More Related Content Similar to CGH in the PGD program: a new tool for improved IVF outcomes? (20) CGH in the PGD program: a new tool for improved IVF outcomes? 3. Current biopsy techniques
> Polar body biopsy
â maternal markers only
> Day 3 biopsy
Day 3 biopsy
â remove 1 or 2 cells
> Blastocyst biopsy
l b
â more labs now implementing
Dec 2011 3
Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
4. Blastocyst biopsy â our approach since 2004
> Why wait till blastocyst stage?
â blastulationâ best developing embryos identified
> fe er embr os need to be anal sed
fewer embryos need to be analysed
â fewer resources needed
> more cells can be taken = more DNA
â improved analysis with less error rate
> reduced impact on embryo?
Dec 2011 4 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
5. Summary â blastocyst biopsy
> Outcomes are better than cleavage stage biopsy
â Improved embryo viability?
Improved embryo viability?
> The number of cycles achieving transfer is lower but outcome per IVFÂ
cycle started is similar
l d i i il
â Fewer futile transfers
> Clinical pregnancy rate per embryo transferred is higher
â sET is possible
> Reduced costs for PGD
â Number of embryos analysed is reduced
y y
Dec 2011 5 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
6. The problems with FISH:
> Accuracy/Error rates
y/
âCell loss
âSignal overlap/splitting
âVariable cell fixation (residual cytoplasm)
âHybridization efficiency/times (multiple)
âCell overlap (blastocyst biopsy)
Cell overlap (blastocyst biopsy)
> Limit on fluorophors availableâ 5
âup to 12 chromosomesâ 3 hybridisations!
p y
> Diploidâaneuploid mosaicism (blastocyst biopsy)
âsmall proportion of aberrant cells in sample
Dec 2011 6 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
7. PGD trial outcomes:Â
> A randomised clinical trial of blastocyst biopsy to ascertain whether chromosomeÂ
screening improves IVF outcomes
screening improves IVF outcomes
â terminated early when we were not able to show any advantage for PGS
Human Reproduction Vol.23, No.7 pp. 1476â1478, 2008
Conclusion:  We needed a more accurate and extensive test for chromosomal error
Dec 2011 7 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
8. Comparative genetic diagnosis â CGH
⢠CGH is a process that allows us to look at all 24Â
chromosomes in an embryo
⢠Female = 46, XX
Female 46, XX
⢠Male = 46, XY
⢠Process takes several days to achieve results therefore allÂ
embryos need to be vitrified
b d t b it ifi d
⢠Cryo embryo transfer in subsequent cycle
Dec 2011 8 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
9. Array CGH
> 60 000 points on chromosomesÂ
measured
> y y p
8 sub arrays = 8 embryos per slide
> embryo karyotype
Dec 2011 9 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
10. CGHÂ â Analysis
Log ratio
Log ratio
Moving average
Dec 2011 10 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
11. Aneuploid chromosomesÂ
25.0
20.0
neuploidy rate (%)
15.0
IVF miscarrage samples
10.0
PGDÂ Embryos
PGD Embryos
An
5 panel = 35%
5.0 9 panel = 72%
12 panel = 78%
0.0
25% of abnormalÂ
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
1
2
3
4
5
6
7
8
9
X/Y
embryos stillÂ
Chromosome missed
Dec 2011 11 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
12. CGHÂ patients
Patient data
Couples with biopsy cycles 105
with transfer (so far) 56
Average maternal
Average maternal age 38.1
38 1
No. previous IVF treatments             <38yrs 2.2
>38yrs 2.1
embryos biopsied 404 (av. 5.7 for <38yrs and 3.9 >38yrs)
aneuploid embryos detected 181 (49%)
y py
Cycles with no biopsy 58%
successful analyses ~94Â %
Dec 2011 12 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
13. CGHÂ outcomes
Pregnancy outcomes
embryos transferred 60
implantation rate (# implantations) 52% (31)
<38yrs 61%Â (23/38)Â
>38yrs 41%Â (8/22)
Clinical pregnancy rate (FH)/oocyte retrieval with transfer
Clinical pregnancy rate (FH)/oocyte retrieval with transfer 67%Â (28/42)
67% (28/42)
<38yrs 81%Â (21/26)
>38yrs 44%Â (7/16)
Dec 2011 13 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au
17. CGHÂ â Conclusion
> Whilst this is a retrospective review of outcomes,
Whilst this is a retrospective review of outcomes,Â
when compared to general IVF patients, applying PGSÂ
with aCGH in poor prognosis patients shows anÂ
with aCGH in poor prognosis patients shows an
improved implantation rate.
â Several randomised trials currently underway
> Other factors, such as uterine receptivity, may also beÂ
contributing to the improved outcomes whenÂ
ib i h i d h
applying aCGH to this cohort of patients
Dec 2011 17 Š 2011 Genea Limited | genea.com.au