se à existência, em nosso
DNA, de uma certa seqüência de bases específica, na qual
reside a informação para a fabricação do pigmento melanina.
Pessoas que apresentam DNA com alterações nessa seqüência
de bases são albinas.
     Para se expressarem, as informações inscritas no DNA têm
de ser primeiramente transcritas para moléculas de RNA. As
duas cadeias que compõem o DNA separam-se e apenas uma
delas orienta a formação de uma cadeia de RNA, para a qual é
transcrita a informação codificada no gene. No RNA não existe
timina; em seu lugar está presente a base uracila (U).
      A regra da transcrição é: onde houver A no DNA, haverá
U no RNA; onde houver T no DNA, haverá A no RNA; onde
houver C no DNA, haverá G no RNA e onde houver G no DNA,
haverá C no RNA. A seqüência AAATCGCCT no DNA, por
exemplo, é transcrita para UUUAGCGGA no RNA.
     Qual é o destino de um RNA para o qual foi transcrita a
informação contida no gene? Alguns genes produzem molé-
culas de RNA capazes de se ligar a aminoácidos (RNA trans-
portador); outros tipos de RNA farão parte da estrutura dos                             Modelo em papel utilizado na simulação dos
ribossomos (RNA ribossômico); outros, ainda, comandarão a                               principais passos da síntese de proteínas sob o
ordenação dos aminoácidos para a fabricação das proteínas                               controle dos genes.
celulares (RNA mensageiro).
*
    Professor do Departamento de Biologia do Instituto de Biociências da Universidade de São P aulo
                                                                                     PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA                    1
SUGESTÕES DE ATIVIDADES
     Nas páginas seguintes apresentamos as informações ne-                   As atividades deste folheto serão mais bem aprovei-
cessárias à realização de duas atividades . Uma delas (abaixo)          tadas se os estudantes já dominarem os conceitos referen-
sugere a teatralização da síntese de proteínas. Além de motivar         tes à composição de ácidos nucléicos e de proteínas, e
a maioria dos estudantes e esclarecer pontos de difícil                 também os princípios básicos da codificação genética. Em
compreensão, esse tipo de atividade permite integrar diversos           nossas obras de Biologia esses assuntos podem ser encon-
tipos de habilidade (incluindo a expressão corporal) ao                 trados nos seguintes volumes:
processo de aprendizagem.
     A segunda atividade consiste em utilizar modelos de                AMABIS, J. M. & MARTHO, G. R. Fundamentos da Biologia moderna,
                                                                           São Paulo, Ed. Moderna, 1997:
papel para simular as principais etapas da síntese de proteí-
nas. Isso torna mais concretos determinados processos                        • Estrutura química de proteínas e enzimas (págs. 91-97);
bioquímicos e permite que, durante a manipulação das peças,                  • Estrutura química dos ácidos nucléicos (págs. 102-103);
os estudantes tenham bastante tempo para refletir sobre os                   • Genes, código genético e síntese de proteínas (págs. 152-158).
princípios biológicos envolvidos.                                       — · Biologia das células (vol. 1),   São Paulo, Ed. Moderna, 1994:
     Cada estudante ou grupo de estudantes deve receber                      • Estrutura química de proteínas e enzimas (págs. 89-98);
xerocópias da página de atividades e das duas páginas com                    • Estrutura química dos ácidos nucléicos (págs. 99-100);
desenhos para recortar. É necessário, também, utilizar uma                   • Os genes e o controle do metabolismo (págs. 311-327).
tabela de codificação genética, como a que foi fornecida                —·   Biologia dos organismos (vol. 3), São Paulo, Ed. Moderna, 1994:
no Temas de Biologia n o 6. Mais detalhes constam da pró-
                          -                                                  • Do genótipo ao fenótipo: como se expressam os genes (págs. 158-173).
pria página de atividades dirigida aos estudantes.

