El documento describe CromoCat y GenoCat, dos bases de datos genéticas de Cataluña con estrategias diferentes. CromoCat almacena datos cromosómicos e incluye referencias bibliográficas, mientras que GenoCat almacena datos de diversidad genética molecular. Recientemente se ha migrado la información a un gestor de documentos para permitir un acceso más fácil y seguro a las fuentes primarias y herramientas colaborativas.

1. CromoCat y GenoCat: dos bases de datos genéticas con estrategias diferentes Joan Simon & Cèsar Blanché Laboratorio de Botánica, Facultad de Farmacia, Universidad de Barcelona Grupo de Biología de la Conservación BioC (GREB, IRBio) C Cromo Cat

3. (Sobre-)Abundancia de datos BIOC La recopilación de la diversidad de los genes y de su distribución es muy incipiente Relativamente pocos y recientes sistemas almacenan datos a nivel genético

4. Procesamiento de datos BIOC Informática de la biodiversidad ( Biodiversity Informatics ) centrado en los organismos individuales, poblaciones y taxones, y su interacción Bioinformática centrado en la biología molecular

5. Procesamiento de datos: resultados BIOC En general, a partir de datos , se genera información (datos interpretados), conocimiento (información sintetizada en forma de reglas y propiedades) y experiencia

9. Consulta BDBC BIOC

10. Diversidad genética BDBC BIOC

13. Recuentos totales BIOC

14. Tareas básicas base de datos BIOC captura de datos transferencia información análisis e interpretación VALIDACIÓN RESPONSABLES Evaluación de los usuarios

16. Fuentes: IPCN / Tropicos BIOC

17. Bases de datos / Europa BIOC

18. Específicas: DNA C-values BIOC

19. Bases de datos especializadas BIOC

20. PubMed / GenBank BIOC

21. Genetical Flora Database BIOC

22. CromoCat/GenoCat: estrategia BIOC CromoCat Datos cromosómicos BASE DE DATOS GESTOR DE DOCUMENTOS Referencias bibliográficas (documentos a texto completo) · CRO-IN · CRO-OUT migración

23. Genocat: migración BIOC GENOCAT v 1.0 (2006) Tablas de valores de C-DNA GENOCAT v. 2.0 (2007) Tabla de Refworks

26. Proveedores BD bibliográficos BIOC SFX fue el primer protocolo en la resolución de enlaces OpenURL

28. Búsqueda información BIOC CROMOCAT (Género o especie + 21 palabras clave) chromosomal chromosome cytogenetic cytogenetical cytogenetics cytological cytology cytotaxonomic cytotaxonomical cytotaxonomy cytotypes karyological karyomorphological karyosystematic karyotaxonomical karyotype karyotypes phylogenetic polyploidy aneuploid poliploid GENOCAT (Género o especie + 29 palabras clave) genetic molecular phylogenetic DNA rbcL 18s AFLP AFLPs RAPD PCR ITS ISSR SSR allozyme allozymes allozymic phylogenetic markers microsatellite isozyme gene population RFLP cpDNA sequence RNA DNA, phylogeography phylogeographic

29. Algunas reflexiones BIOC

30. Biological Flora / Monografías BIOC

31. Herramientas colaborativas BIOC (REPOSITORIO) (WIKI)

33. De la web social a la semántica BIOC Web 2.0 Web 3.0

35. Metadatos BIOC Para compartir datos es imprescindible incorporar metadatos (información que describe el contenido, calidad, estructura y accesibilidad de una serie de datos concreta) y el correcto almacenamiento de los mismos junto a los datos Barreras logísticas para compartir (herramientas y protocolos diferentes)

36. Metadatos BIOC Conseguir la estandarización de los metadatos permite definir una terminología común y posibilita llevar a cabo la entrada, validación, acceso, integración y síntesis de los datos de manera automatizada

37. Estructura de servicios BIOC Entrada de datos (CENTRALIZACIÓN) (DISPONIBILIDAD) (CLOUD COMPUTING) Biocat Microsoft Access®

38. Agradecimientos: este trabajo es financiado por el DMAH de la Generalitat de Catalunya y es consultable en línea a través del Banco de Datos de Biodiversidad de Cataluña ( http://biodiver.bio.ub.es/biocat/homepage.html ) Cromo Cat