Навчальний курс: «Молекулярна онкологія, патологія та генетика»
Медична лабораторія CSD спільно з Center for research and education of translational biology and medicine (www.tbm.center ) пропонує безкоштовний курс навчальних лекцій для усіх бажаючих.
6. РОЛЬ ГЕНОВ BRCA1 И BRCA2
1. Ngeow J, Charis Eng C. Precision medicine in heritable cancer: when somatic tumour testing and germline mutations meet. npj Genomic Medicine (2016) 1, 15006; doi:10.1038/npj-genmed.2015.6; 2. Powell SN, Kachnic LA.
Oncogene 2003;22:5784-91; 3.BRCA Exchange. Электронный ресурс. https://brcaexchange.org/ Дата обращения 06.01.2020. 4. Gorodetska I, Kozeretska I, Dubrovska A. BRCA Genes: The Role in Genome Stability, Cancer
Stemness and Therapy Resistance. J Cancer. 2019 May 14;10(9):2109-2127. doi: 10.7150/jca.30410. PMID: 31205572; PMCID: PMC6548160.
Гены BRCA1 и BRCA2- онкосупрессоры, вовлечены в процесс
гомологической рекомбинации и репарации двухнитевых
разрывов ДНК
Ключевые члены HBOC-генов
Репарация ДНК
Регуляция клеточного цикла
Регуляция транскрипции
Регуляция структуры хроматина
СТАБИЛЬНОСТЬ ГЕНОМА
7. Репарация ДНК и канцерогенез
1. McLornan DP, et al. N Engl J Med. 2014;371(18):1725-1735. 2. Pejovic T, et al. Ovarian cancer. In: Ginsburg GS, et al, eds. Genomic and Personalized Medicine. 2nd ed. San Diego, CA: Academic Press;
2013:714-721.
Апоптоз
Старение
Транскрипционная
регуляция
Постоянная остановка
клеточного цикла
Временная остановка
клеточного цикла
Восстановление ДНК
Внутренние
Герминативные мутации
Спонтанные мутации
Ошибочно спаренные
нуклеотиды
Ошибки репликации
Активные формы О2
Химиотерапия
Радиация
Внешние
Геномная
нестабильность
является
характеристикой
большинства видов
рака.
Повреждение
Ответ на
повреждение ДНК
Конечный
результат
Предотвращение
карциногенеза
8. Репарация ДНК и канцерогенез
• 1. McLornan DP, et al. N Engl J Med. 2014;371(18):1725-1735. 2. Pejovic T, et al. Ovarian cancer. In: Ginsburg GS, et al, eds. Genomic and Personalized Medicine. 2nd ed. San Diego,
CA: Academic Press; 2013:714-721.
Апоптоз
Старение
Транскрипционная
регуляция
Постоянная остановка
клеточного цикла
Временная остановка
клеточного цикла
Восстановление ДНК
Внутренние
Герминативные мутации
Спонтанные мутации
Ошибочно спаренные
нуклеотиды
Ошибки репликации
Активные формы О2
Химиотерапия
Радиация
Внешние
Геномная
нестабильность
является
характеристикой
большинства видов
рака.
Повреждение
Ответ на
повреждение ДНК
Конечный
результат
Предотвращение
карциногенеза
9. Lord CJ and Ashworth A Nature 2012; 481: 287- 293.
Негомологичное соединение
концов (NHEJ)
Относительно простой, но возможны ошибки
Включая прямую лигацию разорванных
концов. Может происходить на любой стадии
клеточного цикла
Гомологичная рекомбинация
(HRR)
Консервативный процесс, который обычно
восстанавливает оригинальную
последовательность ДНК
Реализуется преимущественно в фазе S / G2
клеточного цикла
Основные механизмы репарации
двухнитевых разрывов ДНК
10. ATM, ATM serine/threonine kinase; ATR, ataxia telangiectasia and Rad3-related protein (ATR) or FRAP-related protein 1 (FRP1); BRCA1, BReast CAncer susceptibility protein 1;
BRCA2, BReast CAncer susceptibility protein 2; HRR, homologous recombination repair; MRN, MRE11-RAD50-NBS1; NHEJ, (nonhomologous end joining) – негомологичная
рекомбинация и соединение концов. 1. Frey MK, Pothuri B. Gynecol Oncol Res Pract. 2017;4:4. 2. Konecny GE, Kristeleit RS. Br J Cancer. 2016;115(10):1157-1173. 3. O’Sullivan
CC, et al. Front Oncol. 2014;4:42.