                                             TEATRALIZANDO A SÍNTESE DE PROTEÍNAS

                   MATERIAL NECESSÁRIO
     7 retângulos de papel-cartão branco (+ 20 x 30 cm)
                                             -
     5 pedaços de papel-cartão de cores diferentes (+ 30 x 40 cm)
                                                     -
     7 metros de fio de náilon grosso, tipo “fio de pedreiro”
     4 esferas de isopor (+ 10 cm de diâmetro)
                           -
     Canudinhos plásticos de refrigerante
     Cola plástica ou epóxi
     Fita adesiva e cola para papel
     Tinta plástica de diferentes cores

                        PROCEDIMENTOS                                       Mais dois estudantes devem segurar o modelo de RNAm feito com
                                                                        os sete retângulos pelas pontas dos fios de náilon, mantendo-o esticado
   Construa um modelo do RNAm colando os sete retângulos de             e de frente para a classe. Outro estudante simulará o ribossomo,
papel-cartão lado a lado com fita adesiva. Em seguida, cole a tira      colocando-se atrás do RNAm, junto à sua extremidade esquerda (de
de cartões em dois fios de náilon, deixando cerca de 50 cm de fio       que olha da classe). A partir daí ele deve se deslocar para sua esquerda
livre em cada extremidade. Escreva em cada cartão um códon. A           até encontrar o códon de início. O estudante que representa o RNAt
seqüência sugerida é: AAG - AUG - GCC - ACA - UUC - UGA -               da metionina deve colocar -se atrás do RNAm, à direita do “estudante-
CAU. Sublinhe os códons AUG (de início) e UGA (de término), por         ribossomo” e tendo à sua frente o códon AUG. O estudante-ribossomo
se tratar de códons especiais.                                          deve então erguer os braços, indicando que os sítios P e A, onde se
   Desenhe, em cada pedaço de papel-cartão colorido, modelos dos        alojam os RNAt, se tornaram disponíveis. O estudante-RNAt da
RNAt e do fator de terminação. Faça desenhos semelhantes aos da         metionina ficará sob o braço direito do estudante-ribossomo.
atividade das páginas seguintes. Escreva, nos RNAt, as trincas UAC,         O passo seguinte é a colocação do estudante-RNAt da alanina
CGG, UGU e AAG. Elas representam os anticódons.                         sob o braço esquerdo do estudante-ribossomo, tendo à sua frente o
   Perfure as esferas de isopor ao longo do diâmetro com um arame       códon GCC. O estudante-ribossomo passa o fio de náilon pelo furo
aquecido e ajuste no furo um canudo plástico, cortando o que so-        da alanina, unindo-a à metionina. O estudante-RNAt da metionina
brar; se necessário, use cola plástica para fixar os canudos. Eles      solta seu aminoácido e afasta-se, encerrando sua participação.
facilitam a passagem do fio de náilon, que servirá para manter unidas       O estudante-ribossomo anda para a esquerda e coloca o braço
as esferas. Escreva em cada esfera a abreviatura de um aminoácido       direito sobre o estudante-RNAt da alanina, ficando com o braço
(Met, Ala, Thr, Phe). Passe um pedaço de fio de náilon (80 cm) pelo     esquerdo livre. O estudante-RNAt da treonina coloca-se sob o braço
furo da esfera identificada por Met e dê um vários nós em uma das       esquerdo do estudante-ribossomo, tendo à sua frente o códon ACA.
pontas do fio, de modo que a esfera não escape por ela. Pinte cada      O fio de náilon é passado pelo furo da esfera que representa a treo-
esfera com uma cor semelhante à do cartão do RNAt correspondente        nina, adicionando-a à cadeia polipeptídica.
(UAC = Met; CGG = Ala; UGU = Thr; AAG = Phe).                               O processo repete-se até que o estudante-ribossomo chegue ao có-
   Distribua os modelos dos RNAt para quatro estudantes e solicite      don UGA, onde entra o estudante-fator de terminação. O último estu-
que cada um pegue a esfera com o aminoácido correspondente. Um          dante-RNAt deve soltar o conjunto de esferas que representa a pro-
quinto estudante ficará com o modelo do fator de terminação.            teína. O estudante-ribossomo afasta-se do RNAm e o processo termina.

