SlideShare ist ein Scribd-Unternehmen logo
1 von 39
Downloaden Sie, um offline zu lesen
М И Н И СТ Е РСТ В О О Б РА ЗО В А Н И Я И Н А У К И РО ССИ Й СК О Й
Ф Е Д Е РА Ц И И
В оронежский государственный университет
Ф Е РМ Е Н Т Ы : О Б Щ А Я ХА РА К Т Е РИ СТ И К А И РО ЛЬ
В М Е Т А Б О ЛИ ЧЕ СК И Х ПРО Ц Е ССА Х
У ч ебно-м етодич ес к ое п ос обие
п о сп ец и аль н ост и 020201 (011600) – би ологи я
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
У тверж денонауч но-м етодич ес к им с оветом биолого-п оч венного
ф ак уль тета 16 с ентября2005 г., п роток ол N 6.
У ч ебно-м етодич ес к ое п ос обие п одготовленона к аф едре ф изиологии и
биохим ии рас тенийбиолого-п оч венногоф ак уль тета Воронеж с к ого
гос ударс твенногоуниверс итета.
Рек ом ендуетс я дляс тудентов 2 к урс а дневногообуч ения биолого-
п оч венногоф ак уль тета.
Дляс п ециаль нос ти 020201 (011600) –Биология
Разраб откаданного п особ ия частично п оддержанагрантом
CRDF Y1-B-10-01.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
СО Д Е РЖ А Н И Е
Ф ерм енты ....................................................................................... 4
М етаболизм ..................................................................................... 34
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Ф Е РМ Е Н Т Ы
Ф ерм енты – это биологич ес к ие м олек улы , обладающ ие к аталитич ес к ой
ак тивнос ть ю. В нас тоящ ее врем яизвес тноп рим ерно2000 различ ны х ф ерм ентов,
к атализирующ их с отни м ногос тадийны х хим ич ес к их реак ций, в ходе к оторы х
изм еняютс я биологич ес к ие м олек улы . Подавляющ ее боль ш инс тво ф ерм ентов
являютс я белк овы м и м олек улам и. Ис к люч ение с ос тавляет лиш ь доволь ноузк ая
груп п а рибозим ов – м олек ул РНК, уч ас твующ их в с п лайс инге (с озревании
м атрич нойРНК).
Ф ерм енты вы с ок ос п ециф ич ны к с воим с убс тратам (м олек улам , на к оторы е
воздейс твует ф ерм ент), ус к оряют с трогос п ециф ич ны е хим ич ес к ие реак ции без
образования п обоч ны х п родук тов. Ф ерм енты ф унк ционируют в разбавленны х
водны х рас творах п ри ф изиологич ес к их знач ениях тем п ературы и рН.
Для ф ерм ентативной ак тивнос ти белк ов важ ное знач ение им еет
с охранение их п ервич ной, вторич ной и третич ной с трук тур. М олек улярны е
м ас с ы ф ерм ентов, к ак и вс ех ос таль ны х белк ов, леж ат в п ределах от 12 000 до
1000 000, так ч тоих разм еры нам ногоп ревы ш ают разм еры их с убс тратов или
ф унк циональ ны х груп п , на к оторы е они дейс твуют. Нек оторы е ф ерм енты
с ос тоят толь к о из п олип еп тидны х цеп ей и не с одерж ат ник ак их других
хим ич ес к их груп п , к ром е тех, к оторы е входят в с ос тав ам инок ис лотны х
ос татк ов; к п одобны м ф ерм ентам относ итс я, нап рим ер, рибонук леаза из
п одж елудоч нойж елезы . Однак о для к аталитич ес к ойак тивнос ти м ногих ф ер-
м ентов необходим ещ е и доп олнитель ны йхим ич ес к ийк ом п онент - к оф ак тор.
Роль к оф ак торов м огут играть неорганич ес к ие вещ ес тва, нап рим ер ионы Fе2 +
,
М g2 +
или Mn2 +
, или с лож ны е органич ес к ие вещ ес тва, к оторы е в этом с луч ае
нос ят названия к оф ерм ентов. Для к аталитич ес к ойак тивнос ти ряда ф ерм ентов
требуетс я к ак к оф ерм ент, так и к ак ой-нибудь одинили даж е нес к оль к оионов
м еталлов. У одних ф ерм ентов к оф ерм енты или ионы м еталлов с вязы ваютс я с
белк ом врем еннои неп роч но, тогда к ак у других эти с вязи м огут бы ть п роч ны м и
и п ос тоянны м и; в п ос леднем с луч ае небелк овую ч ас ть ф ерм ента назы вают
п рос тетич ес к ой груп п ой. Вес ь к аталитич ес к и ак тивны й ф ерм ент вм ес те с
к оф ерм ентом или ионом м еталла нос ит название холоф ерм ента.
Ак тивнос ть ф ерм ентов изм еряют п ри оп тим аль ном знач ении рН, к ак ой-
либо оп ределенной, удобной в том или ином отнош ении тем п ературе (к ак
п равило, в интервале от 25 до38°С ) и п ри к онцентрации с убс трата, близк ойк
нас ы щ ающ ей. В этих ус ловиях нач аль ная с к орос ть реак ции обы ч но п ро-
п орциональ на к онцентрации ф ерм ента, п ок райнейм ере, в заданном диап азоне
к онцентрацийф ерм ента (Рис .).
С оглас но м еж дународном у с оглаш ению, за еди н и ц у акт и вн ост и фермен т а
п ри н и мает ся т акоеколи чест во фермен т а, кот ороекат али зи рует п ревращен и е
1 мкмоля субст рат а(1 мкмоль = 10~6
моля) в 1 ми н п ри 25°С в оп т и маль н ыхус-
лови ях дейст ви я фермен т а. У дель н ой акт и вн ост ь ю назы ваетс я ч ис лоединиц
ф ерм ентативнойак тивнос ти в рас ч ете на 1 м г белк а. У дель ная ак тивнос ть - это
м ера ч ис тоты ф ерм ентногоп реп арата: она возрас тает в п роцес с е оч ис тк и ф ер-
м ента и с тановитс я м ак с им аль нойи п ос тоянной, к огда ф ерм ент находитс я в ч и-
с том с ос тоянии.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Чи слом оборот ов ф ерм ента назы ваетс я ч ис ло м олек ул с убс трата,
п ретерп евающ их п ревращ ение в единицу врем ени в рас ч ете на одну м олек улу
ф ерм ента (или один к аталитич ес к ийцентр) в ус ловиях, к огда к онцентрация
ф ерм ента являетс я единс твенны м ф ак тором , лим итирующ им с к орос ть реак ции.
Карбоангидраза - важ ны йф ерм ент, п рис утс твующ ийв боль ш их к онцентрациях
в эритроцитах, - п редс тавляет с обойодиниз наиболее ак тивны х ф ерм ентов с
ч ис лом оборотов 36 000 000 в 1 м инв рас ч ете на одну м олек улу ф ерм ента.
Названия м ногих ф ерм ентов образуютс я п утем п рибавленияс уф ф ик с а
-аза к названию их с убс трата. Так , ф ерм ент, к атализирующ ий гидролиз
м оч евины , назы ваетс я уреазой (от англ. «urea»), а ф ерм ент, гидролизующ ий
аргинин, - арги н азой. Однак ом ногие ф ерм енты им еют названия, не с вязанны е с
названиям и их с убс тратов, нап рим ер п еп си н и т ри п си н . С луч аетс я так ж е, ч то
одини тот ж е ф ерм ент им еет, п ом ень ш ейм ере, два названия или ж е два разны х
ф ерм ента нос ят одно и то ж е название. Из-за этих и других затруднений
терм инологич ес к ого харак тера, а так ж е вс ледс твие вс е возрас тающ его ч ис ла
вновь отк ры ваем ы х ф ерм ентов бы ло п ринято м еж дународное с оглаш ение о
с оздании с ис тем атич ес к ой ном енк латуры и к лас с иф ик ации ф ерм ентов. В
с оответс твии с этой с ис тем ой вс е ф ерм енты в завис им ос ти от тип а
к атализируем ы х им и реак цийделятс яна ш ес ть ос новны х к лас с ов, к аж ды йизк о-
торы х вк люч ает ряд п одк лас с ов. Каж ды йф ерм ент им еет ч еты рехзнач ны й
к одовы й ном ер (ш иф р) и с ис тем атич ес к ое название, к оторое п озволяет
идентиф ицировать к атализируем ую этим ф ерм ентом реак цию (табл.).
К ЛА ССИ Ф И К А Ц И Я И ХА РА К Т Е РИ СТ И К А Ф Е РМ Е Н Т О В
1. О ксидоредуктазы. К к лас с у ок с идоредук таз относ ят ф ерм енты ,
к атализирующ ие реак ции ок ис ления-вос с тановления. Общ ая с хем а их м ож ет
бы ть п редс тавлена с ледующ им образом :
Ок ис ление п ротек ает к ак п роцес с отнятия атом ов Н (элек тронов) от с уб-
с трата, а вос с тановление - к ак п рис оединение атом ов Н (элек тронов) к ак цеп -
тору.
Х арак терной ос обеннос ть ю деятель нос ти ок с идоредук таз в ж ивой к летк е
являетс я их с п ос обнос ть образовы вать с ис тем ы (так назы ваем ы е цеп и
ок ис литель но-вос с тановитель ны х ф ерм ентов), в к оторы х ос ущ ес твляетс я
м ногос туп енч аты йп еренос атом ов водорода или элек тронов от п ервич ного
с убс трата к к онеч ном у ак цеп тору, к оторы м являетс я, к ак п равило,
к ис лород, так ч тов резуль тате образуетс я вода.
Те ок с идоредук тазы , к оторы е п еренос ят атом ы Н или элек троны
неп ос редс твенно на к ис лородны е атом ы , нос ят название аэробны х
дегидрогеназ или ок с идаз. В отлич ие от них ок с идоредук тазы , п еренос ящ ие
атом ы Н и элек троны от одногок ом п онента ок ис литель нойцеп и ф ерм ентов к
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
другом у без п ередач и их на к ис лородны е атом ы назы вают анаэробны м и
дегидрогеназам и или редук тазам и.
Е с ли ф ерм ент к атализирует реак цию отнятия Н неп ос редс твенно от
ок ис ляем ого вещ ес тва (п ервич ного с убс трата), то его назы вают п ервич ной
дегидрогеназой. Е с ли ф ерм ент ус к оряет с нятие водородны х атом ов с о
вторич ногос убс трата, к оторы йп олуч ил атом ы Н п ри п ос редс тве п ервич ной
дегидрогеназы (вторич ны м с убс тратом м ож ет бы ть к оф ерм ент с ам ой
п ервич ной ок с идоредук тазы ), его назы вают вторич ной дегидрогеназой.
Другая ос обеннос ть ок с идоредук таз с ос тоит в том , ч то, будуч и двухк ом -
п онентны м и ф ерм ентам и с вес ь м а огранич енны м набором ак тивны х груп п
(к оф ерм ентов), они с п ос обны ус к орять боль ш ое ч ис ло с ам ы х разнообразны х
ок ис литель но-вос с тановитель ны х реак ций. Э то дос тигаетс я за с ч ет того, ч то
одини тот ж е к оф ерм ент с п ос обенс оединять с я с ом ногим и ап оф ерм ентам и,
образуя к аж ды йраз ок с идоредук тазу, с п ециф ич ную п оотнош ению к том у или
ином у с убс трату или ак цеп тору.
Е щ е одна, п ож алуй, главная ос обеннос ть ок с идоредук таз зак люч аетс я в
том , ч то они ус к оряют п ротек ание хим ич ес к их п роцес с ов, с вязанны х
с вы с вобож дением энергии. Пос ледняя ис п оль зуетс я к ак для обес п еч ения
с интетичес к ихп роцес с ов в организм е, так и длядругих нуж д.
В п риродны х объ ек тах обнаруж ено ок оло п ятис от индивидуаль ны х
ок с идоредук таз. Наиболее рас п рос транены ок с идоредук тазы , с одерж ащ ие в
к ачестве ак тивнойгруп п ы никотинам идадениндинуклеотид, илиНАД+
:
Более п оловины извес тны х в нас тоящ ее врем я ок с идоредук тазс одерж ат НАД+
в
к ачес тве к оф ерм ента. С оединяяс ь с тем или ины м с п ециф ичес к им белк ом и
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
образуя, так им образом , двухк ом п онентны й ф ерм ент, к оторы й с ок ращ енно
назы вают п иридинп ротеином , НАД+
резк о ус иливает с вою с п ос обнос ть
вос с танавливать с я п о ядру ник отинам ида. В результате п иридин-п ротеины
с п ос обны отним ать от с убс тратов (с п ирты , аль дегиды , дик арбоновы е и
к еток ис лоты , ам ины и др.) атом ы Н в виде гидрид-ионов (Н-
) и п ротонов (Н+
),
ок ис ляя, так им образом , ук азанны е с оединения. Вс е п иридинп ротеины являютс я
анаэробны м и дегидрогеназам и, т.е. не п ередают с няты е с с убс трата атом ы
водорода на к ис лород, а п ос ы лают их на ближ айш ий в ок ис литель ной цеп и
другойф ерм ент.
Рас с м отрим с троение и м еханизм дейс твия одного из п иридинп ротеинов -
алкогольдегидрогеназы из п ечени ж ивотны х. В п роцес с е отнятия атом ов Н от
с п ирта образуетс я тройной ап оф ерм ент-к оф ерм ент-с убс тратны й к ом п лек с ,
удерж иваем ы й Zn2
. Неп ос редс твенно к ник отинам идадениндинук леотиду от
м олек улы с п ирта п ереходит одинатом водорода в виде гидридногоиона (Н-
), т.е.
атом а водорода, нес ущ его доп олнительны й элек трон. Второй атом водорода,
отним аем ы й от м олек улы с п ирта, наоборот, теряет элек трон, п ревращ аяс ь в
п ротон (Н+
), и п ос туп ает в реак ционную с реду. Поэтом у уравнение реак ции
ок ис ленияс п ирта п ри уч ас тии НАД+
зап ис ы вают так :
В любом с луч ае НАД+
п олуч ает два элек трона за с ч ет п рис оединения
гидридногоиона.
Кром е НАД+
п иридинф ерм енты с одерж ат в к ач ес тве к оф ерм ента
ник отинам идадениндинук леотидф ос ф ат (НАДФ +
). Э тот к оф ерм ент являетс я
п роизводны м НАД+
, у к отороговодород ОН-груп п ы 2-гоуглеродногоатом а
рибозы аденозина зам ещ енна ос таток ф ос ф орнойк ис лоты .
НАДФ +
, с оединяяс ь с ос п ециф ич ес к им и белк ам и, образует боль ш ую груп п у
п иридинп ротеинов, харак теризующ уюс я с воим набором с убс тратов. М еханизм
ок ис ления п ри уч ас тии НАДФ +
в к ач ес тве к оф ерм ента аналогич ентак овом у
п ри п ос редс тве НАД+
. Более того, НАДН и НАДФ +
, равно к ак НАДФ Н и
НАД+
, п ри к аталитичес к ом уч ас тии с п ециаль ногоф ерм ента –трансгидрогеназы
- с п ос обны обм енивать с я атом ам и водорода и элек тронам и:
Партнером вос с тановленны х ф орм п иридинп ротеинов в ок с идоредук тазной
цеп и, к ак п равило, с луж ат ф лавоп ротеины (Ф П). Так им ф лавоп ротеином ,
нап рим ер, являетс я ф ерм ент, нес ущ ий в к ач ес тве ак тивной груп п ы
ф ос ф орилированны й витам ин В2. Ок ис ленная ф орм а этого ф лавоп ротеина
ок раш ена. Каж дая м олек ула ф ерм ента нес ет м олек улу риб офлавинфосфата
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
(или ф лавинм ононук леотида, Ф М Н), с п ос обного п риним ать и отдавать два
атом а Н п оатом ам N изоаллок с азиновогок оль ца:
Ок раш еннаяф орм а Бес цветная ф орм а
(ок ис ленная) (вос с тановленная)
Другим к оф ерм ентом в ф лавоп ротеинах являетс я
флавинадениндинуклеотид(Ф АД):
Ф лавинадениндинук леотид (Ф АД)
Ф М Н и Ф АД, с оединяяс ь с различ ны м и ап оф ерм ентам и, дают нач ало
п риблизитель но тридцати ф лавоп ротеинам , отлич ающ им с я различ ной
с п ециф ич нос ть ю п оотнош ению к с убс тратам .
Ос новная ф унк ция ф лавоп ротеинов - п еренос элек тронов (атом ов Н) от
вос с тановленны х п иридинп ротеинов к другим к ом п онентам ок ис литель но-
вос с тановитель ной цеп и, т.е. Ф П в боль ш инс тве с луч аев являютс я
вторич ны м и дегидрогеназам и. Однак онек оторы е ф лавоп ротеины , ос обеннос
Ф АД в к ач ес тве к оф ерм ента, м огут неп ос редс твенно с ним ать атом Н с
с убс трата.
Коф ерм ентам и ок с идоредук тазявляютс я так ж е хиноны. Так , с оединяяс ь c
белк ом , убихиноны образуют убихинонп ротеин, являющ ийс я важ нойс ос тавной
ч ас ть ю анс ам блейок с идоредук таз, п ри п ос редс тве к оторы х ос ущ ес твляетс я
п еренос атом ов Н и элек тронов.
У бихиноны являютс я п роизводны м и бензохинона и обладают бок овой
цеп ь ю, с ос тавленнойизболь ш огоч ис ла изоп реноидны х ос татк ов:
В рас тениях эту ф унк цию вы п олняет п охож ее на убихинон
с оединение - п ластохинон.
Ч ис лоизоп реноидны х ф рагм ентов в бок овойцеп и (и) к олеблетс я от 6 до
10. У с тановлено, ч то убихиноны п риним ают уч ас тие в ок ис литель но-
вос с тановитель ны х п роцес с ах в организм е, ос ущ ес твляя п ередач у атом ов Н:
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Наиболее с лож ны й, но и с ам ы йрас п рос траненны йвариант ок ис литель но-
вос с тановитель ногоп роцес с а в к летк е с ос тоит в ок ис лении атом ов Н, с няты х с
с убс трата, п ри п ос редс тве цитохром ной систем ы.
Ц итохром ную с ис тем у образуют нес к оль к о ок с идоредук таз, им еющ их в
к ачес тве п рос тетич ес к их груп п ж елезоп орф ирины . Е щ е в 1915 г., двадцать ю
годам и ранее О. Варбурга, на возм ож ную роль ж елезос одерж ащ их белк ов в
биологич ес к ом ок ис лении обрат или вним ание А . Я . Данилевс к ийи Б.
П. С оловцов. С оединяяс ь с белк ам и различ ногос троения, ж елезоп орф ирины 4
тип ов (А, В, Си , D) дают нач алос ем ейс тву хром оп ротеинов, объ единяем ы х п од
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
общ им названием - цитохром ы. С ейчас извес тно нес к оль к о дес ятк ов
цитохром ов, и с п ис ок их неп реры вно п оп олняетс я. Каж ды йиндивидуаль ны й
цитохром обознач ают с троч нойлатинс к ойбук войа, b, с и d с с оответс твующ им
п орядк овы м индек с ом , нап рим ер blt b2, b3 и т.д., а к лас с цитохром а -
п роп ис ной латинс к ойбук войА, В, С или D. Принадлеж нос ть цитохром а к
оп ределенном у к лас с у оп ределяетс я с троением п рос тетич ес к ой груп п ы
(ж елезоп орф ирина), а ок онч атель ная индивидуаль нос ть - с троением
ап оф ерм ента (белк а). В п ос леднее врем я п редп оч итают, наряду с п орядк овы м
ном ером цитохром а, ук азы вать харак терную длину волны , п ри к оторой
отм ечаетс я п оглощ ение в видим ойчас ти с п ек тра (нап рим ер, цитохром b6 или
b563, найденны йв хлороп лас тах, и т. п .).
Первич ная с трук тура ряда цитохром ов вы яс нена: ок азалос ь , ч тоих видовая
с п ециф ич нос ть с вязана снеболь ш им и различ иям и в ч ередовании ам инок ис лот.
Э ти данны е п ринцип иаль новаж ны для п оним ания п рироды видовойи иной
с п ециф ич нос ти ф ерм ентов: видим о, она оп ределяетс я различ иям и, п реж де
вс его, в п ервич нойс трук т уре ап оф ерм ентов. Ц итохром ы bх, b2, bг и т.д.,
с одерж ащ ие одну и ту ж е п рос тетич ес к ую груп п у, отлич аютс я друг от друга
им енноп оэтом у п ризнак у.
Им енно п оэтом у цитохром ы образуют ц и т охромн ую си ст ем у,
п редс тавляющ ую с обой уп орядоч енное с оч етание в едином к ом п лек с е
различ ны х цитохром ов, нап рим ер b, с и а.
Ц итохром ная с ис тем а с п ос обна п риним ать элек троны , с няты е с атом ов Н
вос с тановленного убихинона. Она п ередает элек троны далее п о цеп и
цитохром ов и, нак онец, на к ис лородны й атом ; п ос ледний, с оединяяс ь с
ионизированны м и атом ам и Н, образует м олек улу Н2О.
В цеп и цитохром ов к аж ды й из индивидуаль ны х цитохром ов заним ает
с трого оп ределенное м ес то. Прос тейш ий вариант цитохром ной с ис тем ы
п риведенна с ледующ ейс хем е:
Как видно из с хем ы , п ередач а элек тронов в цитохром ной цеп и
ос ущ ес твляетс я за с ч ет изм енения валентнос ти атом а Fe п орф ириновогоядра.
Из вс ех цитохром ов толь к о цитохром а, а3 п ередает элек троны на к ис лород.
Поэтом у им енно он заверш ает цеп ь цитохром ов и нос ит название
цитохром оксидазы. Кром е атом ов Fe (в с ос таве гем а) цитохром а, а3
с одерж ит так ж е атом ы С и, с к оторы м и с вязы вают его ок ис литель ны е
с войс тва.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Так овы харак терны е ч ерты дейс твия нек оторы х важ нейш их ок с идоредук тази
ок ис литель но-вос с тановитель ны х с ис тем , обес п еч ивающ их п ревращ ение ряда
вещ ес тв в к летк е.
2. Т рансферазы. В этот к лас с входят ф ерм енты , ус к оряющ ие реак ции
п еренос а ф унк циональ ны х груп п и м олек улярны х ос татк ов от одного
с оединения к другом у. Э то один из наиболее обш ирны х к лас с ов: он
нас ч иты вает ок оло 500 индивидуаль ны х ф ерм ентов. В завис им ос ти от
харак тера п еренос им ы х груп п ировок различ ают ф ос ф отранс ф еразы ,
ам инотранс ф еразы , глик озилтранс ф еразы , ацилтранс ф еразы , транс ф еразы ,
п еренос ящ ие одноуглеродны е ос татк и (м етилтранс ф еразы ,
ф орм илтранс ф еразы ) и др.
Ф осфотрансферазы. С юда относ ятс я ф ерм енты , ус к оряющ ие реак цию
п еренос а ос татк а ф ос ф орной к ис лоты . Э та реак ция им еет ис к люч итель но
важ ное знач ение для ж изнедеятель нос ти организм а, обес п еч ивая п ревращ ение
ряда органич ес к их с оединенийв ф ос ф орны е эф иры , обладающ ие п овы ш енной
хим ич ес к ойак тивнос ть ю и более легк о вс туп ающ ие в п ос ледующ ие реак ции.
Перенос ф ос ф атны х груп п идет на с п иртовы е, к арбок с иль ны е, азотс одерж ащ ие,
ф ос ф орс одерж ащ ие и другие груп п ы тех или ины х органич ес к их с оединений. В
с оответс твии с этим с реди ф ос ф ортранс ф ераз различ ают нес к оль к о
п одп одк лас с ов.
Донором ф ос ф атны х ос татк ов являетс я в боль ш инс тве с луч аев
аденозинтриф ос ф орная к ис лота (АТФ ), новозм ож ны и другие их ис точ ник и. К
ф ос ф отранс ф еразам относ итс я, нап рим ер, гек с ок иназа - ф ерм ент, ус к оряющ ий
п еренос ос татк а ф ос ф орной к ис лоты от м олек улы АТФ к глюк озе (с этой
реак ции обы ч нонач инаетс я п реобразование глюк озы ):
