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Terra-i
             An eye on Habitat Change
Monitoreo en Tiempo Real de Cambios en el Hábitat
  usando Redes Neuronales y Datos Satelitales


              Colombia
Enfoque Conceptual
La intensidad del verde de la vegetación sigue un ciclo natural que depende de factores
climáticos   (precipitación,   temperatura),   variables   de   sitio   (tipo   de   vegetación,
características del suelo) y de las alteraciones.




Terra-i es un modelo capaz de predecir la evolución de la intensidad verde de
la vegetación, con base a medidas de verde anteriores y a medidas climáticas
actuales para detectar cambios significativos en el habitad.
Metodología de Detección de Cambios
Metodología General
Medidas NDVI MODIS (MOD13Q1),                    Medida NDVI
     Precipitación (TRMM)                          actual


           Limpieza                                Limpieza

          Clustering


      Selección aleatoria
          de píxeles.

                                               Diferencia entre el
      Entrenamiento de los
                                                NDVI actual y la
            Modelos
                                                   Predicción
      Predicción NDVI actual


                         No                      Mapas de las
     Cambio en el                 Reglas       probabilidades de
        Pixel
                                                    cambio
                                  Si
  Mapas de los Cambios         Sin Cambio en
      Detectados                   el Píxel
Metodología - Los Modelos

• Predicciones
  Bayesian Neural Network (BNN)


• Entrenamiento y aproximación del ruido
  Scaled Conjugate Gradient (SCG)
  Bayesian evidence function
  Gaussian noise


• Selección de las entradas del modelo
  Automatic relevance determination (ARD)


• Clustering
  Algoritmo de K-Means modificado, para ser distribuido en varios procesadores.
  De cada uno de los clústers se selecciona aleatoriamente 1000 pixeles con los cuales
  se entrenan 10 modelos….Reduciendo así el tiempo de proceso.
Detección de Cambios

             9000

             8500

             8000

             7500

             7000
      NDVI




             6500
                           Measurments
             6000
                           Predictions
                                                               Cambio
             5500          Interval max
                           Interval min
             5000

             4500
                    1     2              3   4      5     6       7       8       9
                                                  Time



Para la detección de cambios, las Redes Neuronales Bayesianas generan tres indicadores: el
valor predicho , la desviación estándar de las predicciones del modelo sobre la función real, el
nivel de ruido (Gausiano) de la medida del satélite.
Limpieza de los Datos




•   Elimina todas las variaciones a corto plazo (< 3 meses)

•   Ajuste iterativo de curvas limpias usando:

             Los datos de calidad de MODIS
             Análisis de Fourier
             Ajuste de mínimos cuadrados con valores de alta calidad
Resúmen Gráfico de la Metodología
Calibración del Modelo en Colombia
Conjunto de datos de Calibración


           • Para calibrar el modelo Terra-i en Colombia, se
             realizó un análisis multitemporal de imágenes
             satelitales Landsat-7 ETM+ suministradas por
             USGS        Global         Visualization   Viewer
             http://glovis.usgs.gov/.



           • Se seleccionaron 12 tiles de Landsat en
             Colombia, y para cada uno de ellos se
             descargaron dos imágenes de la misma época
             del año para el 2004 y el 2009.
Datos de Calibración

  Se seleccionaron 24 ímágenes para el
  proceso   de   calibración   de   Colombia,
  teniendo en cuenta que estas cumplieran
  con las siguientes características:


 Para garantizar una buena detección se
  seleccionaron imágenes con un máximo
  de 10% de cobertura de nubes.


 Los tiles seleccionados       para el año
  2004 y 2009      deben ser de la misma
  epoca del año, y en el caso de que sea
  posible la misma fecha del año.
Detección de la Deforestación usando CLASlite.

                               1. Calibración radiométrica y corrección atmosférica de
                                  las imágenes satelitáles usando información MODIS
                                  de areosoles y vapor de agua y usando el modelo
                                  Second Simulation of the Satellite Signal in the Solar
                                  Spectrum model (6S).

                               2. Análisis cuantitativo a nivel de sub-pixel pixel donde
                                  clasifica cada pixel en tres clases: porcentaje de
                                  vegetación viva, vegetación muerta y superficie
                                  descubierta    usando         el   modelo   Monte   Carlo
Amazonas Colombiano
                                  Automated y una biblioteca de datos espectrales.

