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はじめてのShiny
1.
続・はじめてのShiny
2013/01/26 Tokyo.R#28 和田 計也 サイバー系
2.
サイバー系
はじめに ※この発表は個人の見 解であり、所属する組 織の公式見解ではあり ません。 2 2013/01/26
3.
サイバー系
自己紹介 u 和田 計也(@wdkz) u 静岡県袋井市出身 u サイバー系企業でデータマイニングエンジニア職 u 最近は奥華子ばっか聴いてます u 前職はバイオベンチャー u バイオマーカ探索してた u 学生時代は枯草菌の研究 3 2013/01/26
4.
サイバー系
今日のお話 u Shinyとは? u とりあえずShiny u Shinyアプリの配布 u Shinyの実例 4 2013/01/26
5.
サイバー系
今日のお話 u Shinyとは? u とりあえずShiny u Shinyアプリの配布 u Shinyの実例 5 2013/01/26
6.
サイバー系
(いきなり脱線しますが)Mathematica 9が出ました u シャイニングウィザードと発音するみたいです 6 2013/01/26
7.
サイバー系
Mathematica 9が出ました u MathematicaからRを使うことで ➡こんなインタラクティブなのが出来るみたいです! 7 2013/01/26
8.
サイバー系
Shiny u それ出来ます、そうShinyを使えばね http://glimmer.rstudio.com/wdkz125/theWorld/ 8 2013/01/26
9.
サイバー系
Shinyとは? u Shinyとは、インタラクティブなWebアプリをR でチョー手軽に作れるRのライブラリ Rとnode.jsをwebsocketsで繋いでる感じ u 2012年11月に初登場 u Joe Chengさん作 (RStudio Inc.) UseR!2012でwebsocketsの話してた人やー 9 2013/01/26
10.
サイバー系
ShinyかわいいよShiny u rApacheとかあったじゃん!? だがあれはインタラクティブではない それにrApacheの作者はもう飽きたらしい すまん 飽きた UseR!2012でwebsocketsの話してた人やー 10 2013/01/26
11.
サイバー系
今日のお話 u Shinyとは? u とりあえずShiny u Shinyアプリの配布 u Shinyの実例 11 2013/01/26
12.
サイバー系
とりあえずShiny u さっきの再び出します u これを実際にやってみましょう 12 2013/01/26
13.
サイバー系
Shinyでwebアプリを作る① u 適当なフォルダを作成 今回の例では「01_plot」とした u その中に2個のファイルを作成 ⅰ)server.R ⅱ)ui.R 上記2つのファイル名は必ず こうしなければいけない!! 13 2013/01/26
14.
サイバー系
Shinyでwebアプリを作る② u viewの作成はui.R library(shiny) shinyUI(pageWithSidebar( headerPanel("Hello Shiny!"), sidebarPanel( numericInput("obs", "Number of points:", 1000), sliderInput("mean", "Mean:", min=-100, max=100, value=0), sliderInput("sd", "Standard Deviation:", min=0, max=100, value=1) ), viewは3つからなる mainPanel( ⅰ)ヘッダー・・・タイトル plotOutput("distPlot") ⅱ)サイドバー・・・インプットのとこ ) ⅲ)メイン・・・アウトプットのとこ )) 14 2013/01/26
15.
サイバー系
Shinyでwebアプリを作る③ u view部分ui.Rの深入り_sidebar inputオブジェクトには固有の名前をつけておく sidebarPanel( (server.Rから入力値を取得するのに使う) numericInput("obs", "Number of points:", 1000), sliderInput("mean", "Mean:", min=-100, max=100, value=0), sliderInput("sd", "Standard Deviation:", min=0, max=100, value=1) ), サイドバーは、 Inputを書き足すこと でどんどん増やせる。 Inputに何があ るかはCRAN上のShinyのReference Manual等を見るとわかる 15 2013/01/26
16.
