Dokumen tersebut membahas tentang diagnosis penyakit infeksi melalui pemeriksaan spesimen, termasuk teknik pengambilan dan pengiriman spesimen, metode pemeriksaan mikrobiologi seperti kultur, identifikasi bakteri, tes sensitivitas antibiotik, dan serologi.

1. DX PENYAKIT INFEKSIDX PENYAKIT INFEKSI

3. Pemeriksaan SpesimenPemeriksaan Spesimen
►Type of specimenType of specimen
 Cervical not vaginal swab : N gonorrhoeaeCervical not vaginal swab : N gonorrhoeae
 Sputum not salivaSputum not saliva
►Time of collectionTime of collection
 Urine are best collected soon after patientsUrine are best collected soon after patients
weaksweaks
 SputumSputum
 Blood for culture ; patiens temperature begins toBlood for culture ; patiens temperature begins to
rise, before AB treatment is startedrise, before AB treatment is started

4. Cont …Cont …
• Collection techniques
– Aseptic procedures :
• Prevent contamination
• Protect patient
– Avoid contaminating material with skin
commensals
– Collect specimen in sterile
– Report any abnormal features

5. Cont …Cont …
Labelling of specimensLabelling of specimens

Dete and time of collectionDete and time of collection

Patients namePatients name

NumberNumber

Clinical note :Clinical note :
Patients illness, suspected diagnosisPatients illness, suspected diagnosis
Any AB treatmentAny AB treatment

Specimen contain dangerous pathogen,Specimen contain dangerous pathogen,
labelled high risk :labelled high risk :
Sputum , faecal, ulcer, bloodSputum , faecal, ulcer, blood

6. Cont …Cont …
 Transport MediaTransport Media
 Prevent from dying due to enzyme actionPrevent from dying due to enzyme action
 Change pHChange pH
 Lack of essential nutrientLack of essential nutrient
 Refrigeration ;Refrigeration ;
 Preserve cellsPreserve cells
 Reduce multiplication commensalReduce multiplication commensal
 Amies, Cary and BlairAmies, Cary and Blair

7. Penyakit InfeksiPenyakit Infeksi
• Penyebab :Penyebab :
– BakteriBakteri
– JamurJamur
– VirusVirus
– ParasitParasit
• Temukan agentTemukan agent
• Pemeriksaan spesimenPemeriksaan spesimen

8. Diagnosis Penyakit InfeksiDiagnosis Penyakit Infeksi
• Cara ImunoserologiCara Imunoserologi
• Cara Mikrobiologi :Cara Mikrobiologi :
– Konvensional :Konvensional :
• IsolasiIsolasi
• Identifikasi, KepekaanIdentifikasi, Kepekaan
– Molekuler : PCRMolekuler : PCR
• MO tidak bisa dibiakMO tidak bisa dibiak
• MO sulit dibiakMO sulit dibiak
• MO slow growerMO slow grower

9. Latar BelakangLatar Belakang
►Masalah utama kesehatan di IndonesiaMasalah utama kesehatan di Indonesia
►Morbiditas dan mortalitas masih tinggiMorbiditas dan mortalitas masih tinggi
►Diagnosis yang tepatDiagnosis yang tepat
►Pengobatan rasionalPengobatan rasional
►Langkah yang diperlukan :Langkah yang diperlukan :
 Pengambilan spesimenPengambilan spesimen
 Pengiriman spesimenPengiriman spesimen
 Metode pemeriksaan dan pembacaan hasilMetode pemeriksaan dan pembacaan hasil

10. JENIS SPESIMENJENIS SPESIMEN
• SPESIMEN STERIL
– Diambil dari daerah yang seharusnya tidak
ada bakterinya, misalnya :
• Darah
• Cairan spinal
• Cairan sendi
• Urine
– Bila dikultur mestinya tidak ada bakteri, kalau
ada : patogen

12. Spesimen non sterilSpesimen non steril
Diambil dari daerah yang secara normalDiambil dari daerah yang secara normal
ada bakterinya, misalnya :ada bakterinya, misalnya :

TinjaTinja

GenitalGenital

SputumSputum

PusPus
Bila dikultur akan tumbuh bakteri patogenBila dikultur akan tumbuh bakteri patogen
dan flora normaldan flora normal

15. METODE PEMERIKSAAN
MIKROSKOPIS
PEWARNAAN
SIMPLE STAINING
GRAM
Ziehl-Neelsen (AFB/BTA)
TANPA PEWARNAAN
Dari spesimen cair, kultur cair
Teteskan pada slide
Amati : sel, bakteri, motilitas

24. KULTURKULTUR
 Bakteri tumbuh pada artificial mediaBakteri tumbuh pada artificial media
 Bakteri patogen umumnya heterotrofBakteri patogen umumnya heterotrof
 Constituents of culture media :Constituents of culture media :
 WaterWater
 Sodium chloride, other electrolytesSodium chloride, other electrolytes
 PeptonPepton
 Meat extract, yeast extractMeat extract, yeast extract
 Blood, Agar (KH from sea weed)Blood, Agar (KH from sea weed)