2 PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA
ATIVIDADE:          TRABALHANDO COM UM MODELO PARA A SÍNTESE DE PROTEÍNAS
©Amabis e Martho/Editora Moderna - Reprodução autorizada



                                                            Nome:                                                                                                    Série:


                                                               O objetivo desta atividade é facilitar a compre-                         MATERIAL         NECESSÁRIO
                                                           ensão do mecanismo da síntese de proteínas pela                  Tesoura e/ou estilete
                                                           utilização de modelos de papel. Estes representam                Cola (de preferência em bastão)
                                                           os principais participantes da síntese de proteínas:             11 miniclipes
                                                           RNA mensageiro (RNAm), ribossomo, diversos ti-                   Folhas para recortar com desenhos do mRNA, do
                                                           pos de RNA transportador (RNAt), fator de termi-                  ribossomo, dos aminoácidos, dos tRNA e do fator de
                                                           nação e aminoácidos. A atividade consiste em simu-                terminação (xerox)
                                                           lar, passo a passo, os mecanismos que levam ao                   Painel de isopor ou de cortiça (opcional)
                                                           encadeamento dos aminoácidos da proteína sob o                   Alfinetes de mapa ou percevejos (opcional)
                                                           comando do RNA mensageiro.
                                                                                                                            Lápis ou canetas hidrográficas coloridos (opcional)

                                                                                                         ORIENTAÇÕES GERAIS
                                                               Com tesoura ou estilete recorte, das folhas de desenhos, os modelos do RNAm, do ribossomo, dos aminoácidos, dos
                                                           RNAt e do fator de terminação. Note que o RNAm está dividido em dois pedaços, que precisam ser unidos. Para isso,
                                                           siga as instruções da folha de desenhos e una os dois pedaços com cola. Pode-se também colorir os modelos para que
                                                           sejam mais facilmente reconhecidos. A montagem do modelo pode ser feita sobre uma superfície plana ou fixando-se as
                                                           peças em um painel de isopor ou cortiça por meio de alfinetes de mapa ou percevejos.

                                                                                                                                                                                                   1                                      Met
                                                                      PASSO A PASSO DA SÍNTESE DE PROTEÍNAS




                                                                                                                                                                                             U
                                                           1. Sua primeira tarefa, antes de iniciar a síntese de proteína, consiste em ligar,




                                                                                                                                                                     t
                                                                                                                                                 2




                                                                                                                                                                     Me




                                                                                                                                                                                                   A
                                                                                                                                                                                                   C
                                                              por meio de um miniclipe, cada RNAt à extremidade carboxila (cinza) do
                                                              aminoácido correspondente. Para isso, consulte uma tabela de codificação
                                                              genética, lembrando, porém, que geralmente as tabelas se referem aos
                                                                                                                                                         U A C
                                                              códons (trincas de bases no RNAm) dos aminoácidos. É necessário
                                                                                                                                                 A G A U G C U U U C G C A A U U G C C
                                                              traduzir os códons para os anticódons do RNAt. Por exemplo, se o códon
                                                              para a metionina é AUG, a trinca do RNAt correspondente é UAC.
                                                                                                                                                 3                                 M
                                                                                                                                                                                        et


                                                           2. Alinhe o RNAm na subunidade menor do ribossomo, de maneira que o                                                u
                                                                                                                                                                              Le



                                                              códon de início fique exatamente embaixo do sítio P, na subunidade maior
                                                              do ribossomo. Posicione o RNAt da metionina no sítio P do ribossomo de
                                                                                                                                                             C
                                                              modo que seu anticódon se encaixe ao códon de início. É esse encaixe que               U
                                                                                                                                                         A

                                                              marca o começo da síntese de proteína.                                                                  G A A

                                                                                                                                                 A G A U G C U U U C G C A A U U G C C

                                                           3. Encaixe o RNAt que corresponde ao códon localizado sob o sítio A. O
                                                              aminoácido transportado por esse RNAt será o segundo da cadeia polipep-            4                                           Met
                                                                                                                                                                                        u
                                                                                                                                                                                   Le

