1. Lope Andrés Flórez Weidinger
http://bioinformate.uniandes.edu.co/cap1.htm
Capítulo 1: ¿Cómo encontrar información confiable de
manera eficaz?
VISTAZO .......................................................................................................................................................2
INTRODUCCIÓN .............................................................................................................................................2
CONCEPTOS IMPORTANTES ...........................................................................................................................3
Motor de búsqueda ..................................................................................................................................3
Heurístico.................................................................................................................................................4
Sensibilidad..............................................................................................................................................4
Selectividad ..............................................................................................................................................5
Artículo científico ....................................................................................................................................5
Partes de un artículo ...............................................................................................................................6
Review ......................................................................................................................................................7
Protocolos experimentales ......................................................................................................................7
CUESTIONARIO .............................................................................................................................................7
Primera pregunta.....................................................................................................................................7
Segunda pregunta ....................................................................................................................................8
Tercera pregunta .....................................................................................................................................8
Cuarta pregunta.......................................................................................................................................8
PRACTIEJEMPLOS ..........................................................................................................................................9
1. Estrategias de búsqueda en Google....................................................................................................9
Practiejemplo A - ¿Cómo interpretar los resultados en Google? ........................................................................ 9
Practiejemplo B – Acotando la búsqueda: sensibilidad y selectividad ............................................................. 10
Practiejemplo C – Criterios avanzados de búsqueda ......................................................................................... 12
2. BD accesadas a través de Uniandes .................................................................................................13
Practiejemplo A – Bases de datos suscritas por la Universidad ........................................................................ 13
Practiejemplo B- HINARI: Acceso al contenido de revistas indexadas ........................................................... 14
3. NCBI Books: libros disponibles en línea ..........................................................................................15
Practiejemplo A - Accediendo a un capítulo particular de un libro de texto disponible en Internet ................ 15
Practiejemplo B - ¿Cómo buscar términos biológicos en los libros de texto? .................................................. 16
4. PubMed: búsqueda de Artículos científicos......................................................................................17
Practiejemplo A – Explorando los resultados de PubMed ................................................................................ 17
Practiejemplo B – Accediendo al texto completo de los artículos .................................................................... 19
Practiejemplo C – Una búsqueda estructurada en PubMed............................................................................... 20
Practiejemplo D – Single Citation Matcher ....................................................................................................... 23
EJERCICIOS .................................................................................................................................................24
Primer ejercicio .....................................................................................................................................24
Segundo ejercicio...................................................................................................................................24
Tercer ejercicio......................................................................................................................................25
Cuarto ejercicio .....................................................................................................................................25
Quinto ejercicio .....................................................................................................................................25
Sexto ejercicio........................................................................................................................................25
PROFUNDIZACIÓN .......................................................................................................................................26
Wikipedia ...............................................................................................................................................26
Google Scholar ......................................................................................................................................26
Ayuda de PubMed..................................................................................................................................26
My NCBI ................................................................................................................................................27
1
2. Vistazo
“En este capítulo se presentarán conceptos relacionados con la búsqueda en Internet.
Iniciaremos explorando a fondo el motor de búsqueda Google, aprender a manejarlo más
eficientemente y repasar conceptos que se aplican a cualquier tipo de búsqueda.
Seguidamente empezaremos a explorar la literatura científica aprendiendo primeramente a
ingresar a las bases de datos de artículos científicos a las que está suscrita la Universidad de
los Andes y luego exploraremos NCBI Bookshelf, una página en Internet que accede a libros
universitarios en texto completo y de manera gratuita.
Terminaremos nuestra exploración visitando el motor de búsqueda de artículos científicos más
importante para las ciencias de la salud, PubMed. Aplicaremos estrategias para recopilar
artículos científicos afines a nuestro tema de interés, encontrar una referencia exacta o adquirir
los artículos en texto completo si nos encontramos ubicados en el campus universitario y
tenemos acceso a Science Direct.”
Introducción
“Las dos tecnologías que darán forma al siglo XXI son la biotecnología y la tecnología de la
información.”
Bill Gates
“Si pude ver más lejos fue por estar parado sobre hombros de gigantes.”
Isaac Newton
“Se dice que el genio está más allá de su tiempo. Esto puede ser verdad, pero solo porque está
muy enterado de su tiempo.”
Henry Miller
En este capítulo aprenderemos a encontrar información confiable en Internet. Hoy tenemos
acceso a mucha más información de la que podemos procesar en nuestras vidas, por lo que el
buen uso que hagamos de ella empieza a cobrar mucha más importancia que la información en
sí misma. Podemos, si acaso, aprendernos una pequeñísima parte de la información
disponible... pero podemos hacer uso de una parte mucho más grande para generar valor
agregado.
Tomemos como ejemplo la profesión médica. Si antes era usual aprenderse de memoria “toda”
la patología, anatomía, fisiología, histología, etc., hoy saber todo esto no es suficiente para
ejercer la práctica médica de la mejor manera. Apoyándose en bases de datos de información
médica como PubMed, los médicos son capaces hoy en día de tomar decisiones mucho más
efectivas sobre enfermedades que conocían sólo vagamente.
Igualmente, en todas las otras profesiones se volverá más importante saber manejar la
información que a tenerla en cantidades. Los mayores avances de esta época se logran
aportando sólo un granito de arena a las montañas de información que se tienen, pero ese
granito de arena tiene nuevo valor al dar un análisis diferente, una interpretación nueva de la
realidad científica del momento o por despejar una duda que ha quedado rondando en el aire...
Los descubrimientos usualmente surgen como un aporte pequeño a un proyecto que ha
asumido toda una comunidad científica. Si se mira la parte de referencias de un artículo
2
3. científico es posible notar que cada aporte nuevo toma base en muchos resultados anteriores.
A esto se refería Isaac Newton con la cita de ver más lejos sobre hombros de gigantes.
Dado esto, no es de extrañar que los grupos de investigación modernos estén compuestos por
equipos interdisciplinarios. La bioinformática es un excelente ejemplo de como profesionales de
áreas aparentemente tan disímiles como la biología, la ingeniería de sistemas, la física, las
matemáticas, la administración, etc., confluyen en un objetivo común.
¿Significa que en la era de la información ya no tenemos que saber nada más, pues todo ya
está ahí? No. De hecho pienso todo lo contrario, hay que saber muchísimo más y a dos
niveles: general y especializado.
Se deben tener habilidades propias de cada profesión: Los biólogos deberán ser capaces de
formular hipótesis biológicas de los fenómenos (ejemplo: hay más proteína, porque se ha
potenciado la expresión de un gen, probablemente por activadores transcripcionales...), los
físicos tienen que estar en capacidad de generar modelos matemáticos adecuados a partir de
hipótesis del mundo, l
os ingenieros de sistemas deben dar soluciones informáticas a sus usuarios, implementando
sistemas que permitan depositar y recuperar información de manera rápida, confiable y acorde
a las necesidades particulares de cada tarea.
Paralelamente, cada cual tiene que saber expresar sus necesidades y entender lo que el otro le
está diciendo, por lo que requiere mucha información general. El biólogo tiene que poder
formular sus hipótesis biológicas de manera suficientemente básica (sin dejar de explicitar los
supuestos) para que el físico las pueda entender sin tener que leer todo un libro de biología
molecular. El físico tiene que generar modelos matemáticos que produzcan resultados que el
biólogo pueda interpretar. El ingeniero de sistemas tiene que entender las necesidades
informáticas de sus clientes y darles una solución que ellos puedan utilizar sin necesidad de
acudir a manuales de programación.
¿Hay alguna diferencia entre darle al otro lo que busca o darle al otro solo lo que necesita? ¡Sí
la hay! Un biólogo no puede hacer nada con un teorema (así este describa el caso más general
posible) si él mismo no entiende lo que se puede concluir de él o como usarlo. Y aún así, este
teorema puede ser lo que el biólogo estaba buscando. La problemática en los equipos
interdisciplinarios está en no poder comunicar al otro qué es lo que realmente se necesitaba, o
en no escuchar al otro para darse cuenta qué era lo que se esperaba.
Por tanto se necesita aprender cada vez más y tener humildad. Apoyándose en las habilidades
de los otros y en la información que otras personas han generado podemos ser mucho más
productivos y, curiosamente, mucho más originales. Pero para eso se necesita saber encontrar
y manejar información que no conocemos, así como saber presentar la información que sí
conocemos. La bioinformática consiste precisamente en adquirir habilidades en el estudio de
cómo acumular, procesar, analizar y almacenar información biológica..
Conceptos importantes
Motor de búsqueda
Servicio WWW el cual permite al usuario acceder a información sobre un tema
determinado a través de palabras claves introducidas por él. La información está
contenida en un servidor de información de Internet.
Parafraseado de: http://www.xpress.com.mx/glosario_b.jsp
Los motores de búsqueda son portales a la información que permiten encontrar algo de una
fuente (por ejemplo, una base de datos) sin necesidad de revisar todas las entradas una por
una. Se componen de tres partes: una interfaz, un algoritmo y una fuente de información.
3
4. El motor de búsqueda más popular es Google. La interfaz de Google es la página Web en la
cual se ingresan las búsquedas. El algoritmo es la secuencia de pasos que sigue Google desde
que se hace clic en "búsqueda" y se muestran los resultados en orden de relevancia. La fuente
de información de Google son las páginas Web que ha indexado (esto es, las páginas de
Internet que ha incluido dentro de su base de datos y de las cuales ha extraído y sistematizado
información).
Heurístico
“Método de ensayo y error para acercarse a la solución de un problema. No garantiza
llegar a la solución pero puede acelerar el proceso de hallarla.”
