L application de la physique classique dans le golf.pptx
ConfEvolutionHumaineOrlando
1. L’EVOLUTION DE LA LIGNEE HUMAINE: L’HOMME, LA PALEONTOLOGIE, LES GENES ET LES GENOMES Ludovic ORLANDO Décembre 2008 Paléogénétique et Evolution moléculaire (33)4 72 72 84 65 [email_address] [email_address] Décembre 2008
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3. INTRODUCTION SINGES ANTHROPOMORPHES, GRANDS SINGES & HOMMES 8MA 12-13MA HOMO (BIPEDIE PERMANENTE) PAN (KNUCKLE-WALK) PONGIDES HOMINIDES (FAMILLE) HOMININES (TRIBU) HOMINOÏDES ~ SINGES ANTHROPOMORPHES (SUPERFAMILLE) SINGE ‘INFERIEUR’ GRANDS SINGES GIBBONS SIAMANG [email_address] Décembre 2008
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6. L’HOMO SAPIENS EVENT LES ORIGINES FOSSILES 400 - 30 KYA OMO-1 OMO-2 Herto [email_address] Décembre 2008 196 ±2 104 ±1 154±7 >160 Homo neanderthalensis Homo «erectus» Homo sapiens
7. L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) [email_address] Décembre 2008
8. L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) [email_address] Décembre 2008
9. L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) [email_address] Décembre 2008
10. L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) [email_address] Décembre 2008
11. L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) PREDICTION #1. DIVERSITE AFRICAINE > AUTRES CONTINENTS [email_address] Décembre 2008
12. PREDICTION #2. CROISSANCE DE LA DISTANCE GENETIQUE A L’AFRIQUE ET DECROISSANCE DE LA DIVERSITE AVEC LA DISTANCE GEOGRAPHIQUE L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) D GEN DV GEN D GEO /AFRIQUE D GEO INTERPOP. INTRAPOP. [email_address] Décembre 2008
13. L’HOMO SAPIENS EVENT L’OUT OF AFRICA (REMPLACEMENT RAPIDE) AFRIQUE AFRIQUE + AUTRES CONTINENTS PREDICTION #3. LIGNEES BASALES EN AFRIQUE UNIQUEMENT & ORIGINE <200 KYA [email_address] Décembre 2008
15. L’HOMO SAPIENS EVENT LE MULTIREGIONALISME HOMO « ERECTUS » [email_address] Décembre 2008
16. L’HOMO SAPIENS EVENT LE MULTIREGIONALISME HOMO « ERECTUS » HOMO SAPIENS [email_address] Décembre 2008
17. L’HOMO SAPIENS EVENT LE MULTIREGIONALISME PREDICTION #4. (MONOPHYLIE DES LIGNEES CONTINENTALES) & ORIGINE >1 MYA [email_address] Décembre 2008
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19. L’HOMO SAPIENS EVENT LES OBSERVATIONS (PREDICTIONS #1 & #3) [email_address] Décembre 2008
20. L’HOMO SAPIENS EVENT 1 LOCUS vs N LOCI GENEALOGIE DES GENES vs DES INDIVIDUS [email_address] Décembre 2008
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25. L’HOMO SAPIENS EVENT LES OBSERVATIONS: L’APPORT DES DONNEES NUCLEAIRES (Nb. HT / REGION GENOMIQUE - 54 CHR.) 2,834 SNPs – 12Mb – 927 INDIVIDUS [email_address] Décembre 2008
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27. L’HOMO SAPIENS EVENT LES OBSERVATIONS (PREDICTION #4) PRESENT DIVERGENCE T MRCA >= T DIVERGENCE MRCA MRCA 1 MRCA 2 [email_address] Décembre 2008
28. L’HOMO SAPIENS EVENT LES OBSERVATIONS (PREDICTION #4) POINT DE CALIBRATION SI CONSTANCE DE L’HORLOGE: 171.5 KYA 52.0 KYA [email_address] Décembre 2008
29. L’HOMO SAPIENS EVENT LES OBSERVATIONS (PREDICTION #4) [email_address] Décembre 2008