                                                              tídica. Solte a metionina de seu RNAt e cole sua extremidade carboxila (cinza)
                                                                                                                                                                                              r
                                                                                                                                                                                             Se




                                                              à extremidade amina (branca) do segundo aminoácido.
                                                                                                                                                             C
                                                                                                                                                         A
                                                           4. Deslize com cuidado o ribossomo para a direita. Percorra uma distância                 U

                                                              correspondente a três bases, mantendo encaixados os códons e os anticódons.                             G A A A G C
                                                              O RNAt da metionina fica fora do ribossomo; o segundo RNAt, com os                 A G A U G C U U U C G C A A U U G C C
                                                              dois aminoácidos unidos, passa a ocupar o sítio P; o sítio A fica vazio.
                                                              Encaixe o RNAt que corresponde ao códon localizado sob o sítio A. Solte a          5                                                                     Gln

                                                              dupla de aminoácidos (dipeptídio) do RNAt localizado no sítio P e cole a
                                                                                                                                                                                                                  u


                                                                                                                                                                                                                                Pro
                                                                                                                                                                                                                  Le




                                                                                                                                                                                             Leu
                                                              extremidade carboxila livre à extremidade amina do terceiro aminoácido.                                                              M
                                                                                                                                                                                                       et         er
                                                                                                                                                                                                                                Gl




                                                                                                                                                                                                              S
                                                                                                                                                                                                                                y




                                                                                                                                                                                                                  Ly s

                                                                                                                                                                 A
                                                                                                                                                             A
                                                           5. Repita o procedimento anterior até que o códon de término passe a ocupar
                                                                                                                                                                                                            Phe




                                                                                                                                                         G                                                                          Thr
                                                                                                                                                                                      Fator de                              u
                                                                                                                                                                                                                       Le
                                                                                                                                                                                    terminação
                                                              o sítio A do ribossomo. O encaixe do fator de terminação determina o fim                                    U G A

                                                              da mensagem genética para a proteína, que se desliga do último RNAt e             A U U U C U U A C U U A G C U

                                                              está pronta para atuar.

                                                                                                                          PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA                                                                       3
Folha para recortar




                                                                                                                                                                                     ©Amabis e Martho/Editora Moderna - Reprodução autorizada
                                  RNA mensageiro                                                                                   Ribossomo
✁
                              Parte 1                                                          Parte 2




                                                                                               G
                              A

                                                                                                                    ✁
                                         Une-se à extremida de da Parte 1
                              G




                                                                                               G
                                                                                               C
                              A
    Códon de início




                                                                                                                           Sítio    P                      Sítio   A
                                                                                                A
                              U
                              G




                                                                                               A
                              C




                                                                                               A
                              U




                                                                                               UU
                              U




                                                                                                                                   Sítio do RNAm
                                                                                               U
                              U




                                                                                               C
                              C




                                                                                                                               Aminoácidos
                              G




                                                                                               U




                                                                                                             ✁          Met                                   Gly
                                                                                               U
                              C
                              A




                                                                                               A




                                                                                                                        Leu                                   Lys
                                                                                               C
                              A
                              U




                                                                                               U




                                                                                                                        Ser                                   Phe
                                                                            Códon de término
                              U




                                                                                               U




                                                                                                                                                              Leu
                              G




                                                                                               A




                                                                                                                        Gln
                                                                                               G
                              C




                                                                                                                        Leu                                   Thr
                              C




                                                                                               C




                                                                                                                                                                       Extremidade
                                                                                                                                             Extremidade
                                                                                                                                              carboxila




                                                                                                                                                                          amina
                                                                                               U
                              U




○     ○               ○   ○
                                                                                                                        Pro
      Colar




4 PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA
Folha para recortar
                                                                   Moléculas de RNA transportador e fator de terminação
©Amabis e Martho/Editora Moderna - Reprodução autorizada




