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Propuestas metodológicas para el análisis de la información en  la agricultura específica por sitio  en frutales Secretarias técnicas de las cadenas productivas (mango,aguacate, cítricos, plátano) Con la participación de :
Agricultura de precisión (AP) Agricultura específica por sitio (AEPS) ,[object Object]
Mide la variacióndentro del lote
Analiza el efecto de un factor o factor por factor sobre la productividad.
Modelosrequierenconocimientodetallado de procesosinvolucrados en el crecmiento de lasplantas.
Manejo de lotessegúnsuscaractérísticasparticulares
Mide la variación entre lotes
Analiza la combinación de factoressobresuefecto en la productividad
Modelosconstruidos con limitadoconocimientoacerca de la interacción de los factoresquedeterminan el crecimiento de unaplanta (caña, café)Referencias: Plant, 2001. Computers and electronics in agriculture. Jiménez et al., 2009. Computers and electronics in agriculture Jiménez et al., 2010. Agricultural Systems
Agricultura de Precisión (AP) Variación dentro del lote ,[object Object]
Agua  Riegos
Plagas y enfermedades  Manejo fitosanitario,[object Object]
AP – AESCE …. Queimplementar? FrutalesTropicales Banano Sensoresremoto Automatización Investigación AP AEPS Algunosforestales Maiz Trigo Soya Caña Café Es cuestión de investigar y avanzar en la medida del compromiso de los actores
Antecedentes AEPS en Colombia Caña de azúcar: CENICAÑA ( mas de 20 años) Camarones:  Ceniacua Café : CIAT– Federación nacional de cafeteros  Frutales sin gremios organizados: BIOTEC – CIAT – HEIG-VD Alrededor de 8 años de experiencia en el tema– 6 años detrás de la idea en frutales tropicales
Definición Agricultura Específica por Sitio  Según CENICAÑA: El arte de  realizar  las prácticas  agronómicas  requeridas  por  un cultivo de  acuerdo con las condiciones espaciales y temporales del sitio donde se cultiva,  para obtener de ella su rendimiento potencial. (Isaacs et al., 2004)
1.6 1.6 1.4 1.4 1.2 1.2 1.0 1.0 TAHM TAHM 0.8 0.8 0.6 0.6 0.4 0.4 0.2 0.2 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 Año Año Caña de azúcar y AEPS: Tons of sugar per ha per  month AEPS Technology development for local  conditions based on SSA Tecnología Autóctona TecnologiaImportada Broad Adaptation development Nota: un taller realizado en oct 2010, CENICAÑA ilustro que en sus investigaciones recientes se esta integrando información de las practicas que hacen cañicultores poco y muy exitosos para aprender de lo que realizan Imported technology Cenicaña SSA=  Site Specific Agriculture
3er año 1er año 1 Recopilación “eventos” (sistema centralizado) Sistema de monitoreo (sistema descentralizado) 2 Protocolos de análisis automatizados Análisis de datos Coordinación Capacitación Sistemas de información 3 x 3 Formación de grupos  Contacto con actores Entrega del conocimientoadquirido
Componentes generales del proyecto AESCE ,[object Object]
Analizar e interpretar la información recopilada.