                               3. Enmascaramiento de nubes y cuerpos de agua

                               4. Mapas de cambio en el bosque, donde se obtienen
                                  dos   mapas    uno       de    deforestación   y otro   de
                                  perturbación forestal.
Detección de la Deforestación usando CLASlite.




Para que sirve claslite
Detección de Deforestation usando ERDAS Image.

•   En las áreas de Colombia que no pertenecen al Amazonas se utilizo el programa ERDAS Image 8.7 para
    realizar la detección de cambio en el conjunto de datos de calibración. Aquí se realizó una clasificación no
    supervisada mediante algotitmo “Self-Organizing Data Analysis Technique” (ISODATA).



•   Isodata es un algoritmo iterativo, donde inicialmente se seleccionan de manera arbitraria un número de
    clusters y en cada uno se selecciona el centro. Los píxeles se asignan al centro más cercano, y se vuelven a
    calcular los nuevos centros. Este proceso se repite hasta alcanzar un número de 10 iteraciones, o hasta que
    un porcentaje de píxeles queden sin modificar entre dos iteraciones. Este método utiliza la distancia espectral
    mínima para asignar cada píxel a un centro candidato.
Detección de Deforestation usando ERDAS Image.


                              •   Mediante        este   algoritmo   es
                                  posible identificar diferentes tipos
                                  de coberturas, tales como: nubes,
                                  cuerpos     de    agua,   vegetación
                                  primaria, vegetación secundaria,
                                  areas     sin    cobertura   vegetal,
                                  sombra de nubes, sombra de
                                  montañas y areas urbanas.
Detección de Deforestation usando ERDAS Image.

Luego se utiliza el software ArcGIS para mezclar la
clasificación inicial en tres grandes clases: Vegetación
primaria, areas sin cobertura vegetal y NoData.


Y se calcula la diferencia entre la pareja de imágenes
clasificadas, obteniendo asi una imágen final con tres
valores:
             Incremento(+1),
             Decremento(-1) y
             Sin cambio (0).



    Finalmente,     los   resultados     obtenidos     son   revisados   de   manera   detallada,
    superponiendolos a las imágenes satelitales crudas de los años 2004 y 2009, con el fin de
    encontrar errores en la deteccion, ocasionados principalmente por agricultura intensiva y
    mal enmascaramiento de nubes.
Al realizar la detección de cambios usando los
programas computacionales CLASlite en el
Amazonas y ERDAS en el resto del territorio
nacional, se otiene un mapa final con el cual
se hara la primera calibración de los datos en
Colombia.

Con este proceso se obtuvieron buenos
resultados, sin embargo, se debe tener en
cuenta que este es un proceso continuo por lo
que en un futuro muy cercano se pretende
realizar este mismo proceso usando una
mayor cantidad de imágenes satelitales,
usando   otro   tipo   de   sensores   y   otras
metodologías.
Puerto Concordia - Meta
Calibración de Terra-i.
•   El objetivo de este paso es comparar los resultados de Terra-i con el conjunto de datos de validación para encontrar el
    umbral de probabilidad óptimo. Este análisis se repite para cada clase de la zona analizada lo que permite de definir
    el umbral óptimo de cada clase.
•   Para cada mapa de detecciones del conjunto de datos de validación y para cada clase representando al área
    analizado, se definen 3 variables, con las cuales se puede deducir dos indicadores de cualidad del modelo:


       T: Total de pixeles detectado por Terra-i,
       V: Total de pixeles detectados en el mapa de validación
       M: Número de pixeles cuales son detectados por Terra-i y en el mapa de validación .



Primer Indicador

El primero es la capacidad del modelo de detectar los cambios y se calcula de la siguiente manera:



                        Lo que corresponde a la proporción de pixeles de validación también detectados por Terra-i. Este
                        indicador varia de 0 a 1, 0 representando un modelo mal calibrado y 1 un modelo perfectamente
                        calibrado.
Calibración de Terra-i.
Segundo Indicador
El segundo indicador es la capacidad de Terra-i de detectar únicamente los cambios de cobertura del suelo , es decir,
permite averiguar si el ruido en las detecciones es bajo. Se calcula de la siguiente manera:


                              Lo que corresponde a la proporción de pixeles detectados por terra-i que no pertenecen al
                              conjunto de validación. Este indicador varia de 0 a 1, 1 representando un modelo mal
                              calibrado y 0 un modelo perfectamente calibrado.