Tomado de: http://dewey.uab.es/pmarques/glosario.htm
Los heurísticos son métodos orientados a terminar una tarea (como, por ejemplo, buscar algo
en una gran fuente de información) sin llegar siempre a la solución óptima, pero sí a una
solución razonablemente buena. Si bien son métodos propensos al error, son especialmente
útiles cuando encontrar una solución óptima sea imposible o que tomaría demasiado tiempo
para completarse.
Tomemos un ejemplo: la visita al médico general. Después de unos procedimientos
relativamente sencillos, como medir el pulso, la presión arterial, realizar un tacto abdominal,
etc., el médico es capaz de hacer un diagnóstico total del estado de la persona e intuir posibles
enfermedades asociadas. Nótese que el médico no hace exámenes exhaustivos para
identificar la condición del paciente, y es posible que no consiga diagnosticar correctamente la
enfermedad. Sin embargo, logra el objetivo de detectar síntomas relevantes del paciente de
manera razonablemente buena.
En bioinformática aplicamos heurísticos todo el tiempo: desde que buscamos información en
bases de datos, hasta cuando hacemos inferencias evolutivas alineando secuencias. Conocer
nuestros heurísticos se vuelve importante a la hora de analizar nuestros resultados., Podemos
hacer inferencias siempre y cuando entendamos las limitaciones de nuestros heurísticos.
Sensibilidad
“La capacidad de una prueba de detectar una condición cuando, de hecho, ésta se
encuentra presente.”
Tomado de: http://www.measurementexperts.org/instrument/term_pocket_terms.asp
Según la teoría de la información de Shannon [1], la cantidad de información que se puede
recuperar en una comunicación depende directamente de la relación que hay entre señal y
ruido.
Tomemos un ejemplo: hacemos una grabación de una clase en la universidad, y en la casa
queremos escuchar nuevamente lo que dijo el profesor. Claramente es más entendible una
grabación hecha relativamente cerca del profesor, con un buen micrófono, etc., de manera que
el mensaje (que son las palabras del profesor) se diferencie significativamente del ruido de
fondo.
Supongamos ahora que queremos filtrar un mensaje de una fuente muy ruidosa. Al amplificar
nuestro mensaje necesariamente también se incrementa el ruido - es lo que pasa cuando
subimos el volumen del reproductor al escuchar la grabación que hicimos del profesor.
La sensibilidad es una medida de la amplificación que hacemos de nuestra señal para detectar
el mensaje. Si subimos el volumen del reproductor, seremos capaces de detectar variaciones
muy finas en la voz del profesor, pero también aumentaremos el ruido de fondo.
4
5. En bioinformática, las fuentes de información también tienen ruido. En este caso se representa
en aquellos datos que no deben estar dentro de nuestro análisis, ya sea por erróneos,
incompletos o irrelevantes. Aumentar la sensibilidad en este caso, consiste en utilizar métodos
que permiten la inclusión de muchos datos potencialmente inútiles, con el objetivo de encontrar
también nuevos datos útiles (= información).
[1] Shannon CE, “The mathematical theory of communication”, MD Comput. 1997 Jul-
Aug;14(4):306-17
Selectividad
“Capacidad de un receptor de rechazar transmisiones de frecuencias diferentes a la
específica a la que ha sido calibrado.”
Tomado de: http://www.winegard.com/glossary.htm
Si al aumentar sensibilidad lo que hacemos es amplificar una señal (mensaje y ruido), al
aumentar la selectividad lo que intentamos hacer es minimizar el ruido. En pocas ocasiones es
posible amplificar una señal sin aumentar mucho el ruido; la mayoría de las veces hay que
hacer un compromiso entre selectividad y sensibilidad.
Podemos decir que la sensibilidad es la capacidad de evitar falsos negativos (un falso negativo
es decidir que algo no existe cuando de hecho si tiene presencia). La selectividad, en cambio,
es la capacidad de descartar falsos positivos (un falso positivo es decidir que algo sí existe
cuando de hecho no está). Algo sensible evita descartar, mientras que algo selectivo de hecho
lo incluye; de ahí el compromiso entre los dos conceptos.
En bioinformática, como se mencionó en la definición de sensibilidad, trabajamos con fuentes
de información que incluyen datos que no nos son útiles. Podemos utilizar diferentes
heurísticos para diferenciar qué representa información y qué representa ruido. Estos métodos
nos brindan más selectividad.
Artículo científico
“El artículo científico es similar en formato al informe de laboratorio, pero está escrito
por un científico profesional con el fin de relatar descubrimientos nuevos de ciencia a la
comunidad científica y de contribuir al conocimiento disponible en un campo particular
de estudio.”
Tomado de: http://www.ncsu.edu/labwrite/res/res-glossary.html
Las investigaciones en ciencia concluyen con una divulgación de los resultados a la comunidad
científica. El artículo científico (también conocido por la palabra en inglés "paper") es el medio
escrito por excelencia para presentar estos resultados. Circula en revistas científicas
especializadas en un tema editadas por un comité de expertos, (p.ej. "Journal of industrial
microbiology & biotechnology") o en un tipo de descubrimientos (p.ej. resultados que cambian
el curso de unas disciplinas, como el descubrimiento de la estructura del ADN en 1953, o la
primera clonación de un mamífero de una célula diferenciada - la oveja Dolly- en 1997). Estas
revistas se publican periódicamente, normalmente semanal, quincenal, o mensualmente.
Los artículos científicos están estructurados de forma que permitan la transmisión óptima de la
información. Se puede decir que deben tener tres premisas en mente: Sencillez saber cuáles
fueron los resultados principales, aclaración de todos los análisis de tal forma que el resultado
(experimento y conclusiones) sea reproducible y restricción de la información irrelevante a un
mínimo (ser muy concisos). Estas tres premisas llevan a artículos con una estructura rígida
que suele tener las siguientes ocho secciones, descritas más adelante (aunque esto varía de
revista en revista, y también de acuerdo al tipo de artículo científico): Título, abstract o
5
6. resumen, introducción, materiales y métodos, resultados, discusión, agradecimientos y
referencias.
Una forma directa de evaluar la capacidad de investigación de una persona o de un centro es
mediante su producción científica. Se puede hacer el siguiente paralelo: si el producto principal
de la fábrica automotriz son los carros, el producto principal de un centro de investigación es
conocimiento - y por tanto sus publicaciones científicas. Por tanto, conviene mucho a un
investigador realizar varias publicaciones de calidad.
Partes de un artículo
“IMRaD (IMRyD) es un acrónimo para Introducción, Métodos, Resultados y Discusión.
Está relacionado con la estructura estándar de un artículo científico, que típicamente
incluye estas cuatro secciones en ese orden.”
Tomado de: http://en.wikipedia.org/wiki/IMRAD
Éstas son las secciones de un artículo científico típico:
1. Título: Debe describir de manera clara, corta y precisa el resultado experimental que se
obtuvo. Se espera que con solo leer el título el investigador ya pueda hacerse una idea
completa del artículo.
2. Abstract o Resumen: El abstract de un artículo científico da información concisa sobre
todas las secciones que componen el artículo. Suele incluir las razones por las que se hizo el
estudio, la metodología que se utilizó, los principales resultados y unas conclusiones. Si el título
se limita a responder la pregunta ¿que? el abstract, además de esta pregunta, responde
brevemente el ¿para qué?, ¿cómo? y el ¿que se concluye?
3. Introducción: Pone el estudio dentro de su contexto científico y explica la relevancia de
este. Por tanto, aquí se pueden enumerar algunos estudios previos representativos y preguntas
abiertas que quedaron en estos estudios, los que se espera responder mediante los
experimentos expuestos en el artículo.
4. Materiales y métodos: Es una descripción detallada de todas las condiciones
experimentales utilizadas, de forma que el lector pueda repetir el experimento si lo requiere. En
un experimento de biología molecular, por ejemplo, se podrían describir el tipo de células que
se utilizaron, la forma de obtener la muestra, los métodos de análisis usados con sus tiempos y
señales medidas, las concentraciones de los reactivos, etc.
5. Resultados: Como el nombre lo indica, este es el lugar apropiado para exponer los
resultados del experimento, junto con un primer análisis que se desprende directamente de
éstos. Dado que se dispone de muy poco espacio para presentarlos, éstos suelen resumirse en
forma concisa y propicia para el análisis, como por ejemplo en gráficas o fotos del resultado
final.
6. Discusión: En esta sección se hace un análisis más detallado de los resultados, se sacan
conclusiones y se plantean hipótesis. También se pueden hacer inferencias acerca del próximo
paso lógico a seguir.
7. Agradecimientos: Aquí se mencionan brevemente aportes significativos al estudio,
realizados por personas u organizaciones no incluidas entre los autores. Puede ser, por
ejemplo, la fuente de financiación, investigadores que aportaron materiales difíciles de
conseguir, laboratorios que hicieron parte de una sección del análisis, etc.
8. Referencias: Todo estudio científico debe estar sustentado, ya sea por evidencia empírica
directa o por estudios anteriores que han acumulado esta evidencia (fuentes externas de
información). En la sección de referencias se enumeran de manera sistemática las fuentes
externas de información que se usaron en el artículo.
6
7. Review
“Un review es cualquier intento de sintetizar los resultados y conclusiones de dos o más
publicaciones en un tema específico.”
Tomado de http://informatics.medicine.dal.ca/w4/glossary.html
Es un tipo especial de artículo científico, que tiene como fin resumir de una forma cohesionada
los resultados experimentales de varios escritos acerca de un tema,. El autor de un Review no
incluye dentro de éste evidencias empíricas directas, sino que recopila evidencias publicadas
con anterioridad.