                                                           ✁


                                                           U   A     C       G    A    A        A     G     C         G     U      U




                                                           A   A    C        G    G    A       U     U     U         C      C     G




                                                                                                                            Fator de
                                                                                                                          terminação



                                                           A   A     A       G     A    A       U     G     A




                                                                                              PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA   5

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Simulação da síntese de proteínas em sala de aula

  • 1. TEMAS DE BIOLOGIA PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA NÚMERO 7 JANEIRO DE 1998 EDITORA MODERNA TRABALHANDO TEMAS FUNDAMENTAIS: CÓDIGO GENÉTICO E SÍNTESE DE PROTEÍNAS * J. M. Amabis e G . R. Martho U m dos assuntos que mais desafiam o professor de ensino médio é o mecanismo de fabricação das proteínas sob o comando dos genes, ou seja, o sistema de codificação genética e suas implicações. Para entendê-lo, além de conhecer as estruturas dos ácidos nucléicos e das proteínas, os estudantes têm de ser capazes de relacionar seqüências de bases do DNA com o fenótipo do organismo, o que exige grande esforço de abstração. Pensando nisso, apresentamos duas atividades que tornam mais concreto o sistema de codificação genética e que, por seus aspectos lúdicos, motivam os estudantes a aprender esse tema, de fundamental importância para a compreensão do fenômeno da vida. A decifração do código genético por Nirenberg, Ochoa e A maioria dos genes transcreve suas informações para Khorana, no início de 1960, foi uma das mais espetaculares moléculas de RNA mensageiro. Estas, por sua vez, comandam descobertas científicas do século XX. O código genético é um a síntese das proteínas celulares. sistema de armazenamento de informações hereditárias, as O RNA mensageiro contém suas informações organiza- quais comandam todo o funcionamento celular. A decifração das em trincas de bases, os códons. Cada códon corresponde do código genético mostrou que o controle do metabolismo a um aminoácido, e a seqüência de códons determina a seqüên- das células é fundamentalmente o mesmo desde as bactérias cia de aminoácidos (estrutura primária) que a proteína terá. até a espécie humana, reforçando as evidências de que todos Além de serem constituintes fundamentais da estrutura os seres vivos atuais tiveram ancestrais em comum. celular, grande número de proteínas atua como enzimas, catali- Na maioria dos organismos, as informações que coman- sando a maioria das reações químicas vitais. É por meio das dam o funcionamento celular estão inscritas em moléculas de proteínas, portanto, que os genes controlam praticamente to- DNA. As "letras" do código genético são os quatro tipos de das as características fenotípicas dos seres vivos. bases nitrogenadas: adenina (A), timina (T), citosina (C) e Neste folheto apresentamos duas atividades que podem guanina (G). As unidades de informação do código, compará- ajudar os estudantes a compreender melhor os princípios da veis a palavras, são os genes. Um gene é um segmento de codificação genética e da síntese de proteínas. Ambas envolvem DNA em que a seqüência dos quatro tipos de bases nitrogena- a utilização de modelos, que concretizam parte do longo cami- das (digamos, AAATCGCCT) apresenta determinado signifi- nho que há entre a informação codificada pelo gene e o fenótipo cado funcional. Por exemplo, a presença de pigmentação na manifestado por