Grupos de productores (compartiendo experiencias - Conocimientocolectivo),[object Object]
AESCE información de entrada y de salida Relieve y Suelo ClimaTopografía y paisaje Manejo del cultivo ,[object Object]
Condicionesambientalesideales
Prácticasmasadecuadas
Adaptación de variedades,[object Object]
Topografia SRTM GTOPO30
Paisaje Aspect Landscape Class Elevation Slope Moisture Solar Radiation Exposure Curvature
Suelos RASTA Caracteriza  los suelos y terreno  en forma rápida, confiable y sencilla  en el sitio
Suelos: RASTA:
Manejo (información básica y de monitoreo) Oportunidades actuales  para la compilación de la información en bases de datos www.frutisitio.org ,[object Object]
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Control en tiempo real,[object Object]
Regresiones (lineales y no lineales) Formato de información
Proyecto AESCE :Metodologías empleadas en la modelación de respuestas de los árboles frutales Regresiones lineales Kilos/lote = Clima (b1) + Suelos(b2) + manejo (b3) + (B) ,[object Object]
Regresiones robustas: (permiten  contrarrestar la influencia de outliers)
BLUP (Best Linear Unbiased Predictor ): permiten estimar efectos fijos o aleatorios  ,[object Object]
Clima Parámetro Mat. Suelos Bases de datos Parámetro Mat. Kilos/lote Manejo Parámetro Mat. Info  adicional Proyecto AESCE :Metodologías empleadas en la modelación de respuestas de los árboles frutales Regresiones no lineales (redes neuronales artificiales)
V1 V2 V3 V4 V5 … V60 L 4 L 5 … Kg/lote L 2 L 3 Obs 1 0.1 18 3 312 0.3 … 89 0 1 0 1 0 … 2.39 Obs 2 0.2 15 4 526 0.1 … 52 1 0 0 0 1 … 30.35 Obs 3 0.6 14 1 489 0.2 … 64 0 1 1 1 1 … 42.25 Obs 4 0.05 19 2 523 0.5 … 13 0 0 0 0 1 … 52.50 Obs 5 0.4 13 3 214 0.6 … 57 1 1 1 1 1 … Obs6 0.8 12 4 265 0.4 … 24 1 1 0 1 0 … 82.25 Obs7 0.2 15 1 236 0.8 … 26 0 0 1 0 0 … 89.28 Obs 8 0.1 17 3 541 0.1 … 35 0 1 1 1 0 … 125.0 Obs9 0.6 16 2 845 0.3 … 51 0 0 1 1 0 … 142.8 Obs10 0.1 18 1 126 0.1 … 43 1 1 0 0 1 … 150.0 … … … … … … … … … … … … … … … Obs3000 0.04 15 3 235 0.6 … 85 1 1 1 1 0 … 180 … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs 9 Obs 10 0.1 0.2 0.6 0.05 0.4 0.8 0.2 0.1 0.6 0.1 … 0.04 18 15 14 19 13 12 15 17 16 18 … 15 … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs 9 Obs 10 3 4 1 2 3 4 1 3 2 1 … 3 312 526 489 523 214 265 236 541 845 126 … 235 3.07 29.8 54 60 … 90 100 150 170 149 … 192 0.3 0.1 0.2 0.5 0.6 0.4 0.8 0.1 0.3 0.1 … 0.6 E … … … … … … … … … … … … 89 52 64 13 57 24 26 35 51 43 … 85 Regresiones no lineales (redes neuronales artificiales – perceptronmulti -capa) Predicciónes L 1 Predicho … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs9 Obs 10 2.07 29.0 53.5 50.5 89.5 99.2 120 172 170 … 188 E Real … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs9 Obs 10 … 52.5 2.3 30.3 42.5 82.2 180 142 89.2 125 150
Puntaje= # de classificacionescorrectas # total de objetos a classificar Puntaje=8/10=80% Validación: test Kappa Regresiones no lineales (redes neuronales artificiales – perceptronmulti -capa) Datoscuantitativos Datoscualitativos observado observado predicho predicho
26 Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Dependencia de variables Calidad de vida en el mundo ,[object Object]
39 indicadores fueron tomados describiendo varios factores de calidad de vida tales como salud, nutrición, calida de los servicios públicos, acceso a la educación etc.
Países que tenían indicadores similares se ubicaron cerca el uno del otro en el mapa.