Los reviews sirven para generar una idea bastante general y actualizada sobre un tema de
investigación importante. Si se quiere profundizar en un aspecto en particular, siempre es
posible revisar el artículo científico del cual se extrajo la información consignada, dado que en
la sección de referencias se mencionan explícitamente todas las fuentes.
Protocolos experimentales
Un protocolo es una ejecución y/o esquematización de un proceso, definida con
anticipación y con reglas específicas.
Parafraseado de: http://de.wikipedia.org/wiki/Protokoll
Si un Review tiene como objetivo enumerar resultados de investigación de varios autores - sin
hacer más mención a los procedimientos de lo necesario para trasmitir las conclusiones - los
protocolos experimentales tienen un fin complementario: mostrar de forma más explícita todos
los pasos a seguir para completar procedimientos comunes.
Es como una guía de laboratorio que resume los reactivos que se necesitan junto con sus
concentraciones, los pasos que hay que ejecutar y en qué orden, los instrumentos que se
utilizan, los controles que hay que incluir dentro del experimento, etc. Surgen de optimizar
procedimientos que se sabe han dado resultados. No suelen publicarse en revistas científicas,
sino en libros o manuales.
Cuestionario
Primera pregunta
¿Cuál no es un ejemplo de un heurístico?
a) Escoger las frutas en el supermercado según su aspecto exterior
b) Mirar cómo están las nubes para predecir si va a llover
c) Sacar todos los lápices de la cartuchera y meterlos uno por uno hasta dar con el color
que uno busca
d) Mirar a contraluz un billete para evaluar si es falso
Respuesta:
La opción correcta es la c.
Es la única opción en donde la solución del problema siempre está garantizada. En los otros
casos la aproximación es buena, pero es susceptible al error.
7
8. Segunda pregunta
¿Cuáles de las siguientes acciones aumentan la sensibilidad al usar un motor de búsqueda?
a) Agregar muchos sinónimos separados por “OR”
b) Añadir más términos a una búsqueda para hacerla más específica
c) Mirar únicamente la primera página de resultados
d) Hacer búsquedas con diferentes términos mirando cada vez todos los resultados que
aparecen
Respuesta:
Las respuestas correctas son la a y la d.
Los motores de búsqueda ocultan los resultados negativos – incluso los falsos negativos. Los
métodos a y d logran encontrar algunos de estos falsos negativos, por lo que son más
sensibles.
Tercera pregunta
¿Cuáles de las siguientes afirmaciones son falsas?
a) “La clonación de Dolly” es un buen título para un artículo científico
b) En el Abstract pueden encontrarse algunas conclusiones del artículo
c) La introducción se dedica a resumir todos los estudios anteriores
d) Los resultados principales del artículo se pueden encontrar sin necesidad de leer la
sección de materiales y métodos
e) En los resultados se deben poner todos los datos experimentales que se obtuvieron
f) La discusión responde preguntas planteadas en la introducción
g) Los agradecimientos incluyen a un grupo bastante limitado de personas
h) Todo trabajo mencionado en el artículo debe incluirse en las referencias
Respuesta:
Las opciones a, c y e son falsas.
a) Sólo leyendo el título no hay forma de saber que se trata de un mamífero, c) la introducción
debe enmarcar el tema de manera corta y fundamentar el propósito del estudio, no hacer una
revisión bibliográfica exhaustiva y e) los resultados deben presentarse de manera resumida,
por lo que no hay cabida para todos los datos.
Cuarta pregunta
¿Cuáles de las siguientes descripciones se ajustan más a un Review?
a) Contiene una descripción detallada de todos los pasos experimentales a seguir
b) Describe el “estado del arte” en un tema relativamente amplio
c) Para su elaboración se requiere de mucha lectura
d) Su elaboración requiere repetir un experimento muchas veces cambiando parámetros
Respuesta:
Las descripciones correctas son la b y la c.
Las otras dos descripciones pertenecen más al estilo de un protocolo experimental, por su
énfasis en los materiales y los métodos.
8
9. Practiejemplos
1. Estrategias de búsqueda en Google
Practiejemplo A - ¿Cómo interpretar los resultados en Google?
En este ejemplo exploraremos la forma en que Google nos da resultados y cómo podemos
sacar mayor provecho a esta información.
1. Ingrese a la página principal de Google en: http://www.google.com/. En la casilla de
búsqueda ingrese las palabras online bioinformatics tutorial. A partir de ahora, lo que
ingresemos en una casilla de este estilo lo llamaremos ‘query’ o término de búsqueda.
2. La página resultante seguramente ya es conocida por usted pero vamos a explorarla
más detenidamente. Debajo de la casilla de búsqueda y de la opción de escoger
resultados en un idioma particular, aparece el número de aciertos que arrojó la
búsqueda. El 7 de abril de 2006, se presentaron aproximadamente 421.000 resultados
para esta búsqueda.
Cada resultado tiene cinco partes: El hipervínculo a la página Web con el título de ésta,
una opción de traducir la página si el idioma no es el local, el contexto en el cual se
encontró el término de búsqueda, la parte inicial del URL de la página, un vínculo “En
caché” y un vínculo “Páginas similares”.
3. El título nos da la primera guía para saber si la página se relaciona con nuestro tema.
Resaltando conceptos: Heurístico
Guiarnos por el contenido completo de una página a partir del título es un
heurístico: estamos usando una solución parcial al problema de información
que creemos que da buen resultado. Como todo heurístico tiene sus puntos
débiles. ¿Qué tal que el título parezca no estar relacionado, pero que incluya
una sección que sí es de nuestro interés?
Si el título “Bioinformatica 2003 :: links” aparece entre los resultados, haga clic sobre él.
De lo contrario haga clic en cualquier hipervínculo. Se despliega la página completa, en
este caso resumiendo herramientas útiles en bioinformática. Guiarnos por el título fue
una buena ayuda, como se esperaba.
4. Ingresemos otro término en la casilla de búsqueda: ATP.
¿Qué es ATP?
El ATP (adenosina trifosfato) es una molécula muy importante en el
almacenamiento de energía química en las células. Cuando por ejemplo
digerimos carbohidratos, , el cuerpo los somete a una serie de reacciones
químicas para extraer energía de ellos, la que almacena en los enlaces del
ATP. De esta forma, si el cuerpo requiere energía, mover un músculo por
ejemplo, puede disponer de la energía del metabolismo de los carbohidratos en
todo momento, rompiendo enlaces del ATP.
La búsqueda de ATP arrojó el 7 de abril de 2006 el astronómico valor de 44.500.000
resultados. Dado que es imposible ver las todas las Web una por una, hay que saber
elegir cuál visitar antes de hacer clic en el hipervínculo.
Resaltando conceptos: Selectividad
9
10. Al decidir no visitar un vínculo, se está siendo selectivo: se está descartando
información que creemos que no nos es útil.
No todos los resultados que obtenemos son relevantes. El título de muchos da a
entender, que la página se refiere a tennis profesional. ¿Cómo saber que la página no
está relacionada con nuestro tema si el título no ayuda? Podemos ayudarnos del
contexto en que aparece nuestra palabra para ver si se relaciona con nuestro tema. Sin
embargo, el contexto es en algunos casos bastante corto y no nos da una idea
suficientemente buena.
5. Ingrese a cualquier resultado, esta vez haciendo clic en el vínculo “En caché”. Se
resaltan en colores los términos de nuestro ‘query’, permitiéndonos evaluar el contexto
de manera más clara. Por tanto, complementamos el contexto que se presentó en el
resultado de Google.
6. El URL también nos sirve de guía para evaluar la calidad de la página. Note que la
mayoría de sitios que no tienen que ver con la molécula de ATP tienen como
terminación del dominio ".com". Muchas veces podemos encontrar información
relevante a biología en páginas web de universidades, las cuales usualmente tienen la
terminación ".edu".
Podemos notar que la información que nos proporciona Google es bastante completa. Usando
todas las partes del resultado de Google podemos ser más selectivos a la hora de buscar.
Ejercicio
Ingrese en Google la palabra sugar (azúcar). Entre los primeros 5 resultados, ¿en cuál aparece
más veces la palabra “sugar”?
Practiejemplo B – Acotando la búsqueda: sensibilidad y selectividad
En este ejemplo vamos a utilizar una búsqueda común en Google para entender con mayor
claridad el compromiso entre selectividad y sensibilidad.
1. En el ejemplo anterior buscamos el término ATP en Google obteniendo un gran número
de resultados que no eran pertinentes a biología. Por tanto, es importante aumentar la
selectividad de nuestra búsqueda. En Google esto se logra añadiendo más términos a
nuesto 'query'.
Resaltando conceptos: Heurístico
Note que añadir más términos de búsqueda también es un heurístico, de hecho
el más importante de los motores de búsqueda como Google, el heurístico nos
da más selectividad.
Estamos buscando páginas que contengan exactamente el término que
estamos buscando. Esto nos ayudará a encontrar muchas páginas que tienen
que ver con nuestro tema, pero podría estar descartando aquellas que tienen,
por ejemplo, un sinónimo de nuestra palabra.
Escriba en la casilla de búsqueda las palabras ATP energy. Note que muchas de las
páginas que no tenían que ver con el tema ya no aparecen entre los resultados.
2. Ahora ingrese un término más en la búsqueda de forma que ésta quede así: ATP
energy formula. En principio, esta búsqueda nos debería llevar más rápidamente a la
estructura molecular del ATP. Sin embargo, en este caso, la mayoría de páginas están
relacionadas más bien con productos para acompañar el ejercicio físico.
Resaltando conceptos: Sensibilidad
10
11. En este caso, hemos perdido sensibilidad. Algunas de las páginas que
aparecieron en la búsqueda anterior y que eran afines a nuestro tema no
aparecen al realizar esta nueva búsqueda. Intentamos ser más selectivos, pero
en realidad perdimos información útil.
