第27回統合DBミーティング@NIBIO の内容を共有します。

1. 第27回統合DBミーティング
Integrated MTG in NIBIO
2013/12/20

2. 本日の予定
• Sagace
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アクセス解析
進捗報告
Sagaceに追加するDBについて
検索結果画面のDB毎の表記について
・医薬基盤研内のデータのRDF化
‒ 進捗報告
• 厚生労働科学研究成果データベース
‒ 調査報告と分担について
• 分子生物学会年会
‒ 反省と今後の対策について
• 今後の予定
2

3. アクセス解析(11月）
Google Update?
MEDALS メンテナンス
3

4. データベース順位 (11月）
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
特許
17600
医学・薬学予稿集全文データベース
2900
メルクマニュアル
2900
ゲノムネット医薬品データベース
2900
お薬110番（ハイパー薬辞典）
2400
医療情報サービスMINDS
2300
ここカラダ お薬辞典
2100
メルクマニュアル家庭版
1700
「健康食品」の素材情報データベース
1500
動物用医薬品データベース
1400
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5. 進捗報告（開発版にて）
• 追加予定のデータベースのインデックス作成完了
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感染症の情報
感染症流行予測調査
感染症発生動向調査 週報 (IDWR)
病原体検出マニュアル
生物学的製剤基準
国際化学物質安全性カード
薬剤分類情報閲覧システム
PRIGEN
薬事法
医師法
5

6. 進捗報告
• メタデータの対応
‒ 文献と組織 (Organization)
• クローリングの自動化
6

7. 検索結果画面のDB毎の表記について
• 現状のHyperEstraierだとDB毎の表
記は可能だが，DB内のトップの一件
しか抽出することが出来ない。
• 目的の機能の実装を試みると速度の
大幅な低下が見込まれる
• Apache Solrで可能かどうか調査中
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8. 一件ずつ表記
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9. 現状
9

10. Sagaceに追加するDBについて
ファセット分類／
データベース名
CELLPEDIA (Repository
database for current
knowledge about human
cells)
データベースの種類
その他のデータベース
生物種
ヒト
生体の階層
細胞・組織
分類
B
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11. Sagaceに独自に追加するDB
について
• JAPIC
‒ 添付文書検索
‒ 臨床試験情報検索
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12. 医薬基盤研内のデータのRDF化
• 実験動物資源研究バンク
‒ 松田さんとMTG
‒ RDF化開始
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13. 厚生労働科学研究成果データ
ベースの調査について
• 1エントリ1人調査
‒ 1人55件程度
• 1エントリ2人調査
‒ 1人120件程度
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14. 分子生物学会の反省
ブースについて
• 事前準備の不足点
‒ 各システムについての概要と背景の共有
‒ ひと通りの操作やUse Caseの共有
• 当日対応について
‒ どのような点が難しいかを詳しく聞くこと
で機能の改良に活かせるのではないか
• シフトについて
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15. 今後の予定
• 1月
‒ 実験動物バンクのRDF化
‒ 外部データベースとの連携
‒ BioHackathon 国内版（1月27日∼31日）

16. 次回
• 1月23日（木）？
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