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Análisis Conformacional

Química Orgánica Avanzada
Conformaciones

Son arreglos no idénticos de los átomos de una
molécula, por rotación de enlaces sencillos.

                   <10 kcal mol-1 (Tamb)

Peróxido de Hidrógeno (H2O2)




 Ángulo diedral

∞ confórmeros, aunque algunos son más estables
Análisis conformacional

Estudio de las propiedades físicas (E) y químicas
(reactividad) de los confórmeros de una molécula.

1874 Le Bel y van’t Hoff

1884Baeyer
     los ángulos en los cicloalcanos ≠ 109.2º

           >         >          <          <          <
     60º       90º       108º       120º       138º
Sachse ciclohexano con conformaciones no planares
                            H         H
                                H H
                        H
                    H                     H
                                      H
                            H H
                        H         H

1943 Kohlrausch y Hassel demostró la existencia de
enlaces ecuatoriales y axiales (rayos X)

1950 Barton demostró la importancia de las
consecuencias de las distintas disposiciones axiales y
ecuatoriales de los hidrógenos
Conformación de Moléculas acíclicas
Etano
                         HH                         H         H

                                    H
                                    H           H                 H

                         HH                         H         H




          E



              0    60         120   180   240           300           360

                        Degrees of Rotation 
Tensión torsional o de Pitzer = 3.0 kcal/mol
DGº=3 kcal/mol

K=e-DGº/RT > 100

>99% de las moléculas         de   etano   existen   en
conformación alternada

No se sabe con certeza la razón de la inestabilidad del
confórmero eclipsado

La repulsión de van der Waals explica una diferencia
de 0.5 kcal/mol

Se propone que un mejor argumento es la repulsión de
los orbitales ocupados.
n-butano
                                                           H                      CH3           H
                                CH3        CH3           CH3
       CH CH3              H           H             H                       H
     H H3
                                                                      H
                       H       H                 H                                H                 H
                       H                                              CH3
                                                                  H

                                   H       H               HH                         H       CH3
        H                                                                                 H
       H

                   A                                                                      A

                                       C                         C




           E
                           B                                                 E

                                                     D


               0           60           120          180        240         300           360

                                       Degrees of Rotation 
Proporciones de isómeros en equilibrio

% del isómero      K            DGº25ºC
 más estable                  (kcal/mol)
     50           1.0            0.0
     55           1.22           0.12
     60           1.50           0.24
     70           2.33           0.50
     75           3.0            0.65
     85           5.67           1.03
     90           9.0            1.30
     95           19.0           1.75
     99           99.0           2.72
    99.9         999.0           4.09
Ciclohexano




Dos conformaciones de silla que se interconvierten a Tamb


          H1

               H2       bote, bote torcído             H1

                                                  H2
X
                         
                                              X



 X         -DGº25ºC                X          -DGº25ºC
          (kcal/mol)                         (kcal/mol)
 F                0.25            SH              1.0
Cl                0.4             Me              1.74
Br                0.5             Et              1.8
 I                0.4             i-Pr            2.1
OH                0.7             t-Bu            4.9
OMe               0.8             Ph              2.9
OEt               0.9             CN              0.2


      H
                   X
          H
                             vs               X
                                             H
                                         H
H3C
          H3C                   H3C
                               H3C




                    H



                   H



    H
                                          H
                                      H
H               doble bote torcido
Otros ciclos

                    H                               H           H
        H       H                                           H
                                                H
                        H                               H           H
            H       H                                    H
                                                        H




                    H       HH              H       H
                                        H       H
                     H              H
                H               H                   H   H
                            H            H      H
                        H       H       H
                                                    H
El análisis conformacional de
1,3-Dioxanos monosustituidos
Necesidad de estudio conformacional
 de compuestos heterocíclicos
Ciclohexano y anillos heterocíclicos