3. Aprendimos que añadir la palabra formula no nos proporcionó los mejores resultados.
Aquí, al igual que en todas las búsquedas que realicemos a través de la guía, la
primera escogencia de los términos de búsqueda no siempre es la más apta para
nuestros fines.
Modifiquemos nuestros términos de búsqueda de forma que queden así: ATP
phosphate molecular formula. Esta búsqueda es bastante selectiva e igualmente
sensible. El 8 de abril de 2006, todas las páginas que aparecieron en la primera página
de resultados estaban relacionadas directamente con nuestra molécula. En general, es
conveniente probar con varios 'queries' diferentes antes de empezar a visitar páginas.
4. La búsqueda anterior nos dio un buen resultado, debido a que agregamos términos
muy relacionados con la molécula, como por ejemplo phosphate. Supongamos que
queremos buscar páginas acerca de la electroforesis en gel de poliacrilamida, que en
inglés tiene las siglas PAGE.
¿Qué es PAGE?
La técnica PAGE es una de las más utilizadas en biología molecular para
estudiar proteínas y cadenas de ácido nucleico como el ADN o ARN. Se trata
de separar las moléculas que están mezcladas en una muestra según la
relación entre carga y peso molecular.
La técnica funciona así: Se tiene una capa de gel de poliacrilamida que parece
una gelatina de aprox. 10 cm. de largo, por 10 cm. de largo por 0,5 cm. de alto.
Este gel tiene en la parte superior unos pozos donde se coloca la muestra
compleja. El gel se somete a un campo eléctrico y las moléculas cargadas
empiezan a moverse a través del gel. Las más pequeñas y cargadas
avanzarán rápido a través del gel en tanto que las más grandes y de menor
carga avanzarán más lentamente. Después de unas horas, se puede teñir el
gel y ver pequeñas manchas, llamadas bandas. Cada banda corresponde a
una molécula de ADN o de proteína determinada.
Ingrese el término PAGE en la casilla de búsqueda de Google. Como es de esperarse,
ninguno de los resultados de la primera página habla acerca de la electroforesis. A
diferencia del ejemplo del ATP, no podremos encontrar páginas relacionadas si no
tenemos por lo menos una vaga idea de que es lo que estamos buscando. Si
cambiamos los términos de búsqueda a PAGE gel, obtenemos en la primera página
resultados relevantes a la electroforesis.
Esto nos lleva al siguiente resumen: toda búsqueda tiene inherente un compromiso entre
selectividad y sensibilidad (a no ser que la información sea de un volumen tan pequeño que la
búsqueda sea realizable exhaustivamente). Una búsqueda apropiada nos puede dar suficiente
selectividad sin sacrificar mucha sensibilidad. Para poder encontrar un buen compromiso es
necesario tener información adicional acerca de lo que estamos buscando.
La misión de Google, tal como se presenta en su página web, es organizar la información del
mundo. Google es una herramienta sumamente útil, sin embargo no reemplaza del todo una
mente biológica en busca de resultados con sentido biológico.
Ejercicio:
Escoja un ‘query’ adecuado para saber el nombre científico del elefante africano.
11
12. Practiejemplo C – Criterios avanzados de búsqueda
En este ejemplo vamos a utilizar el vínculo de "Búsqueda avanzada" que nos ofrece Google
para ser más selectivos.
1. Busquemos, por ejemplo, información sobre el gen sonic hedgehog.
¿Qué es el gen sonic hedgehog?
El proceso de formar un individuo pluricelular completo a partir de un sólo óvulo
fecundado es complejo y requiere de muchísima organización. A medida que
las células se reproducen, unas de ellas están destinadas a volverse sistema
nervioso, otras serán tejido cardiaco, etc., y cada una de estas células tiene
que diferenciarse de las demás en el momento y lugar exactos..
Las células que están generando el embrión se mandan señales entre sí para
coordinar sus acciones. Estas señales son moléculas que al llegar a la célula
blanco generan cambios en el interior de ésta dando lugar a diferenciación.
Una de estas moléculas es la proteína Sonic hedgehog. Una de sus funciones
es dar señales a las neuronas en formación, para convertirlas en motoras (son
las neuronas que regulan el funcionamiento de los músculos).
El 8 de abril de 2006, la búsqueda con los términos Sonic hedgehog arrojó en la
primera página varios resultados acerca del erizo de la compañía de videojuegos
SEGA. Como se mencionó en el primer ejemplo, la URL puede diferenciar bastante
bien entre páginas comerciales y páginas académicas por la terminación del dominio y
vamos a ver cómo Google puede facilitarnos la tarea.
2. Haga clic en el vínculo de "Búsqueda avanzada".
Tómese su tiempo
La página "Búsqueda avanzada" de Google le da al usuario varias opciones
para refinar una búsqueda. Se puede seleccionar el número de resultados que
uno quiere ver en cada página; se puede elegir qué idioma, qué formato de
archivo, y cuándo debió ser la última actualización de nuestros resultados;
también se puede determinar en qué lugares buscar el término de búsqueda.
Hay otras opciones que debería explorar por su cuenta.
En la página de búsqueda avanzada ingrese el término .edu (no olvide ingresar
también el punto antes de “edu”) en la casilla "Solamente producir resultados del
dominio o sitio Web". Note que al hacer clic en el botón "Búsqueda en Google" las
primeras páginas que aparecen se refieren a la proteína que estamos buscando.
3. Vamos a ver otro ejemplo de cuándo usar criterios avanzados de búsqueda. Vuelva a
la página de "Búsqueda avanzada", e ingrese en la primera casilla de búsqueda el
término scientific article. También elija como formato de los resultados "Microsoft
Powerpoint (.ppt)". Al hacer clic sobre el botón de búsqueda, aparecen resultados
sobre cómo escribir un artículo científico. El 8 de abril de 2006 el primer resultado
mostró un buen resumen de la estructura de un artículo científico en forma de
presentación de PowerPoint. La URL del sitio, en caso que aún esté disponible, es:
http://www.mailman.hs.columbia.edu/popfam/teach/OutlininganArticle.ppt
En resumen, este ejemplo nos muestra diferentes formas de filtrar los resultados, que pueden
llegar a ser muy útiles para algunos propósitos específicos. Son el fruto de escoger términos de
búsqueda apropiados. A medida que conozcamos mejor las herramientas que tenemos a
nuestra disposición seremos capaces de realizar búsquedas que se ajusten mucho mejor a lo
que estamos buscando.
12
13. Ejercicio:
Encuentre una presentación de Power Point relacionada con la mitosis.
2. BD con acceso a través de Uniandes
Practiejemplo A – Bases de datos suscritas por la Universidad
En este ejemplo aprenderemos a consultar los convenios académicos que tiene la Universidad
de los Andes con organizaciones que mantienen bases de datos de artículos científicos.
Para la comunidad científica es sumamente importante contar con información confiable y
actualizada de manera constante. Como se mencionó en la sección de teoría, el artículo
científico es el medio de comunicación de mayor importancia en entornos académicos. Sin
embargo, la afiliación a algunas revistas de prestigio tiene un alto costo. Existen organizaciones
dedicadas a permitir un acceso sencillo y relativamente económico a estas publicaciones
científicas: pagando un cargo básico que le permite al usuario obtener artículos completos de
una amplia gama de revistas.
La Universidad de los Andes, interesada en brindarle a su comunidad académica todas las
herramientas necesarias para una correcta investigación, se encuentra afiliada a algunas de
estas organizaciones y por tanto pone a disposición de los estudiantes artículos científicos de
las revistas de más alto prestigio. La Universidad los Andes quiere asegurarse que cuellos de
botella en la investigación no tengan origen por falta de información.
Por eso, ha suscrito dos tipos de convenios con varias organizaciones. El primero permite a los
estudiantes ingresar a la base de datos incluso desde su casa mediante un login y password
institucional y el segundo permite acceder a la base de datos desde cualquier computador de
las salas públicas ubicadas dentro del campus universitario. Como se ve, en este último tipo de
convenios no es posible ingresar a la base de datos desde la casa.
Además de estos dos convenios, la Universidad presta a sus estudiantes y profesores un
servicio de búsqueda de artículos científicos a través de la sala virtual de la biblioteca. Si un
artículo científico no se pudo encontrar en las bases de datos suscritas por la Universidad, el
personal de biblioteca consultará con otras organizaciones, como universidades con las que
tiene convenio, y en la mayoría de los casos conseguirán el artículo científico contra paga. Este
valor, de todas formas, será menor al que tendría que pagar el usuario por cuenta propia.
1. Para ver las bases de datos de artículos científicos a las que se tiene acceso, se entra
por la página de la biblioteca de la Universidad.
Ingrese a la página principal: http://biblioteca.uniandes.edu.co.
2. A la derecha está la opción de ingresar el login y el password que les asigna la
universidad a los profesores y estudiantes. Digítelos y haga clic sobre “Entrar”
3. Ingresándolo aparecen en el centro de la página varias opciones sobre las que se
puede hacer clic. Hágalo en "Consulta de bases de datos".
4. Aparecen dos links: uno para bases de datos suscritas y otro para bases de datos en
prueba. Haga clic en el primero.
5. Ingrese en el link de ciencias de la salud. Si se ha registrado correctamente,
aparecerán las descripciones de todas las bases de datos a las que se tiene acceso
como estudiante o profesor, junto con instrucciones para obtener el password
institucional (en las bases de datos donde esto es posible). Actualmente, basta con
enviar un correo electrónico a svirutal@uniandes.edu.co, pidiendo acceso a una base
13
14. de datos e incluyendo el código de carnet. Obtendrá como respuesta el login y el
password a utilizar, junto con condiciones de uso de las bases de datos.