Realizado con datos faltantes,[object Object]
Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Distribución de Iris Dependencia de variables Iris versicolor Iris virgínica Iris setosa
Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Dependencia de variables Base de datosplantas de Iris Kohonen map Iris setosa Iris versicolor Iris virgínica
Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Dependencia de variables Base de datosplantas de Iris Iris setosa Iris versicolor Iris virgínica
Ejemplos reales en frutales en Colombia  (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) – Modelo correcto: (Jiménez, D., Cock, J., Satizábal, F., Barreto, M., Pérez-Uribe, A., Jarvis, A. and Van Damme, P., 2009. Computers and Electronics in Agriculture. 69 (2): 198–208
Ejemplos reales en frutales en Colombia  (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - Análisis de relevancia: (Jiménez, D., Cock, J., Satizábal, F., Barreto, M., Pérez-Uribe, A., Jarvis, A. and Van Damme, P., 2009. Computers and Electronics in Agriculture. 69 (2): 198–208
Ejemplos reales en frutales en Colombia  (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables)  (a) Plano indicando la productividad de mora. La escala a la derecha  indica el valor de productividad kg/planta/semana. La parte superior indica valores altos de producciónmientras la parte inferior muestrabajosvalores. (b)mapa de red neuronal  mostrando 6 grupos de productividad y susetiquetas de acuerdo a los valores de productividad
Ejemplos reales en frutales en Colombia  (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables)  Planos de profundidad efectiva: La escala de la dercha indica el rango de valor en centimetros de profundidad efectiva, la parte superior de la escala indica valores altos mientras la baja indica valores bajos de profundidad efectiva
Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables)  Planos de temperatura: (a)temperatura del mes de cosecha, (b)temperaturapromedio del 1er mes anterior a la cosecha, (c)temperaturapromedio del 2do mes anterior a la cosecha, and (d)temperaturapromedio del 3er mes anterior a la cosechaEn todaslasfiguras, la escala (derecha) indica el rango de temperatura en ◦C . La parte superior indica valores altos de temperatuamientras la baja indica valoresbajos
Ejemplos reales en frutales en Colombia  (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables)  Planos de laslocalidades Nariño–la union–chical alto (izquierda)  y  Nariño–la union–cusillobajoderecha). . La parte superior de la escala a la derecha indica presenciamientras la baja indica vausenciadebido  a que son variables categóricas

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AESCE - Metodologías del Análisis de la información

  • 1. Propuestas metodológicas para el análisis de la información en  la agricultura específica por sitio  en frutales Secretarias técnicas de las cadenas productivas (mango,aguacate, cítricos, plátano) Con la participación de :
  • 2.
  • 4. Analiza el efecto de un factor o factor por factor sobre la productividad.
  • 7. Mide la variación entre lotes
  • 8. Analiza la combinación de factoressobresuefecto en la productividad
  • 9. Modelosconstruidos con limitadoconocimientoacerca de la interacción de los factoresquedeterminan el crecimiento de unaplanta (caña, café)Referencias: Plant, 2001. Computers and electronics in agriculture. Jiménez et al., 2009. Computers and electronics in agriculture Jiménez et al., 2010. Agricultural Systems
  • 10.
  • 12.
  • 13. AP – AESCE …. Queimplementar? FrutalesTropicales Banano Sensoresremoto Automatización Investigación AP AEPS Algunosforestales Maiz Trigo Soya Caña Café Es cuestión de investigar y avanzar en la medida del compromiso de los actores
  • 14. Antecedentes AEPS en Colombia Caña de azúcar: CENICAÑA ( mas de 20 años) Camarones: Ceniacua Café : CIAT– Federación nacional de cafeteros Frutales sin gremios organizados: BIOTEC – CIAT – HEIG-VD Alrededor de 8 años de experiencia en el tema– 6 años detrás de la idea en frutales tropicales
  • 15. Definición Agricultura Específica por Sitio Según CENICAÑA: El arte de realizar las prácticas agronómicas requeridas por un cultivo de acuerdo con las condiciones espaciales y temporales del sitio donde se cultiva, para obtener de ella su rendimiento potencial. (Isaacs et al., 2004)
  • 16. 1.6 1.6 1.4 1.4 1.2 1.2 1.0 1.0 TAHM TAHM 0.8 0.8 0.6 0.6 0.4 0.4 0.2 0.2 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 1960 1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005 2010 Año Año Caña de azúcar y AEPS: Tons of sugar per ha per month AEPS Technology development for local conditions based on SSA Tecnología Autóctona TecnologiaImportada Broad Adaptation development Nota: un taller realizado en oct 2010, CENICAÑA ilustro que en sus investigaciones recientes se esta integrando información de las practicas que hacen cañicultores poco y muy exitosos para aprender de lo que realizan Imported technology Cenicaña SSA= Site Specific Agriculture
  • 17. 3er año 1er año 1 Recopilación “eventos” (sistema centralizado) Sistema de monitoreo (sistema descentralizado) 2 Protocolos de análisis automatizados Análisis de datos Coordinación Capacitación Sistemas de información 3 x 3 Formación de grupos Contacto con actores Entrega del conocimientoadquirido
  • 18.
  • 19. Analizar e interpretar la información recopilada.
  • 20.
  • 21.
  • 24.
  • 26. Paisaje Aspect Landscape Class Elevation Slope Moisture Solar Radiation Exposure Curvature
  • 27. Suelos RASTA Caracteriza  los suelos y terreno  en forma rápida, confiable y sencilla en el sitio
  • 29.