Ос обое вним ание в п ос леднее врем я уделяют изуч ению ф ос ф отранс ф ераз,
обес п еч ивающ их п еренос ос татк а ф ос ф ата с АТФ на белк и, - п ротеинк иназам .
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Они п еренос ят ф ос ф ат на радик алы сер, т ре, т и р, ли з и ги с ряда белк ов, в
резуль тате ч егорезк оизм еняетс я биологич ес к ая ак тивнос ть п ос ледних. Э то, в
с вою оч ередь , с к азы ваетс я на интенс ивнос ти п ротек ания хим ич ес к их п роцес с ов
в организм е, т. е. на регуляции обм ена вещ ес тв.
А м инотрансферазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют реак цию п ереам инирования
ам инок ис лот с к еток ис лотам и и оч ень важ ны для обес п еч ения биос интеза
ам инок ис лот. Ам инотранс ф еразы двухк ом п онентны : п рос тетич ес к ойгруп п ой
их вовс ех с луч аях являетс я п иридок с аль ф ос ф ат, к овалентноп рис оединенны й
к ап оф ерм енту ч ерез с вою аль дегидную груп п у и ионной с вязь ю - ч ерез
ос таток ф ос ф орнойк ис лоты :
М еханизм реак ции п ереам инирования с ейч ас хорош овы яс нен, а с ам а
реак ция отк ры та ещ е в 1937 г. А. Е . Браунш тейном и М . Г. Крицм ан.
На п ервой с тадии ф ерм ентативного к атализа п рос тетич ес к ая груп п а
ф ерм ента (для п рос тоты п ринято, ч то она с вободна, а не с оединена
аль дим инной с вязь ю с ап оф ерм ентом ч ерез ε-ам иногруп п у радик ала ли з)
взаим одейс твует с ам инок ис лотой, п одвергающ ейс я п ереам инированию.
Реак ция идет п оам иногруп п е ам инок ис лоты и аль дегиднойгруп п е ос татк а
п иридок с аль ф ос ф ата:
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
На второйс туп ени к атализа идет п реобразование с убс трата, вы раж ающ еес я
в данном с луч ае в таутом ернойп ерегруп п ировк е:
В резуль тате п ос ледующ его гидролиза ос вобож даютс я к еток ис лота и
ф ерм ент в виде п иридок с ам иноф ерм ента:
Далее м еж ду п иридок с ам иноф ерм ентом и другой к еток ис лотой вновь
возник ает ф ерм ент-с убс тратны йк ом п лек с :
С убс трат в нем с нова п одвергаетс я п реобразованию за с ч ет таутом ерного
п ревращ ения:
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Получ енное с оединение гидролизируетс я, и возник ает новая
ам инок ис лота:
С ледователь но, в резуль тате с ерии реак ций, вк люч ающ их в с ебя
п оп ерем енное образование ф ерм ент-с убс тратны х к ом п лек с ов,
ас п арагиновая к ис лота п ереходит в щ авелевоук с ус ную, а α-к етоглутаровая
к ис лота п ереходит в глутам иновую.
Э товы раж аетс я с ледующ им с ум м арны м уравнением :
Глю козилтрансферазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют реак ции п еренос а
глик озиль ны х ос татк ов из м олек ул ф ос ф орны х эф иров или других с оединенийк
м олек улам м онос ахаридов, п олис ахаридов или ины х вещ ес тв, обес п еч ивая,
главны м образом , реак ции с интеза и рас п ада олиго- и п олис ахаридов в
ж ивотном и рас титель ном м ире.
В с луч ае п еренос а глик озиль ны х ос татк ов на Н3РО4 этот п роцес с назы вают
фосфоролизом , так к ак он ф орм аль но аналогич ен гидролизу, но вм ес то
элем ентов воды п о м ес ту разры ва к ис лородного м ос тик а п рис оединяютс я
водород и ф ос ф атная груп п а ф ос ф орнойк ис лоты
А цилтрансферазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют п еренос ацилов (ос татк ов
к арбоновы х к ис лот) на ам инок ис лоты , ам ины , с п ирты и другие с оединения.
У ниверс аль ны м ис точ ник ом ациль ны х груп п вовс ех этих реак циях являетс я
ацил-к оэнзим А, к оторы йс п олны м ос нованием м ож но рас с м атривать к ак
ак тивную груп п у ацилтранс ф ераз.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Ч ащ е вс егоп еренос у в биологич ес к их объ ек тах п одвергаетс я ацил
ук с ус нойк ис лоты — ацетил
Коэнзим А, с оединяяс ь с ацетиль ны м ос татк ом , к оторы йзаним ает м ес то
водорода в его HS-груп п е, образует ацетил-к оэнзим А. Пос леднийс луж ит
к оф ак тором в с оответс твующ ей реак ции п еренос а. Одним из п рим еров
реак ции транс ацилирования являетс я с интезацетилхолина:
Важ ное знач ение с реди транс ф ераз им еют ф ерм енты , ус к оряющ ие
п еренос одноуглеродны х ф рагм ентов (м етиль ны х, ок с им етиль ны х,
ф орм иль ны х и т. п .), а так ж е нук леотидилтранс ф еразы , к атализирующ ие
п еренос нук леотидны х ос татк ов в п роцес с е с интеза нук леиновы х к ис лот.
3. Гидролазы. Кк лас с у гидролаз относ ят ф ерм енты , ус к оряющ ие реак ции
рас щ еп ления (а иногда и с интеза) органич ес к их с оединенийп ри уч ас тии воды . В
завис им ос ти от харак тера с убс трата, п одвергающ егос я гидролизу, гидролазы
делят на ряд п одк лас с ов, с реди к оторы х наиболее важ ны с ледующ ие:
1) эс теразы , ус к оряющ ие реак ции гидролиза с лож ны х эф иров;
2) глик озидазы , ус к оряющ ие реак ции гидролиза глик озидов, в том чис ле
углеводов;
3) п еп тид-гидролазы , ус к оряющ ие реак ции гидролиза (а в ос обы х
с луч аях и с интеза) белк ов, п еп тидов и других с оединений, с одерж ащ их
п еп тидны е с вязи;
4) гидролазы , дейс твующ ие на С — N-с вязи, отличающ иес яот п еп тидны х
(нап рим ер, ам идазы и т. п .).
Вс егов с ос таве гидролазнас ч иты вают п оч ти 500 ф ерм ентов.
Эстеразы. Э ти ф ерм енты к атализируют реак ции гидролиза с лож ны х эф иров
с п иртов с органич ес к им и и неорганич ес к им и к ис лотам и. Важ нейш им и
п одп одк лас с ам и эс тераз являютс я гидролазы эф иров к арбоновы х к ис лот и
ф ос ф атазы . В к ач ес тве п редс тавителя п ервого п одп одк лас с а рас с м отрим
лип азу. Л ип аза ус к оряет гидролиз внеш них, т. е. α-с лож ноэф ирны х, с вязейв
м олек улах триацилглицеринов (ж иров):
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
М еханизм дейс твия ряда эс тераздеталь ноизуч ен.
Ф ос ф атазы к атализируют гидролиз ф ос ф орны х эф иров. Ос обенно ш ирок о
рас п рос транены ф ос ф атазы , дейс твующ ие на с лож ны е эф иры ф ос ф орной
к ис лоты и углеводов, нап рим ер глюк озо-1-ф ос ф атаза:
Дейс твие ф ос ф атаз п роявляетс я в ш ирок ом с п ек тре рН от 3 до 9.
Боль ш инс тво из них обладает ш ирок ой с убс тратной с п ециф ич нос ть ю.
Ос обенно важ ны для регуляции п роцес с ов ж изнедеятель нос ти
п ротеинф ос ф атазы , обес п еч ивающ ие отщ еп ление ф ос ф ата от
ф ос ф орилированны х белк ов, вс ледс твие ч егоизм еняетс я их биологич ес к ая, в
ч ас тнос ти, ф ерм ентативная ак тивнос ть .
Гликозидазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют реак цию гидролиза глик озидов.
В завис им ос ти от того, на к ак ойп рос транс твенны йизом ер (α или β) дейс твует
ф ерм ент, егоотнос ят к α- или β-глик озидазам . Так им образом , глик озидазы
обладают ярк о вы раж енной п рос транс твенной с п ециф ич нос ть ю. Кром е
глик озидов, с одерж ащ их в к ач ес тве аглик онов ос татк и одноатом ны х с п иртов,
с убс тратам и, на к оторы е рас п рос траняетс я дейс твие тех или ины х глик озидаз,
являютс я олиго- и п олис ахариды . Из дейс твующ их на олигос ахариды глик о-
зидаз уп ом янем м аль тазу (α-глик озидаза) и с ахаразу (β-глик озидаза). Они
ус к оряют с оответс твенногидролизм аль тозы и с ахарозы :
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Из глик озидаз, дейс твующ их на п олис ахариды , наиболее извес тны
ам илазы . В п рироде с ущ ес твует нес к оль к о видов ам илаз, ус к оряющ их
реак ции гидролиза глик озидны х с вязейв м олек уле к рахм ала с образованием
глюк озы , м аль тозы или олигос ахаридов.
Гидролиз других п риродны х п олиглик озидов так ж е ус к оряетс я
с оответс твующ им и глик озидазам и. Нек оторы е глик озидазы к атализируют
так ж е реак ции п еренос а глик озиль ны х ос татк ов, т.е. являютс я
транс глик озидазам и.
Пеп тид-гидролазы. Ф ерм енты этого п одк лас с а ус к оряют гидролиз
п еп тидны х с вязейв белк ах и п еп тидах, а п ри оп ределенны х ус ловиях так ж е и
образование п еп тидны х с вязей, хотя этот п уть с интеза белк а не являетс я
ф изиологич ес к им . Х им изм п роцес с а гидролиза белк ов и п еп тидов п ри уч ас тии
п еп тидгидролазм ож новы разить с ледующ ейс хем ой:
С реди п еп тид-гидролаз различ ают п ротеиназы или п еп тидил-
п еп тидогидролазы , к атализирующ ие гидролиз неболь ш ого ч ис ла внутренних
п еп тидны х с вязей в белк овой м олек уле, в резуль тате ч его п ос ледняя
рас п адаетс я до п еп тидов. Они являютс я, с ледователь но, эндоп еп тидазам и. В
отлич ие от этого п еп тид-гидролазы , назы ваем ы е п еп тидазам и, обес п еч ивают
отщ еп ление от п еп тидной цеп и с вободны х ам инок ис лот, будуч и
эк зоп еп тидазам и.
Протеиназы в завис им ос ти от м еханизм а их дейс твия на внутренние
п еп тидны е с вязи в белк овойм олек уле делят на 4 п одп одк лас с а: 1) с ериновы е
п ротеиназы , нес ущ ие в ак тивном центре радик алы сери ги с, обес п еч ивающ ие
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
ос ущ ес твление к аталитич ес к ого ак та; п редс тавителям и их являютс я
хим отрип с ин и трип с ин, вы деляем ы е п одж елудоч ной ж елезой, с убтилизин,
п родуцируем ы йбак териям и, и др.; 2) тиоловы е (цис теиновы е) п ротеиназы ,
им еющ ие в ак тивном центре ос таток ц и с; к их ч ис лу п ринадлеж ат п ап аиниз
латек с а ды нногодерева Carica papaya, ф ицинизлатек с а ф ик ус а, бром елаиниз
с ок а с твола ананас а, к атеп с инВ - внутрик леточ ны йф ерм ент п озвоноч ны х и
др.; 3) к ис лы е (к арбок с иль ны е) п ротеиназы , им еющ ие оп тим ум рН ниж е 5 и
с одерж ащ ие радик алы дик арбоновы х ам инок ис лот в ак тивном центре; с юда
относ ятс я п еп с ин, вы деляем ы й с лизис той ж елудк а, к атеп с ин D,
харак теризующ ийс я внутрик леточ нойлок ализацией, и ряд к ис лы х п ротеиназ,
п родуцируем ы х разнообразны м и м ик роорганизм ам и; 4) м еталлоп ротеиназы ,
к аталитич ес к ое дейс твие к оторы х завис ит от п рис утс твия ионов м еталлов
(С а2+
, Zn2+
) в ак тивном центре; п рим ерам и их м огут с луж ить к оллагеназа и
ряд п ротеиназ м ик робногоп роис хож дения (терм олизин, к ом п онент п роназы и
др.).
Пеп с ин, трип с ини хим отрип с инвы деляютс я ж елезис ты м и к летк ам и в виде
неак тивны х п роф ерм ентов - зим огенов: п еп с иногена, трип с иногена и
хим отрип с иногена, так к ак их ак тивны е центры блок ированы ф рагм ентам и
п олип еп тиднойцеп и, п ос ле гидролитич ес к ого отщ еп ления к оторы х ф ерм ент
п риобрет ает ак тивнос ть . Э то явление вп ервы е бы ло от к ры т о в
лаборат ории И. П. Павлова.
Оч ень важ нойос обеннос ть ю п ротеиназ являетс я вы бороч ны й(с елек тивны й)
харак тер их дейс твия на п еп тидны е с вязи в белк овойм олек уле. Так , п еп с ин
избиратель ноус к оряет гидролиз п еп тидны х с вязей, образованны х фен и лей;
трип с ин- арг и ли з; хим отрип с ин- аром атич ес к им и ам инок ис лотам и; п ап аин
- арг, ли з и фен и т. д. В резуль тате индивидуаль ны йбелок п од дейс твием
оп ределенной п еп тидил-п еп тидогидролазы рас щ еп ляетс я вс егда на с трого
огранич енное ч ис ло п еп тидов. Э тонаходит п рак тич ес к ое ис п оль зование п ри
оп ределении п ервич ной с трук туры белк ов и им еет огром ное знач ение для
регуляции обм ена вещ ес тв, так к ак м ногие п родук ты с елек тивногогидролиза
белк ов обладают вы с оч айш ей биологич ес к ой ак тивнос ть ю: им енно этим
п утем изп роф ерм ентов возник ают ф ерм енты , изп редш ес твенник ов горм онов
— горм оны и т. п . Прич ина избиратель ногодейс твия п еп тидп еп тидогидролаз
зак люч аетс я в том , ч то радик ал ам инок ис лоты , п о с ос едс тву с к оторой
гидролизуетс я п еп тидная с вязь , с луж ит для образования ф ерм ент-с убс тратного
к ом п лек с а.
Пеп тид-гидролазы , к атализирующ ие гидролиз п еп тидов до с вободны х
ам инок ис лот, м огут отщ еп лять п ос ледние от п еп тида, нач иная либо с
ам инок ис лоты , обладающ ей с вободной NH2-rpyп п у, либо с ам инок ис лоты ,
им еющ ей с вободную С ООН-груп п у. В п ервом с луч ае их назы вают
ам иноп еп тидазам и, вовтором - к арбок с ип еп тидазам и.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Точ к и п рилож ения дейс твия п ротеолитич ес к их ф ерм ентов на п еп тидны е
с вязи в белк овойм олек уле
Нек оторы е ам ино- и к арбок с ип еп тидазы обладают с п ециф ич нос ть ю
дейс твия, т.е. отщ еп ляют с трого оп ределенны е N- или С -к онцевы е
ам инок ис лоты . Третий п одп одк лас с п еп тидаз п редс тавлен
ди п еп т и дги дролазами , ди п еп т и дазами . Их извес тно ок оло дес яти. Они
заверш ают гидролиз белк а. Недавноиз с ос тава п еп тидаз вы ч лененоещ е два
п одп одк лас с а: дип еп тидил-п еп тидгидролазы , отщ еп ляющ ие от N-к онца
п олип еп тида дип еп тид, и п еп тидилдип еп тид-гидролазы , отщ еп ляющ ие
дип еп тид с С -к онца.
А м идазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют гидролиз ам идов к ис лот. Из них
важ ную роль в биохим ич ес к их п роцес с ах в организм е играют уреаза,
ас п арагиназа и глутам иназа.
У реаза бы ла одним из п ервы х белк ов-ф ерм ентов, п олуч енны м в
к рис таллич ес к ом с ос тоянии (Д. С ам нер, 1926). У реаза ус к оряет гидролиз
м оч евины доNH3 и С О2.
Асп арагин аза и глут амин аза ус к оряют гидролиз ам идов дик арбоновы х ам ино-
к ис лот - ас п арагиновойи глутам иновой, нап рим ер:
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Кгидролазам , дейс твующ им на С — N-с вязи, отлич ающ иес я от п еп тидны х,
к ром е ам идазотнос ятс я ф ерм енты , к атализирующ ие гидролизС — N-с вязейв
линейны х ам идинах. К их ч ис лу п ринадлеж ит аргиназа. При п ос редс тве
аргиназы ам инок ис лота аргинингидролизуетс я на орнитини м оч евину:
Э та реак ция ш ирок о п редс тавлена в п рироде, являяс ь зак лючитель ной
с тадией биос интеза м оч евины - одного из к онеч ны х п родук тов рас п ада
азотс одерж ащ их вещ ес тв.
4. Лиазы. К к лас с у лиаз относ ятс я ф ерм енты , ус к оряющ ие
негидролитич ес к ие реак ции рас п ада органич ес к их с оединенийп ос вязям С —
С ; С — N; С — О и т. д. При этом зам ы к аютс я двойны е с вязи и вы деляютс я
так ие п рос тейш ие п родук ты , к ак С О2, Н2О, NH3 и т. п . Нек оторы е из этих
реак ций обратим ы , и с оответс твующ ие ф ерм енты в п одходящ их ус ловиях
к атализируют реак ции не толь к о рас п ада, но и с интеза. Так им образом ,
название этого к лас с а ф ерм ентов не вс егда с оответс твует с одерж анию тех
п роцес с ов, к оторы е им и ус к оряютс я.
Одной из важ нейш их груп п ф ерм ентов этого к лас с а являютс я углерод-
углерод-лиазы (С — С -лиазы ). С реди них ос обое знач ение им еют
к арбок с илиазы (дек арбок с илазы ) и аль дегид-лиазы .
В п рироде ш ирок о рас п рос транены дек арбок с илазы к еток ис лот и
ам инок ис лот, к атализирующ ие реак ции п ос ледующ им с хем ам :
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Э ти ф ерм енты двухк ом п оненты , п рос тетич ес к им и груп п ам и их во м ногих
с луч аях являютс я ф ос ф орны е эф иры водорас творим ы х витам инов: тиам ина и
п иридок с аля.
М еханизм реак ции дек арбок с илирования ам инок ис лот с п ом ощ ь ю
к арбок с илиазы с п иридок с аль ф ос ф атом в к ач ес тве к оф ерм ента оч ень близок к
том у, к оторы й дейс твует п ри п ереам инировании ам инок ис лот. З дес ь тож е
возник ает ш иф ф ово ос нование, в к отором элек тронная п лотнос ть у α-
углеродного атом а ам инок ис лоты резк о ос лаблена. Вс ледс твие этого с иль но
ос лабляетс я с вязь этого углеродного атом а с к арбок с иль ной груп п ой, и
п ос ледняя легк оотщ еп ляетс я.
Х арак терны м п редс тавителем аль дегид-лиаз являетс я аль долаза,
к атализирующ ая обратим ую реак цию рас щ еп ления ф рук тозо-1,6-диф ос ф ата до
ф ос ф отриоз:
Э та реак ция заним ает централь ное м ес то в п реобразовании углеводов.
Аналогич ноаль долазе дейс твуют другие аль дегид-лиазы .
Другую важ ную груп п у лиаз с ос тавляют углерод- к ис лород лиазы
(гидролиазы ), ус к оряющ ие реак ции гидратирования и дегидратирования
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
органич ес к их с оединений. В к ач ес тве п редс тавителя гидролиаз п риведем
фум аратгидратазу:
Реак ции гидратирования и дегидратирования п ос тоянноидут п ри рас п аде и
с интезе углеводов и вы с ш их ж ирны х к ис лот, п оэтом у гидратазы играют
боль ш ую роль в ж изнедеятель нос ти организм ов.
5. И зом еразы. Ф ерм енты , относ ящ иес я к этом у нем ногоч ис ленном у (ок оло
90 индивидуаль ны х ф ерм ентов) к лас с у, ус к оряют геом етрич ес к ие или
с трук турны е изм енения в п ределах одной м олек улы . Э ти изм енения м огут
с ос тоять вовнутрим олек улярном п еренос е водорода, ф ос ф атны х и ациль ны х
груп п , в изм енении п рос транс твенногорас п олож ения атом ны х груп п ировок , в
п ерем ещ ении двойны х с вязейи т. п .
Важ нейш им и изом еразам и являютс я триозоф ос ф атизом ераза,
ф ос ф оглицерат-ф ос ф ом утаза, аль дозом утаротаза и изоп ентенил-
п ироф ос ф атизом ераза.
Триозоф ос ф атизом ераза ус к оряет п еренос атом ов Н в п роцес с е п ревращ ения3-
ф ос ф оглицериновогоаль дегида в ф ос ф одиок с иацетони обратно:
Превращ ение, вероятно, идет ч ерез общ ую эндиоль ную ф орм у.
Ф ос ф оглицерат-ф ос ф ом утаза обес п еч ивает дос таточ ную с к орос ть п ревращ ения
2-ф ос ф оглицериновойк ис лоты в 3-ф ос ф оглицериновую к ис лоту и обратно:
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Оба п роцес с а им еют гром адное знач ение в органич ес к ом м ире, так
к ак п редс тавляют важ нейш ие с тадии рас п ада и с интеза углеводов.
М утаротаза являетс я п редс тавителем с тереоизом ераз, она ус к оряет
реак цию п ревращ ения a-D-глюк оп иранозы в β-D-глюк оп иранозу:
Ф ерм енты этого тип а (с тереоизом еразы ) обес п еч ивают, в ч ас тнос ти,
взаим оп ревращ ения м ногих п рос транс твенны х изом еров м онос ахаридов, и
этот п уть являетс я иногда единс твенны м для с интеза нек оторы х из них в
п рироде. Кс тереоизом еразам относ ятс я так ж е цис -транс изом еразы , нап рим ер
ретинол-изом ераза, п ереводящ ая транс -ретинол в цис -ретинол.
6. Лигазы (синтетазы). Х арак терны е ч ерты дейс твия ф ерм ентов этогок лас с а
вы явлены с овс ем недавно в с вязи с о знач итель ны м и ус п ехам и в изуч ении
м еханизм а с интеза ж иров, белк ов и углеводов. Ок азалос ь , ч тос тары е п ред-
с тавления об образовании этих с оединений, с оглас нок оторы м они возник ают
п ри обращ ении реак цийгидролиза, не с оответс твуют дейс твитель нос ти. Пути
их с интеза п ринцип иаль ноины е.
Главная их ос обеннос ть - с оп ряж еннос ть с интеза с рас п адом вещ ес тв,
с п ос обны х п ос тавлять энергию для ос ущ ес твления биос интетич ес к ого
п роцес с а. Одним из так их п риродны х с оединенийявляетс я АТФ . При отры ве
от ее м олек улы в п рис утс твии лигаз одного или двух к онцевы х ос татк ов
ф ос ф орнойк ис лоты вы деляетс я боль ш ое к олич ес тво энергии, ис п оль зуем ой
для ак тивирования реагирующ их вещ ес тв. Л игазы ж е к аталитич ес к и ус к оряют
с интез органич ес к их с оединений из ак тивированны х за с ч ет рас п ада АТФ
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
ис ходны х п родук тов. Так им образом , к лигазам относ ятс я ф ерм енты ,
к атализирующ ие с оединение друг с другом двух м олек ул, с оп ряж енное с
гидролизом п ироф ос ф атной с вязи в м олек уле АТФ или иного
нук леозидтриф ос ф ата.
М еханизм дейс твия лигаз изуч ен ещ е недос таточ но, но, нес ом ненно, он
вес ь м а с лож ен. В ряде с луч аев док азано, ч тоодноиз уч ас твующ их в ос новной