Tengamos en cuenta dos bases de datos que son de especial importancia en las
ciencias biológicas: HINARI y Science Direct. La primera de ellas tiene un login y un
password institucional. La segunda no tiene un login ni un password, y sólo se podrá
acceder a través de las salas públicas de la Universidad. La versatilidad que nos ofrece
Science Direct se hará evidente en ejemplos posteriores, donde bajaremos artículos en
texto completo sin necesidad de ingresar ningún login ni password. Las opciones de
HINARI las veremos en el siguiente ejemplo.
Ejercicio
Si tiene carnet vigente en la Universidad, envíe un correo electrónico a la sala virtual de la
biblioteca (svirtual@uniandes.edu.co), pidiendo acceso a las bases de datos HINARI y OVID.
Recuerde que debe incluir el código de su carnet.
Practiejemplo B- HINARI: Acceso al contenido de revistas indexadas
En este ejemplo exploraremos la base de datos de HINARI, y veremos cómo se puede acceder
a un artículo científico reciente en texto completo.
1. Para empezar, tenga presente el login y el password institucional que se requiere para
ingresar a la base de datos (ver ejemplo anterior, en especial el ejercicio). Ingrese a la
siguiente página: https://hin-sweb.who.int/. Se puede llegar a esta página también
desde la página de la biblioteca en donde están las bases de datos, si hace clic sobre
el vínculo "HINARI", después hace clic sobre el vínculo "HINARI" y en la página que
aparece desde ahí hace clic en "Login".
2. En esta página ingrese el login y el password institucionales. Deje la opción del menú
desplegable en "HINARI" y haga clic en Sign On.
3. Si aparecen advertencias de seguridad, haga clic en "Sí" ó "Aceptar" para continuar.
4. Dependiendo de las opciones del navegador de Internet, es posible que salgan una o
dos ventanas. Si sale únicamente una, haga clic en el vínculo “hinari” para abrir la
segunda ventana.
Tómese su tiempo
En la parte izquierda de la página hay varias formas de mostrar las revistas
científicas:
a) Según la primera letra de la revista
b) Usando un motor de búsqueda que conoceremos más adelante (PubMed)
c) Por área de conocimiento
d) Por el lenguaje de la publicación
e) Por la editorial.
También se pueden mostrar todas las revistas en una lista continua.
Sin hacer clic en ningún vínculo hacia otra página explore un poco estas
opciones... ¿Nota que no sólo se restringen al área médica? ¿Que hay revistas
publicadas por universidades, sociedades, academias, centros de
investigación, etc.?
Resaltando conceptos: Artículo científico
Existen revistas con más prestigio que otras. Este prestigio se lo ganan por la
tradición, por la rigurosidad del comité editorial, por la organización que las
14
15. edita, entre otras razones. Las revistas indexadas son reconocidas como de
alta calidad por toda la comunidad académica. En HINARI se presenta una
parte de las revistas indexadas.
5. Haga clic en la letra "N". En la página que aparece haga clic en "Nature".
¿Qué es Nature?
Nature es una de las revistas más prestigiosas del mundo académico. Es
realmente un honor poder publicar en ella y el número de publicaciones en esta
revista por parte de una Universidad sirve (junto con otros criterios) en la
elaboración de rankings de calidad de las instituciones (ver por ejemplo
http://ed.sjtu.edu.cn/rank/2005/ARWU2005Methodology.htm#Meth1).
La estructura del ADN, el descubrimiento experimental de nuevas partículas
subatómicas, la clonación de la oveja Dolly, el lanzamiento del "borrador"
(working draft) del genoma humano, etc., fueron todos publicados en esta
revista.
6. Se encuentra ahora en la página principal de Nature, pero todavía tiene el vínculo con
HINARI. Esto se nota por el URL de la página: empieza con “https://hin-sweb.who.int/”,
que es la página de registro de HINARI. Desde esa página principal haga clic sobre el
vínculo que lo lleva a la última edición de la revista. Tendrá acceso a través del índice a
todas las secciones que contiene.
7. Ahora devuélvase a la página web inicial de HINARI y haga clic en el vínculo "View
complete list of journals". El 11 de abril de 2006 había 3283 revistas disponibles a
través de HINARI.
Resaltando conceptos: Interdisciplinariedad
Note que aún siendo un portal dedicado más que todo a la salud humana, en
HINARI se encuentran revistas de temas que no están directamente
relacionados con la práctica médica, como revistas de botánica. Esto nos da
una idea de la interdisciplinariedad de la ciencia. Resultados nuevos
usualmente se descubren en equipos en los que los individuos tienen
diferentes conocimientos previos.
Ejercicio
Ingrese a la última edición de la revista Science y descarge un artículo de su interés.
3. NCBI Books: libros disponibles en línea
Practiejemplo A - Accediendo a un capítulo particular de un libro de texto disponible
en Internet
En este ejemplo vamos a explorar NCBI Books, que es un servicio público que ofrece el Centro
Nacional de Información de Biotecnología (NCBI en inglés) de los Estados Unidos. En esta
página web encontraremos muchos libros de texto de nivel universitario disponibles de forma
gratuita a través de nuestro navegador de Internet.
1. Para empezar, ingrese a la siguiente página:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Books
Tómese su tiempo
15
16. Note la cantidad de libros que están disponibles. El 8 de abril de 2006, esta
lista incluía 59 libros en texto completo. Posiblemente algunos de ellos hayan
sido utilizados como libros guía en alguno de sus cursos.
2. Podemos entrar a la tabla de contenido de todos los libros que se encuentran en la
página de inicio de NCBI Books. Ingresemos por ejemplo al siguiente libro: "Molecular
biology of the cell". Eso se consigue haciendo clic en la portada del libro o haciendo clic
en el título.
3. En la parte superior del índice, es posible escoger entre ver la tabla de contenidos corta
o la detallada. Haga clic en "Full contents" para visualizar el índice detallado del libro.
4. Supongamos que queremos ver qué contiene la sección "Fractionation of cells" que se
encuentra en el capítulo III.8. Para hacerlo, copie el título de la sección en la casilla de
búsqueda que se encuentra a la derecha y haga clic en el botón "GO".
5. El primer link que aparece nos llevará directamente a esta sección. Además de tener el
texto completo del capítulo, podemos mirar las figuras incluidas en el libro haciendo clic
en los vínculos que se encuentran al izquierdo de la página. Ingrese por ejemplo a la
figura 8-14: "SDS polyacrylamide-gel electrophoresis (SDS-PAGE)".
No todos los libros que se encuentran en la página principal tienen acceso a las figuras
que se encuentran el texto. No por eso dejan de ser muy útiles para aprender algo más
acerca de las ciencias biológicas. En el siguiente ejemplo veremos cómo buscar
información acerca de un término biológico para podernos hacer una idea de lo que
significa.
Ejercicio
Ingrese a la sección titulada “Metabolic Energy” del capítulo I.2, del libro “The Cell – A
molecular approach”.
Practiejemplo B - ¿Cómo buscar términos biológicos en los libros de texto?
Muchas veces queremos averiguar algo acerca de un término biológico, y los resultados de
Google no son muy detallados o son muy difíciles de entender. Un libro de texto muestra un
buen punto intermedio para poder empezar nuestra investigación. En este ejemplo aprenderá a
usar NCBI Bookshelf para encontrar capítulos que están relacionados con su tema.
1. Ingrese la página inicial de NCBI Books:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Books
1. En la casilla de búsqueda ingrese un término biológico de interés, como por ejemplo
Sonic Hedgehog. Aparece una página en donde están todos los libros que hacen
referencia al término que se está buscando.
2. Ingrese a los resultados de "Molecular Biology of the Cell" haciendo clic en el link (si
hace clic en la portada del libro irá al índice de este).
3. Entre los resultados aparece el siguiente título: "Hedgehog Proteins Act Through a
Receptor Complex of Patched and Smoothened, Which Oppose Each Other". Haciendo
clic en ese vínculo verá el mecanismo de transmisión de la señal de Sonic Hedgehog a
las células blanco.
4. Si hace clic en la figura 15-73 (a la izquierda de la página), verá este mecanismo de
forma gráfica.
16
17. 5. Recuerde que si desea saber más acerca de estas moléculas señalizadoras, puede
seguir el procedimiento del practiejemplo anterior y visitar el capítulo completo en el
que se encuentra esta figura.
6. NCBI Bookshelf también tiene opciones de búsqueda avanzada como Google.
Devuélvase a la página inicial y haga clic en la pestaña "Limits".
7. Ahí puede seleccionar si desea limitar la búsqueda únicamente a figuras o al título y
puede escoger de qué libros debe tomar la búsqueda. Ingrese en la casilla de
búsqueda de los términos induced fit in Hexokinase, y marque la casilla de selección
"Figures" únicamente.
¿Que es ajuste inducido y hexokinasa?
En un ejemplo anterior se hablaba del ATP: la molécula energética de las
células. El primer proceso bioquímico que transforma la glucosa (que es el
constituyente principal de los carbohidratos) en energía en forma de ATP se
conoce como glucólisis. En ésta, el primer paso es activar energéticamente a la
glucosa. Para esto, una proteína, llamada Hexokinasa, toma energía guardada
de una molécula de ATP y la transfiere a la glucosa. Solo la glucosa
energéticamente activa es capaz de continuar los pasos que siguen en
glucólisis.
El ajuste inducido es un cambio en la estructura tridimensional que ocurre en la
Hexokinasa cuando la glucosa se une a ésta. Al generar este cambio en la
estructura tridimensional, la Hexokinasa puede realizar su reacción de manera
más rápida y precisa.