  • 31.
  • 32. Regresiones (lineales y no lineales) Formato de información
  • 33.
  • 34. Regresiones robustas: (permiten contrarrestar la influencia de outliers)
  • 35.
  • 36. Clima Parámetro Mat. Suelos Bases de datos Parámetro Mat. Kilos/lote Manejo Parámetro Mat. Info adicional Proyecto AESCE :Metodologías empleadas en la modelación de respuestas de los árboles frutales Regresiones no lineales (redes neuronales artificiales)
  • 37. V1 V2 V3 V4 V5 … V60 L 4 L 5 … Kg/lote L 2 L 3 Obs 1 0.1 18 3 312 0.3 … 89 0 1 0 1 0 … 2.39 Obs 2 0.2 15 4 526 0.1 … 52 1 0 0 0 1 … 30.35 Obs 3 0.6 14 1 489 0.2 … 64 0 1 1 1 1 … 42.25 Obs 4 0.05 19 2 523 0.5 … 13 0 0 0 0 1 … 52.50 Obs 5 0.4 13 3 214 0.6 … 57 1 1 1 1 1 … Obs6 0.8 12 4 265 0.4 … 24 1 1 0 1 0 … 82.25 Obs7 0.2 15 1 236 0.8 … 26 0 0 1 0 0 … 89.28 Obs 8 0.1 17 3 541 0.1 … 35 0 1 1 1 0 … 125.0 Obs9 0.6 16 2 845 0.3 … 51 0 0 1 1 0 … 142.8 Obs10 0.1 18 1 126 0.1 … 43 1 1 0 0 1 … 150.0 … … … … … … … … … … … … … … … Obs3000 0.04 15 3 235 0.6 … 85 1 1 1 1 0 … 180 … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs 9 Obs 10 0.1 0.2 0.6 0.05 0.4 0.8 0.2 0.1 0.6 0.1 … 0.04 18 15 14 19 13 12 15 17 16 18 … 15 … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs 9 Obs 10 3 4 1 2 3 4 1 3 2 1 … 3 312 526 489 523 214 265 236 541 845 126 … 235 3.07 29.8 54 60 … 90 100 150 170 149 … 192 0.3 0.1 0.2 0.5 0.6 0.4 0.8 0.1 0.3 0.1 … 0.6 E … … … … … … … … … … … … 89 52 64 13 57 24 26 35 51 43 … 85 Regresiones no lineales (redes neuronales artificiales – perceptronmulti -capa) Predicciónes L 1 Predicho … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs9 Obs 10 2.07 29.0 53.5 50.5 89.5 99.2 120 172 170 … 188 E Real … Obs3000 Obs 1 Obs 2 Obs 3 Obs 4 Obs 5 Obs 6 Obs 7 Obs 8 Obs9 Obs 10 … 52.5 2.3 30.3 42.5 82.2 180 142 89.2 125 150
  • 38. Puntaje= # de classificacionescorrectas # total de objetos a classificar Puntaje=8/10=80% Validación: test Kappa Regresiones no lineales (redes neuronales artificiales – perceptronmulti -capa) Datoscuantitativos Datoscualitativos observado observado predicho predicho
  • 39.
  • 40. 39 indicadores fueron tomados describiendo varios factores de calidad de vida tales como salud, nutrición, calida de los servicios públicos, acceso a la educación etc.
  • 41. Países que tenían indicadores similares se ubicaron cerca el uno del otro en el mapa.
  • 42.
