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19/06/2013
Curso formativo SpainRDR 2013
Introducción a los estándares y
sistemas de codificaciĂłn de
enfermedades (I)
Miguel Angel Mayer
Research Program on Biomedical Informatics
IMIM - Universitat Pompeu Fabra, Barcelona
19/06/2013
Curso formativo SpainRDR
¿Qué son los estándares y los
sistemas de codificaciones?
• Son un conjunto de conceptos
estructurados, diseñados para describir
de una forma más precisa y sin
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informaciĂłn
• Conceptos relacionados: terminologías,
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nomenclaturas, clasificaciones…
2
19/06/2013
Curso formativo SpainRDR
Objetivos generales
• No es necesario “reinventar la rueda”
cuando se desarrollan nuevos sistemas
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• Facilitan:
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• Ayudas técnicas para personas con
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Lenguajes de integraciĂłn de informaciĂłn
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19/06/2013
Curso formativo SpainRDR
Retos y acciones (I)
• Son necesarios diversos sistemas de
codificaciĂłn
• La implementación de estándares debe
tener en cuenta:
– La heterogeneidad de los sistemas
– Cambios en los contenidos
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19/06/2013
Curso formativo SpainRDR
Retos y acciones (II)
• Integración con codificaciones locales
• En el plan de implementación:
– Interoperabilidad con los sitemas y datos
anteriores
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en su implementaciĂłn
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19/06/2013
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Otras consideraciones
• La codificación correcta de los
diagnĂłsticos es fundamental
• Debe tenerse en cuenta el personal que
realiza las codificaciones
• Los sistemas automatizados de
codificaciĂłn deben evaluarse
7
19/06/2013
Curso formativo SpainRDR
Referencias bibliográficas
• Mayer MA. Why interoperability and use of coded terminologies and
standards in Biomedicine and Health Care are so important.
INBIOMEDvision. Translational and Integrative Bioinformatics
Postgraduate course. Barcelona, 2013.
• Jensen PB, Lars J, Brunak S. Mining electronic health records: towards
better research applications and clinical care. Nature Review Genetics
2012;13:395-405.
• Stanfill et al. A systematic literature review of automated clinical coding
and classifications systems. JAMIA 2010;17:646-651.
• Richesson RL, Krischer J. Data Standards in Clinical Research: gaps,
overlaps, challenges and future directions. JAMIA 2007;14(6):687-696.
• Shortliffe EH. Biomedical Informatics. Computer Applications in Health
Care and Biomedicine. Springer, 2006.
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SpainRDR

  • 1. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR 2013 IntroducciĂłn a los estándares y sistemas de codificaciĂłn de enfermedades (I) Miguel Angel Mayer Research Program on Biomedical Informatics IMIM - Universitat Pompeu Fabra, Barcelona
  • 2. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR ÂżQuĂ© son los estándares y los sistemas de codificaciones? • Son un conjunto de conceptos estructurados, diseñados para describir de una forma más precisa y sin ambigĂĽedades, diferentes tipos de informaciĂłn • Conceptos relacionados: terminologĂ­as, diccionarios, vocabularios, ontologĂ­as, nomenclaturas, clasificaciones… 2
  • 3. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR Objetivos generales • No es necesario “reinventar la rueda” cuando se desarrollan nuevos sistemas de informaciĂłn (HCE, BD biomĂ©dicas, informaciĂłn farmacolĂłgica, imágenes) • Facilitan: – el intercambio de de datos entre sistemas – análisis de datos – evitar la redundancia 3
  • 4. Sistemas de clasificaciĂłn y codificaciĂłn Estándares de comunicaciĂłn HCE • HL7 • DICOM • LOINC Clasificaciones internacionales de problemas de salud: - Familia Internacional de Clasificaciones de la OMS (FIC-OMS, 2004) de referencia • CIE (CIE-9-MC, CIE-10) • ICF (Functioning, Disability and Health) • ClasificaciĂłn Internacional de Intervenciones Sanitarias • DSM-IV-TR - Codificaciones internacionales de problemas de salud (WONCA) • CIPSAP (problemas de salud) • CIAP i CIAP-2 - ISO 9999 de la International Organization for Standardzitation • Ayudas tĂ©cnicas para personas con discapacidad Lenguajes de integraciĂłn de informaciĂłn biomĂ©dica • UMLS • SNOMED-CT 4
  • 5. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR Retos y acciones (I) • Son necesarios diversos sistemas de codificaciĂłn • La implementaciĂłn de estándares debe tener en cuenta: – La heterogeneidad de los sistemas – Cambios en los contenidos – Versiones – Cobertura – EvoluciĂłn histĂłrica 5
  • 6. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR Retos y acciones (II) • IntegraciĂłn con codificaciones locales • En el plan de implementaciĂłn: – Interoperabilidad con los sitemas y datos anteriores – Tener en cuenta el esfuerzo coste/beneficio en su implementaciĂłn – Coste/beneficio de la actualizaciĂłn y mapeos – Escalabilidad (flexible y extensible) 6
  • 7. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR Otras consideraciones • La codificaciĂłn correcta de los diagnĂłsticos es fundamental • Debe tenerse en cuenta el personal que realiza las codificaciones • Los sistemas automatizados de codificaciĂłn deben evaluarse 7
  • 8. 19/06/2013 Curso formativo SpainRDR Referencias bibliográficas • Mayer MA. Why interoperability and use of coded terminologies and standards in Biomedicine and Health Care are so important. INBIOMEDvision. Translational and Integrative Bioinformatics Postgraduate course. Barcelona, 2013. • Jensen PB, Lars J, Brunak S. Mining electronic health records: towards better research applications and clinical care. Nature Review Genetics 2012;13:395-405. • Stanfill et al. A systematic literature review of automated clinical coding and classifications systems. JAMIA 2010;17:646-651. • Richesson RL, Krischer J. Data Standards in Clinical Research: gaps, overlaps, challenges and future directions. JAMIA 2007;14(6):687-696. • Shortliffe EH. Biomedical Informatics. Computer Applications in Health Care and Biomedicine. Springer, 2006. 8