El objetivo es reducir al mínimo I2, mientras se maximiza I1.
Lo que se hace fácilmente calculando los indicadores con
diferentes umbrales y luego calcular una puntuación P para
cada umbral cual corresponde a la distancia euclidiana entre
el punto T (, ) y la solución óptima O (1,0).


                                         Were selected the
                                         threshold with the
                                            lower score.
Detection Terra-i.

Para el monitoreo de cambios en el hábitat
en Colombia fueron seleccionadas cuatro
areas y cada una fue corrida de manera
independiente.
En   cada   una    de    estas áreas    Terra-I
selecciono seis clusters, teniendo asi un total
de 24 clusters en todo Colombia.
Luego se entrenaron 3 modelos con cada
uno de estos clustres.


El proceso de clustering mostro buenos
resultados con esta distribución .
Zona 1: Norte del País

La primer area seleccionada corresponde a la
parte norte del pais. En esta zona el modelo
Terra-i creo 6 cluster para el entrenamiento, y a
cada uno de estos mediante el proceso de
calibración le asignó un valor de probabilidad.
Zone 2: Centro del País

La segunda area seleccionada corresponde
a la parte centro del pais, principalmente la
region andina. En esta zona el modelo
Terra-i creo 6 cluster para el entrenamiento,
y a cada uno de estos mediante el proceso
de calibración le asignó un valor de
probabilidad.
Zone 3: Region Pacifico.

La tercer area seleccionada corresponde en
gran parte al pacífico Colombiano. En esta
zona se tiene información de muy baja
calidad, sin embargo como meta a corto
plazo se pretende usar datos diarios de
MODIS con el fin de aumentar la cobertura
de deteccion en la zona, Al igual que en los
anteriores casos se crearon 6 cluster para el
entrenamiento.
Zone 4: Sur y Oriente del País.

La cuarta area seleccionada corresponde a
la region amazonica y los llanos orientales
de Colombia. Al igual que en los anteriores
casos   se   crearon   6    cluster   para   el
entrenamiento y a cada uno de estos
mediante el proceso de calibración le asignó
un valor de probabilidad.
Resultados Terra-i




  Tasa de Deforestacion
    151,754 Ha/año
Resultados Terra-i




Las prácticas de tala selectiva en el departamento de
Santander, ocurren principalmente en la zona del
Magdalena Medio santandereano y el bajo Rionegro.
Esta deforestación pone en peligro las fuentes
hídricas   de    muchos     municipios    de    este
departamento.


                Deforestation Rate

                  12,600 Ha/año
Resultados Terra-i




La región oriental presenta una creciente pérdida
de   los    bosques,   debido   principalmente   a
ampliación de la frontera agrícola, colonización en
las riberas de los ríos, ganadería y explotación
maderera.

                Tasa de Deforestación

                  21,300 Ha/año
Gracias!

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Karolina Argote - Monitoreo de cambios en el hábitat en Colombia (Octubre 2010)