       Semejanzas                  Diferencias




• Conformación silla más estable
• Barreras energéticas de inversión comparables
Diferencias entre sistemas cabocíclicos
                y heterocíclicos
• Longitudes de enlaces C-X
   – C-C (1.54 Å)     - C-N (1.47 Å)
   – C-O (1.43 Å)     - C-S (1.82 Å
   – C-S-C ≈ 100°
• Presencia de momentos dipolares
• Radios de Van der Waals.
  La ausencia de ligandos (N, O, S) disminuye las
  interacciones estéricas.
• Otros factores
   – Puente de hidrógeno intramolecular (-OH)
   – Inversión del Nitrógeno
1,3-Dioxano


   109.5°                111°           Águlos torsionales
            1.43 Å                    O-C-O-C      63°
1.50 Å                                C-O-C-C      59°
                      1.41 Å
                                      O-C-C-C      55°

                       111°


   Barrera de inversión del anillo:
         1,3-dioxano          <        ciclohexano
     (ΔG 9.5 kcal/mol)                (ΔG 10.5 kcal/mol)
1,3-Dioxanos-2-Sustituidos




                R: CH3       CH2CH3          i-Pr         C6H5
ΔG° (1,3-dioxano)    -4.0    -4.0            -4.2         -3.1
ΔG° (ciclohexano)    -1.7    -1.8            -2.1         -2.9


   Mayor preferencia por la posición ecuatorial en los 1,3-
   dioxanos

                                             Repulsión estérica

                    1.42 Å          1.54 Å
≈

    Repulsión estérica
Modelos Anancoméricos


• Modelos conformacionalmente rígidos
• Poseen un sustituyente R’ que ancla el anillo en una
  sola conformación.




• La equilibración de los modelos diastereoméricos se
  logra mediante catálisis ácida.
R: CH3      CH2CH3   i-Pr   C6H5
ΔG° (1,3-dioxano)   -0.9    -0.8     -1.0   -1.4
ΔG° (ciclohexano)   -1.74   -1.8     -2.1   -4.9




  Repulsión esterica entre el sustituyente axial en
  ciclohexano y los H sin-diaxales
Equilibrios Conformacionales en 1,3-Dioxanos
         con Sustituyentes Polares en C(5)
            Ciclohexanos monosustituidos

    Axial              Estabilidad        Ecuatorial




                            excepciones
• Acetato
• Cloruro de
  ciclohexilmercurio
1,3-dioxanos con sustituyentes polares en C(5)




 • Conformero ecuatorial posee menor repulsión dipolo-dipolo
           X                     Disolvente          ΔG° (Kcal/mol)
           F                     C6H12               0.21
                                 CH3CN               1.22
           Cl                    CCl4                -1.40
                                 CH3CN               -0.25
           CN                    CH3CN               0.55
           OH                    C6H12               0.90
                                 DME                 -0.50
           SCH3                  C6H12               -1.82
           S(O)CH3               CHCl3               0.82
           SO2CH3                CHCl3               1.19
          No se cumple en disolventes poco polares
Grupo OH (efectos del disolvente)

                       δ+
Poco polares
                  δ-



               Puente de hidrogeno intramolecular


Polares




                Puente de hidrogeno intermolecular
X= F y CN (efecto gauche atractivo)




•   Grupos pequeños y muy electronegativos
•   Prefieren la conformación gauche en lugar de la anti
• El grupo SMe prefiere la posición ecuatorial(-ΔG°)
• Se esperaría que para el análogo S(O)Me, haya
  mayor preferencia ecuatorial.
• Muestra preferencia axial
Para X= SO2CH3

• Un ligando forzosamente se ubica sobre el anillo
• Se espera un valor mayor de -ΔG°(ecuatorial)
• Tiene preferencia por el conformero axial




• Por RMN-H1 se observa que el grupo metilo
  apunta hacia dentro del anillo.
La atracción electroestática explica el
predominio axial de X=S(O)CH3 y SO2CH3



             δ+
                               δ+
        δ-                δ-
Comportamiento conformacional de los grupos
t-Butil-tio, t-Butil-sulfinilo y t-Butil-sulfonilo en
                         C(5).




