1. MirOB:
инструмент анализа генных сетей для
решения задач персонализированной
медицины
http://mirob.interactome.ru

3. Визуализция данных

4. Вначале была база данных

5. Надо бы это все визуализировать

6. Генная сеть TP53 на GraphViz

7. Много статичной и однородной
информации на одном экране.
Что делать?

8. Создали графическую и цветовую нотацию:

9. Опять инфохаос

10. Связали Ген-РНК-Белок-микроРНК в единые сущности

11. А что будет, если использовать открытые базы?
данных?ç

12. Еще улучшили графическую нотацию

13. Информация об узле Информация о ребре

14. Информация о генной сети

16. Все равно все очень сложно и непонятно.

17. Фильтры
Планируем добавить фильтры:
● Тканевая специфичность
● Cut-off по уровням экспрессии
● По сигнальным каскадам
● Другие

18. Колоректальный рак

19. Gene Ontology?

20. MirOB Ontology!

21. Cisplatin resistance gene network

23. Диаграмма уровней экспрессии микроРНК

24. Случайно уронили SNPPer

25. Лекартсва, действующие на мишени

26. MirOB -- инструмент анализа генных сетей
http://mirob.interactome.ru

27. Что дальше
● Динамическая визуализация генных сетей
● Градации по экспрессионным уровням на генной сети
● Анализ “сырых” данных NGS в облаке
● GWAS анализ
● База данных генных сетей для совместного обсуждения
● Распределенные вычисления
Полноценный workflow от загрузки любых данных, до
понятного отчета.

28. Александр Фокин, CEO MirOB
bifurc8@gmail.com
http://mirob.interactome.ru
+7 910 452 44 84