Cardiomiopatia Hipertrófica, estudo genético

1. Módulo I.I – Biologia Molecular e Celular
CARDIOMIOPATIA
HIPERTRÓFICA
Margarida Fernandes
Brandon Allan
Carolina Medo
João Faria
Daniel Carvalho
2013/2014

2.  Heterogeneidade génica
 Descrição da doença
 Manifestações clínicas
 Hereditariedade
 Diagnóstico
 Mapping
 Tratamentos
 Dados populacionais
 Pateogénese
1. A) QUE INFORMAÇÕES SOBRE HCM SE PODEM
OBTER NESTA BASE DE DADOS (OMIM OU
GENETESTS)?

3. O QUE É UM SARCÓMERO?

5.  Autossómica Recessiva.
 21 genes, entre os quais TNNT2.

6. Proteína Gene LOCUS
Cadeia pesada β -
miosina
MYH7 14q12
Proteína C que liga à
miosina
MYBPC3 11p11.2
Troponina T cardíaca TNNT2 1q32
Troponina I cardíaca TNNI3 19q13.4
α-Tropomiosina TPM1 15q22.1
Cadeia leve miosina
reguladora
MYL2 12q24.11
Teletonina TCAP 17q12
Troponina C TNNC1 3p21.1
Titina TTN 2q31
α2-Actina ACTN2 1q43
Cadeia leve miosina
essencial
MYL3 3p21.2-p21.3
α-Actina ACTC1 15q11-q14
Cisteína e Glicina tipo 3 CSRP3 11p15.1
Cadeia pesada da α-
miosina
MYH6 14q12
CONTINUAÇÃO
1.C)
1.B) QUE
PROTEÍNAS
SÃO
CODIFICADAS
POR ESTE OU
ESTES GENES?

7. Proteína Gene LOCUS
F actin binging protein CMH20 1p31.1
Calreticulin 3 CALR3 19p13.11
Phospholamban PLN 6q22.31
Junctophilin 2 JPH2 20q13.12
Myozenin 2 MYOZ2 4q26
Vinculin CMH15 10Q22.2

8. 2. RELATIVAMENTE AO GENE
ASSOCIADO À DOENÇA EM ESTUDO
(CONSIDERAR O GENE TNNT2 NA
HCM), PROCURE-O NUMA BASE DE
DADOS DE SEQUÊNCIAS GENÓMICAS,
ENSEMBL OU NCBI.

9. 2.1. EM QUE CROMOSSOMA ESTÁ ESTE GENE
LOCALIZADO, NO GENOMA HUMANO?

10. 2.2. EM QUE ESPÉCIES EXISTEM ORTÓLOGOS DO
GENE SELECIONADO ?
55 espécies
diferentes

11. 2.3. Quantos exões/intrões tem?
Este gene
contém 16
exões e 15
intrões.

12. 2.3.1. Qual é a estrutura deste gene?
TnC
Ião
cálcio
TnT
TnI

13. 2.4. Quantos transcritos alternativos estão descritos
para o gene no genoma humano? Em que diferem estes
transcritos?
12

14. 3) PROCURE EM BASES DE DADOS
(OMIM) AS MUTAÇÕES DO GENE
SELECIONADO QUE SÃO
ASSOCIADAS COM FENÓTIPOS
PATOLÓGICOS

15. QUE TIPOS DE MUTAÇÕES ESTÃO
IDENTIFICADAS?
Mutações no gene TNNT2:
•6 mutações cardiomiopatia dilatada
•31 mutações cardiomiopatia hipertrófica
•1 variante de efeito desconhecido
•5 polimorfismos

16. EM QUE REGIÕES DO GENE SE LOCALIZAM
ESSAS MUTAÇÕES?

17. 4. CONSULTE UMA BASE
DE DADOS DE
PROTEÍNAS, UNIPROTKB
OU SWISS-PROT/EXPASY.
PROCURE A INFORMAÇÃO
RELATIVA À PROTEÍNA
CODIFICADA PELO GENE
EM ESTUDO.

18. 4.1. A PROTEÍNA CODIFICADA TEM
DOMÍNIOS FUNCIONAIS DESCRITOS?

19. 4.2.AS MUTAÇÕES ASSOCIADAS À DOENÇA EM
ESTUDO LOCALIZAM-SE EM ALGUM DOMÍNIO
FUNCIONAL RECONHECIDO DA PROTEÍNA?
From:
Circ Cardiovasc, Genet.Author manuscript; available in PMC 2010 August
Published in final edited form as:
Circ Cardiovasc Genet. 2009 August; 2(4): 306–313.
Published online 2009 May 15. doi: 10.1161/CIRCGENETICS.108.846733

20. 4.1. A proteína codificada tem domínios
funcionais descritos?

23. 5. ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL
DA TNNT2

24. 5.EXISTE ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL
DESCRITA PARA O PRODUTO DO GENE ?
Troponin C
Troponina I
Troponin T
Ião Cálcio

25. O arranjo tridimensional por
vezes corresponde à
estrutura que confere à
proteína uma função
biológica específica
5. IMPORTÂNCIA DO CONHECIMENTO DE UMA
ESTRUTURA TRIDIMENSIONAL

26. 6. INTERACTOMA DA PROTEÍNA CODIFICADA
PELO GENE ASSOCIADO À DOENÇA

27. As proteínas que
acabou de identificar
têm alguma associação
com a patologia?
6. COM QUE PROTEÍNAS INTERAGE?

28. 6. A REDE DE INTERAÇÕES DETERMINADA
ESTÁ CONSERVADA EM OUTROS
ORGANISMOS

29. 6. A REDE DE INTERAÇÕES DETERMINADA
ESTÁ CONSERVADA EM OUTROS
ORGANISMOS

31. FIM