um ser vivo. pele, no cabelo e nos olhos deve-se à existência, em nosso DNA, de uma certa seqüência de bases específica, na qual reside a informação para a fabricação do pigmento melanina. Pessoas que apresentam DNA com alterações nessa seqüência de bases são albinas. Para se expressarem, as informações inscritas no DNA têm de ser primeiramente transcritas para moléculas de RNA. As duas cadeias que compõem o DNA separam-se e apenas uma delas orienta a formação de uma cadeia de RNA, para a qual é transcrita a informação codificada no gene. No RNA não existe timina; em seu lugar está presente a base uracila (U). A regra da transcrição é: onde houver A no DNA, haverá U no RNA; onde houver T no DNA, haverá A no RNA; onde houver C no DNA, haverá G no RNA e onde houver G no DNA, haverá C no RNA. A seqüência AAATCGCCT no DNA, por exemplo, é transcrita para UUUAGCGGA no RNA. Qual é o destino de um RNA para o qual foi transcrita a informação contida no gene? Alguns genes produzem molé- culas de RNA capazes de se ligar a aminoácidos (RNA trans- portador); outros tipos de RNA farão parte da estrutura dos Modelo em papel utilizado na simulação dos ribossomos (RNA ribossômico); outros, ainda, comandarão a principais passos da síntese de proteínas sob o ordenação dos aminoácidos para a fabricação das proteínas controle dos genes. celulares (RNA mensageiro). * Professor do Departamento de Biologia do Instituto de Biociências da Universidade de São P aulo PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA 1
  • 2. SUGESTÕES DE ATIVIDADES Nas páginas seguintes apresentamos as informações ne- As atividades deste folheto serão mais bem aprovei- cessárias à realização de duas atividades . Uma delas (abaixo) tadas se os estudantes já dominarem os conceitos referen- sugere a teatralização da síntese de proteínas. Além de motivar tes à composição de ácidos nucléicos e de proteínas, e a maioria dos estudantes e esclarecer pontos de difícil também os princípios básicos da codificação genética. Em compreensão, esse tipo de atividade permite integrar diversos nossas obras de Biologia esses assuntos podem ser encon- tipos de habilidade (incluindo a expressão corporal) ao trados nos seguintes volumes: processo de aprendizagem. A segunda atividade consiste em utilizar modelos de AMABIS, J. M. & MARTHO, G. R. Fundamentos da Biologia moderna, São Paulo, Ed. Moderna, 1997: papel para simular as principais etapas da síntese de proteí- nas. Isso torna mais concretos determinados processos • Estrutura química de proteínas e enzimas (págs. 91-97); bioquímicos e permite que, durante a manipulação das peças, • Estrutura química dos ácidos nucléicos (págs. 102-103); os estudantes tenham bastante tempo para refletir sobre os • Genes, código genético e síntese de proteínas (págs. 152-158). princípios biológicos envolvidos. — · Biologia das células (vol. 1), São Paulo, Ed. Moderna, 1994: Cada estudante ou grupo de estudantes deve receber • Estrutura química de proteínas e enzimas (págs. 89-98); xerocópias da página de atividades e das duas páginas com • Estrutura química dos ácidos nucléicos (págs. 99-100); desenhos para recortar. É necessário, também, utilizar uma • Os genes e o controle do metabolismo (págs. 311-327). tabela de codificação genética, como a que foi fornecida —· Biologia dos organismos (vol. 3), São Paulo, Ed. Moderna, 1994: no Temas de Biologia n o 6. Mais detalhes constam da pró- - • Do genótipo ao fenótipo: como se expressam os genes (págs. 158-173). pria página de atividades dirigida aos estudantes. TEATRALIZANDO A SÍNTESE DE PROTEÍNAS MATERIAL NECESSÁRIO 7 retângulos de papel-cartão branco (+ 20 x 30 cm) - 5 pedaços de papel-cartão de cores diferentes (+ 30 x 40 cm) - 7 metros de fio de náilon grosso, tipo “fio de pedreiro” 4 esferas de isopor (+ 10 cm de diâmetro) - Canudinhos plásticos de refrigerante Cola plástica ou epóxi Fita adesiva e