    Equilibración cis-trans de los sulfuros, sulfóxidos y sulfonas.
           Dioxano           X                  ΔG° (Kcal/mol)
           118               S-t-Bu             -1.90
           119               SO-t-Bu            +0.10
           120               SO2-t-Bu           -1.14
           121               SCH3               -1.73
           122               S(O)CH3            +0.82
           123               SO2CH3             +1.19
Sulfuros 118 y 121

• Valores de ΔG° similares
• Me y t-Bu se orientan hacia fuera del anillo
Analisis conformacional
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Analisis conformacional

  • 2. Conformaciones Son arreglos no idénticos de los átomos de una molécula, por rotación de enlaces sencillos. <10 kcal mol-1 (Tamb) Peróxido de Hidrógeno (H2O2)  Ángulo diedral ∞ confórmeros, aunque algunos son más estables
  • 3. Análisis conformacional Estudio de las propiedades físicas (E) y químicas (reactividad) de los confórmeros de una molécula. 1874 Le Bel y van’t Hoff 1884Baeyer los ángulos en los cicloalcanos ≠ 109.2º > > < < < 60º 90º 108º 120º 138º
  • 4. Sachse ciclohexano con conformaciones no planares H H H H H H H H H H H H 1943 Kohlrausch y Hassel demostró la existencia de enlaces ecuatoriales y axiales (rayos X) 1950 Barton demostró la importancia de las consecuencias de las distintas disposiciones axiales y ecuatoriales de los hidrógenos
  • 5. Conformación de Moléculas acíclicas Etano HH H H H H H H HH H H E 0 60 120 180 240 300 360 Degrees of Rotation  Tensión torsional o de Pitzer = 3.0 kcal/mol
  • 6. DGº=3 kcal/mol K=e-DGº/RT > 100 >99% de las moléculas de etano existen en conformación alternada No se sabe con certeza la razón de la inestabilidad del confórmero eclipsado La repulsión de van der Waals explica una diferencia de 0.5 kcal/mol Se propone que un mejor argumento es la repulsión de los orbitales ocupados.
  • 7. n-butano H CH3 H CH3 CH3 CH3 CH CH3 H H H H H H3 H H H H H H H CH3 H H H HH H CH3 H H H A A C C E B E D 0 60 120 180 240 300 360 Degrees of Rotation 
  • 8. Proporciones de isómeros en equilibrio % del isómero K DGº25ºC más estable (kcal/mol) 50 1.0 0.0 55 1.22 0.12 60 1.50 0.24 70 2.33 0.50 75 3.0 0.65 85 5.67 1.03 90 9.0 1.30 95 19.0 1.75 99 99.0 2.72 99.9 999.0 4.09
  • 9. Ciclohexano Dos conformaciones de silla que se interconvierten a Tamb H1 H2 bote, bote torcído H1 H2
  • 10. X  X X -DGº25ºC X -DGº25ºC (kcal/mol) (kcal/mol) F 0.25 SH 1.0 Cl 0.4 Me 1.74 Br 0.5 Et 1.8 I 0.4 i-Pr 2.1 OH 0.7 t-Bu 4.9 OMe 0.8 Ph 2.9 OEt 0.9 CN 0.2 H X H vs X H H
  • 11. H3C H3C H3C H3C H H H H H H doble bote torcido
  • 12. Otros ciclos H H H H H H H H H H H H H H H HH H H H H H H H H H H H H H H H H H
  • 13. El análisis conformacional de 1,3-Dioxanos monosustituidos
  • 14. Necesidad de estudio conformacional de compuestos heterocíclicos
  • 15. Ciclohexano y anillos heterocíclicos Semejanzas Diferencias • Conformación silla más estable • Barreras energéticas de inversión comparables