30. L’HOMO SAPIENS EVENT UNE NOUVELLE CRITIQUE DE L’OUT OF AFRICA N HAPLOTYPES ~ DIVERSITE << NON-AFRICAINES AFRICAINES EXPANSION DEMOGRAPHIQUE EXPANSION DEMOGRAPHIQUE [email_address] Décembre 2008
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34. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS ht ANCESTRAL DIVERSITE + FAIBLE APPARITION NOUVEAUX ht (+ RECENTS) EFFET FONDATEUR POP2 POP1 [email_address] Décembre 2008
35. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS DIVERSITE + FAIBLE APPARITION NOUVEAUX ht (+ RECENTS) EFFET FONDATEUR POP2 POP1 ht ANCESTRAL [email_address] Décembre 2008
36. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS DIVERSITE + FAIBLE APPARITION NOUVEAUX ht (+ RECENTS) EFFET FONDATEUR POP2 POP1 ht ANCESTRAL [email_address] Décembre 2008
37. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS DIVERSITE + FAIBLE APPARITION NOUVEAUX ht (+ RECENTS) EFFET FONDATEUR POP2 POP1 ht ANCESTRAL [email_address] Décembre 2008
38. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS DIVERSITE + FAIBLE APPARITION NOUVEAUX ht (+ RECENTS) EFFET FONDATEUR POP2 POP1 ht ANCESTRAL [email_address] Décembre 2008
39. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS DATER LA MIGRATION: LE PRINCIPE DE LA FOUNDER ANALYSIS HYPOTHESE: MIGRATION UNIQUE, INSTANTANEE RESEAU WORLDWIDE RESEAU POPULATION [email_address] Décembre 2008
40. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS RESEAU WORLDWIDE RESEAU POPULATION F1 F2 F3 F4 F6 F5 F7 [email_address] Décembre 2008
41. LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS RESEAU WORLDWIDE RESEAU POPULATION F1 F2 F3 F4 F6 F5 F7 3 MUTATIONS in 4 INDIVIDUS 3 in 4 2 in 3 3 in 3 2 in 3 3 in 4 2 in 2 SI TOUS LES Fi PROVIENNENT DE LA MÊME POPULATION & HORLOGE MOLECULAIRE (1 MUT / 20,000 ANS) ALORS LA POPULATION A ETE FONDEE IL Y A 18/23*20,000 ~ 15,562 ANS 18 in 23 [email_address] Décembre 2008
43. LIGNEES MATERNELLES LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS [email_address] Décembre 2008
44. LIGNEES PATERNELLES LA SORTIE D’AFRIQUE L’HISTOIRE DES MIGRATIONS https://www3.nationalgeographic.com/genographic/atlas.html [email_address] Décembre 2008
45. LA SORTIE D’AFRIQUE L’ORIGINE DE L’HABILLEMENT: LA SPECIATION POUX DE LA TÊTE / DU CORPS P. humanus capitis P. h. humanus P. h. corporis HABILLEMENT B H [email_address] Décembre 2008
46. LA SORTIE D’AFRIQUE L’ORIGINE DE L’HABILLEMENT: LA SPECIATION POUX DE LA TÊTE / DU CORPS K2 NJ ND4 + CYTB H [email_address] Décembre 2008
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48. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES SIGNATURES D’INTROGRESSIONS ANCIENNES PRESENT [email_address] Décembre 2008
49. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES SIGNATURES D’INTROGRESSIONS ANCIENNES PRESENT HYBRIDATION [email_address] Décembre 2008
50. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES SIGNATURES D’INTROGRESSIONS ANCIENNES PRESENT HYBRIDATION [email_address] Décembre 2008
51. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES SIGNATURES D’INTROGRESSIONS ANCIENNES PRESENT HYBRIDATION [email_address] Décembre 2008
52. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES SIGNATURES D’INTROGRESSIONS ANCIENNES Microcephalin D: Asp314His EXON 8 [email_address] Décembre 2008 DIVERGENT Homo POPULATION FUTURE Homo sapiens POPULATION
53. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES HYBRIDATIONS AVEC D’AUTRES HOMMES DU PASSE ? LEVEL C = MOUSTERIEN CHATELPERRONIEN CHATELPERRONIEN AURIGNACIEN POINTES COEXISTENCE MOUSTERIEN ~ NEANDERTAL CHATELPERRONIEN ~ NEANDERTAL AURIGNACIEN ~ SAPIENS [email_address] Décembre 2008
54. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES HYBRIDATIONS AVEC D’AUTRES HOMMES DU PASSE ? CRÂNE LARGEUR COURONNE DENTAIRE [email_address] Décembre 2008 NEANDERTALIENS 1ERS HOMMES SAPIENS D’EUROPE GRAVETTIEN (HOMMES SAPIENS) MUERII OASE 2 MLADEC
55. 3’OH 5’P N-GLYCOSIDIQUE PHOSPHODIESTER NUCLEOTIDE A T NICK G C 5’P .. .. .. AAAGTCGCGA TGCGCATAGCGATAGCAGCATATGCCCAGATATCG GATATCGCG A SITE ABASIQUE T 5’-PROTRUDENTES 5’P A T NICK -ELIMINATION DESAMINATIONS (URACILES) AUTTCGCGATATC CGATATCTGGGCATAGGCTGCTAT h GCTATGCGCATTCGCGACTTT G G C C CROSSLINK ADN-ADN T h OXYDATIONS (HYDANTOINES) d [email_address] Décembre 2008 A U T T A T 3’OH a e f c b
56. AMPLIFICATION (PCR) EXTRACTION SEQUENCAGE ANALYSE BIOINFORMATIQUE DEGRADATIONS TAPHONOMIQUES PROBLEMES DE CONTAMINATIONS SALLES BLANCHES LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL MANIPULER DE L’ADN FOSSILE [email_address] Décembre 2008
57. LES POPULATIONS D’HOMMES MODERNES DES HYBRIDATIONS AVEC D’AUTRES HOMMES DU PASSE ? Feldhofer I Vindija 75 Vindija 80 El Sidron 1252 Mt. Lessini Mezmaïskaya Feldhofer II Okladnikov Scladina Teshik Tash Homo sapiens 0.005 HVR-1 660 KYA [email_address] Décembre 2008
58. LA RENCONTRE AVEC NEANDERTAL DES HYBRIDATIONS AVEC D’AUTRES HOMMES DU PASSE ? LARGEUR COURONNE DENTAIRE [email_address] Décembre 2008 MLADEC NEANDERTALIENS 1ERS HOMMES SAPIENS D’EUROPE GRAVETTIEN (HOMMES SAPIENS)
59. LES POPULATIONS D’HOMMES MODERNES HYBRIDATIONS ? L’APPORT GENOMIQUE END-REPAIR 1 2 [email_address] Décembre 2008
60. LES POPULATIONS D’HOMMES MODERNES HYBRIDATIONS ? L’APPORT GENOMIQUE Homo GENERIC PRIMERS [email_address] Décembre 2008
61. LES POPULATIONS D’HOMMES MODERNES HYBRIDATIONS ? L’APPORT GENOMIQUE [email_address] Décembre 2008
62. SNP T A A A C A >0.5 MY T <0.2 MY A SITUATION PASSEE, AU MOMENT DE L’HYBRIDATION SNP T A A C A >0.5 MY T <0.2 MY A SITUATION ACTUELLE, APRES HYBRIDATION: ► INTROGRESSION NEANDERTALIENNE DANS LE POOL GENIQUE SAPIENS ► SEGREGATION DE POLYMORPHISMES ARCHAÎQUES CHEZ NEANDERTAL C C LES POPULATIONS D’HOMMES MODERNES HYBRIDATIONS ? L’APPORT GENOMIQUE [email_address] Décembre 2008
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64. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE GENOMIQUE COMPAREE A T A ? A 0.5MY Homme moderne AGCTCTAACTGCTTATAGTCGTATACGCGCTA Néandertal .........A...................... Australopithèque ???????????????????????????????? Chimpanzé .........A...................... Gorille .........A...................... ? T A ? A 6-8MY A A A A A ? ? A SANS GENOME NEANDERTALIEN AVEC GENOME NEANDERTALIEN ? ALIGNEMENT D’UNE REGION HOMOLOGUE DU GENOME [email_address] Décembre 2008
65. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE GENOMIQUE COMPAREE: HOMME vs CHIMPANZE [email_address] Décembre 2008 GAIN DE FONCTION Ex. LANGAGE PERTE DE FONCTION Ex. PILLOSITE REGULATION
66. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE GENOMIQUE COMPAREE: HOMME vs CHIMPANZE RECEPTEURS OLFACTIFS (>1,000 GENES) PSEUDOGENES [ / 50] %DIVERGENCE MOINDRE DEPENDANCE CHEMOSENSORIELLE >2 INDIVIDUS / ESPECE [email_address] Décembre 2008
67. PEDIGREE FAMILIAL KE ATTEINT LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE LE LANGAGE ARTICULE RIGHT RIGHT LEFT LEFT KE WORD REPETITION TEST CEREBELLUM MEDULLA FOREBRAIN [email_address] Décembre 2008
68. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE LE LANGAGE ARTICULE: LE GENE FOX-P2 MUTATIONS NON-SYNONYMES DATATION 0-200 KYA [email_address] Décembre 2008
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70. SNPs: X, Y, CHR. 8 AFRICA WORLWIDE CHR.8 / CHR. X T C A T C A A C - T C T T G ANCESTRAL DERIVE ? LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE LE LANGAGE ARTICULE n=98 n=18 n=18 % PCRs INDEPENDENTES QUASI-ABSENCE DE CONTAMINATION PAR DE L’ADN MODERNE n=53 EXTRACT #1253 [email_address] Décembre 2008
71. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE LE LANGAGE ARTICULE n=98 n=18 n=18 n=57 n=16 n=53 EXTRACT #1253 FOX-P2 AFRICA WORLWIDE ANCESTRAL DERIVE % PCRs INDEPENDENTES C 911 A 977 C 911 A 977 A 911 G 977 A 911 G 977 A 911 G 977 [email_address] Décembre 2008
72. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE TRANSCRIPTOMIQUE COMPAREE [email_address] Décembre 2008
73. LES SPECIFICITES DE L’HOMME MODERNE TRANSCRIPTOMIQUE COMPAREE SELECTION SEXUELLE ? CONTRE-SELECTION DES CHANGEMENTS DE NIVEAUX D’EXPRESSION SP j SP k GENE i DISTANCES PAR COUPLES DE VALEUR [email_address] Décembre 2008
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76. PERSPECTIVES UN NOUVEAU VENU: HOMO FLORESIENSIS 380-410cc ~1m INDIVIDU MALADE / DIFORME ? MICROCEPHALIE PIGMEES INDIVIDU SAIN ? NANISME INSULAIRE F, 30 ANS [email_address] Décembre 2008
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78. PERSPECTIVES DE L’ADN D’AUTRES HOMMES PREHISTORIQUES ? Homo heidelbergensis Atapuerca (350-500 KYA) Homo floresiensis Flores (12-95 KYA) Larson et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Sep 25 Valdiosera et al. Biol Lett. 2006 Dec 22 [email_address] Décembre 2008
![L’EVOLUTION DE LA LIGNEE HUMAINE: L’HOMME, LA PALEONTOLOGIE, LES GENES ET LES GENOMES Ludovic ORLANDO Décembre 2008 Paléogénétique et Evolution moléculaire (33)4 72 72 84 65 [email_address] [email_address] Décembre 2008](https://image.slidesharecdn.com/confevolutionhumaineorlando-23652/85/ConfEvolutionHumaineOrlando-1-320.jpg)
![[object Object],STREPSIRHINIENS PEIGNE DENTAIRE TRUFFE A VIBRISSES HAPLORHINIENS PLACENTA HEMOCHORIAL PROSIMIENS SIMIIFORMES ORBITE REDUITE, FERMEE DVT CEREBRAL SINGES ANTHROPOMORPHES LORIS, GALAGO TARSIERS SINGES DU OW PLATYRRHINIENS QUEUE PREHENSILE NARINES CLOISONNEES SINGES DU NW LEMURIENS INTRODUCTION LA PLACE DE L’HOMME PARMI LES PRIMATES CATARRHINIENS NARINES VERS LE BAS, FINE CLOISON PROCONSUL KENYA HOMINOÏDES COCCYX AEGYPTOPITHECUS EGYPTE [email_address] Décembre 2008](data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAIAAAAAAAP///yH5BAEAAAAALAAAAAABAAEAAAIBRAA7)