8. Dentro de los resultados que aparecen en la búsqueda anterior se encuentra el
siguiente título correspondiente a una figura: "Figure 16.4. Induced Fit in Hexokinase".
Esta figura pertenece a la quinta edición del libro "Biochemistry" de los autores Berg,
Tymoczko y Stryer.
Rápidamente podemos hacernos una idea de lo que significa el ajuste inducido.
Ejercicio:
Encuentre una figura que describa el ciclo del ácido cítrico.
4. PubMed: búsqueda de Artículos científicos
Practiejemplo A – Explorando los resultados de PubMed
En este ejemplo vamos a encontrar artículos científicos mediante un motor de búsqueda del
NCBI, llamado PubMed. Dada la cantidad de artículos científicos que se publican en el mundo
anualmente, es sumamente conveniente tener un motor de búsqueda que permita filtrar los
títulos que nos son más relevantes de la mejor manera. PubMed filtra artículos científicos
similar a la forma en que Google nos permite filtrar páginas Web. La base de datos de artículos
científicos a los que se tiene acceso a través de PubMed contiene a MEDLINE, que es la base
de datos más importante en las ciencias de la salud de los Estados Unidos. Las publicaciones
científicas no son sólo del área de medicina, revistas como "Plant Physiology" y "Nuclear
Physics" también son accesibles desde PubMed.
1. Al igual que en Google, los resultados que se obtienen en una búsqueda en PubMed
contienen mucha información. Para empezar ingrese a la página principal de PubMed
en:
http://www.pubmed.com/
17
18. 2. Ingrese en la casilla de búsqueda los términos induced fit Hexokinase. El 8 de abril de
2006, esta búsqueda arrojó 10 resultados.
3. Estudie por un momento cada resultado. Contiene en primera instancia el nombre de
los autores del artículo. En la siguiente línea está el título del artículo. Posteriormente
se muestra la referencia bibliográfica (que incluye la revista científica y la fecha de
publicación) y un PMID (PubMed ID), que es un identificador del artículo dentro de la
base de datos.
Resaltando conceptos: Estructura de un artículo
El título de un artículo científico debe ser capaz de describir el resultado
experimental que se obtuvo en muy pocas palabras. Debe ser conciso, directo
y descriptivo.
Nos damos cuenta cuál es la funcionalidad de un título con este estilo: si una
búsqueda arroja demasiados resultados, o disponemos únicamente del índice
de una revista científica, somos capaces de hacernos una idea general de lo
que contiene el artículo con sólo leer una frase.
El PMID es útil si se quiere acceder a un artículo posteriormente. En lugar de tener que
recordar los términos de búsqueda y la posición en que se encontraba nuestro artículo,
basta con ingresar este número y lo obtendremos como único resultado en la página de
resultados.
Resaltando conceptos: Selectividad
Encontrar un artículo mediante el ingreso de su PMID en la casilla de búsqueda
es tener la máxima selectividad. Sólo aparece el artículo que nos interesa y
todos los otros artículos serán descartados en los resultados.
4. Note también que a la izquierda del título hay un icono en forma de páginas. En esta
búsqueda específica se originan todos los íconos posibles.
Uno de ellos tiene dos páginas y líneas en la página de portada. Este icono significa,
que se dispone del Abstract además del título.
Otro icono tiene cuatro páginas, la página de portada tiene texto y resalta por unas
bandas anaranjadas y verdes. Los artículos que tienen este ícono, además de tener a
disposición el Abstract también tienen disponible el texto completo (en el ejemplo
siguiente se bajarán textos completos de artículos).
El tercer tipo de icono tiene dos páginas, pero no tiene líneas escritas en la portada.
Estas publicaciones no ponen a disposición ni el texto completo ni el abstract a través
de PubMed.
5. Vamos a aprovechar la interfaz de PubMed para visualizar con más detalle el contenido
de los artículos de esta página. Para esto hacemos clic en el primer menú emergente
("Display") que aparece debajo de las pestañas en la parte superior y seleccionamos
Abstract. Observe que no tuvimos que marcar todas las casillas de selección. Nota: Si
ninguna casilla de selección está seleccionada al momento de cambiar de
visualización, PubMed asume que uno quiere aplicar esta vista a todos los artículos.
6. Aparece el Abstract de todos los artículos que tienen un ícono con líneas en la portada.
Lea uno de estos Abstract.
Resaltando conceptos: Abstract o Resumen
El Abstract de un artículo científico da información concisa sobre todas las
secciones que componen el artículo. Suele incluir las razones por las que se
18
19. hizo el estudio, la metodología que se utilizó, los principales resultados y unas
conclusiones.
Si el título se limita a responder la pregunta ¿que? el abstract, además de esta
pregunta, responde brevemente el ¿para qué?, ¿cómo? y el ¿qué se concluye?
Como se mencionó anteriormente, algunos de los artículos se encuentran disponibles en texto
completo. En el siguiente ejemplo veremos cómo es posible descargarlos.
Ejercicio:
Seleccione otro término de búsqueda y escoja 5 artículos que tengan Abstract. Luego, utilice el
menú desplegable “Display” junto con el menú desplegable “Send to” para tener estos Abstract
en un archivo de texto.
Practiejemplo B – Accediendo al texto completo de los artículos
En este ejemplo aprenderemos a utilizar PubMed Central y Science Direct para obtener el texto
completo de artículos científicos.
1. Este ejemplo empieza donde terminó el anterior. Para llegar a este punto se ingresó a
la página principal de PubMed:
http://www.pubmed.com/
Luego se ingresó como término de búsqueda induced fit Hexokinase, y se seleccionó la
opción "Abstract" en el menú emergente "Display".
2. Debajo de la referencia bibliográfica de algunos artículos se encuentra un icono que se
refiere a texto completo. Hay, por ejemplo, un icono acerca de PubMed Central. La
Librería Nacional de Medicina (NLM) de los Estados Unidos, a la cual pertenece el
NCBI, ha puesto a disposición del público un conjunto de publicaciones relevantes en
texto completo de manera gratuita: son los artículos de PubMed Central.
3. Haga clic en alguno de los iconos de PubMed Central, por ejemplo en el que tiene el
PMID 7619052.
Tómese su tiempo:
Además de la información que se obtiene en la interfaz de PubMed, esta
página incluye vistas en miniatura de las páginas, un vínculo al texto completo
en formato pdf, un link a las figuras en tamaño grande (muy útil para
presentaciones...) y la lista completa de referencias. Esta lista tiene vínculos a
PubMed y PubMed Central, por lo que es una perfecta opción para seguir
explorando el tema.
4. Haga clic en el vínculo que se encuentra en la sección "Full text" que le permite bajar
este artículo en formato pdf. Se pueden ver todas las secciones del artículo en un
formato que es muy fácil de imprimir. Puede guardarlo en su computador para verlo
cuando no esté conectado a Internet, a diferencia de las páginas web que uno
consigue a través de Google o NCBI Books.
5. Vuelva otra vez al inicio de este ejemplo. Entre los resultados hay un artículo que tiene
el PMID 5014492. Haga clic en el icono que acompaña ese artículo. La página que
verá a continuación dependerá del lugar en que se encuentre. Si está en un
computador que no tiene acceso a la base de datos de Science Direct (esto es, si no se
encuentra en un computador de las salas públicas de la Universidad) verá una página
en donde se le permite ver el texto completo únicamente después de un pago o una
suscripción a la revista. Si está en uno de los computadores con acceso a Science
19
20. Direct verá una página similar a la que vio cuando estaba visitando el artículo de
PubMed Central, y podrá bajar el texto completo.
6. Algunos artículos no tienen un icono debajo de la referencia. Está, por ejemplo, el
artículo con PMID 789076. ¿Es posible acceder al texto completo de este artículo? ¡Sí,
a través de la red de HINARI!
Siga los pasos descritos en el Practiejemplo 2B para llegar a la página de HINARI en
que se muestran las publicaciones científicas a las que se tiene acceso.
7. Desde ahí haga clic sobre la letra "E", y entre las revistas que aparecen escoja
"European Journal of Biochemistry".
8. Busqué la edición de septiembre 15 de 1976 y revise el contenido. Encontrará el
artículo que estamos buscando y también podremos bajarlo en texto completo.
Como ve, es una gran ventaja para los estudiantes y los profesores poder contar con
suscripciones a bases de datos como HINARI y Science Direct. Como se mencionó
anteriormente, también es posible encontrar un artículo científico que no se encontró en estas
bases de datos haciendo una solicitud en la sala virtual de la biblioteca de la Universidad. Si no
se cuenta con ningún convenio que permita acceder al texto completo del artículo de manera
gratuita, muchas veces es posible conseguir el artículo pagando un pequeño monto en la
biblioteca de la Universidad.
Ejercicio:
Baje el texto completo del artículo con PMID 283394 en formato pdf.
Practiejemplo C – Una búsqueda estructurada en PubMed
Muchas veces estamos realizando una investigación sobre un tema y queremos escoger
artículos que nos permitan saber los últimos avances al respecto. Para facilitar nuestra
búsqueda PubMed ofrece una interfaz con muchas opciones, permitiéndonos elegir artículos
con diferente nivel de selectividad y con diferentes heurísticos.
Nota: Algunas de las opciones que se usan en este ejemplo requieren que su navegador de
Internet permita recibir Cookies. Por tanto, es posible que en algunos casos los resultados no
se desplieguen como se describe aquí.
En este ejemplo buscaremos temas relacionados con usos de RNAi (RNA interferente) en
estudios de Drosophila melanogaster.
¿Qué es RNAi?