サイバー系
Shinyでwebアプリを作る④ u logicの作成はserver.R library(shiny) ui.Rで定義した、アウトプットの固有名 shinyServer(function(input, output) { output$distPlot <- reactivePlot(function() { dist <- rnorm(input$obs, mean=input$mean, ui.Rで定義した、インプットの固有名を sd=input$sd) 使うことで値を取得できる hist(dist, prob=TRUE) lines(density(dist, adjust=2), lty="dotted", col="blue") }) }) メインパネルは、server.R内で reactive 関数をオーバーライドするこ とでinteractiveな描写ができるようにな る。reactive 関数に何があるかは Reference Manual等を見るとわかる 16 2013/01/26
17.
サイバー系
Shinyでwebアプリを起動する u カレントフォルダに01_plotフォルダ があってその中にserver.Rとui.Rと がある状態でRコンソールから > library(shiny) > runApp(“01_plot”) Listening on port 8100 デフォルトブラウザが起動 17 2013/01/26
18.
サイバー系
今日のお話 u Shinyとは? u とりあえずShiny u Shinyアプリの配布 u Shinyの実例 18 2013/01/26
19.
サイバー系
Shinyアプリの配布方法_ローカル編 u プログラムごと渡してローカルで起動してもらう 1.フォルダごとzipで固めて渡す。渡された人は解凍してR 起動してshiny::runApp( hogehoge )する 利点:最も汎用性高い 欠点:ITリテラシーの高くない人に、Rを起動してrunApp してもらうことの絶望感 2.Gistにコードを上げて shiny::runGist( hogehoge )してもらう 利点:URLを教えるだけでいいのが楽 欠点:社外秘情報を含むものには使えないし、1同様 3.@hoxo_mさん作成のOpenShiny.exeを使う 利点:ITリテラシーに関係なく使ってもらえそう 欠点:Winマシン限定。exeファイルを配布するというドキドキ感 19 2013/01/26
20.
サイバー系
3.OpenShiny.exeの紹介 u @hoxo_mさんが.netで作った「Shinyをワンクリックで起動する やつ」 配布方法:適当なフォルダに①「OpenShiny.exe」 ②「server.R」③「ui.R」を置いてフォルダごと配布 使用方法:もらった人はOpenShiny.exeをクリックするだけ!! フォルダ名は 適当なのつけてね 20 2013/01/26
21.
サイバー系
Shinyアプリの配布方法_サーバ編 u サーバにデプロイしてURLをみてもらう 4.rApacheに組み込んじゃう 無理 即答 5.Shinyホスティングサービス(RStudio.com運営)を使う 楽 β版だからいつ止まっても(有償化しても)おかしくない 社外秘情報を含むものには使えない 6.Shiny-serverを使ってデプロイ ちょい面倒だけど社内で使うならこれかな 21 2013/01/26
22.
サイバー系
5.RStudio.com運営shinyホスティングサービス u まああれだ、ホスティング用のアカウント発行したぜ!って いうe-mailに書かれてる通りやればできる 1.sshでログインして 2.自分のホームに /ShinyApp/ディレクトリ作って 3.そこに適当なディレクトリ(例えばtheWorld)作って 4.scpでそこにui.Rとserver.Rをアップロード http://glimmer.rstudio.com/wdkz125/theWorld/ ディレクトリ名 ユーザ名 22 2013/01/26
23.
サイバー系
6.Shiny-serverについて http://blog.rstudio.org/2012/12/04/shiny-update/ とりあえずlinux で動くけどwinと かmacosxで動 かないよ オープンソースに してみたよ!! 有償版も考えてるらしい 23 2013/01/26
24.
サイバー系
6.Shiny-server有償版についてわかっていること とりあえず、有償版では何らかの認証ができたらいいな って思ってるらしい 24 2013/01/26
25.
サイバー系
6.Shiny-serverのインストール u Shiny-severインストールに必要なもの 1. R.2.15.0以上 2. Rのshinyライブラリをユーザフォルダじゃないところに インストール 3. node.js 0.8.16以上 ubuntuの場合 sudo apt-‐get install python-‐software-‐properties python g++ make sudo add-‐apt-‐repository ppa:chris-‐lea/node.js sudo apt-‐get update sudo apt-‐get install nodejs npm u Shiny-severのインストール sudo npm install -‐g shiny-‐server sudo useradd -‐r shiny sudo mkdir -‐p /var/shiny-‐server/www sudo mkdir -‐p /var/shiny-‐server/log 25 2013/01/26
26.