реак ции вещ ес тв с нач ала дает п ром еж уточ ное с оединение с ф рагм ентом
рас п адающ ейс я м олек улы АТФ , а вс лед за этим ук азанны йп ром еж уточ ны й
п родук т взаим одейс твует с овторы м п артнером ос новнойхим ич ес к ойреак ции
с образованием к онеч ногоп родук та.
В к ач ес тве п рим ера дейс твия лигазы м ож ноп ривес ти с интез п антотеновой
к ис лоты изα, γ-диок с и-β, β-дим етилм ас лянойк ис лоты и β-аланина:
Пантотенатсинтетаза, к ак с ледует из п риведенногоуравнения, относ итс я
к груп п е лигаз, ус к оряющ их реак ции с интеза С — N-с вязей. Э та груп п а лигаз
нас ч иты вает ок оло 40 п редс тавителей. В нас тоящ ее врем я изуч ено более 75
различ ны х лигаз, обес п еч ивающ их важ нейш ие с интетич ес к ие п роцес с ы в
ж ивотнойи рас титель нойк летк ах.
Кром е ус к орения реак ций с интеза С — N-с вязей, в ч ас тнос ти п еп тидны х,
лигазы к атализируют образование с вязейС — С , С — О и С — S. Кгруп п е лигаз,
образующ их С — С -с вязи, относ ятс я карб оксилазы. Они обес п еч ивают
к арбок с илирование ряда с оединений, в резуль тате ч егоп роис ходит удлинение
углеродны х цеп ей. Одной из важ нейш их к арбок с илаз являетс я
п ируваткарб оксилаза, ус к оряющ ая реак цию образования щ авелевоук с ус ной
к ис лоты изп ировинограднойк ис лоты и ок с ида углерода (IV):
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Э та реак ция им еет ис к люч итель ное знач ение в обм ене вещ ес тв, обес п еч ивая
взаим ос вязь обм ена углеводов и белк ов и ак цеп тирование С О2.
Л игазам , к атализирующ им с интез С — О-с вязей, п ринадлеж ит важ нейш ая
роль в биос интезе белк ов, так к ак они ус к оряют реак ции ак тивирования
ам инок ис лот п еред вс туп лением п ос ледних в п еп тидную с вязь . Одной из
п рос тейш их реак цийэтоготип а являетс я образование ам иноациладенилатов. С
ам иноациладенилатов ам инок ис лоты п ередаютс я на тРНК, образуя
ам иноацил-тРНК, ис п оль зуем ы е неп ос редс твенноп ри с интезе п олип еп тидов.
Л игазы , к ром е того, ос ущ ес твляют ус к орение реак цийобразования С — S-
с вязей, являяс ь ацил-к оэнзим А-с интетазам и. В к ач ес тве п рим ера дейс твия
ацил-к оэнзим А-с интетазы м ож ноп ривес ти образование ацетил-к оэнзим а А
изук с ус нойк ис лоты и к оэнзим а А, п ротек ающ ее с оп ряж енос рас п адом АТФ :
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Таблица
Клас с иф ик ация ф ерм ентов
Груп п а Катализируем ая
реак ция
Тип ич ная
реак ция
Прим еры
ф ерм ентов*
Ок с идоредук -
тазы
Перенос атом ов Н и
О или элек тронов от
одного вещ ес тва к
другом у (NAD+
,
NADP+
, FAD, O2).
AH + B =
A + BH
A + O = AO
М алатдегидрогена-
за, глюк озо-6-
ф ос ф ат-
дегидрогеназа
С ук цинатдегидро-
геназа
Ц итохром ок с идаза
Транс ф еразы Перенос
оп ределенной
груп п ы атом ов –
м етиль ной,
ациль ной, ф ос ф ат-
ной или ам ино-
груп п ы – от одного
вещ ес тва к другом у.
AB + C = A + BC Глициндек ар-
бок с илаза
Ацилк арнитинтранс
-ф ераза
Гек с ок иназа
Ас п артатам ино-
транс ф ераза
Гидролазы Реак ции гидролиза,
п ри к оторы х из
с убс трата образуют-
с я два п родук та.
AB + H2O =
AOH + BH
Л ип аза, ам илаза,
п еп тидаза
Л иазы Негидролитич ес к ое
п рис оединение к
с убс трату или
отщ еп ление от него
груп п ы атом ов. При
этом м огут разры -
вать с яс вязи C-C,
C-N, C-O или C-S
O
R-C-C =
OH
H
R-C +
O
CO2
Ф ум араза,
аль долаза,
изоцитратлиаза,
п ируватдек арбок -
с илаза
Изом еразы Внутрим олек уляр-
наяп ерес тройк а
AB = BA Триозоф ос ф атизо-
м ераза,
ф ос ф оглюк ом утаза
Л игазы С оединение двух
м олек ул в
резуль тате
образования новы х
с вязейС -О, C-S,
C-N или C-C,
с оп ряж енного с
рас п адом АТФ .
X + Y + АТФ =
XY + АДФ + Ф н
Пируват-
к арбок с илаза
*Даны тривиаль ны е названия ф ерм ентов.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Ацетил-КоА с луж ит к оф ерм ентом в реак циях транс ацилирования, п оэтом у
дейс твие ф ерм ентов этих двух груп п - лигаз и ацилтранс ф ераз - в ж ивы х
с ис тем ах тес но увязано друг с другом . Аналогич ная взаим озавис им ос ть
харак терна и для м ногих других ф ерм ентов.
М еханизм дей ствия ферм ентов
У с к орение любойхим ич ес к ойреак ции дос тигаетс я за с ч ет увелич ения
доли м олек ул, обладающ их дос таточ нойвнутреннейэнергиейдля дос тиж ения
п ереходного с ос тояния. Одним из м еханизм ов п овы ш ения с к орос ти реак ции
являетс я увелич ение тем п ературы . Как п равило, п овы ш ение тем п ературы на
10о
С вы зы вает ус к орение хим ич ес к ойреак ции п риблизитель нов два раза.
Второйп уть ус к орения хим ич ес к ойреак ции - добавление к атализатора.
Катализаторы ус к оряют хим ич ес к ие реак ции, находя «обходны е п ути»,
п озволяющ ие м олек улам п реодолевать ак тивационны йбарь ер на более низк ом
энергетич ес к ом уровне. Ф ерм енты , так ж е к ак и другие к атализаторы ,
с оединяютс яс ос воим и с убс тратам и в ходе к аталитич ес к огоцик ла.
Ф ерм ент-к атализатор (обознач им егобук войЕ ) на п ром еж уточ нойс тадии
реак ции взаим одейс твует с реагентом А с образованием новогок ом п лек с а или
с оединения Е А, п ереходном у с ос тоянию к оторого с оответс твует знач итель но
более низк ая энергия ак тивации п о с равнению с п ереходны м с ос тоянием
реагента в нек атализируем ойреак ции.
Рис унок 2. Изм енение с вободнойэнергии с ис тем ы п ри п ротек ании
хим ич ес к ойреак ции в п рис утс твии и отс утс твии к атализатора
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
З атем к ом п лек с ф ерм ент-с убс трат (Е А) рас п адаетс я на п родук т Р и
с вободны йк атализатор, к оторы йм ож ет оп ять с оединить с я с другойм олек улой
А и п овторить вес ь цик л. Им енно так им образом к атализаторы с ниж ают
энергию ак тивации хим ич ес к ой реак ции; в их п рис утс твии гораздо более
знач итель ная доля м олек ул даннойп оп уляции вс туп ает в реак цию в единицу
врем ени. Ф ерм енты , так ж е к ак и другие к атализаторы , с оединяютс я с ос воим и
с убс тратам и в ходе к аталитич ес к огоцик ла. Ф ерм енты п овы ш ают с к орос ти к ата-
лизируем ы х им и реак цийв 108
-1020
раз. Нап рим ер, уреаза ус к оряет гидролиз
м оч евины в 1014
раз п ри рН 8 и 20°С . Как ж е удаетс я ф ерм ентам п роявлять
так ую необы ч айно вы с ок ую к аталитич ес к ую ак тивнос ть в с толь м ягк их
ус ловиях?
С ущ ес твуют ч еты ре ос новны х ф ак тора, оп ределяющ их с п ос обнос ть
ф ерм ентов ус к орять хим ич ес к ие реак ции.
Сбли ж ен и е и ори ен т ац и я. Ф ерм ент с п ос обен с вязы вать м олек улу
с убс трата так им образом , ч тоатак уем ая ф ерм ентом с вязь ок азы ваетс я не толь к о
рас п олож еннойв неп ос редс твеннойблизос ти от к аталитич ес к ойгруп п ы , нои
п равиль но ориентированнойп о отнош ению к ней. В резуль тате вероятнос ть
того, ч то к ом п лек с Е S дос тигнет п ереходного с ос тояния, с иль но
увелич иваетс я.
Нап ряж ен и е и деформац и я: и н дуц и рован н ое соот вет ст ви е.
Прис оединение с убс трата м ож ет вы зы вать к онф орм ационны е изм енения в
м олек уле ф ерм ента, к оторы е п риводят к нап ряж ению с трук туры ак тивного
центра, а так ж е нес к оль к о деф орм ируют с вязанны й с убс трат, облегч ая тем
с ам ы м дос тиж ение к ом п лек с ом Е А п ереходногос ос тояния.
При этом возник ает так назы ваем ое и н дуц и рован н ое соот вет ст ви е
ф ерм ента с убс трату. Так им образом , неболь ш ие изм енения третич нойили ч ет-
вертич нойс трук туры относ итель нок руп нойм олек улы ф ерм ента м огут играть
роль м еханич ес к огоры ч ага для м олек улы с убс трата. Возм ож но, ч тоим енноп о
этойп рич ине ф ерм енты п редс тавляют с обойбелк и и, с ледователь но, п ос воим
разм ерам знач итель ноп ревос ходят м олек улы боль ш инс тва с убс тратов.
О бщи й ки слот н о-осн овн ый кат али з. В ак тивном центре ф ерм ента м огут
находить с я груп п ы с п ециф ич ес к их ам инок ис лотны х ос татк ов, к оторы е являютс я
хорош им и донорам и или ак цеп торам и п ротонов. Так ие к ис лотны е или ос новны е
груп п ы общ его тип а п редс тавляют с обой м ощ ны е к атализаторы м ногих
органич ес к их реак ций, п ротек ающ их в водны х с ис тем ах.
Ковален т н ый кат али з. Нек оторы е ф ерм енты реагируют с о с воим и
с убс тратам и, образуя оч ень нес табиль ны е, к овалентно с вязанны е ф ерм ент-
с убс тратны е к ом п лек с ы , из к оторы х в ходе п ос ледующ ейреак ции образуютс я
п родук ты реак ции, п рич ем знач итель но бы с трее, ч ем в с луч ае
нек атализируем ы х реак ций.
Переч ис ленны е вы ш е ч еты ре ф ак тора, п о-видим ом у, внос ят различ ны й
вк лад в ус к орение хим ич ес к их реак цийф ерм ентам и разны х тип ов, однак они
для одного ф ерм ента п ок а не извес тно точ ного м еханизм а, обес п еч ивающ его
ус к орение тойили инойс п ециф ич ес к ойдля негореак ции.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
А ллостерическиеферм енты
Как и вс е ф ерм енты , аллос терич ес к ие ф ерм енты им еют к аталитич ес к ий
центр, в к отором п роис ходит с вязы вание с убс трата и п ревращ ение его в
п родук т, но у аллос терич ес к их ф ерм ентов ес ть , п о м ень ш ейм ере, ещ е один
регуляторны й, или аллос терич ес к ий, центр для с вязы вания регулирующ его
м етаболита, назы ваем ого эф ф ек тором или м одулятором (рис . 1).
Аллос терич ес к ийцентр с п ециф ич енп оотнош ению к с воем у м одулятору анало-
гич но том у, к ак к аталитич ес к ийцентр с п ециф ич ен п о отнош ению к с воем у
с убс трату. Во-вторы х, м олек улы аллос терич ес к их ф ерм ентов обы ч но нам ного
к руп нее и более с лож но ус троены п ос равнению с м олек улам и п рос ты х ф ер-
м ентов. Боль ш инс твоиз них с ос тоит из двух или более п олип еп тидны х цеп ей,
или с убъ единиц. И нак онец, в-треть их, к инетик а реак ций, к атализируем ы х
аллос терич ес к им и ф ерм ентам и, обы ч но знач итель но отк лоняетс я от к лас с ич е-
с к огоуравнения М ихаэлис а-М ентен. Э тоодиниз п ризнак ов, п ок отором у они
бы ли вп ервы е обнаруж ены .
Когда с п ециф ич ес к ий ингибирующ ий, или отрицатель ны й, м одулятор
с вязы ваетс я с аллос терич ес к им центром , ч то п роис ходит п ри п овы ш ении
к онцентрации м одулятора в к летк е, ф ерм ент п ереходит в м енее ак тивную или
с овс ем неак тивную ф орм у, т.е. «вы к люч аетс я». Когда ж е к онцентрация
м одулятора в к летк е с ниж аетс я, ингибитор п ок идает аллос терич ес к ийцентр и
ф ерм ент вновь «вк люч аетс я», т.е. п ереходит в ак тивную ф орм у.
С ущ ес твуют, однак о, и так ие аллос терич ес к ие ф ерм енты , к оторы е ак тиви-
руютс я м олек улам и м одулятора. В этом с луч ае ф унк цию ак тивирующ его, или
п олож итель ного, м одулятора вы п олняет не к онеч ны й п родук т данной цеп и
ф ерм ентативны х реак ций, а к ак ой-то другой м етаболит, к оторы й с луж ит
м олек улярны м с игналом , означ ающ им , ч тоф ерм ент долж ен«п ос п еш ить ». Ч ас то
в роли ак тивирующ его м одулятора так ого тип а вы с туп ает с ам а м олек ула
с убс трата. Аллос терич ес к ие ф ерм енты этогок лас с а, назы ваем ы е гом отроп ны м и
(так к ак м одулятором и с убс тратом с луж ит однои тож е с оединение), им еют два
или боль ш ее ч ис лоцентров с вязы вания для с убс трата. Э ти центры с вязы вания
нередк о вы п олняют двойную ф унк цию, дейс твуя и к ак к аталитич ес к ие, и к ак
регуляторны е центры . Аллос терич ес к ие ф ерм енты этого тип а реагируют на
с итуации, п ри к оторы х с убс трат нак ап ливаетс я в избы точ ны х к олич ес твах и
долж енбы ть удаленв ходе п ос ледующ их реак ций.
Так им образом , им еютс я аллос терич ес к ие ф ерм енты двух тип ов.
Ф ерм енты п ервоготип а ингибируютс я с воим и м одуляторам и, к оторы е обы ч но
п о с воем у хим ич ес к ом у с троению отлич аютс я от с убс трата (п оэтом у эти
ф ерм енты назы ваютс я гетеротроп ны м и). Нек оторы е аллос терич ес к ие
ф ерм енты п одверж ены влиянию двух и более м одуляторов, к оторы е м огут
ок азы вать на ф ерм ент п ротивоп олож ное дейс твие, т.е. один м одулятор (или
боль ш ее их ч ис ло) ак тивирует ф ерм ент, а другой(или другие) - ингибирует его.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Т естовыезадания для сам оконтроля п о тем е«Ф ерм енты»
1. Ф ерм ентативнойак тивнос ть ю обладают:
1. Толь к обелк и
2. Толь к онук леиновы е к ис лоты
3. Л ип иды
4. Белк и и РНК
5. Глик оп ротеины .
2. Коф ак тором назы ваетс я:
1. Ап обелок + п рос тетич ес к ая груп п а
2. Полип еп тиднаяцеп ь
3. Ап оф ерм ент + к оф ерм ент
4. Коф ерм ент + п рос тетич ес к ая груп п а
5. Ионы м еталлов.
3. При к ак ом знач ение рН с оответс твует рН оп тим ум у боль ш инс твоф ерм ентов:
1. 1.5-2.5
2. 5-6
3. 7-8
4. 10-11
5. 0-7.
4. Конс танта М ихаэлис а равняетс я:
1. Концентрации ф ерм ента, п ри к оторойс к орос ть реак ции м ак с им аль на
2. Концентрации с убс трата, п ри к оторойс к орос ть реак ции м ак с им аль на
3. Концентрации с убс трата, п ри к оторойс к орос ть реак ции м иним аль на
4. Концентрации с убс трата, п ри к оторойс к орос ть реак ции равна п оловине
м ак с им аль ной
5. Концентрации ф ерм ента, п ри к оторойс к орос ть реак ции равна п оловине
м ак с им аль ной.
5. При нек онк урентном ингибировании:
1. Ингибитор с вязы ваетс яс к оф ерм ентом
2. Ингибитор с вязы ваетс яс ак тивны м центром
3. Ингибитор с вязы ваетс яс белк овойм олек улойне в ак тивном центре
4. Ингибитор с вязы ваетс яс с убс тратом
5. Ингибитор с вязы ваетс яс п ром еж уточ ны м п родук том .
6. У равнение М ихаэлис а-М ентеноп ис ы вает:
1. З авис им ос ть обратнойс к орос ти от обратнойк онцентрации с убс трата
2. Поведение аллос терич ес к их ф ерм ентов
3. З авис им ос ть с к орос ти ф ерм ента от к онцентрации с убс трата
4. З авис им ос ть ак тивнос ти ф ерм ентов от тем п ературы
5. З авис им ос ть ак тивнос ти ф ерм ентов от рН.
7. Ф ерм енты , к атализирующ ие п рис оединение м олек ул п одвойнойс вязи
относ ятс як к лас с у:
1. Ок с идоредук тазы
2. Транс ф еразы
3. Гидролазы
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
4. Л иазы
5. Изом еразы .
8. Л ак татдегидрогеназа относ итс як :
1. Ок с идоредук тазам
2. Транс ф еразам
3. Гидролазам
4. Л иазам
5. Изом еразам .
9. Оп ределите, к к ак ом у к лас с у относ итс я даннаяф ерм ентативная реак ция
C2H5OH + NAD+
= CH3CHO + NADH + H+
:
1. Ок с идоредук тазы
2. Транс ф еразы
3. Гидролазы
4. Л иазы
5. Изом еразы .
10. Аллос терич ес к ие ф ерм енты :
1. С ос тоят изоднойс убъ единицы
2. С ос тоят изнес к оль к их с убъ единиц
3. М еняют к онф орм ацию п ри взаим одейс твии с с убс тратом
4. М еняют к онф орм ацию п ри взаим одейс твии с м ем бранны м п отенциалом
5.Х арак теризуютс я К0.5
11. Ковалентнойм одиф ик ациейназы ваетс ярегуляцияс к орос ти реак ции за с ч ет
того, ч то:
1. С убс трат к овалентнос вязы ваетс яс п родук том
2. Проис ходит ф ос ф орилирование с убс трата
3. Прос ходит ф ос ф орилирование ф ерм ента
4. Ф ерм ент к овалентнос вязы ваетс яс к ак ой-либоф унк циональ нойгруп п ой
5. Катализп ротек ает с образованием к овалентны х с вязей.
12. Дайте название ф ерм енту, к атализирующ ем у реак цию
С ук цинат + FAD = ф ум арат + FADH2
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Рис.1.
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
М Е Т А Б О ЛИ ЗМ
М етаболизм – с овок уп нос ть биохим ич ес к их п роцес с ов, п ротек ающ их в
ж ивом организм е. Протек ание м етаболич ес к их п роцес с ов обес п еч иваетс я
налич ием в к летк е с лож нойс ис тем ы ф ерм ентов, а так ж е к леточ нойм ем браны ,
огранич ивающ ейее с одерж им ое от внеш нейс реды .
К атаб олизм ианаб олизм
Катаболизм – ф аза м етаболизм а, на к оторойп роис ходит рас п ад м олек ул,
п ос туп ающ их с п ищ ейили зап ас енны х ж ивы м организм ом донеорганич ес к их
вещ ес тв (H2O, CO2, NH4). В ходе к атаболич ес к их п роцес с ов вы с вободивш аяс я
п ри ок ис лении энергия зап ас аетс я в ф орм е АТР, NAD(P)H и м ем бранного
п отенциала.
Анаболизм –с интез биологич ес к их м ак ром олек ул из низк ом олек улярны х
п редш ес твенник ов. Для п ротек ания анаболизм а требуетс я п ос тоянны йп риток
энергии.
Ф ункцииА Т Р, NAD(P)H, ∆µH+
Белк и Белк и
У глеводы У глеводы
Ж иры Ж иры , ДНК, РНК
А Т Р, NAD(P)H, ∆µH+
H2O, CO2, NH4 Ам инок ис лоты ,
М онос ахариды
Ж ирны е к ис лоты
Азотис ты е ос нования
АТР, NAD(P)H, ∆µH+
в к летк е вы п олняют роль с вязующ егозвена м еж ду
п ос туп ающ ей в организм энергией (с вет, рас п ад органич ес к их вещ ес тв) и
энергетич ес к им и п отребнос тям и к летк и. Протек ание к атаболич ес к их реак ций
обес п еч ивает ак к ум уляцию энергии в виде АТР, NADPH и ∆µH+
. АТР и NADPH
ис п оль зуютс я на биос интетич ес к ие реак ции, а ∆µH+
п реим ущ ес твенно
обес п еч ивает п роцес с ы ак тивного транс п орта ч ерез м ем брану, терм огенез,
с интез АТР. Ос новны м и органоидам и, отвеч ающ им и за п ротек ание
к атаболич ес к их п роцес ов, являютс ям итохондрии, цитоп лазм а и лизос ом ы .
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
О б щ ая схем акатаб олических п роцессов
Белк и У глеводы Ж иры
Ам инок ис лоты Гек с озы , п ентозы Глицерин, ж ирны е к ис лоты
Глюк оза
Пируват
Ацетил-С оА
Ц ТКЦ
NADH Э ТЦ
H2O CO2
Гликолиз – основной п уть окисления углеводов
Глик олиз–универс аль ны йп роцес с ок ис ленияглюк озы - извес тенп оч ти у вс ех
ж ивы х организм ов. У эук ариот п ротек ает в цитозоле. Глик олизобес п еч ивает
ок ис ление С 6-м олек улы глюк озы додвух С 3 м олек ул п ирувата (в аэробны х
ус ловиях) или лак тата (в анаэробны х ус ловиях) с образованием 2 м олек ул АТР.
С ос тоит из2-х ос новны х с тадий:
- на п ервой с тадии п роис ходит ак тивация с убс тратов за с ч ет
ф ос ф орилирования (затрач иваетс я 2 АТР), вк люч ение в данны й п роцес с
других с ахаров, рас п ад на две С 3 м олек улы (глицераль дегид-3-ф ос ф ат и
дигидрок с иацетонф ос ф ат).
- На втором этап е п роис ходит ок ис ление глицераль дегид-3-ф ос ф ата до
п ирувата (в аэробны х ус ловиях) или до лак тата (п ри анаэробиозе) с
образованием 4-х м олек ул АТР.
Ц Т К
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
Глюк оза
гек с ок иназа
Глюк озо-6-ф ос ф ат
ф ос ф оглюк оизом ераза
Ф рук тозо-6-ф ос ф ат
ф ос ф оф рук ток иназа
Ф рук тозо-1,6-бис ф ос ф ат
аль долаза
Глицераль дегид-3- ф ос ф ат Дигидрок с иацетонф ос ф ат
триозоф ос ф атизом ераза
NAD+
+Pi
NADH глицераль дегид-3-ф ос ф атдегидрогеназа
1,3-диф ос ф оглицерат
АДР ф ос ф оглицератк иназа
АТР
3-ф ос ф оглицерат
ф ос ф оглицератм утаза
2-ф ос ф оглицерат
енолаза
ф ос ф оенолп ируват
АДР п ируватк иназа
АТР
п ируват
Путиокисления м оно- ип олисахаридов
Галактоза Гликоген К рахм ал М анноза
UDP-галак тоза м аннозо-6-ф ос ф ат
Глюк озо-1-ф ос ф ат
UDP-глюк оза ф ос ф оглюк ом утаза
Глюк озо-6-ф ос ф ат Глюк оза С ахароза
ф ос ф оглюк оизом ераза
Ф рук тозо-6-ф ос ф ат Ф рук тоза
ф ос ф оф рук ток иназа
Ф рук тозо-1,6-бис ф ос ф ат
Путим етаб олизм ап ирувата
А наэроб иоз (недостатоккислорода)
Пируват + NADH = лак тат + NAD+
(лакт ат деги дроген аза) –
м олоч нок ис лое брож ение
п и руват декарбокси лаза алкоголь деги дроген аза
Пируват - Ацеталь дегид - Э танол – с п иртовое
брож ение
Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах
392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах
392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах
392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах

Weitere ähnliche Inhalte

Ähnlich wie 392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах

клещевой энцефалит
клещевой энцефалитклещевой энцефалит
клещевой энцефалитcdo_presentation
 
аминокислоты Reaviz2016
аминокислоты Reaviz2016аминокислоты Reaviz2016
аминокислоты Reaviz2016Konstantin German
 
физическая и коллоидная химия
физическая и коллоидная химияфизическая и коллоидная химия
физическая и коллоидная химияИван Иванов
 
Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...
Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...
Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...ФГБУ «НЦЭСМП» Минздрава России
 
реавиз ферменты
реавиз ферментыреавиз ферменты
реавиз ферментыKonstantin German
 
Приветствуем участников III областной урологической конференции
Приветствуем участников III областной урологической конференцииПриветствуем участников III областной урологической конференции
Приветствуем участников III областной урологической конференцииИгорь Шадеркин
 
722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...
722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...
722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...Иван Иванов
 
Химический состав клетки
Химический состав клеткиХимический состав клетки
Химический состав клеткиLotosPlay
 
Ershaydullina
ErshaydullinaErshaydullina
ErshaydullinaShEl_El
 
Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...
Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...
Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...Alex_Zadorin
 
Лекция 26, Почки
Лекция 26, ПочкиЛекция 26, Почки
Лекция 26, ПочкиGreen Radullo
 
2016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 2016
2016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 20162016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 2016
2016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 2016Konstantin German
 
Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)
Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)
Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)Natasa Spasic
 
Маъруза-2_Регенерация_UZB.pdf
Маъруза-2_Регенерация_UZB.pdfМаъруза-2_Регенерация_UZB.pdf
Маъруза-2_Регенерация_UZB.pdfRamazonNarmanov2
 
Каберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемии
Каберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемииКаберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемии
Каберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемииAleksandra Mukhina
 

Ähnlich wie 392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах (20)

клещевой энцефалит
клещевой энцефалитклещевой энцефалит
клещевой энцефалит
 
аминокислоты Reaviz2016
аминокислоты Reaviz2016аминокислоты Reaviz2016
аминокислоты Reaviz2016
 
физическая и коллоидная химия
физическая и коллоидная химияфизическая и коллоидная химия
физическая и коллоидная химия
 
Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...
Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...
Сычёв Д.А. 'Биотрансформации лекарственных средств: значение информации для и...
 