El ADN, que es nuestro material hereditario, codifica en el orden de sus bases
nitrogenadas la forma en que deben sintetizarse todas las proteínas del cuerpo.
La información que se encuentra en el ADN se transcribe primero en una
molécula llamada ARN mensajero (mRNA en inglés). Este mRNA después es
traducido a proteínas dentro de las células. Son estas proteínas las que hacen
que los tejidos cumplan sus funciones y les dan su identidad: la piel, por
ejemplo, tiene células que producen la proteína colágeno protegiendo nuestro
cuerpo del medio exterior; el páncreas genera insulina para regular la cantidad
de glucosa en la sangre, etc.
Los organismos pluricelulares tienen muchos mecanismos para impedir que se
formen proteínas en el lugar incorrecto, por ejemplo insulina en la piel. En los
últimos años se descubrió uno de estos mecanismos para regular la producción
de proteínas: el RNAi (ARN interferente). Son unas moléculas pequeñas de
ARN que se unen al ARN mensajero y lo inactivan, impidiendo que se forme la
proteína. Ahora es posible generar RNAi en algunas células a voluntad del
20
21. investigador, para estudiar, por ejemplo, el efecto que tiene una proteína en la
formación de un órgano.
¿Qué es Drosophila melanogaster?
La mosca de la fruta (Drosophila melanogaster) es uno de los organismos más
estudiados del planeta. A principios del siglo 20, el investigador Thomas Hunt
Morgan la usó en sus estudios genéticos, ganando el primer premio Nóbel de
"Medicina ó Fisiología" otorgado a estudios genéticos.
Desde entonces, su uso se ha extendido a estudios evolutivos, de desarrollo,
de biología molecular, etc. Entre las ventajas de estudiar este organismo se
encuentra su corto ciclo de vida, la facilidad de mantenerla en laboratorio, el
alto número de descendientes, la facilidad con que se pueden distinguir
mutaciones genéticas, y otras razones.
1. Para empezar, ingrese a la página inicial de PubMed:
http://www.pubmed.com
2 Desde ahí haga clic en la pestaña "Limits/Preview". Este es un buen lugar para
empezar a escoger los términos de nuestro 'query', pues nos muestra el número de
resultados que vamos a obtener si hacemos una búsqueda particular y nos propone
combinaciones de palabras que nos dan más selectividad.
3 Ingrese el término RNAi y haga clic en “Preview”. El 11 de abril de 2.006 se hallaron
5759 artículos al respecto.
4 Dado que es prácticamente imposible revisar los más de 5000 resultados que arroja la
búsqueda, concluimos que es necesario volver más selectiva la búsqueda. Esta vez,
cambie el query a RNAi Drosophila y vuelva a hacer clic en "Preview". El 11 de abril de
2.006 se hallaron 731 resultados, mucho menos cantidad a los obtenidos del paso anterior,
pero aún siguen siendo demasiados.
5 Ahora, escriba nuevamente RNAi Drosophila, pero en lugar de hacer clic en "Preview"
presione en "Index".
6 En la nueva página se puede ver un índice de términos que añaden más selectividad a
nuestra búsqueda. Podemos hacer clic, por ejemplo, en "RNAi effect", hacer clic en "AND"
escribir Drosophila en la casilla de búsqueda, volver a hacer clic en "AND" y volver a hacer
clic en "Preview".
Como vemos, se ha reducido muchísimo el número de resultados (el 11 de abril de 2.006
salieron solo 5). Haciendo clic sobre el número de resultados se ve la página de ellos que
exploramos en el ejemplo anterior.
7 También es posible limitar las búsquedas de otra forma. Borre toda la información que
se encuentra en la casilla de búsqueda que está en la parte superior de la página y vaya a
la pestaña "Limits".
Tómese su tiempo
Esta página tiene muchas opciones para filtrar los resultados. Se puede limitar
según autor, según revista, según el lugar en que se encuentre la palabra
dentro del artículo, según la fecha de publicación o de indexación en PubMed,
según el idioma y otras opciones de filtrado que son muy convenientes para
médicos investigadores. Es como la "búsqueda avanzada" de Google,
adaptada a artículos científicos relacionados con medicina.
21
22. 8 Haga clic en la casilla de verificación "Abstracts", escoja como idioma inglés y en el
menú desplegable "Default Tag:" escoga "Title". En la casilla de búsqueda ingrese las
palabras RNAi Drosophila y haga clic en "Go".
Aparecen los resultados que se ajustan a la búsqueda: que tienen el Abstract disponible a
través de PubMed, que están en inglés y además tienen los términos de búsqueda en el
título. Note que la pestaña "Limits" ahora tiene una casilla de verificación y que debajo de
ésta se encuentra, resaltado en amarillo, el resumen de los límites empleados.
Como pudo darse cuenta, la pestaña Limits es una excelente forma de filtrar. Al elegir que
las palabras salieran en el título le hemos pedido a PubMed que se ciña a uno de nuestros
heurísticos más utilizados.
9 Aparecen dos tipos de resultados en pestañas diferentes: "All" y "Review". Haga clic en
la pestaña “Review”, seleccione los cuatro artículos (o déjelos todos sin seleccionar, que
tiene el mismo efecto) y luego haga clic en el menú desplegable "Send to" y elija
"Clipboard". Posteriormente en el ejemplo verá la utilidad de haber seleccionado esta
opción.
Resaltando conceptos: Review
Los Reviews son una recopilación ordenada de muchos resultados de
investigación.
Normalmente incluyen los avances presentados en cientos de artículos que se
refieren al tema. Son, por tanto, una excelente forma de actualizarse en un
tema particular sin entrar en los detalles particulares de la metodología o los
resultados.
Por su objetivo no mantienen la estructura de los otros artículos científicos
(Título, Abstract, Introducción, Metodología,...), y tienen una extensa lista de
referencias, usualmente cientos de ellas.
10 Ahora que ya tenemos unos Reviews sobre el tema podemos investigar cuáles son los
avances más recientes haciendo clic en "All". Los resultados más recientes suelen
mostrarse primero en Pubmed. Si no es así, haga clic en "All" y luego escoja "Pub Date" en
el menú desplegable "Sort by:".
11 Escoja unos cuantos resultados y vuelva a enviarlos al "Clipboard" como hizo antes con
los Reviews.
12 Vamos a ampliar más la búsqueda. Es posible que haya artículos que no mencionen a
Drosophila explícitamente en el título, pero sí la mencionen en el Abstract. Haga clic en la
pestaña "Limits" nuevamente, y seleccione esta vez las casillas de verificación "Links to
free full text" y "Abstracts", escoja como idioma inglés y en "Default Tag:" seleccione
"Title/Abstract".
13 Al ingresar RNAi Drosophila en la casilla de búsqueda y hacer clic en “Go” aparecen
muchos más resultados que antes. Estamos interesados en los Reviews al respecto, para
hacernos una idea más amplia del RNAi, no limitado únicamente a Drosophila. El 11 de
abril de 2006, esta búsqueda nos proporcionó 4 Reviews diferentes a los que habíamos
seleccionado antes. Podemos elegir ver el Abstract en el menú desplegable "Display", y
seleccionar uno o dos que parezcan complementarios enviándolos otra vez al "Clipboard".
14 Después de esto hagamos clic en la pestaña History para ver cuáles han sido mis
búsquedas. Si quisiera volver a una búsqueda anterior, bastaría con dar clic en el vínculo
adecuado.
15 Ahora haga clic en la pestaña "Clipboard". Como ve, todos los artículos que nos han
interesado se encuentran aquí. Como el nombre lo indica, es un portapapeles: un lugar
22
23. para almacenar temporalmente unos artículos para su posterior consulta. Puedo
seleccionar "Abstract" en el menú desplegable "Display" y luego hacer clic en "Send to file"
en el menú desplegable "Send to:", obteniendo así un archivo de texto con el Abstract de
los artículos que más me interesaron.
Este ha sido sólo un ejemplo de cómo estructurar una búsqueda en PubMed. Dependiendo de
las necesidades se puede modificar la estrategia de búsqueda.
Ejercicio
Siguiendo el procedimiento descrito en el ejemplo, seleccione tres Reviews que se refieran a
RNAi en Caenorhabditis elegans, un nemátodo casi tan famoso como Drosophila.
Practiejemplo D – Single Citation Matcher
Single Citation Matcher es una interfaz accesoria de PubMed diseñada para aquellos casos en
que buscamos un artículo teniendo información bibliográfica incompleta.
1. Veamos dos posibles escenarios en que esta herramienta puede ser útil, comparándola
con una búsqueda con límites como la del ejemplo anterior.
Escenario 1: Asumamos que estamos buscando un artículo publicado por Silvia
Restrepo en la revista “Genome”.
2. Vaya a la página principal de PubMed
http://www.pubmed.com/
3. Haga clic en “Limits”, luego en el botón “Add Author" e ingrese en el cuadro de texto
Restrepo S (note que la interfaz le ayuda a detectar errores de digitación).
4. Haga clic en “Add Journal” e ingrese Genome.
5. Tras hacer clic en “Go” nos aparece únicamente un resultado, que era lo que
queríamos lograr.
Mire el ‘query’ que generó este resultado en la casilla de búsqueda: “Genome[Jour]
AND Restrepo S[author]”. En realidad, lo que hizo al usar la pestaña “Limits” es
añadirle modificadores a su ‘query’: “Jour” que restringe la búsqueda a una revista
particular y “author” que restringe la búsqueda a un autor particular.
6. Ahora vuelva a la página principal de PubMed y haga clic en el vínculo “Single Citation
Matcher” que se encuentra a la izquierda para llegar a la página principal de esta
herramienta.