  • 16. Diferencias entre sistemas cabocíclicos y heterocíclicos • Longitudes de enlaces C-X – C-C (1.54 Å) - C-N (1.47 Å) – C-O (1.43 Å) - C-S (1.82 Å – C-S-C ≈ 100° • Presencia de momentos dipolares • Radios de Van der Waals. La ausencia de ligandos (N, O, S) disminuye las interacciones estéricas. • Otros factores – Puente de hidrógeno intramolecular (-OH) – Inversión del Nitrógeno
  • 17. 1,3-Dioxano 109.5° 111° Águlos torsionales 1.43 Å O-C-O-C 63° 1.50 Å C-O-C-C 59° 1.41 Å O-C-C-C 55° 111° Barrera de inversión del anillo: 1,3-dioxano < ciclohexano (ΔG 9.5 kcal/mol) (ΔG 10.5 kcal/mol)
  • 18. 1,3-Dioxanos-2-Sustituidos R: CH3 CH2CH3 i-Pr C6H5 ΔG° (1,3-dioxano) -4.0 -4.0 -4.2 -3.1 ΔG° (ciclohexano) -1.7 -1.8 -2.1 -2.9 Mayor preferencia por la posición ecuatorial en los 1,3- dioxanos Repulsión estérica 1.42 Å 1.54 Å
  • 19. Repulsión estérica
  • 20. Modelos Anancoméricos • Modelos conformacionalmente rígidos • Poseen un sustituyente R’ que ancla el anillo en una sola conformación. • La equilibración de los modelos diastereoméricos se logra mediante catálisis ácida.
  • 21. R: CH3 CH2CH3 i-Pr C6H5 ΔG° (1,3-dioxano) -0.9 -0.8 -1.0 -1.4 ΔG° (ciclohexano) -1.74 -1.8 -2.1 -4.9 Repulsión esterica entre el sustituyente axial en ciclohexano y los H sin-diaxales
  • 22. Equilibrios Conformacionales en 1,3-Dioxanos con Sustituyentes Polares en C(5) Ciclohexanos monosustituidos Axial Estabilidad Ecuatorial excepciones • Acetato • Cloruro de ciclohexilmercurio
  • 23. 1,3-dioxanos con sustituyentes polares en C(5) • Conformero ecuatorial posee menor repulsión dipolo-dipolo X Disolvente ΔG° (Kcal/mol) F C6H12 0.21 CH3CN 1.22 Cl CCl4 -1.40 CH3CN -0.25 CN CH3CN 0.55 OH C6H12 0.90 DME -0.50 SCH3 C6H12 -1.82 S(O)CH3 CHCl3 0.82 SO2CH3 CHCl3 1.19 No se cumple en disolventes poco polares
  • 24. Grupo OH (efectos del disolvente) δ+ Poco polares δ- Puente de hidrogeno intramolecular Polares Puente de hidrogeno intermolecular
  • 25. X= F y CN (efecto gauche atractivo) • Grupos pequeños y muy electronegativos • Prefieren la conformación gauche en lugar de la anti
  • 26. • El grupo SMe prefiere la posición ecuatorial(-ΔG°) • Se esperaría que para el análogo S(O)Me, haya mayor preferencia ecuatorial. • Muestra preferencia axial
  • 27. Para X= SO2CH3 • Un ligando forzosamente se ubica sobre el anillo • Se espera un valor mayor de -ΔG°(ecuatorial) • Tiene preferencia por el conformero axial • Por RMN-H1 se observa que el grupo metilo apunta hacia dentro del anillo.
  • 28. La atracción electroestática explica el predominio axial de X=S(O)CH3 y SO2CH3 δ+ δ+ δ- δ-
  • 29. Comportamiento conformacional de los grupos t-Butil-tio, t-Butil-sulfinilo y t-Butil-sulfonilo en C(5). Equilibración cis-trans de los sulfuros, sulfóxidos y sulfonas. Dioxano X ΔG° (Kcal/mol) 118 S-t-Bu -1.90 119 SO-t-Bu +0.10 120 SO2-t-Bu -1.14 121 SCH3 -1.73 122 S(O)CH3 +0.82 123 SO2CH3 +1.19
  • 30. Sulfuros 118 y 121 • Valores de ΔG° similares • Me y t-Bu se orientan hacia fuera del anillo