реавиз ферменты
реавиз ферментыреавиз ферменты
реавиз ферменты
 
Приветствуем участников III областной урологической конференции
Приветствуем участников III областной урологической конференцииПриветствуем участников III областной урологической конференции
Приветствуем участников III областной урологической конференции
 
коблатор
коблаторкоблатор
коблатор
 
холера
холерахолера
холера
 
722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...
722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...
722.влияние пробиотиков на показатели резистентности и иммунный статус органи...
 
Химический состав клетки
Химический состав клеткиХимический состав клетки
Химический состав клетки
 
Ershaydullina
ErshaydullinaErshaydullina
Ershaydullina
 
Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...
Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...
Радиационная безопасность. Действие ионизирующего излучения на здоровье челов...
 
Лимфология и эндоэкология
Лимфология и эндоэкологияЛимфология и эндоэкология
Лимфология и эндоэкология
 
спектральная фототерапия
спектральная фототерапияспектральная фототерапия
спектральная фототерапия
 
Лекция 26, Почки
Лекция 26, ПочкиЛекция 26, Почки
Лекция 26, Почки
 
2016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 2016
2016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 20162016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 2016
2016 общая химия гокжаев-белова-герман-афанасьев 2016
 
Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)
Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)
Organele rbozomierga-111113124746-phpapp02 (1)
 
Маъруза-2_Регенерация_UZB.pdf
Маъруза-2_Регенерация_UZB.pdfМаъруза-2_Регенерация_UZB.pdf
Маъруза-2_Регенерация_UZB.pdf
 
Каберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемии
Каберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемииКаберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемии
Каберголин - 25 лет в терапии патологической гиперпролактинемии
 
столбняк
столбнякстолбняк
столбняк
 

Mehr von ivanov15548 (20)