HRR-опосредованная
репарация ДНК
DSBs may be repaired
via error-prone NHEJ
RAD51
ATR/
ATM BRCA1
BRCA2
MRN
complex
Двухнитевые разрывы
сохраняются
Геномная
нестабильность
Карциногенез
НАРУШЕНИЕ HRR (включая BRCA1 и/или BRCA2) могут
приводить к геномной нестабильности и карциногенезу.
Двухнитевые разрывы могут быть восстановлены
с помощью подверженного ошибкам NHEJ-пути
HRD
11. Гены, вовлеченные в HRR
Turner N, Tutt A, Ashworth A. Hallmarks of 'BRCAness' in sporadic cancers. Nat Rev Cancer. 2004 Oct;4(10):814-9. doi: 10.1038/nrc1457.
16. Почему при РЯ – тестируем только BRCA1/2?
А при оценке риска развития наследственных форм рака
– рекомендуют мультигенное тестирование?
17. Miller RE, et al. ESMO recommendations on predictive biomarker testing for homologous recombination deficiency and PARP inhibitor benefit in ovarian cancer. Ann Oncol. 2020
Dec;31(12):1606-1622. doi: 10.1016/j.annonc.2020.08.2102.
18. Miller RE, et al. ESMO recommendations on predictive biomarker testing for homologous recombination deficiency and PARP inhibitor benefit in ovarian cancer. Ann Oncol. 2020
Dec;31(12):1606-1622. doi: 10.1016/j.annonc.2020.08.2102.
19. Miller RE, et al. ESMO recommendations on predictive biomarker testing for homologous recombination deficiency and PARP inhibitor benefit in ovarian cancer. Ann Oncol. 2020
Dec;31(12):1606-1622. doi: 10.1016/j.annonc.2020.08.2102.
BRCA1/2 GIS
iPARP
21. Что важно при BRCA-тестировании?
1. Выбор материала для исследования:
• Опухоль
• Кровь
2. Выбор метода исследования:
• ПЦР или
• Секвенирование (NGS)
3. Интерпретация результатов исследования
• Классификация мутаций
• Клиническое значение мутаций
1.BRACAnalysis. Myriad website. https://myriad.com/products-services/hereditary-cancers/bracanalysis/. Accessed November 30, 2016. 2.Tumor BRACAnalysis. Myriad website.
http://myriadgenetics.eu/products/tumor-bracanalysis-cdx 3.Brian T.J. Hennessy et al. J Clin Oncol 2010: 28:3570-3576 4.Ramūnas Janavičius. EPMA Journal (2010) 1:397–412
22. ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ МУТАЦИЙ BRCA
Gallardo-Rincón D et al. Clinical Evaluation of BRCA1/2 Mutation in Mexican Ovarian Cancer Patients. Transl Oncol. 2020 Feb;13(2):212-220. doi: 10.1016/j.tranon.2019.11.003.
> 12000 мутаций BRCA различной клинической значимости
консолидированы в специализированные базы данных3:
BRCAexchange.org Другие…
http://arup.utah.edu/database/BRCA/
23. BRCA-ТЕСТИРОВАНИЕ МЕТОДОМ ПЦР или NGS?
ПЦР – полимеразная цепная реакция. NGS – next generation sequencing – секвенирование нового поколения.
Все возможные выявляемые мутации – 100%
Цельная кровь
Методы выявления
частых 8 мутаций
(например, ПЦР)
Гистологический блок
с опухолевой тканью
Секвенирование
следующего
поколения (NGS)
Цельная кровь
Секвенирование
нового
поколения
(NGS)
ЧАСТЫЕ
ГЕРМИНАТИВНЫЕ ~30%
РЕДКИЕ
ГЕРМИНАТИВНЫЕ ~40%
СОМАТИЧЕСКИЕ ~30%
1. Brian T.J. Hennessy et al. J Clin Oncol 28:3570-3576. 2. Ramūnas Janavičius. EPMA Journal (2010) 1:397–412; 2 Marchetti C. et al., BRCA status assessment in epithelial ovarian
cancer and the challange of tumor testing. Int. J. Gynecol. 2020:0:1-2. doi:10.1136/ikgc-2020-001670.