cola para papel Tinta plástica de diferentes cores PROCEDIMENTOS Mais dois estudantes devem segurar o modelo de RNAm feito com os sete retângulos pelas pontas dos fios de náilon, mantendo-o esticado Construa um modelo do RNAm colando os sete retângulos de e de frente para a classe. Outro estudante simulará o ribossomo, papel-cartão lado a lado com fita adesiva. Em seguida, cole a tira colocando-se atrás do RNAm, junto à sua extremidade esquerda (de de cartões em dois fios de náilon, deixando cerca de 50 cm de fio que olha da classe). A partir daí ele deve se deslocar para sua esquerda livre em cada extremidade. Escreva em cada cartão um códon. A até encontrar o códon de início. O estudante que representa o RNAt seqüência sugerida é: AAG - AUG - GCC - ACA - UUC - UGA - da metionina deve colocar -se atrás do RNAm, à direita do “estudante- CAU. Sublinhe os códons AUG (de início) e UGA (de término), por ribossomo” e tendo à sua frente o códon AUG. O estudante-ribossomo se tratar de códons especiais. deve então erguer os braços, indicando que os sítios P e A, onde se Desenhe, em cada pedaço de papel-cartão colorido, modelos dos alojam os RNAt, se tornaram disponíveis. O estudante-RNAt da RNAt e do fator de terminação. Faça desenhos semelhantes aos da metionina ficará sob o braço direito do estudante-ribossomo. atividade das páginas seguintes. Escreva, nos RNAt, as trincas UAC, O passo seguinte é a colocação do estudante-RNAt da alanina CGG, UGU e AAG. Elas representam os anticódons. sob o braço esquerdo do estudante-ribossomo, tendo à sua frente o Perfure as esferas de isopor ao longo do diâmetro com um arame códon GCC. O estudante-ribossomo passa o fio de náilon pelo furo aquecido e ajuste no furo um canudo plástico, cortando o que so- da alanina, unindo-a à metionina. O estudante-RNAt da metionina brar; se necessário, use cola plástica para fixar os canudos. Eles solta seu aminoácido e afasta-se, encerrando sua participação. facilitam a passagem do fio de náilon, que servirá para manter unidas O estudante-ribossomo anda para a esquerda e coloca o braço as esferas. Escreva em cada esfera a abreviatura de um aminoácido direito sobre o estudante-RNAt da alanina, ficando com o braço (Met, Ala, Thr, Phe). Passe um pedaço de fio de náilon (80 cm) pelo esquerdo livre. O estudante-RNAt da treonina coloca-se sob o braço furo da esfera identificada por Met e dê um vários nós em uma das esquerdo do estudante-ribossomo, tendo à sua frente o códon ACA. pontas do fio, de modo que a esfera não escape por ela. Pinte cada O fio de náilon é passado pelo furo da esfera que representa a treo- esfera com uma cor semelhante à do cartão do RNAt correspondente nina, adicionando-a à cadeia polipeptídica. (UAC = Met; CGG = Ala; UGU = Thr; AAG = Phe). O processo repete-se até que o estudante-ribossomo chegue ao có- Distribua os modelos dos RNAt para quatro estudantes e solicite don UGA, onde entra o estudante-fator de terminação. O último estu- que cada um pegue a esfera com o aminoácido correspondente. Um dante-RNAt deve soltar o conjunto de esferas que representa a pro- quinto estudante ficará com o modelo do fator de terminação. teína. O estudante-ribossomo afasta-se do RNAm e o processo termina. 2 PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA
  • 3. ATIVIDADE: TRABALHANDO COM UM MODELO PARA A SÍNTESE DE PROTEÍNAS ©Amabis e Martho/Editora Moderna - Reprodução autorizada Nome: Série: O objetivo desta atividade é facilitar a compre- MATERIAL NECESSÁRIO ensão do mecanismo da síntese de proteínas pela Tesoura e/ou estilete utilização de modelos de papel. Estes representam Cola (de preferência em bastão) os principais participantes da síntese de proteínas: 11 miniclipes RNA mensageiro (RNAm), ribossomo, diversos ti- Folhas para recortar com desenhos do mRNA, do pos de RNA transportador (RNAt), fator de termi- ribossomo, dos aminoácidos, dos tRNA