100206
100206100206
100206
 
100221
100221100221
100221
 
100201
100201100201
100201
 
100200
100200100200
100200
 
100208
100208100208
100208
 
100202
100202100202
100202
 
100203
100203100203
100203
 
100205
100205100205
100205
 
100210
100210100210
100210
 
100207
100207100207
100207
 
100209
100209100209
100209
 
100211
100211100211
100211
 
100212
100212100212
100212
 
100218
100218100218
100218
 
100215
100215100215
100215
 
100219
100219100219
100219
 
100214
100214100214
100214
 
100217
100217100217
100217
 
100216
100216100216
100216
 
100222
100222100222
100222
 

392.ферменты общая характеристика и роль в метаболических процессах

  • 1. М И Н И СТ Е РСТ В О О Б РА ЗО В А Н И Я И Н А У К И РО ССИ Й СК О Й Ф Е Д Е РА Ц И И В оронежский государственный университет Ф Е РМ Е Н Т Ы : О Б Щ А Я ХА РА К Т Е РИ СТ И К А И РО ЛЬ В М Е Т А Б О ЛИ ЧЕ СК И Х ПРО Ц Е ССА Х У ч ебно-м етодич ес к ое п ос обие п о сп ец и аль н ост и 020201 (011600) – би ологи я Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 2. У тверж денонауч но-м етодич ес к им с оветом биолого-п оч венного ф ак уль тета 16 с ентября2005 г., п роток ол N 6. У ч ебно-м етодич ес к ое п ос обие п одготовленона к аф едре ф изиологии и биохим ии рас тенийбиолого-п оч венногоф ак уль тета Воронеж с к ого гос ударс твенногоуниверс итета. Рек ом ендуетс я дляс тудентов 2 к урс а дневногообуч ения биолого- п оч венногоф ак уль тета. Дляс п ециаль нос ти 020201 (011600) –Биология Разраб откаданного п особ ия частично п оддержанагрантом CRDF Y1-B-10-01. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 3. СО Д Е РЖ А Н И Е Ф ерм енты ....................................................................................... 4 М етаболизм ..................................................................................... 34 Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 4. Ф Е РМ Е Н Т Ы Ф ерм енты – это биологич ес к ие м олек улы , обладающ ие к аталитич ес к ой ак тивнос ть ю. В нас тоящ ее врем яизвес тноп рим ерно2000 различ ны х ф ерм ентов, к атализирующ их с отни м ногос тадийны х хим ич ес к их реак ций, в ходе к оторы х изм еняютс я биологич ес к ие м олек улы . Подавляющ ее боль ш инс тво ф ерм ентов являютс я белк овы м и м олек улам и. Ис к люч ение с ос тавляет лиш ь доволь ноузк ая груп п а рибозим ов – м олек ул РНК, уч ас твующ их в с п лайс инге (с озревании м атрич нойРНК). Ф ерм енты вы с ок ос п ециф ич ны к с воим с убс тратам (м олек улам , на к оторы е воздейс твует ф ерм ент), ус к оряют с трогос п ециф ич ны е хим ич ес к ие реак ции без образования п обоч ны х п родук тов. Ф ерм енты ф унк ционируют в разбавленны х водны х рас творах п ри ф изиологич ес к их знач ениях тем п ературы и рН. Для ф ерм ентативной ак тивнос ти белк ов важ ное знач ение им еет с охранение их п ервич ной, вторич ной и третич ной с трук тур. М олек улярны е м ас с ы ф ерм ентов, к ак и вс ех ос таль ны х белк ов, леж ат в п ределах от 12 000 до 1000 000, так ч тоих разм еры нам ногоп ревы ш ают разм еры их с убс тратов или ф унк циональ ны х груп п , на к оторы е они дейс твуют. Нек оторы е ф ерм енты с ос тоят толь к о из п олип еп тидны х цеп ей и не с одерж ат ник ак их других хим ич ес к их груп п , к ром е тех, к оторы е входят в с ос тав ам инок ис лотны х ос татк ов; к п одобны м ф ерм ентам относ итс я, нап рим ер, рибонук леаза из п одж елудоч нойж елезы . Однак о для к аталитич ес к ойак тивнос ти м ногих ф ер- м ентов необходим ещ е и доп олнитель ны йхим ич ес к ийк ом п онент - к оф ак тор. Роль к оф ак торов м огут играть неорганич ес к ие вещ ес тва, нап рим ер ионы Fе2 + , М g2 + или Mn2 + , или с лож ны е органич ес к ие вещ ес тва, к оторы е в этом с луч ае нос ят названия к оф ерм ентов. Для к аталитич ес к ойак тивнос ти ряда ф ерм ентов требуетс я к ак к оф ерм ент, так и к ак ой-нибудь одинили даж е нес к оль к оионов м еталлов. У одних ф ерм ентов к оф ерм енты или ионы м еталлов с вязы ваютс я с белк ом врем еннои неп роч но, тогда к ак у других эти с вязи м огут бы ть п роч ны м и и п ос тоянны м и; в п ос леднем с луч ае небелк овую ч ас ть ф ерм ента назы вают п рос тетич ес к ой груп п ой. Вес ь к аталитич ес к и ак тивны й ф ерм ент вм ес те с к оф ерм ентом или ионом м еталла нос ит название холоф ерм ента. Ак тивнос ть ф ерм ентов изм еряют п ри оп тим аль ном знач ении рН, к ак ой- либо оп ределенной, удобной в том или ином отнош ении тем п ературе (к ак п равило, в интервале от 25 до38°С ) и п ри к онцентрации с убс трата, близк ойк нас ы щ ающ ей. В этих ус ловиях нач аль ная с к орос ть реак ции обы ч но п ро- п орциональ на к онцентрации ф ерм ента, п ок райнейм ере, в заданном диап азоне к онцентрацийф ерм ента (Рис .). С оглас но м еж дународном у с оглаш ению, за еди н и ц у акт и вн ост и фермен т а п ри н и мает ся т акоеколи чест во фермен т а, кот ороекат али зи рует п ревращен и е 1 мкмоля субст рат а(1 мкмоль = 10~6 моля) в 1 ми н п ри 25°С в оп т и маль н ыхус- лови ях дейст ви я фермен т а. У дель н ой акт и вн ост ь ю назы ваетс я ч ис лоединиц ф ерм ентативнойак тивнос ти в рас ч ете на 1 м г белк а. У дель ная ак тивнос ть - это м ера ч ис тоты ф ерм ентногоп реп арата: она возрас тает в п роцес с е оч ис тк и ф ер- м ента и с тановитс я м ак с им аль нойи п ос тоянной, к огда ф ерм ент находитс я в ч и- с том с ос тоянии. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 5. Чи слом оборот ов ф ерм ента назы ваетс я ч ис ло м олек ул с убс трата, п ретерп евающ их п ревращ ение в единицу врем ени в рас ч ете на одну м олек улу ф ерм ента (или один к аталитич ес к ийцентр) в ус ловиях, к огда к онцентрация ф ерм ента являетс я единс твенны м ф ак тором , лим итирующ им с к орос ть реак ции. Карбоангидраза - важ ны йф ерм ент, п рис утс твующ ийв боль ш их к онцентрациях в эритроцитах, - п редс тавляет с обойодиниз наиболее ак тивны х ф ерм ентов с ч ис лом оборотов 36 000 000 в 1 м инв рас ч ете на одну м олек улу ф ерм ента. Названия м ногих ф ерм ентов образуютс я п утем п рибавленияс уф ф ик с а -аза к названию их с убс трата. Так , ф ерм ент, к атализирующ ий гидролиз м оч евины , назы ваетс я уреазой (от англ. «urea»), а ф ерм ент, гидролизующ ий аргинин, - арги н азой. Однак ом ногие ф ерм енты им еют названия, не с вязанны е с названиям и их с убс тратов, нап рим ер п еп си н и т ри п си н . С луч аетс я так ж е, ч то одини тот ж е ф ерм ент им еет, п ом ень ш ейм ере, два названия или ж е два разны х ф ерм ента нос ят одно и то ж е название. Из-за этих и других затруднений терм инологич ес к ого харак тера, а так ж е вс ледс твие вс е возрас тающ его ч ис ла вновь отк ры ваем ы х ф ерм ентов бы ло п ринято м еж дународное с оглаш ение о с оздании с ис тем атич ес к ой ном енк латуры и к лас с иф ик ации ф ерм ентов. В с оответс твии с этой с ис тем ой вс е ф ерм енты в завис им ос ти от тип а к атализируем ы х им и реак цийделятс яна ш ес ть ос новны х к лас с ов, к аж ды йизк о- торы х вк люч ает ряд п одк лас с ов. Каж ды йф ерм ент им еет ч еты рехзнач ны й к одовы й ном ер (ш иф р) и с ис тем атич ес к ое название, к оторое п озволяет идентиф ицировать к атализируем ую этим ф ерм ентом реак цию (табл.). К ЛА ССИ Ф И К А Ц И Я И ХА РА К Т Е РИ СТ И К А Ф Е РМ Е Н Т О В 1. О ксидоредуктазы. К к лас с у ок с идоредук таз относ ят ф ерм енты , к атализирующ ие реак ции ок ис ления-вос с тановления. Общ ая с хем а их м ож ет бы ть п редс тавлена с ледующ им образом : Ок ис ление п ротек ает к ак п роцес с отнятия атом ов Н (элек тронов) от с уб- с трата, а вос с тановление - к ак п рис оединение атом ов Н (элек тронов) к ак цеп - тору. Х арак терной ос обеннос ть ю деятель нос ти ок с идоредук таз в ж ивой к летк е являетс я их с п ос обнос ть образовы вать с ис тем ы (так назы ваем ы е цеп и ок ис литель но-вос с тановитель ны х ф ерм ентов), в к оторы х ос ущ ес твляетс я м ногос туп енч аты йп еренос атом ов водорода или элек тронов от п ервич ного с убс трата к к онеч ном у ак цеп тору, к оторы м являетс я, к ак п равило, к ис лород, так ч тов резуль тате образуетс я вода. Те ок с идоредук тазы , к оторы е п еренос ят атом ы Н или элек троны неп ос редс твенно на к ис лородны е атом ы , нос ят название аэробны х дегидрогеназ или ок с идаз. В отлич ие от них ок с идоредук тазы , п еренос ящ ие атом ы Н и элек троны от одногок ом п онента ок ис литель нойцеп и ф ерм ентов к Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 6. другом у без п ередач и их на к ис лородны е атом ы назы вают анаэробны м и дегидрогеназам и или редук тазам и. Е с ли ф ерм ент к атализирует реак цию отнятия Н неп ос редс твенно от ок ис ляем ого вещ ес тва (п ервич ного с убс трата), то его назы вают п ервич ной дегидрогеназой. Е с ли ф ерм ент ус к оряет с нятие водородны х атом ов с о вторич ногос убс трата, к оторы йп олуч ил атом ы Н п ри п ос редс тве п ервич ной дегидрогеназы (вторич ны м с убс тратом м ож ет бы ть к оф ерм ент с ам ой п ервич ной ок с идоредук тазы ), его назы вают вторич ной дегидрогеназой. Другая ос обеннос ть ок с идоредук таз с ос тоит в том , ч то, будуч и двухк ом - п онентны м и ф ерм ентам и с вес ь м а огранич енны м набором ак тивны х груп п (к оф ерм ентов), они с п ос обны ус к орять боль ш ое ч ис ло с ам ы х разнообразны х ок ис литель но-вос с тановитель ны х реак ций. Э то дос тигаетс я за с ч ет того, ч то одини тот ж е к оф ерм ент с п ос обенс оединять с я с ом ногим и ап оф ерм ентам и, образуя к аж ды йраз ок с идоредук тазу, с п ециф ич ную п оотнош ению к том у или ином у с убс трату или ак цеп тору. Е щ е одна, п ож алуй, главная ос обеннос ть ок с идоредук таз зак люч аетс я в том , ч то они ус к оряют п ротек ание хим ич ес к их п роцес с ов, с вязанны х с вы с вобож дением энергии. Пос ледняя ис п оль зуетс я к ак для обес п еч ения с интетичес к ихп роцес с ов в организм е, так и длядругих нуж д. В п риродны х объ ек тах обнаруж ено ок оло п ятис от индивидуаль ны х ок с идоредук таз. Наиболее рас п рос транены ок с идоредук тазы , с одерж ащ ие в к ачестве ак тивнойгруп п ы никотинам идадениндинуклеотид, илиНАД+ : Более п оловины извес тны х в нас тоящ ее врем я ок с идоредук тазс одерж ат НАД+ в к ачес тве к оф ерм ента. С оединяяс ь с тем или ины м с п ециф ичес к им белк ом и Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 7. образуя, так им образом , двухк ом п онентны й ф ерм ент, к оторы й с ок ращ енно назы вают п иридинп ротеином , НАД+ резк о ус иливает с вою с п ос обнос ть вос с танавливать с я п о ядру ник отинам ида. В результате п иридин-п ротеины с п ос обны отним ать от с убс тратов (с п ирты , аль дегиды , дик арбоновы е и к еток ис лоты , ам ины и др.) атом ы Н в виде гидрид-ионов (Н- ) и п ротонов (Н+ ), ок ис ляя, так им образом , ук азанны е с оединения. Вс е п иридинп ротеины являютс я анаэробны м и дегидрогеназам и, т.е. не п ередают с няты е с с убс трата атом ы водорода на к ис лород, а п ос ы лают их на ближ айш ий в ок ис литель ной цеп и другойф ерм ент. Рас с м отрим с троение и м еханизм дейс твия одного из п иридинп ротеинов - алкогольдегидрогеназы из п ечени ж ивотны х. В п роцес с е отнятия атом ов Н от с п ирта образуетс я тройной ап оф ерм ент-к оф ерм ент-с убс тратны й к ом п лек с , удерж иваем ы й Zn2 . Неп ос редс твенно к ник отинам идадениндинук леотиду от м олек улы с п ирта п ереходит одинатом водорода в виде гидридногоиона (Н- ), т.е. атом а водорода, нес ущ его доп олнительны й элек трон. Второй атом водорода, отним аем ы й от м олек улы с п ирта, наоборот, теряет элек трон, п ревращ аяс ь в п ротон (Н+ ), и п ос туп ает в реак ционную с реду. Поэтом у уравнение реак ции ок ис ленияс п ирта п ри уч ас тии НАД+ зап ис ы вают так : В любом с луч ае НАД+ п олуч ает два элек трона за с ч ет п рис оединения гидридногоиона. Кром е НАД+ п иридинф ерм енты с одерж ат в к ач ес тве к оф ерм ента ник отинам идадениндинук леотидф ос ф ат (НАДФ + ). Э тот к оф ерм ент являетс я п роизводны м НАД+ , у к отороговодород ОН-груп п ы 2-гоуглеродногоатом а рибозы аденозина зам ещ енна ос таток ф ос ф орнойк ис лоты . НАДФ + , с оединяяс ь с ос п ециф ич ес к им и белк ам и, образует боль ш ую груп п у п иридинп ротеинов, харак теризующ уюс я с воим набором с убс тратов. М еханизм ок ис ления п ри уч ас тии НАДФ + в к ач ес тве к оф ерм ента аналогич ентак овом у п ри п ос редс тве НАД+ . Более того, НАДН и НАДФ + , равно к ак НАДФ Н и НАД+ , п ри к аталитичес к ом уч ас тии с п ециаль ногоф ерм ента –трансгидрогеназы - с п ос обны обм енивать с я атом ам и водорода и элек тронам и: Партнером вос с тановленны х ф орм п иридинп ротеинов в ок с идоредук тазной цеп и, к ак п равило, с луж ат ф лавоп ротеины (Ф П). Так им ф лавоп ротеином , нап рим ер, являетс я ф ерм ент, нес ущ ий в к ач ес тве ак тивной груп п ы ф ос ф орилированны й витам ин В2. Ок ис ленная ф орм а этого ф лавоп ротеина ок раш ена. Каж дая м олек ула ф ерм ента нес ет м олек улу риб офлавинфосфата Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 8. (или ф лавинм ононук леотида, Ф М Н), с п ос обного п риним ать и отдавать два атом а Н п оатом ам N изоаллок с азиновогок оль ца: Ок раш еннаяф орм а Бес цветная ф орм а (ок ис ленная) (вос с тановленная) Другим к оф ерм ентом в ф лавоп ротеинах являетс я флавинадениндинуклеотид(Ф АД): Ф лавинадениндинук леотид (Ф АД) Ф М Н и Ф АД, с оединяяс ь с различ ны м и ап оф ерм ентам и, дают нач ало п риблизитель но тридцати ф лавоп ротеинам , отлич ающ им с я различ ной с п ециф ич нос ть ю п оотнош ению к с убс тратам . Ос новная ф унк ция ф лавоп ротеинов - п еренос элек тронов (атом ов Н) от вос с тановленны х п иридинп ротеинов к другим к ом п онентам ок ис литель но- вос с тановитель ной цеп и, т.е. Ф П в боль ш инс тве с луч аев являютс я вторич ны м и дегидрогеназам и. Однак онек оторы е ф лавоп ротеины , ос обеннос Ф АД в к ач ес тве к оф ерм ента, м огут неп ос редс твенно с ним ать атом Н с с убс трата. Коф ерм ентам и ок с идоредук тазявляютс я так ж е хиноны. Так , с оединяяс ь c белк ом , убихиноны образуют убихинонп ротеин, являющ ийс я важ нойс ос тавной ч ас ть ю анс ам блейок с идоредук таз, п ри п ос редс тве к оторы х ос ущ ес твляетс я п еренос атом ов Н и элек тронов. У бихиноны являютс я п роизводны м и бензохинона и обладают бок овой цеп ь ю, с ос тавленнойизболь ш огоч ис ла изоп реноидны х ос татк ов: В рас тениях эту ф унк цию вы п олняет п охож ее на убихинон с оединение - п ластохинон. Ч ис лоизоп реноидны х ф рагм ентов в бок овойцеп и (и) к олеблетс я от 6 до 10. У с тановлено, ч то убихиноны п риним ают уч ас тие в ок ис литель но- вос с тановитель ны х п роцес с ах в организм е, ос ущ ес твляя п ередач у атом ов Н: Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 9. Наиболее с лож ны й, но и с ам ы йрас п рос траненны йвариант ок ис литель но- вос с тановитель ногоп роцес с а в к летк е с ос тоит в ок ис лении атом ов Н, с няты х с с убс трата, п ри п ос редс тве цитохром ной систем ы. Ц итохром ную с ис тем у образуют нес к оль к о ок с идоредук таз, им еющ их в к ачес тве п рос тетич ес к их груп п ж елезоп орф ирины . Е щ е в 1915 г., двадцать ю годам и ранее О. Варбурга, на возм ож ную роль ж елезос одерж ащ их белк ов в биологич ес к ом ок ис лении обрат или вним ание А . Я . Данилевс к ийи Б. П. С оловцов. С оединяяс ь с белк ам и различ ногос троения, ж елезоп орф ирины 4 тип ов (А, В, Си , D) дают нач алос ем ейс тву хром оп ротеинов, объ единяем ы х п од Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 10. общ им названием - цитохром ы. С ейчас извес тно нес к оль к о дес ятк ов цитохром ов, и с п ис ок их неп реры вно п оп олняетс я. Каж ды йиндивидуаль ны й цитохром обознач ают с троч нойлатинс к ойбук войа, b, с и d с с оответс твующ им п орядк овы м индек с ом , нап рим ер blt b2, b3 и т.д., а к лас с цитохром а - п роп ис ной латинс к ойбук войА, В, С или D. Принадлеж нос ть цитохром а к оп ределенном у к лас с у оп ределяетс я с троением п рос тетич ес к ой груп п ы (ж елезоп орф ирина), а ок онч атель ная индивидуаль нос ть - с троением ап оф ерм ента (белк а). В п ос леднее врем я п редп оч итают, наряду с п орядк овы м ном ером цитохром а, ук азы вать харак терную длину волны , п ри к оторой отм ечаетс я п оглощ ение в видим ойчас ти с п ек тра (нап рим ер, цитохром b6 или b563, найденны йв хлороп лас тах, и т. п .). Первич ная с трук тура ряда цитохром ов вы яс нена: ок азалос ь , ч тоих видовая с п ециф ич нос ть с вязана снеболь ш им и различ иям и в ч ередовании ам инок ис лот. Э ти данны е п ринцип иаль новаж ны для п оним ания п рироды видовойи иной с п ециф ич нос ти ф ерм ентов: видим о, она оп ределяетс я различ иям и, п реж де вс его, в п ервич нойс трук т уре ап оф ерм ентов. Ц итохром ы bх, b2, bг и т.д., с одерж ащ ие одну и ту ж е п рос тетич ес к ую груп п у, отлич аютс я друг от друга им енноп оэтом у п ризнак у. Им енно п оэтом у цитохром ы образуют ц и т охромн ую си ст ем у, п редс тавляющ ую с обой уп орядоч енное с оч етание в едином к ом п лек с е различ ны х цитохром ов, нап рим ер b, с и а. Ц итохром ная с ис тем а с п ос обна п риним ать элек троны , с няты е с атом ов Н вос с тановленного убихинона. Она п ередает элек троны далее п о цеп и цитохром ов и, нак онец, на к ис лородны й атом ; п ос ледний, с оединяяс ь с ионизированны м и атом ам и Н, образует м олек улу Н2О. В цеп и цитохром ов к аж ды й из индивидуаль ны х цитохром ов заним ает с трого оп ределенное м ес то. Прос тейш ий вариант цитохром ной с ис тем ы п риведенна с ледующ ейс хем е: Как видно из с хем ы , п ередач а элек тронов в цитохром ной цеп и ос ущ ес твляетс я за с ч ет изм енения валентнос ти атом а Fe п орф ириновогоядра. Из вс ех цитохром ов толь к о цитохром а, а3 п ередает элек троны на к ис лород. Поэтом у им енно он заверш ает цеп ь цитохром ов и нос ит название цитохром оксидазы. Кром е атом ов Fe (в с ос таве гем а) цитохром а, а3 с одерж ит так ж е атом ы С и, с к оторы м и с вязы вают его ок ис литель ны е с войс тва. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 11. Так овы харак терны е ч ерты дейс твия нек оторы х важ нейш их ок с идоредук тази ок ис литель но-вос с тановитель ны х с ис тем , обес п еч ивающ их п ревращ ение ряда вещ ес тв в к летк е. 2. Т рансферазы. В этот к лас с входят ф ерм енты , ус к оряющ ие реак ции п еренос а ф унк циональ ны х груп п и м олек улярны х ос татк ов от одного с оединения к другом у. Э то один из наиболее обш ирны х к лас с ов: он нас ч иты вает ок оло 500 индивидуаль ны х ф ерм ентов. В завис им ос ти от харак тера п еренос им ы х груп п ировок различ ают ф ос ф отранс ф еразы , ам инотранс ф еразы , глик озилтранс ф еразы , ацилтранс ф еразы , транс ф еразы , п еренос ящ ие одноуглеродны е ос татк и (м етилтранс ф еразы , ф орм илтранс ф еразы ) и др. Ф осфотрансферазы. С юда относ ятс я ф ерм енты , ус к оряющ ие реак цию п еренос а ос татк а ф ос ф орной к ис лоты . Э та реак ция им еет ис к люч итель но важ ное знач ение для ж изнедеятель нос ти организм а, обес п еч ивая п ревращ ение ряда органич ес к их с оединенийв ф ос ф орны е эф иры , обладающ ие п овы ш енной хим ич ес к ойак тивнос ть ю и более легк о вс туп ающ ие в п ос ледующ ие реак ции. Перенос ф ос ф атны х груп п идет на с п иртовы е, к арбок с иль ны е, азотс одерж ащ ие, ф ос ф орс одерж ащ ие и другие груп п ы тех или ины х органич ес к их с оединений. В с оответс твии с этим с реди ф ос ф ортранс ф ераз различ ают нес к оль к о п одп одк лас с ов. Донором ф ос ф атны х ос татк ов являетс я в боль ш инс тве с луч аев аденозинтриф ос ф орная к ис лота (АТФ ), новозм ож ны и другие их ис точ ник и. К ф ос ф отранс ф еразам относ итс я, нап рим ер, гек с ок иназа - ф ерм ент, ус к оряющ ий п еренос ос татк а ф ос ф орной к ис лоты от м олек улы АТФ к глюк озе (с этой реак ции обы ч нонач инаетс я п реобразование глюк озы ): Ос обое вним ание в п ос леднее врем я уделяют изуч ению ф ос ф отранс ф ераз, обес п еч ивающ их п еренос ос татк а ф ос ф ата с АТФ на белк и, - п ротеинк иназам . Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 12. Они п еренос ят ф ос ф ат на радик алы сер, т ре, т и р, ли з и ги с ряда белк ов, в резуль тате ч егорезк оизм еняетс я биологич ес к ая ак тивнос ть п ос ледних. Э то, в с вою оч ередь , с к азы ваетс я на интенс ивнос ти п ротек ания хим ич ес к их п роцес с ов в организм е, т. е. на регуляции обм ена вещ ес тв. А м инотрансферазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют реак цию п ереам инирования ам инок ис лот с к еток ис лотам и и оч ень важ ны для обес п еч ения биос интеза ам инок ис лот. Ам инотранс ф еразы двухк ом п онентны : п рос тетич ес к ойгруп п ой их вовс ех с луч аях являетс я п иридок с аль ф ос ф ат, к овалентноп рис оединенны й к ап оф ерм енту ч ерез с вою аль дегидную груп п у и ионной с вязь ю - ч ерез ос таток ф ос ф орнойк ис лоты : М еханизм реак ции п ереам инирования с ейч ас хорош овы яс нен, а с ам а реак ция отк ры та ещ е в 1937 г. А. Е . Браунш тейном и М . Г. Крицм ан. На п ервой с тадии ф ерм ентативного к атализа п рос тетич ес к ая груп п а ф ерм ента (для п рос тоты п ринято, ч то она с вободна, а не с оединена аль дим инной с вязь ю с ап оф ерм ентом ч ерез ε-ам иногруп п у радик ала ли з) взаим одейс твует с ам инок ис лотой, п одвергающ ейс я п ереам инированию. Реак ция идет п оам иногруп п е ам инок ис лоты и аль дегиднойгруп п е ос татк а п иридок с аль ф ос ф ата: Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 13. На второйс туп ени к атализа идет п реобразование с убс трата, вы раж ающ еес я в данном с луч ае в таутом ернойп ерегруп п ировк е: В резуль тате п ос ледующ его гидролиза ос вобож даютс я к еток ис лота и ф ерм ент в виде п иридок с ам иноф ерм ента: Далее м еж ду п иридок с ам иноф ерм ентом и другой к еток ис лотой вновь возник ает ф ерм ент-с убс тратны йк ом п лек с : С убс трат в нем с нова п одвергаетс я п реобразованию за с ч ет таутом ерного п ревращ ения: Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 14. Получ енное с оединение гидролизируетс я, и возник ает новая ам инок ис лота: С ледователь но, в резуль тате с ерии реак ций, вк люч ающ их в с ебя п оп ерем енное образование ф ерм ент-с убс тратны х к ом п лек с ов, ас п арагиновая к ис лота п ереходит в щ авелевоук с ус ную, а α-к етоглутаровая к ис лота п ереходит в глутам иновую. Э товы раж аетс я с ледующ им с ум м арны м уравнением : Глю козилтрансферазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют реак ции п еренос а глик озиль ны х ос татк ов из м олек ул ф ос ф орны х эф иров или других с оединенийк м олек улам м онос ахаридов, п олис ахаридов или ины х вещ ес тв, обес п еч ивая, главны м образом , реак ции с интеза и рас п ада олиго- и п олис ахаридов в ж ивотном и рас титель ном м ире. В с луч ае п еренос а глик озиль ны х ос татк ов на Н3РО4 этот п роцес с назы вают фосфоролизом , так к ак он ф орм аль но аналогич ен гидролизу, но вм ес то элем ентов воды п о м ес ту разры ва к ис лородного м ос тик а п рис оединяютс я водород и ф ос ф атная груп п а ф ос ф орнойк ис лоты А цилтрансферазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют п еренос ацилов (ос татк ов к арбоновы х к ис лот) на ам инок ис лоты , ам ины , с п ирты и другие с оединения. У ниверс аль ны м ис точ ник ом ациль ны х груп п вовс ех этих реак циях являетс я ацил-к оэнзим А, к оторы йс п олны м ос нованием м ож но рас с м атривать к ак ак тивную груп п у ацилтранс ф ераз. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 15. Ч ащ е вс егоп еренос у в биологич ес к их объ ек тах п одвергаетс я ацил ук с ус нойк ис лоты — ацетил Коэнзим А, с оединяяс ь с ацетиль ны м ос татк ом , к оторы йзаним ает м ес то водорода в его HS-груп п е, образует ацетил-к оэнзим А. Пос леднийс луж ит к оф ак тором в с оответс твующ ей реак ции п еренос а. Одним из п рим еров реак ции транс ацилирования являетс я с интезацетилхолина: Важ ное знач ение с реди транс ф ераз им еют ф ерм енты , ус к оряющ ие п еренос одноуглеродны х ф рагм ентов (м етиль ны х, ок с им етиль ны х, ф орм иль ны х и т. п .), а так ж е нук леотидилтранс ф еразы , к атализирующ ие п еренос нук леотидны х ос татк ов в п роцес с е с интеза нук леиновы х к ис лот. 3. Гидролазы. Кк лас с у гидролаз относ ят ф ерм енты , ус к оряющ ие реак ции рас щ еп ления (а иногда и с интеза) органич ес к их с оединенийп ри уч ас тии воды . В завис им ос ти от харак тера с убс трата, п одвергающ егос я гидролизу, гидролазы делят на ряд п одк лас с ов, с реди к оторы х наиболее важ ны с ледующ ие: 1) эс теразы , ус к оряющ ие реак ции гидролиза с лож ны х эф иров; 2) глик озидазы , ус к оряющ ие реак ции гидролиза глик озидов, в том чис ле углеводов; 3) п еп тид-гидролазы , ус к оряющ ие реак ции гидролиза (а в ос обы х с луч аях и с интеза) белк ов, п еп тидов и других с оединений, с одерж ащ их п еп тидны е с вязи; 4) гидролазы , дейс твующ ие на С — N-с вязи, отличающ иес яот п еп тидны х (нап рим ер, ам идазы и т. п .). Вс егов с ос таве гидролазнас ч иты вают п оч ти 500 ф ерм ентов. Эстеразы. Э ти ф ерм енты к атализируют реак ции гидролиза с лож ны х эф иров с п иртов с органич ес к им и и неорганич ес к им и к ис лотам и. Важ нейш им и п одп одк лас с ам и эс тераз являютс я гидролазы эф иров к арбоновы х к ис лот и ф ос ф атазы . В к ач ес тве п редс тавителя п ервого п одп одк лас с а рас с м отрим лип азу. Л ип аза ус к оряет гидролиз внеш них, т. е. α-с лож ноэф ирны х, с вязейв м олек улах триацилглицеринов (ж иров): Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 16. М еханизм дейс твия ряда эс тераздеталь ноизуч ен. Ф ос ф атазы к атализируют гидролиз ф ос ф орны х эф иров. Ос обенно ш ирок о рас п рос транены ф ос ф атазы , дейс твующ ие на с лож ны е эф иры ф ос ф орной к ис лоты и углеводов, нап рим ер глюк озо-1-ф ос ф атаза: Дейс твие ф ос ф атаз п роявляетс я в ш ирок ом с п ек тре рН от 3 до 9. Боль ш инс тво из них обладает ш ирок ой с убс тратной с п ециф ич нос ть ю. Ос обенно важ ны для регуляции п роцес с ов ж изнедеятель нос ти п ротеинф ос ф атазы , обес п еч ивающ ие отщ еп ление ф ос ф ата от ф ос ф орилированны х белк ов, вс ледс твие ч егоизм еняетс я их биологич ес к ая, в ч ас тнос ти, ф ерм ентативная ак тивнос ть . Гликозидазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют реак цию гидролиза глик озидов. В завис им ос ти от того, на к ак ойп рос транс твенны йизом ер (α или β) дейс твует ф ерм ент, егоотнос ят к α- или β-глик озидазам . Так им образом , глик озидазы обладают ярк о вы раж енной п рос транс твенной с п ециф ич нос ть ю. Кром е глик озидов, с одерж ащ их в к ач ес тве аглик онов ос татк и одноатом ны х с п иртов, с убс тратам и, на к оторы е рас п рос траняетс я дейс твие тех или ины х глик озидаз, являютс я олиго- и п олис ахариды . Из дейс твующ их на олигос ахариды глик о- зидаз уп ом янем м аль тазу (α-глик озидаза) и с ахаразу (β-глик озидаза). Они ус к оряют с оответс твенногидролизм аль тозы и с ахарозы : Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 17. Из глик озидаз, дейс твующ их на п олис ахариды , наиболее извес тны ам илазы . В п рироде с ущ ес твует нес к оль к о видов ам илаз, ус к оряющ их реак ции гидролиза глик озидны х с вязейв м олек уле к рахм ала с образованием глюк озы , м аль тозы или олигос ахаридов. Гидролиз других п риродны х п олиглик озидов так ж е ус к оряетс я с оответс твующ им и глик озидазам и. Нек оторы е глик озидазы к атализируют так ж е реак ции п еренос а глик озиль ны х ос татк ов, т.е. являютс я транс глик озидазам и. Пеп тид-гидролазы. Ф ерм енты этого п одк лас с а ус к оряют гидролиз п еп тидны х с вязейв белк ах и п еп тидах, а п ри оп ределенны х ус ловиях так ж е и образование п еп тидны х с вязей, хотя этот п уть с интеза белк а не являетс я ф изиологич ес к им . Х им изм п роцес с а гидролиза белк ов и п еп тидов п ри уч ас тии п еп тидгидролазм ож новы разить с ледующ ейс хем ой: С реди п еп тид-гидролаз различ ают п ротеиназы или п еп тидил- п еп тидогидролазы , к атализирующ ие гидролиз неболь ш ого ч ис ла внутренних п еп тидны х с вязей в белк овой м олек уле, в резуль тате ч его п ос ледняя рас п адаетс я до п еп тидов. Они являютс я, с ледователь но, эндоп еп тидазам и. В отлич ие от этого п еп тид-гидролазы , назы ваем ы е п еп тидазам и, обес п еч ивают отщ еп ление от п еп тидной цеп и с вободны х ам инок ис лот, будуч и эк зоп еп тидазам и. Протеиназы в завис им ос ти от м еханизм а их дейс твия на внутренние п еп тидны е с вязи в белк овойм олек уле делят на 4 п одп одк лас с а: 1) с ериновы е п ротеиназы , нес ущ ие в ак тивном центре радик алы сери ги с, обес п еч ивающ ие Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 18. ос ущ ес твление к аталитич ес к ого ак та; п редс тавителям и их являютс я хим отрип с ин и трип с ин, вы деляем ы е п одж елудоч ной ж елезой, с убтилизин, п родуцируем ы йбак териям и, и др.; 2) тиоловы е (цис теиновы е) п ротеиназы , им еющ ие в ак тивном центре ос таток ц и с; к их ч ис лу п ринадлеж ат п ап аиниз латек с а ды нногодерева Carica papaya, ф ицинизлатек с а ф ик ус а, бром елаиниз с ок а с твола ананас а, к атеп с инВ - внутрик леточ ны йф ерм ент п озвоноч ны х и др.; 3) к ис лы е (к арбок с иль ны е) п ротеиназы , им еющ ие оп тим ум рН ниж е 5 и с одерж ащ ие радик алы дик арбоновы х ам инок ис лот в ак тивном центре; с юда относ ятс я п еп с ин, вы деляем ы й с лизис той ж елудк а, к атеп с ин D, харак теризующ ийс я внутрик леточ нойлок ализацией, и ряд к ис лы х п ротеиназ, п родуцируем ы х разнообразны м и м ик роорганизм ам и; 4) м еталлоп ротеиназы , к аталитич ес к ое дейс твие к оторы х завис ит от п рис утс твия ионов м еталлов (С а2+ , Zn2+ ) в ак тивном центре; п рим ерам и их м огут с луж ить к оллагеназа и ряд п ротеиназ м ик робногоп роис хож дения (терм олизин, к ом п онент п роназы и др.). Пеп с ин, трип с ини хим отрип с инвы деляютс я ж елезис ты м и к летк ам и в виде неак тивны х п роф ерм ентов - зим огенов: п еп с иногена, трип с иногена и хим отрип с иногена, так к ак их ак тивны е центры блок ированы ф рагм ентам и п олип еп тиднойцеп и, п ос ле гидролитич ес к ого отщ еп ления к оторы х ф ерм ент п риобрет ает ак тивнос ть . Э то явление вп ервы е бы ло от к ры т о в лаборат ории И. П. Павлова. Оч ень важ нойос обеннос ть ю п ротеиназ являетс я вы бороч ны й(с елек тивны й) харак тер их дейс твия на п еп тидны е с вязи в белк овойм олек уле. Так , п еп с ин избиратель ноус к оряет гидролиз п еп тидны х с вязей, образованны х фен и лей; трип с ин- арг и ли з; хим отрип с ин- аром атич ес к им и ам инок ис лотам и; п ап аин - арг, ли з и фен и т. д. В резуль тате индивидуаль ны йбелок п од дейс твием оп ределенной п еп тидил-п еп тидогидролазы рас щ еп ляетс я вс егда на с трого огранич енное ч ис ло п еп тидов. Э тонаходит п рак тич ес к ое ис п оль зование п ри оп ределении п ервич ной с трук туры белк ов и им еет огром ное знач ение для регуляции обм ена вещ ес тв, так к ак м ногие п родук ты с елек тивногогидролиза белк ов обладают вы с оч айш ей биологич ес к ой ак тивнос ть ю: им енно этим п утем изп роф ерм ентов возник ают ф ерм енты , изп редш ес твенник ов горм онов — горм оны и т. п . Прич ина избиратель ногодейс твия п еп тидп еп тидогидролаз зак люч аетс я в том , ч то радик ал ам инок ис лоты , п о с ос едс тву с к оторой гидролизуетс я п еп тидная с вязь , с луж ит для образования ф ерм ент-с убс тратного к ом п лек с а. Пеп тид-гидролазы , к атализирующ ие гидролиз п еп тидов до с вободны х ам инок ис лот, м огут отщ еп лять п ос ледние от п еп тида, нач иная либо с ам инок ис лоты , обладающ ей с вободной NH2-rpyп п у, либо с ам инок ис лоты , им еющ ей с вободную С ООН-груп п у. В п ервом с луч ае их назы вают ам иноп еп тидазам и, вовтором - к арбок с ип еп тидазам и. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 19. Точ к и п рилож ения дейс твия п ротеолитич ес к их ф ерм ентов на п еп тидны е с вязи в белк овойм олек уле Нек оторы е ам ино- и к арбок с ип еп тидазы обладают с п ециф ич нос ть ю дейс твия, т.е. отщ еп ляют с трого оп ределенны е N- или С -к онцевы е ам инок ис лоты . Третий п одп одк лас с п еп тидаз п редс тавлен ди п еп т и дги дролазами , ди п еп т и дазами . Их извес тно ок оло дес яти. Они заверш ают гидролиз белк а. Недавноиз с ос тава п еп тидаз вы ч лененоещ е два п одп одк лас с а: дип еп тидил-п еп тидгидролазы , отщ еп ляющ ие от N-к онца п олип еп тида дип еп тид, и п еп тидилдип еп тид-гидролазы , отщ еп ляющ ие дип еп тид с С -к онца. А м идазы. Э ти ф ерм енты ус к оряют гидролиз ам идов к ис лот. Из них важ ную роль в биохим ич ес к их п роцес с ах в организм е играют уреаза, ас п арагиназа и глутам иназа. У реаза бы ла одним из п ервы х белк ов-ф ерм ентов, п олуч енны м в к рис таллич ес к ом с ос тоянии (Д. С ам нер, 1926). У реаза ус к оряет гидролиз м оч евины доNH3 и С О2. Асп арагин аза и глут амин аза ус к оряют гидролиз ам идов дик арбоновы х ам ино- к ис лот - ас п арагиновойи глутам иновой, нап рим ер: Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 20. Кгидролазам , дейс твующ им на С — N-с вязи, отлич ающ иес я от п еп тидны х, к ром е ам идазотнос ятс я ф ерм енты , к атализирующ ие гидролизС — N-с вязейв линейны х ам идинах. К их ч ис лу п ринадлеж ит аргиназа. При п ос редс тве аргиназы ам инок ис лота аргинингидролизуетс я на орнитини м оч евину: Э та реак ция ш ирок о п редс тавлена в п рироде, являяс ь зак лючитель ной с тадией биос интеза м оч евины - одного из к онеч ны х п родук тов рас п ада азотс одерж ащ их вещ ес тв. 4. Лиазы. К к лас с у лиаз относ ятс я ф ерм енты , ус к оряющ ие негидролитич ес к ие реак ции рас п ада органич ес к их с оединенийп ос вязям С — С ; С — N; С — О и т. д. При этом зам ы к аютс я двойны е с вязи и вы деляютс я так ие п рос тейш ие п родук ты , к ак С О2, Н2О, NH3 и т. п . Нек оторы е из этих реак ций обратим ы , и с оответс твующ ие ф ерм енты в п одходящ их ус ловиях к атализируют реак ции не толь к о рас п ада, но и с интеза. Так им образом , название этого к лас с а ф ерм ентов не вс егда с оответс твует с одерж анию тех п роцес с ов, к оторы е им и ус к оряютс я. Одной из важ нейш их груп п ф ерм ентов этого к лас с а являютс я углерод- углерод-лиазы (С — С -лиазы ). С реди них ос обое знач ение им еют к арбок с илиазы (дек арбок с илазы ) и аль дегид-лиазы . В п рироде ш ирок о рас п рос транены дек арбок с илазы к еток ис лот и ам инок ис лот, к атализирующ ие реак ции п ос ледующ им с хем ам : Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 21. Э ти ф ерм енты двухк ом п оненты , п рос тетич ес к им и груп п ам и их во м ногих с луч аях являютс я ф ос ф орны е эф иры водорас творим ы х витам инов: тиам ина и п иридок с аля. М еханизм реак ции дек арбок с илирования ам инок ис лот с п ом ощ ь ю к арбок с илиазы с п иридок с аль ф ос ф атом в к ач ес тве к оф ерм ента оч ень близок к том у, к оторы й дейс твует п ри п ереам инировании ам инок ис лот. З дес ь тож е возник ает ш иф ф ово ос нование, в к отором элек тронная п лотнос ть у α- углеродного атом а ам инок ис лоты резк о ос лаблена. Вс ледс твие этого с иль но ос лабляетс я с вязь этого углеродного атом а с к арбок с иль ной груп п ой, и п ос ледняя легк оотщ еп ляетс я. Х арак терны м п редс тавителем аль дегид-лиаз являетс я аль долаза, к атализирующ ая обратим ую реак цию рас щ еп ления ф рук тозо-1,6-диф ос ф ата до ф ос ф отриоз: Э та реак ция заним ает централь ное м ес то в п реобразовании углеводов. Аналогич ноаль долазе дейс твуют другие аль дегид-лиазы . Другую важ ную груп п у лиаз с ос тавляют углерод- к ис лород лиазы (гидролиазы ), ус к оряющ ие реак ции гидратирования и дегидратирования Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 22. органич ес к их с оединений. В к ач ес тве п редс тавителя гидролиаз п риведем фум аратгидратазу: Реак ции гидратирования и дегидратирования п ос тоянноидут п ри рас п аде и с интезе углеводов и вы с ш их ж ирны х к ис лот, п оэтом у гидратазы играют боль ш ую роль в ж изнедеятель нос ти организм ов. 5. И зом еразы. Ф ерм енты , относ ящ иес я к этом у нем ногоч ис ленном у (ок оло 90 индивидуаль ны х ф ерм ентов) к лас с у, ус к оряют геом етрич ес к ие или с трук турны е изм енения в п ределах одной м олек улы . Э ти изм енения м огут с ос тоять вовнутрим олек улярном п еренос е водорода, ф ос ф атны х и ациль ны х груп п , в изм енении п рос транс твенногорас п олож ения атом ны х груп п ировок , в п ерем ещ ении двойны х с вязейи т. п . Важ нейш им и изом еразам и являютс я триозоф ос ф атизом ераза, ф ос ф оглицерат-ф ос ф ом утаза, аль дозом утаротаза и изоп ентенил- п ироф ос ф атизом ераза. Триозоф ос ф атизом ераза ус к оряет п еренос атом ов Н в п роцес с е п ревращ ения3- ф ос ф оглицериновогоаль дегида в ф ос ф одиок с иацетони обратно: Превращ ение, вероятно, идет ч ерез общ ую эндиоль ную ф орм у. Ф ос ф оглицерат-ф ос ф ом утаза обес п еч ивает дос таточ ную с к орос ть п ревращ ения 2-ф ос ф оглицериновойк ис лоты в 3-ф ос ф оглицериновую к ис лоту и обратно: Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 23. Оба п роцес с а им еют гром адное знач ение в органич ес к ом м ире, так к ак п редс тавляют важ нейш ие с тадии рас п ада и с интеза углеводов. М утаротаза являетс я п редс тавителем с тереоизом ераз, она ус к оряет реак цию п ревращ ения a-D-глюк оп иранозы в β-D-глюк оп иранозу: Ф ерм енты этого тип а (с тереоизом еразы ) обес п еч ивают, в ч ас тнос ти, взаим оп ревращ ения м ногих п рос транс твенны х изом еров м онос ахаридов, и этот п уть являетс я иногда единс твенны м для с интеза нек оторы х из них в п рироде. Кс тереоизом еразам относ ятс я так ж е цис -транс изом еразы , нап рим ер ретинол-изом ераза, п ереводящ ая транс -ретинол в цис -ретинол. 