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Implementación de un
Repositorio de Datos Científicos
usando Dspace
Edwin Barrios, Rodrigo Torréns
Centro Nacional de Cálculo Científico,
Universidad de Los Andes, (CECALCULA) Mérida, Venezuela
Luis A. Torres
Grupo Halley, de Astronomía y Ciencias Aeroespaciales
Universidad Industrial de Santander Bucaramanga, Colombia
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Centro Virtual de Altos Estudios en Altas Energías
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e-research
• Descubrimiento. Soportes físicos de
almacenamiento
• archivos de medición del instrumento
• Cuaderno bitácora del investigador.
• Recuperación. Acceso y normalización en algún
formato.
• Análisis. Mecanismos para procesar y analizar los
datos y construir información y, posteriormente
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• Resultados. A partir de análisis de los datos se
obtienen los resultados, generando información y
conocimiento.
• Almacenamiento. Los datos y los resultados de sus
análisis son almacenados para luego ser
catalogados y diseminados.
• Catalogación y Publicación. Parte/todos los datos
(medidos, simulados y procesados ) son
diseminados, utilizado y reutilizados por los
investigadores..
Ciclo de vida
de los datos
Puntos cruciales de los repositorios de datos:
• Generadores de creación. Cada vez mas, la actividad de I+D de apoya, con mayor énfasis, en
reportes técnicos que emergen del modelado y remodelado datos. Las las publicaciones
acabadas son vistas como un producto final luego de varios de estos reportes. Esa situación se
nota con mayor frecuencia en las grandes colaboraciones. Disponer de repositorios de datos
que preserven los distintos resultados del modelado se hace imprescindible
• Conectores de Comunidades.. Los ambientes de preservación reflejan el tipo de investigación
que se está desarrollando y los metadatos informan sobre el tipo y calidad de las medidas.
Cada vez mas la interrelación entre distintas fuentes de datos, proveniente de distintas
disciplinas, se convierte en el centro de la actividad para la producción de conocimiento.
• Curaduría de Datos. Las redes de repositorios se convierten en bancos de preservación de
datos. Las volátiles y frágiles bitácoras de laboratorios, o los archivos en sistemas de medición
son transportados y clasificados a sistemas robustos desde donde pueden ser accedidos mucho
tiempo después de que el experimento haya finalizado e, inclusive, de que el grupo de
investigación que lo generó se haya disuelto.
R.E Luce. No Brief Candle: Reconceiving Research Libraries for the 21st Century, volume 142, chapter A New Value Equation
Challenge: The Emergence of eResearch and Roles for Research Libraries,, pages 42–51. Council on Library and Information
Resources, 2008.
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•Física
•BaBar (Colaboración mundial, SLAC)
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•VE:
•Univ Los Andes
•Univ Central de Venezuela
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•Univ Industrial Santander
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• Se implementa una rutina en Java para
optimizar la visualización de la
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• Se implementa una rutina en Java para
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• Datos LAGO se clasifican en tres tipos
– Datos de calibración del Instrumento
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• Cada archivo de datos está tipificado por un
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Choroní, 2nd EELA-2
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• Rutina en Java para Auto-ingestión
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• Generación automática del
formato Simple Archive Format
de DSpace.
• Generación automática de
metadatos por medio de la
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• Ingestión automática al
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ARQUITECTURA DE LAGODATOS
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Equipo LAGODatos
• Rodrigo Torréns torrens@ula.ve
• Luis A. Torres luis.torres@correo.uis.edu.co
• Luis A. Núñez lnunez@uis.edu.co y nunez@ula.ve
AGRADECIMIENTOS
Los autores agradecen los financiamiento de RedCLARA, bajo el programa de
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¡ Gracias !

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Implementación de repositorio científico Dspace LAGO

  • 1. Implementación de un Repositorio de Datos Científicos usando Dspace Edwin Barrios, Rodrigo Torréns Centro Nacional de Cálculo Científico, Universidad de Los Andes, (CECALCULA) Mérida, Venezuela Luis A. Torres Grupo Halley, de Astronomía y Ciencias Aeroespaciales Universidad Industrial de Santander Bucaramanga, Colombia Luis A. Núñez Centro Virtual de Altos Estudios en Altas Energías Universidad Industrial de Santander Bucaramanga, Colombia Centro Nacional de Cálculo Científico, Universidad de Los Andes, (CECALCULA) Mérida, Venezuela
  • 2. Radio Lejano Infrarojo Visible Visible + rayosX Polvo Densidad Galactica SSimulaciones de Supernovas Simulaciones Estructura del Universo ¿ De los datos al conocimiento ? Tsunami de Datos En los últimos 5 años de Astronomía se han generado más datos que en toda su historia
  • 4.
  • 5.