e do fator de nação e aminoácidos. A atividade consiste em simu- terminação (xerox) lar, passo a passo, os mecanismos que levam ao Painel de isopor ou de cortiça (opcional) encadeamento dos aminoácidos da proteína sob o Alfinetes de mapa ou percevejos (opcional) comando do RNA mensageiro. Lápis ou canetas hidrográficas coloridos (opcional) ORIENTAÇÕES GERAIS Com tesoura ou estilete recorte, das folhas de desenhos, os modelos do RNAm, do ribossomo, dos aminoácidos, dos RNAt e do fator de terminação. Note que o RNAm está dividido em dois pedaços, que precisam ser unidos. Para isso, siga as instruções da folha de desenhos e una os dois pedaços com cola. Pode-se também colorir os modelos para que sejam mais facilmente reconhecidos. A montagem do modelo pode ser feita sobre uma superfície plana ou fixando-se as peças em um painel de isopor ou cortiça por meio de alfinetes de mapa ou percevejos. 1 Met PASSO A PASSO DA SÍNTESE DE PROTEÍNAS U 1. Sua primeira tarefa, antes de iniciar a síntese de proteína, consiste em ligar, t 2 Me A C por meio de um miniclipe, cada RNAt à extremidade carboxila (cinza) do aminoácido correspondente. Para isso, consulte uma tabela de codificação genética, lembrando, porém, que geralmente as tabelas se referem aos U A C códons (trincas de bases no RNAm) dos aminoácidos. É necessário A G A U G C U U U C G C A A U U G C C traduzir os códons para os anticódons do RNAt. Por exemplo, se o códon para a metionina é AUG, a trinca do RNAt correspondente é UAC. 3 M et 2. Alinhe o RNAm na subunidade menor do ribossomo, de maneira que o u Le códon de início fique exatamente embaixo do sítio P, na subunidade maior do ribossomo. Posicione o RNAt da metionina no sítio P do ribossomo de C modo que seu anticódon se encaixe ao códon de início. É esse encaixe que U A marca o começo da síntese de proteína. G A A A G A U G C U U U C G C A A U U G C C 3. Encaixe o RNAt que corresponde ao códon localizado sob o sítio A. O aminoácido transportado por esse RNAt será o segundo da cadeia polipep- 4 Met u Le tídica. Solte a metionina de seu RNAt e cole sua extremidade carboxila (cinza) r Se à extremidade amina (branca) do segundo aminoácido. C A 4. Deslize com cuidado o ribossomo para a direita. Percorra uma distância U correspondente a três bases, mantendo encaixados os códons e os anticódons. G A A A G C O RNAt da metionina fica fora do ribossomo; o segundo RNAt, com os A G A U G C U U U C G C A A U U G C C dois aminoácidos unidos, passa a ocupar o sítio P; o sítio A fica vazio. Encaixe o RNAt que corresponde ao códon localizado sob o sítio A. Solte a 5 Gln dupla de aminoácidos (dipeptídio) do RNAt localizado no sítio P e cole a u Pro Le Leu extremidade carboxila livre à extremidade amina do terceiro aminoácido. M et er Gl S y Ly s A A 5. Repita o procedimento anterior até que o códon de término passe a ocupar Phe G Thr Fator de u Le terminação o sítio A do ribossomo. O encaixe do fator de terminação determina o fim U G A da mensagem genética para a proteína, que se desliga do último RNAt e A U U U C U U A C U U A G C U está pronta para atuar. PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA 3
  • 4. Folha para recortar ©Amabis e Martho/Editora Moderna - Reprodução autorizada RNA mensageiro Ribossomo ✁ Parte 1 Parte 2 G A ✁ Une-se à extremida de da Parte 1 G G C A Códon de início Sítio P Sítio A A U G A C A U UU U Sítio do RNAm U U C C Aminoácidos G U ✁ Met Gly U C A A Leu Lys C A U U Ser Phe Códon de término U U Leu G A Gln G C Leu Thr C C Extremidade Extremidade carboxila amina U U ○ ○ ○ ○ Pro Colar 4 PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA
  • 5. Folha para recortar Moléculas de RNA transportador e fator de terminação ©Amabis e Martho/Editora Moderna - Reprodução autorizada ✁ U A C G A A A G C G U U A A C G G A U U U C C G Fator de terminação A A A G A A U G A PROPOSTAS PARA DESENVOLVER EM SALA DE AULA 5