6. Лигазы (синтетазы). Х арак терны е ч ерты дейс твия ф ерм ентов этогок лас с а вы явлены с овс ем недавно в с вязи с о знач итель ны м и ус п ехам и в изуч ении м еханизм а с интеза ж иров, белк ов и углеводов. Ок азалос ь , ч тос тары е п ред- с тавления об образовании этих с оединений, с оглас нок оторы м они возник ают п ри обращ ении реак цийгидролиза, не с оответс твуют дейс твитель нос ти. Пути их с интеза п ринцип иаль ноины е. Главная их ос обеннос ть - с оп ряж еннос ть с интеза с рас п адом вещ ес тв, с п ос обны х п ос тавлять энергию для ос ущ ес твления биос интетич ес к ого п роцес с а. Одним из так их п риродны х с оединенийявляетс я АТФ . При отры ве от ее м олек улы в п рис утс твии лигаз одного или двух к онцевы х ос татк ов ф ос ф орнойк ис лоты вы деляетс я боль ш ое к олич ес тво энергии, ис п оль зуем ой для ак тивирования реагирующ их вещ ес тв. Л игазы ж е к аталитич ес к и ус к оряют с интез органич ес к их с оединений из ак тивированны х за с ч ет рас п ада АТФ Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 24. ис ходны х п родук тов. Так им образом , к лигазам относ ятс я ф ерм енты , к атализирующ ие с оединение друг с другом двух м олек ул, с оп ряж енное с гидролизом п ироф ос ф атной с вязи в м олек уле АТФ или иного нук леозидтриф ос ф ата. М еханизм дейс твия лигаз изуч ен ещ е недос таточ но, но, нес ом ненно, он вес ь м а с лож ен. В ряде с луч аев док азано, ч тоодноиз уч ас твующ их в ос новной реак ции вещ ес тв с нач ала дает п ром еж уточ ное с оединение с ф рагм ентом рас п адающ ейс я м олек улы АТФ , а вс лед за этим ук азанны йп ром еж уточ ны й п родук т взаим одейс твует с овторы м п артнером ос новнойхим ич ес к ойреак ции с образованием к онеч ногоп родук та. В к ач ес тве п рим ера дейс твия лигазы м ож ноп ривес ти с интез п антотеновой к ис лоты изα, γ-диок с и-β, β-дим етилм ас лянойк ис лоты и β-аланина: Пантотенатсинтетаза, к ак с ледует из п риведенногоуравнения, относ итс я к груп п е лигаз, ус к оряющ их реак ции с интеза С — N-с вязей. Э та груп п а лигаз нас ч иты вает ок оло 40 п редс тавителей. В нас тоящ ее врем я изуч ено более 75 различ ны х лигаз, обес п еч ивающ их важ нейш ие с интетич ес к ие п роцес с ы в ж ивотнойи рас титель нойк летк ах. Кром е ус к орения реак ций с интеза С — N-с вязей, в ч ас тнос ти п еп тидны х, лигазы к атализируют образование с вязейС — С , С — О и С — S. Кгруп п е лигаз, образующ их С — С -с вязи, относ ятс я карб оксилазы. Они обес п еч ивают к арбок с илирование ряда с оединений, в резуль тате ч егоп роис ходит удлинение углеродны х цеп ей. Одной из важ нейш их к арбок с илаз являетс я п ируваткарб оксилаза, ус к оряющ ая реак цию образования щ авелевоук с ус ной к ис лоты изп ировинограднойк ис лоты и ок с ида углерода (IV): Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 25. Э та реак ция им еет ис к люч итель ное знач ение в обм ене вещ ес тв, обес п еч ивая взаим ос вязь обм ена углеводов и белк ов и ак цеп тирование С О2. Л игазам , к атализирующ им с интез С — О-с вязей, п ринадлеж ит важ нейш ая роль в биос интезе белк ов, так к ак они ус к оряют реак ции ак тивирования ам инок ис лот п еред вс туп лением п ос ледних в п еп тидную с вязь . Одной из п рос тейш их реак цийэтоготип а являетс я образование ам иноациладенилатов. С ам иноациладенилатов ам инок ис лоты п ередаютс я на тРНК, образуя ам иноацил-тРНК, ис п оль зуем ы е неп ос редс твенноп ри с интезе п олип еп тидов. Л игазы , к ром е того, ос ущ ес твляют ус к орение реак цийобразования С — S- с вязей, являяс ь ацил-к оэнзим А-с интетазам и. В к ач ес тве п рим ера дейс твия ацил-к оэнзим А-с интетазы м ож ноп ривес ти образование ацетил-к оэнзим а А изук с ус нойк ис лоты и к оэнзим а А, п ротек ающ ее с оп ряж енос рас п адом АТФ : Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 26. Таблица Клас с иф ик ация ф ерм ентов Груп п а Катализируем ая реак ция Тип ич ная реак ция Прим еры ф ерм ентов* Ок с идоредук - тазы Перенос атом ов Н и О или элек тронов от одного вещ ес тва к другом у (NAD+ , NADP+ , FAD, O2). AH + B = A + BH A + O = AO М алатдегидрогена- за, глюк озо-6- ф ос ф ат- дегидрогеназа С ук цинатдегидро- геназа Ц итохром ок с идаза Транс ф еразы Перенос оп ределенной груп п ы атом ов – м етиль ной, ациль ной, ф ос ф ат- ной или ам ино- груп п ы – от одного вещ ес тва к другом у. AB + C = A + BC Глициндек ар- бок с илаза Ацилк арнитинтранс -ф ераза Гек с ок иназа Ас п артатам ино- транс ф ераза Гидролазы Реак ции гидролиза, п ри к оторы х из с убс трата образуют- с я два п родук та. AB + H2O = AOH + BH Л ип аза, ам илаза, п еп тидаза Л иазы Негидролитич ес к ое п рис оединение к с убс трату или отщ еп ление от него груп п ы атом ов. При этом м огут разры - вать с яс вязи C-C, C-N, C-O или C-S O R-C-C = OH H R-C + O CO2 Ф ум араза, аль долаза, изоцитратлиаза, п ируватдек арбок - с илаза Изом еразы Внутрим олек уляр- наяп ерес тройк а AB = BA Триозоф ос ф атизо- м ераза, ф ос ф оглюк ом утаза Л игазы С оединение двух м олек ул в резуль тате образования новы х с вязейС -О, C-S, C-N или C-C, с оп ряж енного с рас п адом АТФ . X + Y + АТФ = XY + АДФ + Ф н Пируват- к арбок с илаза *Даны тривиаль ны е названия ф ерм ентов. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 27. Ацетил-КоА с луж ит к оф ерм ентом в реак циях транс ацилирования, п оэтом у дейс твие ф ерм ентов этих двух груп п - лигаз и ацилтранс ф ераз - в ж ивы х с ис тем ах тес но увязано друг с другом . Аналогич ная взаим озавис им ос ть харак терна и для м ногих других ф ерм ентов. М еханизм дей ствия ферм ентов У с к орение любойхим ич ес к ойреак ции дос тигаетс я за с ч ет увелич ения доли м олек ул, обладающ их дос таточ нойвнутреннейэнергиейдля дос тиж ения п ереходного с ос тояния. Одним из м еханизм ов п овы ш ения с к орос ти реак ции являетс я увелич ение тем п ературы . Как п равило, п овы ш ение тем п ературы на 10о С вы зы вает ус к орение хим ич ес к ойреак ции п риблизитель нов два раза. Второйп уть ус к орения хим ич ес к ойреак ции - добавление к атализатора. Катализаторы ус к оряют хим ич ес к ие реак ции, находя «обходны е п ути», п озволяющ ие м олек улам п реодолевать ак тивационны йбарь ер на более низк ом энергетич ес к ом уровне. Ф ерм енты , так ж е к ак и другие к атализаторы , с оединяютс яс ос воим и с убс тратам и в ходе к аталитич ес к огоцик ла. Ф ерм ент-к атализатор (обознач им егобук войЕ ) на п ром еж уточ нойс тадии реак ции взаим одейс твует с реагентом А с образованием новогок ом п лек с а или с оединения Е А, п ереходном у с ос тоянию к оторого с оответс твует знач итель но более низк ая энергия ак тивации п о с равнению с п ереходны м с ос тоянием реагента в нек атализируем ойреак ции. Рис унок 2. Изм енение с вободнойэнергии с ис тем ы п ри п ротек ании хим ич ес к ойреак ции в п рис утс твии и отс утс твии к атализатора Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 28. З атем к ом п лек с ф ерм ент-с убс трат (Е А) рас п адаетс я на п родук т Р и с вободны йк атализатор, к оторы йм ож ет оп ять с оединить с я с другойм олек улой А и п овторить вес ь цик л. Им енно так им образом к атализаторы с ниж ают энергию ак тивации хим ич ес к ой реак ции; в их п рис утс твии гораздо более знач итель ная доля м олек ул даннойп оп уляции вс туп ает в реак цию в единицу врем ени. Ф ерм енты , так ж е к ак и другие к атализаторы , с оединяютс я с ос воим и с убс тратам и в ходе к аталитич ес к огоцик ла. Ф ерм енты п овы ш ают с к орос ти к ата- лизируем ы х им и реак цийв 108 -1020 раз. Нап рим ер, уреаза ус к оряет гидролиз м оч евины в 1014 раз п ри рН 8 и 20°С . Как ж е удаетс я ф ерм ентам п роявлять так ую необы ч айно вы с ок ую к аталитич ес к ую ак тивнос ть в с толь м ягк их ус ловиях? С ущ ес твуют ч еты ре ос новны х ф ак тора, оп ределяющ их с п ос обнос ть ф ерм ентов ус к орять хим ич ес к ие реак ции. Сбли ж ен и е и ори ен т ац и я. Ф ерм ент с п ос обен с вязы вать м олек улу с убс трата так им образом , ч тоатак уем ая ф ерм ентом с вязь ок азы ваетс я не толь к о рас п олож еннойв неп ос редс твеннойблизос ти от к аталитич ес к ойгруп п ы , нои п равиль но ориентированнойп о отнош ению к ней. В резуль тате вероятнос ть того, ч то к ом п лек с Е S дос тигнет п ереходного с ос тояния, с иль но увелич иваетс я. Нап ряж ен и е и деформац и я: и н дуц и рован н ое соот вет ст ви е. Прис оединение с убс трата м ож ет вы зы вать к онф орм ационны е изм енения в м олек уле ф ерм ента, к оторы е п риводят к нап ряж ению с трук туры ак тивного центра, а так ж е нес к оль к о деф орм ируют с вязанны й с убс трат, облегч ая тем с ам ы м дос тиж ение к ом п лек с ом Е А п ереходногос ос тояния. При этом возник ает так назы ваем ое и н дуц и рован н ое соот вет ст ви е ф ерм ента с убс трату. Так им образом , неболь ш ие изм енения третич нойили ч ет- вертич нойс трук туры относ итель нок руп нойм олек улы ф ерм ента м огут играть роль м еханич ес к огоры ч ага для м олек улы с убс трата. Возм ож но, ч тоим енноп о этойп рич ине ф ерм енты п редс тавляют с обойбелк и и, с ледователь но, п ос воим разм ерам знач итель ноп ревос ходят м олек улы боль ш инс тва с убс тратов. О бщи й ки слот н о-осн овн ый кат али з. В ак тивном центре ф ерм ента м огут находить с я груп п ы с п ециф ич ес к их ам инок ис лотны х ос татк ов, к оторы е являютс я хорош им и донорам и или ак цеп торам и п ротонов. Так ие к ис лотны е или ос новны е груп п ы общ его тип а п редс тавляют с обой м ощ ны е к атализаторы м ногих органич ес к их реак ций, п ротек ающ их в водны х с ис тем ах. Ковален т н ый кат али з. Нек оторы е ф ерм енты реагируют с о с воим и с убс тратам и, образуя оч ень нес табиль ны е, к овалентно с вязанны е ф ерм ент- с убс тратны е к ом п лек с ы , из к оторы х в ходе п ос ледующ ейреак ции образуютс я п родук ты реак ции, п рич ем знач итель но бы с трее, ч ем в с луч ае нек атализируем ы х реак ций. Переч ис ленны е вы ш е ч еты ре ф ак тора, п о-видим ом у, внос ят различ ны й вк лад в ус к орение хим ич ес к их реак цийф ерм ентам и разны х тип ов, однак они для одного ф ерм ента п ок а не извес тно точ ного м еханизм а, обес п еч ивающ его ус к орение тойили инойс п ециф ич ес к ойдля негореак ции. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 29. А ллостерическиеферм енты Как и вс е ф ерм енты , аллос терич ес к ие ф ерм енты им еют к аталитич ес к ий центр, в к отором п роис ходит с вязы вание с убс трата и п ревращ ение его в п родук т, но у аллос терич ес к их ф ерм ентов ес ть , п о м ень ш ейм ере, ещ е один регуляторны й, или аллос терич ес к ий, центр для с вязы вания регулирующ его м етаболита, назы ваем ого эф ф ек тором или м одулятором (рис . 1). Аллос терич ес к ийцентр с п ециф ич енп оотнош ению к с воем у м одулятору анало- гич но том у, к ак к аталитич ес к ийцентр с п ециф ич ен п о отнош ению к с воем у с убс трату. Во-вторы х, м олек улы аллос терич ес к их ф ерм ентов обы ч но нам ного к руп нее и более с лож но ус троены п ос равнению с м олек улам и п рос ты х ф ер- м ентов. Боль ш инс твоиз них с ос тоит из двух или более п олип еп тидны х цеп ей, или с убъ единиц. И нак онец, в-треть их, к инетик а реак ций, к атализируем ы х аллос терич ес к им и ф ерм ентам и, обы ч но знач итель но отк лоняетс я от к лас с ич е- с к огоуравнения М ихаэлис а-М ентен. Э тоодиниз п ризнак ов, п ок отором у они бы ли вп ервы е обнаруж ены . Когда с п ециф ич ес к ий ингибирующ ий, или отрицатель ны й, м одулятор с вязы ваетс я с аллос терич ес к им центром , ч то п роис ходит п ри п овы ш ении к онцентрации м одулятора в к летк е, ф ерм ент п ереходит в м енее ак тивную или с овс ем неак тивную ф орм у, т.е. «вы к люч аетс я». Когда ж е к онцентрация м одулятора в к летк е с ниж аетс я, ингибитор п ок идает аллос терич ес к ийцентр и ф ерм ент вновь «вк люч аетс я», т.е. п ереходит в ак тивную ф орм у. С ущ ес твуют, однак о, и так ие аллос терич ес к ие ф ерм енты , к оторы е ак тиви- руютс я м олек улам и м одулятора. В этом с луч ае ф унк цию ак тивирующ его, или п олож итель ного, м одулятора вы п олняет не к онеч ны й п родук т данной цеп и ф ерм ентативны х реак ций, а к ак ой-то другой м етаболит, к оторы й с луж ит м олек улярны м с игналом , означ ающ им , ч тоф ерм ент долж ен«п ос п еш ить ». Ч ас то в роли ак тивирующ его м одулятора так ого тип а вы с туп ает с ам а м олек ула с убс трата. Аллос терич ес к ие ф ерм енты этогок лас с а, назы ваем ы е гом отроп ны м и (так к ак м одулятором и с убс тратом с луж ит однои тож е с оединение), им еют два или боль ш ее ч ис лоцентров с вязы вания для с убс трата. Э ти центры с вязы вания нередк о вы п олняют двойную ф унк цию, дейс твуя и к ак к аталитич ес к ие, и к ак регуляторны е центры . Аллос терич ес к ие ф ерм енты этого тип а реагируют на с итуации, п ри к оторы х с убс трат нак ап ливаетс я в избы точ ны х к олич ес твах и долж енбы ть удаленв ходе п ос ледующ их реак ций. Так им образом , им еютс я аллос терич ес к ие ф ерм енты двух тип ов. Ф ерм енты п ервоготип а ингибируютс я с воим и м одуляторам и, к оторы е обы ч но п о с воем у хим ич ес к ом у с троению отлич аютс я от с убс трата (п оэтом у эти ф ерм енты назы ваютс я гетеротроп ны м и). Нек оторы е аллос терич ес к ие ф ерм енты п одверж ены влиянию двух и более м одуляторов, к оторы е м огут ок азы вать на ф ерм ент п ротивоп олож ное дейс твие, т.е. один м одулятор (или боль ш ее их ч ис ло) ак тивирует ф ерм ент, а другой(или другие) - ингибирует его. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 30. Т естовыезадания для сам оконтроля п о тем е«Ф ерм енты» 1. Ф ерм ентативнойак тивнос ть ю обладают: 1. Толь к обелк и 2. Толь к онук леиновы е к ис лоты 3. Л ип иды 4. Белк и и РНК 5. Глик оп ротеины . 2. Коф ак тором назы ваетс я: 1. Ап обелок + п рос тетич ес к ая груп п а 2. Полип еп тиднаяцеп ь 3. Ап оф ерм ент + к оф ерм ент 4. Коф ерм ент + п рос тетич ес к ая груп п а 5. Ионы м еталлов. 3. При к ак ом знач ение рН с оответс твует рН оп тим ум у боль ш инс твоф ерм ентов: 1. 1.5-2.5 2. 5-6 3. 7-8 4. 10-11 5. 0-7. 4. Конс танта М ихаэлис а равняетс я: 1. Концентрации ф ерм ента, п ри к оторойс к орос ть реак ции м ак с им аль на 2. Концентрации с убс трата, п ри к оторойс к орос ть реак ции м ак с им аль на 3. Концентрации с убс трата, п ри к оторойс к орос ть реак ции м иним аль на 4. Концентрации с убс трата, п ри к оторойс к орос ть реак ции равна п оловине м ак с им аль ной 5. Концентрации ф ерм ента, п ри к оторойс к орос ть реак ции равна п оловине м ак с им аль ной. 5. При нек онк урентном ингибировании: 1. Ингибитор с вязы ваетс яс к оф ерм ентом 2. Ингибитор с вязы ваетс яс ак тивны м центром 3. Ингибитор с вязы ваетс яс белк овойм олек улойне в ак тивном центре 4. Ингибитор с вязы ваетс яс с убс тратом 5. Ингибитор с вязы ваетс яс п ром еж уточ ны м п родук том . 6. У равнение М ихаэлис а-М ентеноп ис ы вает: 1. З авис им ос ть обратнойс к орос ти от обратнойк онцентрации с убс трата 2. Поведение аллос терич ес к их ф ерм ентов 3. З авис им ос ть с к орос ти ф ерм ента от к онцентрации с убс трата 4. З авис им ос ть ак тивнос ти ф ерм ентов от тем п ературы 5. З авис им ос ть ак тивнос ти ф ерм ентов от рН. 7. Ф ерм енты , к атализирующ ие п рис оединение м олек ул п одвойнойс вязи относ ятс як к лас с у: 1. Ок с идоредук тазы 2. Транс ф еразы 3. Гидролазы Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 31. 4. Л иазы 5. Изом еразы . 8. Л ак татдегидрогеназа относ итс як : 1. Ок с идоредук тазам 2. Транс ф еразам 3. Гидролазам 4. Л иазам 5. Изом еразам . 9. Оп ределите, к к ак ом у к лас с у относ итс я даннаяф ерм ентативная реак ция C2H5OH + NAD+ = CH3CHO + NADH + H+ : 1. Ок с идоредук тазы 2. Транс ф еразы 3. Гидролазы 4. Л иазы 5. Изом еразы . 10. Аллос терич ес к ие ф ерм енты : 1. С ос тоят изоднойс убъ единицы 2. С ос тоят изнес к оль к их с убъ единиц 3. М еняют к онф орм ацию п ри взаим одейс твии с с убс тратом 4. М еняют к онф орм ацию п ри взаим одейс твии с м ем бранны м п отенциалом 5.Х арак теризуютс я К0.5 11. Ковалентнойм одиф ик ациейназы ваетс ярегуляцияс к орос ти реак ции за с ч ет того, ч то: 1. С убс трат к овалентнос вязы ваетс яс п родук том 2. Проис ходит ф ос ф орилирование с убс трата 3. Прос ходит ф ос ф орилирование ф ерм ента 4. Ф ерм ент к овалентнос вязы ваетс яс к ак ой-либоф унк циональ нойгруп п ой 5. Катализп ротек ает с образованием к овалентны х с вязей. 12. Дайте название ф ерм енту, к атализирующ ем у реак цию С ук цинат + FAD = ф ум арат + FADH2 Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 32. Рис.1. Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 33. М Е Т А Б О ЛИ ЗМ М етаболизм – с овок уп нос ть биохим ич ес к их п роцес с ов, п ротек ающ их в ж ивом организм е. Протек ание м етаболич ес к их п роцес с ов обес п еч иваетс я налич ием в к летк е с лож нойс ис тем ы ф ерм ентов, а так ж е к леточ нойм ем браны , огранич ивающ ейее с одерж им ое от внеш нейс реды . К атаб олизм ианаб олизм Катаболизм – ф аза м етаболизм а, на к оторойп роис ходит рас п ад м олек ул, п ос туп ающ их с п ищ ейили зап ас енны х ж ивы м организм ом донеорганич ес к их вещ ес тв (H2O, CO2, NH4). В ходе к атаболич ес к их п роцес с ов вы с вободивш аяс я п ри ок ис лении энергия зап ас аетс я в ф орм е АТР, NAD(P)H и м ем бранного п отенциала. Анаболизм –с интез биологич ес к их м ак ром олек ул из низк ом олек улярны х п редш ес твенник ов. Для п ротек ания анаболизм а требуетс я п ос тоянны йп риток энергии. Ф ункцииА Т Р, NAD(P)H, ∆µH+ Белк и Белк и У глеводы У глеводы Ж иры Ж иры , ДНК, РНК А Т Р, NAD(P)H, ∆µH+ H2O, CO2, NH4 Ам инок ис лоты , М онос ахариды Ж ирны е к ис лоты Азотис ты е ос нования АТР, NAD(P)H, ∆µH+ в к летк е вы п олняют роль с вязующ егозвена м еж ду п ос туп ающ ей в организм энергией (с вет, рас п ад органич ес к их вещ ес тв) и энергетич ес к им и п отребнос тям и к летк и. Протек ание к атаболич ес к их реак ций обес п еч ивает ак к ум уляцию энергии в виде АТР, NADPH и ∆µH+ . АТР и NADPH ис п оль зуютс я на биос интетич ес к ие реак ции, а ∆µH+ п реим ущ ес твенно обес п еч ивает п роцес с ы ак тивного транс п орта ч ерез м ем брану, терм огенез, с интез АТР. Ос новны м и органоидам и, отвеч ающ им и за п ротек ание к атаболич ес к их п роцес ов, являютс ям итохондрии, цитоп лазм а и лизос ом ы . Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 34. О б щ ая схем акатаб олических п роцессов Белк и У глеводы Ж иры Ам инок ис лоты Гек с озы , п ентозы Глицерин, ж ирны е к ис лоты Глюк оза Пируват Ацетил-С оА Ц ТКЦ NADH Э ТЦ H2O CO2 Гликолиз – основной п уть окисления углеводов Глик олиз–универс аль ны йп роцес с ок ис ленияглюк озы - извес тенп оч ти у вс ех ж ивы х организм ов. У эук ариот п ротек ает в цитозоле. Глик олизобес п еч ивает ок ис ление С 6-м олек улы глюк озы додвух С 3 м олек ул п ирувата (в аэробны х ус ловиях) или лак тата (в анаэробны х ус ловиях) с образованием 2 м олек ул АТР. С ос тоит из2-х ос новны х с тадий: - на п ервой с тадии п роис ходит ак тивация с убс тратов за с ч ет ф ос ф орилирования (затрач иваетс я 2 АТР), вк люч ение в данны й п роцес с других с ахаров, рас п ад на две С 3 м олек улы (глицераль дегид-3-ф ос ф ат и дигидрок с иацетонф ос ф ат). - На втором этап е п роис ходит ок ис ление глицераль дегид-3-ф ос ф ата до п ирувата (в аэробны х ус ловиях) или до лак тата (п ри анаэробиозе) с образованием 4-х м олек ул АТР. Ц Т К Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»
  • 35. Глюк оза гек с ок иназа Глюк озо-6-ф ос ф ат ф ос ф оглюк оизом ераза Ф рук тозо-6-ф ос ф ат ф ос ф оф рук ток иназа Ф рук тозо-1,6-бис ф ос ф ат аль долаза Глицераль дегид-3- ф ос ф ат Дигидрок с иацетонф ос ф ат триозоф ос ф атизом ераза NAD+ +Pi NADH глицераль дегид-3-ф ос ф атдегидрогеназа 1,3-диф ос ф оглицерат АДР ф ос ф оглицератк иназа АТР 3-ф ос ф оглицерат ф ос ф оглицератм утаза 2-ф ос ф оглицерат енолаза ф ос ф оенолп ируват АДР п ируватк иназа АТР п ируват Путиокисления м оно- ип олисахаридов Галактоза Гликоген К рахм ал М анноза UDP-галак тоза м аннозо-6-ф ос ф ат Глюк озо-1-ф ос ф ат UDP-глюк оза ф ос ф оглюк ом утаза Глюк озо-6-ф ос ф ат Глюк оза С ахароза ф ос ф оглюк оизом ераза Ф рук тозо-6-ф ос ф ат Ф рук тоза ф ос ф оф рук ток иназа Ф рук тозо-1,6-бис ф ос ф ат Путим етаб олизм ап ирувата А наэроб иоз (недостатоккислорода) Пируват + NADH = лак тат + NAD+ (лакт ат деги дроген аза) – м олоч нок ис лое брож ение п и руват декарбокси лаза алкоголь деги дроген аза Пируват - Ацеталь дегид - Э танол – с п иртовое брож ение Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»