  • 1. Terra-i An eye on Habitat Change Monitoreo en Tiempo Real de Cambios en el Hábitat usando Redes Neuronales y Datos Satelitales Colombia
  • 2. Enfoque Conceptual La intensidad del verde de la vegetación sigue un ciclo natural que depende de factores climáticos (precipitación, temperatura), variables de sitio (tipo de vegetación, características del suelo) y de las alteraciones. Terra-i es un modelo capaz de predecir la evolución de la intensidad verde de la vegetación, con base a medidas de verde anteriores y a medidas climáticas actuales para detectar cambios significativos en el habitad.
  • 4. Metodología General Medidas NDVI MODIS (MOD13Q1), Medida NDVI Precipitación (TRMM) actual Limpieza Limpieza Clustering Selección aleatoria de píxeles. Diferencia entre el Entrenamiento de los NDVI actual y la Modelos Predicción Predicción NDVI actual No Mapas de las Cambio en el Reglas probabilidades de Pixel cambio Si Mapas de los Cambios Sin Cambio en Detectados el Píxel
  • 5. Metodología - Los Modelos • Predicciones Bayesian Neural Network (BNN) • Entrenamiento y aproximación del ruido Scaled Conjugate Gradient (SCG) Bayesian evidence function Gaussian noise • Selección de las entradas del modelo Automatic relevance determination (ARD) • Clustering Algoritmo de K-Means modificado, para ser distribuido en varios procesadores. De cada uno de los clústers se selecciona aleatoriamente 1000 pixeles con los cuales se entrenan 10 modelos….Reduciendo así el tiempo de proceso.
  • 6. Detección de Cambios 9000 8500 8000 7500 7000 NDVI 6500 Measurments 6000 Predictions Cambio 5500 Interval max Interval min 5000 4500 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Time Para la detección de cambios, las Redes Neuronales Bayesianas generan tres indicadores: el valor predicho , la desviación estándar de las predicciones del modelo sobre la función real, el nivel de ruido (Gausiano) de la medida del satélite.
  • 7. Limpieza de los Datos • Elimina todas las variaciones a corto plazo (< 3 meses) • Ajuste iterativo de curvas limpias usando:  Los datos de calidad de MODIS  Análisis de Fourier  Ajuste de mínimos cuadrados con valores de alta calidad
  • 8. Resúmen Gráfico de la Metodología
  • 10. Conjunto de datos de Calibración • Para calibrar el modelo Terra-i en Colombia, se realizó un análisis multitemporal de imágenes satelitales Landsat-7 ETM+ suministradas por USGS Global Visualization Viewer http://glovis.usgs.gov/. • Se seleccionaron 12 tiles de Landsat en Colombia, y para cada uno de ellos se descargaron dos imágenes de la misma época del año para el 2004 y el 2009.
  • 11. Datos de Calibración Se seleccionaron 24 ímágenes para el proceso de calibración de Colombia, teniendo en cuenta que estas cumplieran con las siguientes características:  Para garantizar una buena detección se seleccionaron imágenes con un máximo de 10% de cobertura de nubes.  Los tiles seleccionados para el año 2004 y 2009 deben ser de la misma epoca del año, y en el caso de que sea posible la misma fecha del año.
  • 12. Detección de la Deforestación usando CLASlite. 1. Calibración radiométrica y corrección atmosférica de las imágenes satelitáles usando información MODIS de areosoles y vapor de agua y usando el modelo Second Simulation of the Satellite Signal in the Solar Spectrum model (6S). 2. Análisis cuantitativo a nivel de sub-pixel pixel donde clasifica cada pixel en tres clases: porcentaje de vegetación viva, vegetación muerta y superficie descubierta usando el modelo Monte Carlo Amazonas Colombiano Automated y una biblioteca de datos espectrales. 3. Enmascaramiento de nubes y cuerpos de agua 4. Mapas de cambio en el bosque, donde se obtienen dos mapas uno de deforestación y otro de perturbación forestal.
  • 13. Detección de la Deforestación usando CLASlite. Para que sirve claslite
  • 14. Detección de Deforestation usando ERDAS Image. • En las áreas de Colombia que no pertenecen al Amazonas se utilizo el programa ERDAS Image 8.7 para realizar la detección de cambio en el conjunto de datos de calibración. Aquí se realizó una clasificación no supervisada mediante algotitmo “Self-Organizing Data Analysis Technique” (ISODATA). • Isodata es un algoritmo iterativo, donde inicialmente se seleccionan de manera arbitraria un número de clusters y en cada uno se selecciona el centro. Los píxeles se asignan al centro más cercano, y se vuelven a calcular los nuevos centros. Este proceso se repite hasta alcanzar un número de 10 iteraciones, o hasta que un porcentaje de píxeles queden sin modificar entre dos iteraciones. Este método utiliza la distancia espectral mínima para asignar cada píxel a un centro candidato.
  • 15. Detección de Deforestation usando ERDAS Image. • Mediante este algoritmo es posible identificar diferentes tipos de coberturas, tales como: nubes, cuerpos de agua, vegetación primaria, vegetación secundaria, areas sin cobertura vegetal, sombra de nubes, sombra de montañas y areas urbanas.
