EAAP 2015 - Pascale Le Mézec (1) Marion Benoit (2) Sophie Moureaux (1, 4) Clotilde Patry (2, 3) (1) Institut de l’Elevage, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12 (2) Allice, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12 (3) EuroGenomics, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12 (4) INRA‐GABI, Domaine de Vilvert, 78352 JOUY‐EN‐JOSAS cedex

1. Génomique semence sexée :
changements dans les choix de
reproduction des troupeaux laitiers
en France
Pascale Le Mézec (1) Marion Benoit (2) Sophie Moureaux (1, 4) Clotilde Patry (2, 3)
(1) Institut de l’Elevage, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12
(2) Allice, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12
(3) EuroGenomics, 149, rue de Bercy, 75595 PARIS cedex 12
(4) INRA‐GABI, Domaine de Vilvert, 78352 JOUY‐EN‐JOSAS cedex

2. De nouveaux outils innovants pour les
stratégies de sélection et de reproduction
Génomique :
Index génomiques disponibles pour
les jeunes ♂ … puis pour les ♀ en 2011
Précision élevée pour tous les
caractères
Possibilité d’accroître le progrès
génétique surtout pour les
caractères fonctionnels
Semence sexée :
Succès : 90% veaux ♀
après IA sexée ♀ (réussie)
Possibilité de trier les
femelles en élevage
X
Pour les éleveurs : des changements dans le management du
troupeau et de la stratégie de renouvellement
Dans les programmes de sélection : des changements
dans les orientations génétiques
dans la mise en œuvre de la sélection des mâles et des femelles
2015
2009
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030422

3. La population de bovins laitiers en France :
sélection et insémination
• Taureaux sur le marché / an – Programmes de sélection
2014 Nombre d’IA
Nombre de
taureaux >1000 IA
Nombre de vaches +
génisses inséminées
Holstein 4 050 774 527 2 450 032
Montbéliarde 828 105 201 634 263
Normande 523 453 135 340 550
2009 2014
Taureaux de
testage
Taureaux de
service
Jeunes taureaux évalués en
génomique sans descendance
Holstein 600 50 180
Montbéliarde 180 20 130
Normande 150 15 80
• Inséminations (IA) – Principales races laitières
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030423

4. définition utilisation
Évaluation classique
Taureaux testés sur
descendance
Peu de taureaux,
+ milliers d’IA
Taureaux de testage Nombreux taureaux,
300 IA premières
Évaluation génomique
Jeunes taureaux avec
index génomique,
sans filles
Centaines de taureaux,
peu d’IA
Taureaux évalués en
génomique, confirmés
par des filles
Dizaines de taureaux,
quelques milliers d’IA
Une révolution dans
l’utilisation des taureaux d’IA
2014: 70% IA par
des jeunes
taureaux évalués
en génomique
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030424

5. Deux phases de taureaux contribuant au
progrès génétique
2009 : 1ère évaluation
génomique = des index
disponibles pour 4
séries de taureaux en
attente de résultats de
testage. Choix élargis,
précision plus élevée
surtout pour les
caractères fonctionnels
Depuis 2012 : les taureaux indexés sont issus de programmes de sélection
basés sur la génomique. Intensité de sélection accrue, précision améliorée
Évolution génétique des IA 1ères en race holstein ‐ Caractères fonctionnels et index de synthèse ISU
2009 : 1ère
évaluation
génomique
2012: 1ère génération de
taureaux sélectionnés /
infos génomiques
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030425

6. + de progrès génétique pour les caractères
fonctionnels
Évolution génétique des IA 1ères holstein en France (en unité standard : écart‐type génétique ECT)
En 2012 la composition de l’index de synthèse (ISU)
est mise à jour avec + de poids pour les caractères
fonctionnels : 37,5% ↗ 50% (Holstein)
2004‐2009 1ère
évaluation
génomique
2009‐2014 2004‐2014
Caractères fonctionnels ↗ +0,3 ECT ↗↗ +0,8 ECT +1,1
Production :
Lait
TP
↗ +0,7 ECT
↘ ‐0,2 ECT
→ 0 ECT
↗ +0,5 ECT
+0,7
+0,3
Morphologie ↗ ↗ +1,0 ECT ↗ ↗ +1,3 ECT +2,3
ISU =
Index de synthèse ↗ ↗ +1,3 ECT ↗ ↗ +1,5 ECT +2,8
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030426

7. Le génotypage des
femelles
2014 : 100 000 ♀
génotypées dans
les élevages
(cumulé)
Programmes de sélection ,races laitières :
• ~ 25 000 génotypages/ an
dont 15 000 femelles Stable =
Élevages commerciaux :
• + de 100 000 femelles avec
index génomique
• 75 000 nouvelles femelles
génotypées attendues en
2015
• 96% ont – de 18 mois
• ~ 6 000 éleveurs ont
essayé le génotypage
Croissance ++
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030427

8. De nouveaux outils pour mettre l’accent
sur les femelles
• Les éleveurs français demandent et paient le génotypage pour
leur propre usage
• Possible grâce à :
L’arrivée de la puce LD en 2012
Le prix en baisse
• Des plans d’accouplements appuyés sur de nouveaux outils avec
une information génétique précoce et complète pour les femelles
(pour tous les caractères)
→ regard neuf sur la diversité des femelles
Et plus de services :
• Tests de parenté
• Tests sur haplotypes et mutations
pour identifier des caractéristiques
génétiques ou des anomalies (+ de
20 tests / 4 races)
• Pour choisir parmi les femelles aux profils génétiques variés
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 00152030428

9. 2010‐2014 : essor de la
semence sexée
2014 : 91% veaux femelles après une IA sexée femelle
réussie en 2013 (/115 000 naissances)
La meilleure fertilité de la race montbéliarde permet plus
d’IA en semence sexée sur vaches.
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 0015203042
2014 : 35%
génisses laitières
inséminées avec
la semence
sexée ♀
9

10. De multiples raisons pour choisir
d’inséminer en semence sexée
Les motivations pour utiliser la semence sexée avec 90%
chances d’obtenir un veau femelle :
• Agrandir le troupeau sans achat extérieur
• Vendre des femelles en cas de marché favorable
• Limiter les difficultés de vêlage chez les génisses
• Éviter les veaux mâles, quand il ne sont pas intéressants
• Cibler et assurer le renouvellement avec une part de
croisement (lait ou viande)
• Pour choisir parmi un nombre important de femelles
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 001520304210

11. Combiner semence sexée et génotypage
pour façonner son troupeau
→ l’éleveur peut sélectionner les femelles dans son troupeau
et leur associer les taureaux en suivant ses objectifs
Le génotypage → pour choisir parmi les femelles aux profils génétiques
variés = des informations plus fiables
Les IA en semence sexée → pour choisir parmi un nombre important de
femelles = une intensité de sélection plus forte
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 0015203042
2014 :
70% IA par des
jeunes taureaux
évalués en
génomique
2014 :
100 000 ♀
génotypées
dans les
élevages
2014 :
35% génisses
laitières IA
semence sexée
♀
11

12. Perspectives en France
• Les éleveurs sont confiants : ils adoptent massivement les
innovations pour adapter leur troupeau à son environment,
selon leur objectif propre
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 0015203042
• La sélection génomique arrive aussi dans les autres races
bovines (régionales et allaitantes) et dans les autres
espèces (ovins laitiers et caprins).
• Le progrès génétique pour les caractères fonctionnels
devient sensible dans les troupeaux dès maintenant (CEL)
ou bientôt (REPRO)
12

13. Merci pour votre attention
Génomique, semence sexée... Institut de l'Elevage, réf 001520304213