الأمراض النباتية البكتيرية
- 2. اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺗﻘﺴﻴﻢ
Dr Alhudaib
اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ وﺗﻌﺮﻳﻒ ﺗﻘﺴﻴﻢ ﻓﻲ اﻷﺳﺲ أن)Taxonomy(ﻣﺮاﺣﻞ ﺛﻼﺛﺔ ﻋﻠﻰ ﻳﻌﺘﻤﺪ:
Classification
واﻟﻨﻮع ﺟﻨﺲ اﻟﻰ ﻗﺴﻢ ﺗﺤﺖ ﻣﻦ ﺗﻘﺴﻴﻢ وهﻮ
Nomenclature
اﻟﺘﺴﻤﻴﺔ ﻓﻲ اﻟﻌﺎﻟﻤﻴﺔ اﻷﺳﺲ ﻣﻊ وﺗﻨﻄﺒﻖ اﻟﺴﺎﺑﻖ ﻋﻠﻰ وﺗﻌﺘﻤﺪ ﺗﺴﻤﻴﺔ
)IJSEM(/http://ijs.sgmjournals.org
Identification
اﻟﺴﺎﺑﻖ ﻋﻠﻰ وﺗﻌﺘﻤﺪ ﻣﻌﺮف اﻟﻐﻴﺮ اﻟﻜﺎﺋﻦ ﻟﺘﻌﺮﻳﻒ
- 4. اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺗﻌﺮﻳﻒ ﻓﻲ اﻷﺳﺲ:
اﻟﻨﻈﺮﻳﺔ اﻟﻈﺎهﺮﻳﺔ اﻟﺼﻔﺎت)Macroscopic Morphology(
اﻟﻘﻮام و اﻟﺤﺠﻢ ﺣﻴﺚ ﻣﻦ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ ﻟﻠﻤﺴﺘﻌﻤﺮات اﻟﻌﺎم أﺷﻜﻞ وﺗﺸﻤﻞ
واﻟﺼﺒﻐﺎتاﻟﻌﺎﺋﻞ ﻋﻠﻰ وﺗﺄﺛﺮاهﺎ ،اﻟﺒﻴﺌﺎت ﻋﻠﻰ اﻟﻨﻤﻮ وﺳﺮﻋﺔ
Dr Alhudaib
- 8. وﻟﻮﺟﻲ اﻟﺴﻴﺮ اﻟﺘﺤﻠﻴﻞ)Serological Analysis(
اﻟﻤﺨﺘﻠﻔﺔ اﻟﺒﻜﺘﺮﻳﺎ أﻧﻮاع ﻟﺘﻌﺮﻳﻒ ﻣﺤﺪدة ﻣﻀﺎدة أﺟﺴﺎم اﺳﺘﻌﻤﺎل
اﻟﻨﻮوي اﻟﺤﻤﺾ ﺗﺤﻠﻴﻞDNAاﻟﻮراﺛﻴﺔ اﻷﺳﺲ ﺑﺎﺳﺘﻌﻤﺎل
وﻣﻮﺳﻮﻣﺎت اﻟﻜﺮ ﻋﻠﻰ اﻟﻨﻮوﻳﺔ اﻷﺣﻤﺎض ﺗﺮﺗﻴﺐ أن اﻟﻤﻌﺮوف ﻣﻦ
ﻧﻮع ﻟﻜﻞ اﻟﺜﺎﺑﺘﺔ اﻟﺼﻔﺎت ﻣﻦ ﻳﻌﺘﺒﺮ.اﻟﺘﻬﺠﻴﻦ ﻋﻤﻠﻴﺎت وﺑﺎﺳﺘﺨﺪام
Hybridizationاﻟﻤﺨﺘﻠﻔﺔ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ اﻷﻧﻮاع ﺗﻌﺮﻳﻒ ﻓﻲ.