  • 16. Detección de Deforestation usando ERDAS Image. Luego se utiliza el software ArcGIS para mezclar la clasificación inicial en tres grandes clases: Vegetación primaria, areas sin cobertura vegetal y NoData. Y se calcula la diferencia entre la pareja de imágenes clasificadas, obteniendo asi una imágen final con tres valores:  Incremento(+1),  Decremento(-1) y  Sin cambio (0). Finalmente, los resultados obtenidos son revisados de manera detallada, superponiendolos a las imágenes satelitales crudas de los años 2004 y 2009, con el fin de encontrar errores en la deteccion, ocasionados principalmente por agricultura intensiva y mal enmascaramiento de nubes.
  • 17. Al realizar la detección de cambios usando los programas computacionales CLASlite en el Amazonas y ERDAS en el resto del territorio nacional, se otiene un mapa final con el cual se hara la primera calibración de los datos en Colombia. Con este proceso se obtuvieron buenos resultados, sin embargo, se debe tener en cuenta que este es un proceso continuo por lo que en un futuro muy cercano se pretende realizar este mismo proceso usando una mayor cantidad de imágenes satelitales, usando otro tipo de sensores y otras metodologías.
  • 19. Calibración de Terra-i. • El objetivo de este paso es comparar los resultados de Terra-i con el conjunto de datos de validación para encontrar el umbral de probabilidad óptimo. Este análisis se repite para cada clase de la zona analizada lo que permite de definir el umbral óptimo de cada clase. • Para cada mapa de detecciones del conjunto de datos de validación y para cada clase representando al área analizado, se definen 3 variables, con las cuales se puede deducir dos indicadores de cualidad del modelo: T: Total de pixeles detectado por Terra-i, V: Total de pixeles detectados en el mapa de validación M: Número de pixeles cuales son detectados por Terra-i y en el mapa de validación . Primer Indicador El primero es la capacidad del modelo de detectar los cambios y se calcula de la siguiente manera: Lo que corresponde a la proporción de pixeles de validación también detectados por Terra-i. Este indicador varia de 0 a 1, 0 representando un modelo mal calibrado y 1 un modelo perfectamente calibrado.
  • 20. Calibración de Terra-i. Segundo Indicador El segundo indicador es la capacidad de Terra-i de detectar únicamente los cambios de cobertura del suelo , es decir, permite averiguar si el ruido en las detecciones es bajo. Se calcula de la siguiente manera: Lo que corresponde a la proporción de pixeles detectados por terra-i que no pertenecen al conjunto de validación. Este indicador varia de 0 a 1, 1 representando un modelo mal calibrado y 0 un modelo perfectamente calibrado. El objetivo es reducir al mínimo I2, mientras se maximiza I1. Lo que se hace fácilmente calculando los indicadores con diferentes umbrales y luego calcular una puntuación P para cada umbral cual corresponde a la distancia euclidiana entre el punto T (, ) y la solución óptima O (1,0). Were selected the threshold with the lower score.
  • 21. Detection Terra-i. Para el monitoreo de cambios en el hábitat en Colombia fueron seleccionadas cuatro areas y cada una fue corrida de manera independiente. En cada una de estas áreas Terra-I selecciono seis clusters, teniendo asi un total de 24 clusters en todo Colombia. Luego se entrenaron 3 modelos con cada uno de estos clustres. El proceso de clustering mostro buenos resultados con esta distribución .
  • 22. Zona 1: Norte del País La primer area seleccionada corresponde a la parte norte del pais. En esta zona el modelo Terra-i creo 6 cluster para el entrenamiento, y a cada uno de estos mediante el proceso de calibración le asignó un valor de probabilidad.
  • 23. Zone 2: Centro del País La segunda area seleccionada corresponde a la parte centro del pais, principalmente la region andina. En esta zona el modelo Terra-i creo 6 cluster para el entrenamiento, y a cada uno de estos mediante el proceso de calibración le asignó un valor de probabilidad.
  • 24. Zone 3: Region Pacifico. La tercer area seleccionada corresponde en gran parte al pacífico Colombiano. En esta zona se tiene información de muy baja calidad, sin embargo como meta a corto plazo se pretende usar datos diarios de MODIS con el fin de aumentar la cobertura de deteccion en la zona, Al igual que en los anteriores casos se crearon 6 cluster para el entrenamiento.
  • 25. Zone 4: Sur y Oriente del País. La cuarta area seleccionada corresponde a la region amazonica y los llanos orientales de Colombia. Al igual que en los anteriores casos se crearon 6 cluster para el entrenamiento y a cada uno de estos mediante el proceso de calibración le asignó un valor de probabilidad.
  • 26. Resultados Terra-i Tasa de Deforestacion 151,754 Ha/año
  • 27.
  • 28. Resultados Terra-i Las prácticas de tala selectiva en el departamento de Santander, ocurren principalmente en la zona del Magdalena Medio santandereano y el bajo Rionegro. Esta deforestación pone en peligro las fuentes hídricas de muchos municipios de este departamento. Deforestation Rate 12,600 Ha/año
  • 29. Resultados Terra-i La región oriental presenta una creciente pérdida de los bosques, debido principalmente a ampliación de la frontera agrícola, colonización en las riberas de los ríos, ganadería y explotación maderera. Tasa de Deforestación 21,300 Ha/año