  • 43. Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Distribución de Iris Dependencia de variables Iris versicolor Iris virgínica Iris setosa
  • 44. Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Dependencia de variables Base de datosplantas de Iris Kohonen map Iris setosa Iris versicolor Iris virgínica
  • 45. Métodos de Clustering (redes neuronales artificiales – Mapas de Kohonen) Dependencia de variables Base de datosplantas de Iris Iris setosa Iris versicolor Iris virgínica
  • 46. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) – Modelo correcto: (Jiménez, D., Cock, J., Satizábal, F., Barreto, M., Pérez-Uribe, A., Jarvis, A. and Van Damme, P., 2009. Computers and Electronics in Agriculture. 69 (2): 198–208
  • 47. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - Análisis de relevancia: (Jiménez, D., Cock, J., Satizábal, F., Barreto, M., Pérez-Uribe, A., Jarvis, A. and Van Damme, P., 2009. Computers and Electronics in Agriculture. 69 (2): 198–208
  • 48. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables) (a) Plano indicando la productividad de mora. La escala a la derecha indica el valor de productividad kg/planta/semana. La parte superior indica valores altos de producciónmientras la parte inferior muestrabajosvalores. (b)mapa de red neuronal mostrando 6 grupos de productividad y susetiquetas de acuerdo a los valores de productividad
  • 49. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables) Planos de profundidad efectiva: La escala de la dercha indica el rango de valor en centimetros de profundidad efectiva, la parte superior de la escala indica valores altos mientras la baja indica valores bajos de profundidad efectiva
  • 50. Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables) Planos de temperatura: (a)temperatura del mes de cosecha, (b)temperaturapromedio del 1er mes anterior a la cosecha, (c)temperaturapromedio del 2do mes anterior a la cosecha, and (d)temperaturapromedio del 3er mes anterior a la cosechaEn todaslasfiguras, la escala (derecha) indica el rango de temperatura en ◦C . La parte superior indica valores altos de temperatuamientras la baja indica valoresbajos
  • 51. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en regresión y visualización de dependencia de variables) Caso de estudio: Mora (Rubusglaucus) - visualización de dependencia de variables) Planos de laslocalidades Nariño–la union–chical alto (izquierda) y Nariño–la union–cusillobajoderecha). . La parte superior de la escala a la derecha indica presenciamientras la baja indica vausenciadebido a que son variables categóricas
  • 52. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en combinación con metodologías tradicionales) Caso de estudio: Lulo (Solanum quitoense) – Modelocorrecto Jiménez, D., Cock, J., Jarvis, A., Garcia, J., Satizábal, H.F., Van Damme, P., Pérez-Uribe, A. and Barreto-Sanz, M., 2010. Interpretation of Commercial Production Information: A case study of lulo (Solanum quitoense), an under-researched Andean fruit. Agricultural Systems. In press. published online at: http://dx.doi.org/10.1016/j.agsy.2010.10.004
  • 53. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en combinación con metodologías tradicionales) Caso de estudio: Lulo (Solanum quitoense) – Modelo correcto
  • 54. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en combinación con metodologías tradicionales) Caso de estudio: Lulo (Solanum quitoense) – Análisis de relevancia Tres variables: 1. Profundidadefectiva, 2. Temperatura y 3. Pendientefueronrelevantesparaambasregresiones lineal y no lineal
  • 55. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en combinación con metodologías tradicionales) Caso de estudio: Lulo (Solanum quitoense) – clustering Las tres variables relevantes fueron utilizadas para definir grupos con condiciones ambientales homogéneas = 3
  • 56. Ejemplos reales en frutales en Colombia (Redes neuronales artificiales en combinación con metodologías tradicionales) Caso de estudio: Lulo (Solanum quitoense) – Modelomixtoparaconocer los efectossobre la productividad de grupos con condiciones ambientales homogéneas Condiciones ambiental homogénea 3 fue la mas productiva – 41 gr de lulo /planta más que el promedio
  • 57.
  • 58.
  • 59. Analizar e interpretar la información recopilada Naranja Antioquia produce más naranja con la mitad de las hectáreas cultivadas en Tolima  Oportunidad Fuente MADR (promedio 2002- 2008)
  • 60.
  • 61. Si clima y suelos influyen en la adaptabilidad del cultivo, en sitios con climas y suelos similares tendrían adaptabilidad similar
  • 62.
  • 63. Hacia un nuevo Homologue: Modelación de grandes bases de datos - Cuantización vectorial – Visualización - Lógica difusa para “suavizar” la asignación de categorías Crisp Fuzzy
  • 64. Aplicaciones utilizadas: FENNIX SomToolbox - MATLABscript BIS
  • 65. Estrategias de colecta de información primaria Niveles de Intervención a. Investigadores CIAT v Cadenas Asohofrucol MADR b. Facilitadores de lasCadenas Organizaciones Nivel de intervención c. Facilitadores de lasSecretarías de agricultura Federaciones d. Individualesacceso virtual Grupos
  • 66. Promoción al consumo - Biblioteca con ruedas – Unidad multimedia móvil