  • 6. • Descubrimiento. Soportes físicos de almacenamiento • archivos de medición del instrumento • Cuaderno bitácora del investigador. • Recuperación. Acceso y normalización en algún formato. • Análisis. Mecanismos para procesar y analizar los datos y construir información y, posteriormente conocimiento • Resultados. A partir de análisis de los datos se obtienen los resultados, generando información y conocimiento. • Almacenamiento. Los datos y los resultados de sus análisis son almacenados para luego ser catalogados y diseminados. • Catalogación y Publicación. Parte/todos los datos (medidos, simulados y procesados ) son diseminados, utilizado y reutilizados por los investigadores.. Ciclo de vida de los datos
  • 7. Puntos cruciales de los repositorios de datos: • Generadores de creación. Cada vez mas, la actividad de I+D de apoya, con mayor énfasis, en reportes técnicos que emergen del modelado y remodelado datos. Las las publicaciones acabadas son vistas como un producto final luego de varios de estos reportes. Esa situación se nota con mayor frecuencia en las grandes colaboraciones. Disponer de repositorios de datos que preserven los distintos resultados del modelado se hace imprescindible • Conectores de Comunidades.. Los ambientes de preservación reflejan el tipo de investigación que se está desarrollando y los metadatos informan sobre el tipo y calidad de las medidas. Cada vez mas la interrelación entre distintas fuentes de datos, proveniente de distintas disciplinas, se convierte en el centro de la actividad para la producción de conocimiento. • Curaduría de Datos. Las redes de repositorios se convierten en bancos de preservación de datos. Las volátiles y frágiles bitácoras de laboratorios, o los archivos en sistemas de medición son transportados y clasificados a sistemas robustos desde donde pueden ser accedidos mucho tiempo después de que el experimento haya finalizado e, inclusive, de que el grupo de investigación que lo generó se haya disuelto. R.E Luce. No Brief Candle: Reconceiving Research Libraries for the 21st Century, volume 142, chapter A New Value Equation Challenge: The Emergence of eResearch and Roles for Research Libraries,, pages 42–51. Council on Library and Information Resources, 2008.
  • 8. Sistemade Información BioClimática delSurdelLago deMaracaibo Aroa El Moralito Pueblo Nuevo CIPLAT- Est. Chama CeCalCULA Mapas Gráfic os Boletine s Productores Agricultores Investigadores Intern et Estaciones Meteorológicas Datos de Satélites Datos Numéricos Internet Datos de Satélites Estación Repetidora Estaciones Receptoras CIPLAT, Est. Chama Estaciones Meteorológicas (Sur del Lago) Investigadores, Productores, Usuarios CeCalCULA (Procesamiento de los datos) Estaciones Meteorológicas (Mérida)
  • 9. HY Contreras, Z Méndez, R Torréns, y LA Núñez. Desarrollo de la red bioclimática del estado mérida, venezuela: Estrategias de captura, manejo y preservación de datos ambientales. Interciencia, 33(11):795, 2008. http://www.saber.ula.ve
  • 10.
  • 11. Centro Virtual de Altos Estudios en Altas energías cevale2 •Física •BaBar (Colaboración mundial, SLAC) •LAGO (Colaboración, LA) •ATLAS (Colaboración mundial, CERN) •TIC GridComputing/GridCollaboration •Estudios Sociales / Comunicación Científica •VE: •Univ Los Andes •Univ Central de Venezuela •CO •Univ Industrial Santander •Univ Antonio Nariño •Univ Tolima •Univ del Norte Barranquilla
  • 12. ¡ 250 Km! ~ 20 univs la frontera más activa de América Latina Corredor Binacional de Ciencia y Tecnología
  • 13. LAGO: Large Aperture GRB Observatory Fisica Solar GRB Sierra Negra 4600 msnm Chacaltaya 5300msnm Mérida 4700 msnm Malargue 1400 msnm
  • 14. LAGO Binacional •Superposición de vista •Distancias equivalentes a otras intalaciones •Inicio del Corredor de CyT
  • 15. • Repostiorios de Datos LAGO: los destellos gamma preservados y al alcance LAGO-DRWCD
  • 17. • Acceso a Red de Repositorios de Datos • Análisis y minería de datos
  • 18. Instalación de DSpace Instalación de LAGODatos Cambio en el código fuente de Dspace y de su instalador.
  • 19. • Se adapta la Interfaz de DSpace para las necesidades del Grupo. INTERFAZ DE USUARIO - LAGODATOS
  • 20. • Se implementa una rutina en Java para optimizar la visualización de la jerarquía Comunidad – Colección. • Se implementa una rutina en Java para optimizar la selección de Comunidades – Colecciones.
  • 21. • Datos LAGO se clasifican en tres tipos – Datos de calibración del Instrumento – Medidas de los Instrumentos WCD – Datos Simulados • Cada archivo de datos está tipificado por un modelo de metadatos adaptado a LAGO • El modelo de metadatos LAGOvirtual es una adaptación del CCLRC (Council for the Central Laboratory of the Research Councils. UK) y Dublin Core
  • 22. Choroní, 2nd EELA-2 Conference. 25-27 november 2009 22
  • 23. Choroní, 2nd EELA-2 Conference. 25-27 november 2009 23 LAGOvirtual user interface Item Metadata Item archivos asociados
  • 24. Choroní, 2nd EELA-2 Conference. 25-27 november 2009 24 LAGOvirtual user interface Data file
  • 25. LAGODATOS - AUTOINGESTIÓN • Rutina en Java para Auto-ingestión de Datos. • Generación automática del formato Simple Archive Format de DSpace. • Generación automática de metadatos por medio de la cabecera de los archivos. • Ingestión automática al repositorio mediante línea de comandos.
  • 27. LAGO Virtual Acceso Instrumentos instumental Datos Compartidos Reales/Simulados Ambiente de análisis y simulación en Línea Base de Conocimientos Portal LAGO Virtual Portal AIRES (AIRshower Extended Simulations) CORSIKA (COsmic Ray SImulations for KAscade)
  • 28. Equipo LAGODatos • Rodrigo Torréns torrens@ula.ve • Luis A. Torres luis.torres@correo.uis.edu.co • Luis A. Núñez lnunez@uis.edu.co y nunez@ula.ve AGRADECIMIENTOS Los autores agradecen los financiamiento de RedCLARA, bajo el programa de ComCLARA2010 y de la Vicerrectoría de Investigación y Extensión de la Universidad Industrial de Santander, Bucaramanga Colombia bajo el proyecto GridUIS2 5541 ¡ Gracias !