25. MEDIA PADATMEDIA PADAT
 Dispensed in plastic or glass petri dishesDispensed in plastic or glass petri dishes
 Ditambah agar 1,5 %Ditambah agar 1,5 %
 Keuntungan :Keuntungan :
 It allows separate colony formationIt allows separate colony formation
 Colonial morphology – presumptive identif.Colonial morphology – presumptive identif.
 QuantitationQuantitation
 Pure culturePure culture

26. LIQUID MEDIALIQUID MEDIA
 Dispense in tubesDispense in tubes
 Growth is recognised by turbidityGrowth is recognised by turbidity
 KEGUNAAN :KEGUNAAN :
– Bila bakteri dlm jumlah kecil – tumbuh padaBila bakteri dlm jumlah kecil – tumbuh pada
media cairmedia cair
– Digunakan utk tes biokimia : identifikasiDigunakan utk tes biokimia : identifikasi
– Sering sbg media penyuburSering sbg media penyubur

28. SEMI SOLID MEDIASEMI SOLID MEDIA
 Mengandung 0,5 % agarMengandung 0,5 % agar
 Digunakan untuk :Digunakan untuk :
 Medium transportMedium transport
 Contoh : Stuart, Cary and BlairContoh : Stuart, Cary and Blair
 Melihat gerak kuman :Melihat gerak kuman :
 Contoh : SIM, MIO, MIUContoh : SIM, MIO, MIU

31. IDENTIFIKASI
• Morfologi Bakteri
– Warna dan bentuk koloni digunakan untuk
presumptive identification
– Hasil pewarnaan koloni
• Kebutuhan Pertumbuhan
– Tumbuh pada kondisi aerob atau anaerob
– Tumbuh pada simple media, enriched, or
selective media

32. • Tes Biokimia
– Ada yang commercial : API system
– Dibuat dalam tb reaksi (konvensional)
• Tes Enzim : contoh Coagulase
menggunakan plasma utk identifikasi
Staphylococcus aureus.
• Struktur Antigenik : untuk mengenal
antigen flagel, dinding sel, kapsul dll.

35. SENSITIVITY TESTSENSITIVITY TEST
• Disc DiffusionDisc Diffusion
– Tes ini yang paling banyak digunakanTes ini yang paling banyak digunakan
– Metode : cakram ditetesi lar antibiotik tertentuMetode : cakram ditetesi lar antibiotik tertentu
diletakkan diatas permukaan edium yangdiletakkan diatas permukaan edium yang
ditanam bakteri yang sudah diidentifikasi sbgditanam bakteri yang sudah diidentifikasi sbg
penyebab infeksipenyebab infeksi
– Digunakan cara :Digunakan cara :
• Kirby- BauerKirby- Bauer
• Stokes methodStokes method

37. • Tube Dilution
– Metode : serial tabung dengan konsentrasi
antibiotik (doubling dilutions) dalam media
cair.
– Pengamatan : tabung tanpa pertumbuhan
bakteri (jernih) – didapatkan KHM (MIC)
– Juga dapat ditentukan MBC dg menanam ke
solid media

38. SEROLOGYSEROLOGY
Beberapa penyakit di diagnosis denganBeberapa penyakit di diagnosis dengan
menentukan antibodi dari darah pasien.menentukan antibodi dari darah pasien.
Dengan menentukan titer antibodi sepertiDengan menentukan titer antibodi seperti
Widal, ASTO atau VDRLWidal, ASTO atau VDRL
METODE :METODE :

Aglutinasi : antibodi dari serum pasien diAglutinasi : antibodi dari serum pasien di
deteksi dari adanya agregasi dengandeteksi dari adanya agregasi dengan
suspensi bakteri.suspensi bakteri.

39.  Presipitasi : antigen dlm bentuk solublePresipitasi : antigen dlm bentuk soluble
dan antibodi di deteksi dg pembentukandan antibodi di deteksi dg pembentukan
presipitat (visible line) sebagai akibatpresipitat (visible line) sebagai akibat
difusi pd agar gel.difusi pd agar gel.
 Complement FixationComplement Fixation
 Kombinasi antigen dg antibodi diikat dgKombinasi antigen dg antibodi diikat dg
komplemen.komplemen.
 Ditambah indikator ; terjadi hemolisis bilaDitambah indikator ; terjadi hemolisis bila
free atau unfixed complementfree atau unfixed complement

40.  Immunofluorescence : antigen akanImmunofluorescence : antigen akan
berfluoresensi bila dilihat dg mikroskopberfluoresensi bila dilihat dg mikroskop
menggunakan UV.menggunakan UV.
 RIARIA
 ELISAELISA
 Antibodi dari serum pasien di deteksi dg radioaktifAntibodi dari serum pasien di deteksi dg radioaktif
atau perubahan warna yg dihasilkan dari ikatanatau perubahan warna yg dihasilkan dari ikatan
enzim dengan substrat tertentu.enzim dengan substrat tertentu.