Dr Alhudaib
- 10. اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﺗﺮﺗﻴﺐ وأﻳﻀﺎاﻟﻨﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔﻓﻲ
اﻟﻨﻮوي اﻟﺤﻤﺾRibosomal
RNAﻣﺪى ﻋﻠﻰ اﻟﻘﻮﻳﺔ اﻟﺪﻻﺋﻞ اﺣﺪ
ﺑﻴﻦ اﻟﻘﺮﺑﻰ ودرﺟﺔ اﻟﺘﻄﻮرﻳﺔ اﻟﻌﻼﻗﺔ
اﻷﻓﺮاد.ان ﻣﻌﺮوف هﻮ آﻤﺎ
اﻟﺮﻳﺒﻮﺳﻮﻣﺎتﺗﺨﻠﻴﻖ ﺑﻮﻇﻴﻔﺔ ﺗﻘﻮم
ﻓﺄﻧﻬﺎ وﻋﻠﻴﺔ اﻟﺨﻠﻴﺔ ﻓﻲ اﻟﺒﺮوﺗﻴﻨﺎت
اﻷﺣﻤﺎض ﺑﺘﺮﺗﻴﺐ ﺗﺤﺘﻔﻆاﻻﻣﻴﻨﻴﺔ
)اﻟﻘﻮاﻋﺪاﻟﻨﻴﺘﺮوﺟﻴﻨﻴﺔ(اﻟﺤﻤﺾ ﻓﻲ
اﻟﻨﻮويrRNA.اﻟﺤﻤﺾ هﺬا وﺑﺘﺤﻠﻴﻞ
وﺗﻌﺮﻳﻒ ﺗﺤﺪﻳﺪ ﻋﻠﻰ ﻳﺴﺎﻋﺪ ﻓﺄﻧﻪ
ﺣﺘﻰ اﻟﺪﻗﺔ ﻣﻦ ﻋﺎﻟﻴﺔ ﺑﺪرﺟﺔ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ
اﻟﻨﻮع درﺟﺔSpecies.
Dr Alhudaib
- 11. اﻟﻨﻮوي اﻟﺤﻤﺾ وﺗﺤﻠﻴﻞ اﻟﻨﻮوﻳﺔ اﻟﺤﻤﺾ ﺗﺮﺗﻴﺐrRNA
اﻟﻨﻮوي اﻟﺤﻤﺾ أن ﻣﻌﺮوف هﻮ آﻤﺎDNA or RNAﻋﻠﻰ ﻳﺤﺘﻮي
)ﺳﻜﺮﺧﻤﺎس+ﻓﺴﻔﻮر+ﻗﺎﻋﺪة)اﻻدﻧﻴﻦ-ﺛﻴﻤﻴﻦوﺟﻮاﻧﻴﻦ-ﺳﻴﺘﻮزﻳﻦ((
ﻧﺴﺒﺔ وﺑﻘﻴﺎساﻟﺠﻮاﻧﻴﻦواﻟﺴﻴﺘﻮزﻳﻦﻓﻲ هﻮ آﻤﺎ اﻟﻘﻮاﻋﺪ ﻣﺠﻤﻮع اﻟﻰ
اﻟﺘﺎﻟﻴﺔ اﻟﻤﻌﺎدﻟﺔ:
GC ratios = G+C÷(G+C+A+T) X 100
ﺗﻘﺎرب ﻋﻠﻰ ذﻟﻚ دل آﻤﺎ ﺧﻠﻴﺘﻴﻦ ﺑﻴﻦ ﻣﺘﻘﺎرﺑﺔ اﻟﻨﺴﺒﺔ هﺬﻩ آﺎﻧﺖ وآﻠﻤﺎ
ذﻟﻚ وﻣﺜﺎل اﻟﻜﺎﺋﻨﺎن هﺬان:
Erwinia GCr = 50-55%
Corynebacterium GCr = 70%
اﻟﻤﻤﺮﺿﺔPseudomonas GCr = 55-60%
اﻟﻤﻤﺮﺿﺔ اﻟﻐﻴﺮPseudomonas GCr = 59-67%
Dr Alhudaib
- 13. وﻳﺴﻤﻰ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ اﻟﻨﺒﺎﺗﺎت أﻣﺮاضPhytobacteriology
Erwin Smith (1853-1938)
اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ اﻟﻨﺒﺎت اﻣﺮاض ﻣﻦ اﻟﻌﺪﻳﺪ وﺻﻒواﻋﺮاﺿﻬﺎوﻋﺰﻟﻬﺎ
ﻋﺰﻟﻬﺎ ﻃﺮق وﺗﻄﻮﻳﺮ وﺗﻨﻤﻴﺘﻬﺎ.اﻣﺮاض ﻋﻠﻢ وﺟﺪ ﻣﻦ هﻮ وﻳﻌﺘﺒﺮ
اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ اﻟﻨﺒﺎت
Thomas Burrill (1839-1916)
ﺑﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺳﺒﺒﻬﺎ اﻟﻨﺎرﻳﺔ ﺑﺎﻟﻠﻔﺤﺔ اﻻﺻﺎﺑﺔ ان اﺛﺒﺖ)اﻟﻤﺤﺎﺿﺮة اﻧﻈﺮ
اﻻوﻟﻲ(
Jan Wakker (1859-1927)
ﻓﺮوض ﺑﺘﻄﺒﻴﻖ اﻟﻨﺒﺎت ﺗﺼﻴﺐ اﻟﺒﻜﺘﺮﻳﺎ ان اﺛﺒﺖ ﻣﻦ أول آﺎن
آﻮخDr Alhudaib
- 14. اﻟﻨﺒﺎﺗﺎت ﺗﺼﻴﺐ اﻟﺘﻰ ﺑﻜﺘﺮﻳﺎ وﻋﺰل ﺗﺸﺨﻴﺺ
Diagnosis of bacterial plant disease
•اﻟﺘﺒﻘﻌﺎتواﻟﻠﻔﺤﺎت
•اﻟﺘﺪرنواﻷورام
•اﻟﺬﺑﻮل
•اﻟﺘﻌﻔﻦ
•اﻟﺘﻘﺮح
Bacterial leaf spot & blight disease
Bacterial gall & tumor disease
Bacterial wilt disease
Bacterial rot disease
Bacterial canker disease
اﻻﻋﺮاض دراﺳﺔ
Dr Alhudaib
- 15. اﻟﺒﻜﺘﻴﺮي اﻟﻤﺴﺒﺐ ﻋﺰل:
اﻟﻤﺮﻓﻘﺔ اﻟﻮرﻗﺔ اﻧﻈﺮ
اﻟﻜﺜﻴﺮ ﻋﻠﻴﻪ وﺗﻨﻤﻮ اﺧﺘﻴﺎرﻳﺔ ﻏﻴﺮ ﺑﻴﺌﺔ ﻋﻠﻰ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﻋﺰل ﻳﺘﻢ آﺬﻟﻚ
اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﻣﻦ
اﻟﺤﻴﻮﻳﺔ اﻟﻤﻀﺎدات اﺧﺘﺒﺎر ﺣﺎﻟﺔ ﻓﻲ وﺗﺴﺘﺨﺪم اﺧﺘﻴﺎرﻳﺔ ﺷﺒﻪ ﺑﻴﺌﺔ أﻣﺎ
اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﻣﻦ واﺣﺪ ﻧﻮع ﺑﻨﻤﻮ ﻓﻘﻂ ﺗﺴﻤﺢ اﻟﺒﻴﺌﺔ وهﺬﻩ اﺧﺘﻴﺎرﻳﺔ ﺑﻴﺌﺔ
Dr Alhudaib
- 16. اﻟﻨﻘﻴﺔ اﻟﻤﺰرﻋﺔ:
اﻟﻮرﻗﺔ اﻧﻈﺮ
آﻠﻮﻧﻰ ﻋﻠﻰ ﺗﺤﺘﻮى ﻧﻘﻴﺔ ﺑﻴﺌﺔ ﻋﻠﻰ اﻟﺤﺼﻮل)Colony(واﺣﺪ
هﺬﻩ ﺗﻌﺘﺒﺮ ﺣﻴﺚاﻟﻜﻠﻮﻧﻰاﻟﻨﻘﻴﺔ واﻟﻤﺰرﻋﺔ واﺣﺪة ﺧﻠﻴﺔ ﻣﻦ ﺗﻄﻮر
اﻟﻼﺣﻘﺔ اﻟﺪراﺳﺎت ﻓﻲ ﻣﻬﻤﺔ
Dr Alhudaib
- 17. اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ وﺗﻌﺮﻳﻒ ﺗﺸﺨﻴﺺ:
اهﻤﻬﺎ ﻃﺮق ﺑﻌﺪة اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺗﺸﺨﻴﺺ ﻳﺘﻢاﻟﺴﻴﺮوﻟﻮﺟﻴﺔاﺳﺘﺨﺪام ﻣﺜﻞ
immuno-fluorescence and ELISAﻟﻬﺎ اﻟﻄﺮق وهﺬﻩ
ﺣﻮل ﻋﺎﻟﻲ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺗﺮآﻴﺰ ﻳﻜﻮن ان ﻟﺒﺪ ﺣﻴﺚ ﺳﻠﺒﻴﺎت)105-106
cells/ml(اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ اﻧﻮاع ﺑﻴﻦ اﻟﺘﺪاﺧﻞ وأﻳﻀﺎ.
DrAlhudaib
- 18. اﺧﺮى ﻃﺮق وهﻨﺎك:
وﻟﻮﻧﻬﺎ اﻟﺨﺎرﺟﻲ ﺑﺸﻜﻠﻬﺎ اﻟﻨﻘﻴﺔ اﻟﻤﺰرﻋﺔ ﻋﻠﻰ اﻟﺘﻌﺮف
ﺻﺒﻐﺘﻬﺎ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺔ اﻟﺨﻠﻴﺔ ﺑﺸﻜﻞ–او+
اﻟﺤﺮارة درﺟﺔ ﻣﺜﻞ اﻟﻔﺴﻴﻮﻟﻮﺟﻴﺔ اﻟﺼﻔﺎت)4-37ﻣﺌﻮﻳﺔ(
اﻟﻜﻴﻤﻴﺎﺋﻴﺔ اﻟﺼﻔﺎت
اﻟﺼﻔﺎتاﻟﺴﻴﺮوﻟﻮﺟﻴﺔ
اﻟﺤﺪﻳﺜﺔ اﻟﻄﺮقاﻟﻤﺴﺘﺨﺪاﻣﺔﻣﻨﻬﺎ اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ ﺗﻌﺮﻳﻒ ﻓﻲ
اﻟﻤﻀﺎدة اﻻﺟﺴﺎم اﺳﺘﺨﺪام)Monoclonal antibodies(
PCR
Real-time PCR
Dr Alhudaib
- 24. •آﻮخ ﻓﺮوض ﺑﺎﺳﺘﺨﺪام اﻟﺒﻜﺘﻴﺮي اﻟﻤﺮض اﺧﺘﺒﺎر
•اﻟﺴﺎﺑﻘﺔ اﻟﺘﻌﺮﻳﻒ ﻃﺮق واﺳﺘﺨﺪام ﻋﺰل أﻋﺎدة
•اﻟﺒﻜﺘﻴﺮﻳﺎ وﻣﻄﺎﺑﻘﺔ ﺳﺒﻖ آﻤﺎ اﻟﺘﻌﺮﻳﻒ أﻋﺎدة
•ﺑﺎﻟﻤﺮض اﻟﺘﻘﺮﻳﺮ وأﻋﺪاد اﻟﻤﻼﺣﻈﺎت آﺘﺎﺑﺔ
Dr Alhudaib