24. ИНТЕРПРЕТАЦИЯ ДАННЫХ NGS
Патогенный
Класс 5
Патогенный
Класс 4
Вероятно патогенный
Неопределенный
Класс 3
Вариант
неопределенного
значения (VUS)
Не патогенный
Класс 2
Вероятно
доброкачественный
Класс1
Доброкачественный
Клинически
значимы
Клинически НЕ значимы
1. Ngeow J, Charis Eng C. Precision medicine in heritable cancer: when somatic tumour testing and germline mutations meet. npj Genomic Medicine (2016) 1, 15006; doi:10.1038/npj-genmed.2015.6; 2. Powell SN,
Kachnic LA. Oncogene 2003;22:5784-91; 3. Электронный ресурс http://ngs.med-gen.ru/mgngs19/Руководство%20NGS%202019%20вер.2.pdf. Дата обращения 30.01.2021
25. NGS-ЛАБОРАТОРИИ В CSD
Платформа Illumina
• «Золотой стандарт» NGS в онкологии
• Экспертное решение в онкологии для
мультигенных панелей
• Возможность идентификации 100% генетических
альтераций
• NGS-панель наследственных мутаций в генах BRCA1/2 (кровь, Illumina)
• NGS-панель мутаций в генах BRCA1/2 (гистологический материал, Illumina,)
26. •PARP, poly (ADP-ribose) polymerase.
1. Balmaña J, et al. Ann Oncol 2010;21(Suppl. 5):v20–v22; 2. Daly M, et al. NCCN Guidelines. Genetic/familial high-risk assessment: Breast and ovarian. Version 4.2013;
3. NICE clinical guideline 164. June 2013. guidance.nice.org.uk/cg164. 4. Petrucell N, et al. Genetics in Medicine 2010;12(5):245-259; 5. Agarwal R. and Kaye SB. Ann Oncol 2005;16: 4–6,
1. помогает определить риск развития второго рака (РМЖ);
2. позволяет оценить риск развития злокачественных опухолей у
здоровых родственников с последующей ранней диагностикой и
своевременным лечением
Оценка риска
BRCA статус является важным прогностическим фактором наряду с
такими показателями как объем циторедукции, стадия заболевания и
гистологический тип опухоли
Прогноз
1Dann RB, DeLoia JA, Timms KM et al. BRCA1/2 mutations and expression: response to platinum chemotherapy in patients with advanced stage epithelial ovarian cancer. Gynecol Oncol 2012; 125(3): 677–682. 2.Alsop K, Fereday S, Meldrum C et al. BRCA mutation
frequency and patterns of treatment response in BRCA mutation-positive women with ovarian cancer: a report from the Australian Ovarian Cancer Study Group. J Clin Oncol 2012; 30(21): 2654–2663. 3.Safra T, Borgato L, Nicoletto MO et al. BRCA mutation status
and de- terminant of outcome in women with recurrent epithelial ovarian can- cer treated with pegylated liposomal doxorubicin. Mol Cancer Ther2011; 10(10): 2000–2007 4Moore K, et al. N Engl J Med 2018; 379:2495-2505.5.Pujade-Lauraine et al. Lancet Oncol.
2017;18:1274-1284; 6.D.K. Armstrong, J. L. Walker Role of Intraperitoneal Therapy in the Initial Management of Ovarian Cancer// J. Clin. Oncol., 2019.-37(27).- P.2416-2419.
Тактика лечения
1. Наличие mBRCA при серозном раке яичников − предиктор
• чувствительности опухоли к препаратам платины, эффективности
эндоабдоминальной ХТ;
• выбора второго агента химиотерапии
2. Открытие нового вида поддерживающей таргетной терапии - с применением
i-PARP позволяет персонализировать лечение РЯ
Клиническое значение ВRCA-тестирования при РЯ
The main point on this slide is that the two major mechanisms for the repair of a double strand break are fundamentally different from one another, with the essential difference being in the fidelity of the repair achieved
NHEJ is simple but error prone and does not necessarily result in a faithful repair
HRR is more complex but is designed to faithfully restore the damaged DNA to its original sequence
Notes
Non-homologous end joining (NHEJ) mediates repair by directly ligating the ends of a DSB
Because it does not depend on sequence homology, NHEJ is a relatively simple pathway and can operate at any stage of the cell cycle
However, NHEJ is an error-prone process that can cause the deletion or mutation of DNA sequences around the site of damage
Homologous recombination repair (HRR) is a conservative process that typically restores the original DNA sequence at the damaged site
HRR operates mainly in the S/G2 phase of the cell cycle, when homologous regions of DNA are brought into close proximity with one another through the formation of sister chromatids
10
For the next few slides, questions can be asked about how HCP receives and interprets testing results and if this is a hurdle or bottleneck for them for subsequent treatment decisions.
Коллеги, нам очень важно определить особенности клинического течения рака яичников с наличием BRCAm. Пациентки с BRCAm обладают более благоприятным клинически прогнозом