Tómese su tiempo
Esta página ofrece restricciones a los resultados diferentes a la de la pestaña
Limits: Revista, fecha, primera página, autor, palabras en el título… Esta es
toda la información que acompaña una referencia bibliográfica.
7. En el cuadro de texto “Journal” escriba Genome y en el cuadro de texto “Author”
escriba Restrepo S. Tras presionar en “Go” obtiene el mismo resultado.
Note que el ‘query’ es el mismo de la búsqueda anterior. En realidad hizo la misma
búsqueda, con los mismos criterios en dos interfaces de PubMed diferentes.
8. Veamos un segundo escenario, donde la interfaz de “Single Citation Matcher” puede
ser más ventajosa que la utilizada en el Ejemplo10:
23
24. Escenario 2: Supongamos que buscamos un artículo que apareció en la página 419 de
la revista “Plant Physiology” de febrero de 2003.
9. Si queremos encontrar este artículo usando la pestaña límites de la página principal de
PubMed, lo primero sería incluir la revista “Plant Physiology” tal como incluimos
“Genome” en la búsqueda anterior. Sin embargo, ¿cómo ingresar el número de página
o la fecha de publicación? Incluya “Plant Physiology” dentro de las revistas a buscar y
luego haga clic en “Go” sin cambiar nada más. El 12 de abril de 2.006 aparecieron
7852 resultados.
10. Dado que PubMed ordena cronológicamente sus entradas podemos empezar a buscar
las que se publicaron en febrero de 2003 avanzando páginas de resultados hasta llegar
a la que contiene las de ese mes. Cuando ya se encuentran los artículos publicados en
ese mes, se puede ver la línea de referencia que aparece en los resultados para llegar
al artículo que se está buscando.
11. Es mucho más sencillo hacerlo por el “Single Citation Matcher”. Ingrese a la página
principal de esta herramienta, entre la revista “Plant Physiology”, escriba en la casilla
de fecha 2003/02 y en la casilla del número de la primera página escriba 419. Tras
hacer clic en “Go” aparece el Abstract del artículo que buscamos como único resultado.
Esto permite resaltar, que la interfaz a utilizar depende del objetivo que se persigue. “Single
Citation Matcher” fue diseñando con un objetivo en mente, que es diferente al de la pestaña
Limits. En ambos casos, se le facilita al usuario una búsqueda, que podría haber hecho
directamente desde la página principal de PubMed de tener conocimiento de los modificadores
al ‘query’.
Ejercicio
¿Cuál es el título de la siguiente referencia? ¿A qué hace mención el artículo?
Ann R Coll Surg Engl. 2004 May;86(3):218-9.
Ejercicios
Primer ejercicio
Usando la opción de búsqueda avanzada de Google, encuentre una animación acerca de RNAi
en la página de Nature.
Practiejemplos de repaso
1C
Segundo ejercicio
Ovid es una base de datos muy reconocida por la comunidad médica. Al igual que HINARI, se
accede a la información mediante el pago de una afiliación.
Con la información registrada en la página de la biblioteca de la Universidad, y solicitando la
clave institucional de la base de datos Ovid, ingrese a esta base de datos y busque el libro
“Cancer: Principles & Practice of Oncology”.
Esto muestra que a través de las bases de datos de la Universidad también es posible llegar a
libros completos, adicionales a los de NCBI Books.
Practiejemplos de repaso
2A
24
25. Tercer ejercicio
Use NCBI Bookshelf para encontrar la respuesta a esta pregunta: ¿Cuál es el potencial de
membrana que hay en una neurona en reposo de un calamar?
Cite la referencia completa del libro en donde encontró la respuesta e incluya el link a la página
Web donde está la información.
Practiejemplos de repaso
3 A, 3 B
Cuarto ejercicio
Como se mencionaba en la introducción, una investigación consiste en aportar un grano de
arena a la montaña de información disponible.
Para visualizar esto busque a través de PubMed un artículo cualquiera, pero que se pueda
descargar en texto completo. Cuente cuántas referencias tiene.
Luego, seleccione 5 de estas referencias y encuéntrelas en texto completo. Para cada una de
ellas cuente cuántas referencias tiene.
¿Cuántas referencias dieron en total los 5 artículos en texto completo que escogió?
Practiejemplos de repaso
4 A, 4 B, 4 D
Quinto ejercicio
Encuentre el artículo original de la revista Nature (en texto completo) en que reportan la
clonación de la oveja Dolly.
Practiejemplos de repaso
3 B, 4 B, 4 D
Sexto ejercicio
Google Earth:
Como aprendimos en el Practiejemplo 4D, diferentes interfaces nos permiten encontrar
información más rápidamente.
Google Earth es una interfaz para explorar, buscar y descubrir sitios sobre el globo terráqueo.
Se basa en fotografías satelitales que ha tomado de todo el planeta.
Mediante Google, encuentre el sitio oficial de Google Earth, descargue e instale el programa.
Luego busque: 8600 Rockville Pike, Bethesda, MD 20894.
Esta es la dirección del NCBI, el centro que administra PubMed y NCBI Bookshelf. ¿Nota el
grado de detalle a que puede llegar este programa?
Después responda: ¿En qué continente queda “Bandar Seri Begawan”?
Practiejemplos de repaso
25
26. 1 A, 1 B
Profundización
Wikipedia
Página principal de Wikipedia:
http://www.wikipedia.org/
Esta es la descripción de Wikipedia, tal como aparece en la página Web:
“Wikipedia es una enciclopedia libre multilingüe basada en la tecnología wiki. Wikipedia se
escribe de forma colaborativa por voluntarios, permitiendo que la gran mayoría de los artículos
sean modificados por cualquier persona con acceso mediante un navegador web. El proyecto
comenzó el 15 de enero de 2001 como complemento de la enciclopedia escrita por expertos
Nupedia. Ahora depende de la fundación sin ánimo de lucro Wikimedia Foundation. Wikipedia
tiene más de 3.210.000 artículos, incluyendo más de 1.000.000 en su edición en inglés, y a
finales de febrero de 2006 alcanzó la cifra de 1.000.000 de usuarios registrados. Desde su
concepción, Wikipedia no sólo ha ganado en popularidad, sino que su éxito ha propiciado la
aparición de proyectos hermanos. Recientemente la revista científica Nature declaró a
Wikipedia casi tan exacta como la prestigiosa enciclopedia Británica.”
Tomado de: http://es.wikipedia.org/wiki/Wikipedia
La mayoría de términos biológicos que se tratan en esta guía están explicados de manera
sencilla pero completa en esta enciclopedia, lo que la hace una excelente herramienta de
consulta. Cada artículo tiene a su vez varios vínculos a otros artículos que se han escrito,
permitiendo ahondar en el conocimiento de un tema, sin necesidad de búsquedas adicionales
en Google.
Google Scholar
Página principal de Google Scholar:
http://scholar.google.com/
Google también tiene un motor de búsqueda de literatura científica, que se puede usar de
manera complementaria a PubMed. Busca en más fuentes de información y además nos dice
cuántas publicaciones citan cada artículo, lo cual nos da una idea de la relevancia de la
investigación. Esta es la descripción que aparece en la página Web de Google Scholar:
“Qué es Google Académico?
Google Académico permite buscar bibliografía especializada de una manera sencilla. Desde un
solo sitio se podrá realizar búsquedas en un gran número de disciplinas y fuentes como, por
ejemplo, estudios revisados por especialistas, tesis, libros, resúmenes y artículos de fuentes
como editoriales académicas, sociedades profesionales, depósitos de impresiones
preliminares, universidades y otras organizaciones académicas. Google Académico ayuda a
encontrar el material más relevante dentro del mundo de la investigación académica.”
Tomado de: http://scholar.google.com.co/intl/es/scholar/about.html
Ayuda de PubMed
26
27. Índice de la ayuda de PubMed:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=helppubmed.chapter.pubmedhelp
Si se desea aprender a utilizar PubMed más a fondo conviene hacer una visita a la ayuda de
PubMed.
Un ejemplo de lo que se puede encontrar es la lista completa de modificadores de los términos
de búsqueda:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=helppubmed.box.pubmedhelp.Box_1_Search_Fie
ld_D
Como se mencionó en el Practiejemplo 4D, las interfaces “Limits” y “Single Citation Matcher”
sirven de ayuda para elaborar un ‘query’ muy selectivo, que no pierda mucha sensibilidad a lo
que estamos buscando. Añadir [AU] dentro de los términos de búsqueda restringe esta a
autores, añadir [TA] busca sólo entre los títulos, etc.
Nota: La ayuda de PubMed es un libro que se encuentra dentro de NCBI Books, por lo que
también puede usar la interfaz de NCBI Books para explorarla.
My NCBI
Página principal de MyNCBI:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/login.fcgi?call=0NTQw95KEIM-
1pLA3kA7v3&callpath=0uCLll6RsOWKAxLZIhf_kBTWPAea1vUINU3g
My NCBI: Suponga que hace una búsqueda en PubMed en un computador de la Universidad y
quiere recuperar los resultados desde su casa, o que realizó una búsqueda y quiere resaltar
algunos términos como en el link “en cache” de Google. Si usa PubMed de manera frecuente
puede encontrar útil esta herramienta del NCBI. Así se describe en la página Web:
“My NCBI almacena búsquedas y resultados e incluye una opción de actualizar
automáticamente resultados de búsqueda almacenados y enviarlos por e-mail. My NCBI
incluye características adicionales como resaltar términos de búsqueda, almacenar una
dirección de correo electrónico, filtrar los resultados de búsqueda [...]. [Traducción del inglés]”
Tomado de:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=helppubmed.section.pubmedhelp.My_NCBI
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 2.5
License.
27