サイバー系
6.Shiny-serverの起動 u 以下のディレクトリに適当な名前のディレクトリ作成して そこにui.Rとserver.Rとをコピって /var/shiny-server/www/AppName u 起動 sudo shiny-server u ブラウザからアクセス http://<hostname>:3838/AppName 26 2013/01/26
27.
サイバー系
今日のお話 u shinyとは? u とりあえずshiny u shinyアプリの配布 u shinyの実例 27 2013/01/26
28.
サイバー系
shinyの実例デモ u デモで使うデータはもちろんiris irisに関する詳しい資料は以下を参照して下さい➡ 「irisの正体 (R Advent Calendar 2012 6日目)」 http://d.hatena.ne.jp/tsutatsutatsuta/20121206/1354737461 28 2013/01/26
29.
サイバー系
shinyの利用例 tabで いろいろ 選べる 29 2013/01/26
30.
サイバー系
shinyの利用例 summ aryの tabを 選択す ると もっと下のほうにsummary結果も出てるんだけど、見えんな 30 2013/01/26
31.
サイバー系
shinyの利用例 ここでデータのレンジを絞ると、下のグラフ中のデータポイント も変化する 31 2013/01/26
32.
サイバー系
shinyの利用例 WebG L使って 3次元p lotも出 来る 32 2013/01/26
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サイバー系
shinyの利用例 決定木 選んで みたり 33 2013/01/26
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サイバー系
shinyの利用例 GLM選 んでみ たり 34 2013/01/26
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サイバー系
shinyの利用例 サイド バーも ックス チェッ オンオ クボ 変わる フで動 よ 的に 35 2013/01/26
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サイバー系
shinyのTips u staticなページ(タブ)を作りたい HTML()関数でhtmlを直書きする u インタラクティブすぎる submitButtonを配置すれば、ボタン押すまで反映しない u サイドバーパネルもインタラクティブにしたい conditionalPanelを使う conditionalPanel(condition= input.@@=true ,,,) u サイドバーパネルをもっとインタラクティブにしたい ui.R中はuiOutput("rice") みたいにしておいてserver.Rで output$rice <- reactiveUI(function(){ selectInput( gets , dandy , choice=1:10, selected=1) }) ってすればいい。↑ここでinputの値取得して条件分岐とかバリバリ書く 36 2013/01/26
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サイバー系
shinyのここがイマイチ u 日本語一切使えない。コメントにすら日本語が含まれると動かない u 左にサイドバーパネル、右にグラフパネルという構図が固定 幅とか変えたいのに.... u レンジスライダーのレンジを保持して左右に動いて欲しい u レンジスライダー、キーボードの矢印で操作できない u レンジスライダーにintegerの値しか使えない u submitButtonをcheckboxで出したり消したりしたい 37 2013/01/26
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サイバー系
参考文献 u shiny https://github.com/rstudio/shiny/ u shiny-server https://github.com/rstudio/shiny-server u tutorial http://rstudio.github.com/shiny/tutorial/ u google group https://groups.google.com/forum/?fromgroups#!forum/shiny-discuss u shinyでrglを使う https://github.com/trestletech/shiny-sandbox/tree/master/rgl u hoxo_mさんのShinyアプリをワンクリックで起動するやつ http://d.hatena.ne.jp/hoxo_m/20121122/p1 u バタデ先生の、みんなでシャイニイイイイイイイイイイイイイイイ http://d.hatena.ne.jp/dichika/touch/20130118/1358470135 38 2013/01/26
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サイバー系
まとめ 1. シャイニングウィザードを紹介して 2. ついでにshinyも紹介して 3. shinyアプリの配布方法も紹介して 4. 最後にデモった 39 2013/01/26