La importancia de la taxonomía se debe a que brinda una estructura ordenada de información sobre los organismos vivos.
Las colecciones son el respaldo, la memoria y, de cierta manera, la culminación del esfuerzo que ha hecho el hombre por conocer y organizar su conocimiento de los organismos que lo acompañan poblando la tierra.
Si el objetivo de las colecciones biológicas es representar la diversidad, se puede valorar la tarea que enfrentan los centros que guardan estos materiales; parece más evidente que es indispensable recurrir a las computadoras para manipular adecuadamente esas inmensas cantidades de datos.
Tema 1. Generalidades de Microbiologia Universidad de Oriente
Bases de datos en taxonomía y colecciones científicas
1. Bases de Datos en Taxonomía y
Colecciones Científicas
L.C.A. José Arturo Guerra Cantú
2. Taxonomía, colecciones científicas e informática
“Se de cuenta o no todo biólogo
(aún el que trabaja en el nivel
molecular) trabaja con especies o
partes de especies y sus hallazgos
pueden ser influidos por la elección
de una especie en particular. La
comunicación de sus resultados
dependerá de la correcta
identificación de la especie
involucrada y, de esta manera, de su
taxonomía”Ernest Mayr (1957)
3. La importancia de la taxonomía se debe a que brinda
una estructura ordenada de información sobre los
organismos vivos
Legado de Linneo, sentado las bases teóricas y prácticas
para la formación de colecciones botánicas, junto con
su sistema de clasificación y de nomenclatura
4. Las colecciones científicas
(herbarios y museos) son la
base principal del trabajo
taxonómico
Principal objetivo:
Representación de la
diversidad biológica por medio
de especímenes
5. Las colecciones son el respaldo, la memoria y, de cierta
manera, la culminación del esfuerzo que ha hecho el
hombre por conocer y organizar su conocimiento de los
organismos que lo acompañan poblando la tierra.
<< No cambiará su importancia, cambiará la forma de
registrar, consultar y comunicar la información taxonómica >>
6. Los museos y herbarios son centros de información
Catálogos y BibliografíaEspecímenes
Datos:
Nombres científicos
Esquemas de clasificación de los
organismos de la colección
Ejemplares
Morfología y características de taxa
Distribución o localización de los
mismos
Otros datos (según el fin):
Descriptivos (citoquímicos, bioquímicos,
sonidos grabados)
Descriptivos de su entorno (geograficos,
ecológicos, climatológicos)
Forma de utilizar (Farmacológicos,
gastronómicos, religiosos)
7. Colecciones Científicas y crisis de la biodiversidad
Sistemática, Levantar un inventario de la diversidad
biológica (Colecciones).
Colecciones Mostrarán especies que existieron de
manera incompleta
EXTINCIÓN
Necesidad de que la sistemática adecúe y mejore sus
procedimientos de trabajo para ayudar a dar
respuestas a los desafíos del deterioro ecológico.
8. Magnitudes de la información
sobre la diversidad biológica
Los herbarios tienen una tradición más acendrada
que los museos zoológicos como centros de acopio
de ejemplares biológicos.
9. Herbarios más grandes y estimación de la cantidad de
ejemplares que poseen (Radford et al., 1974)
Siglas Núm. De especímenes
Kew, Inglaterra K 7 000 000
París, Francia P 5 000 000
Ginebra, Suiza G 4 000 000
Lyon, Francia LY 3 800 000
Nueva York,
EUA
NY 3 000 000
Chicago, EUA F 2 350 000
10. Herbarios con más de 50 000 ejemplares y con sistema
de información automatizada (Pankhurst, 1984)
Colección País Núm. De
especímenes
Fecha apox. De
inicio
Notre Dame EUA 65 000 1968
Smithsonian
Institution
EUA 53 000 (algas)
70 000 (tipos)
1969
Flora de Veracruz México 60 000 1970
Brisbane Australia 360 000 1973
Bogotá Colombia 120 000 1974
Pretoria Sudáfrica 620 000 1974
Programa Flora Brasil 220 000 1976
UNAM México 60 000 1982
11. Si el objetivo de las colecciones biológicas es
representar la diversidad, se puede valorar la tarea que
enfrentan los centros que guardan estos materiales;
parece más evidente que es indispensable recurrir a las
computadoras para manipular adecuadamente esas
inmensas cantidades de datos
12. El papel de las computadoras en las colecciones
• Informática: disciplina que se encarga
de lo relacionado con el manejo
automatizado de la información
• Deficiencia por la carencia de
suficiente personal especializado en
análisis de sistemas, programadores
de computadoras, administradores de
bases de datos y responsables del
sistema
13. Bases de Datos
Sistema de mantenimiento de registros basados en
computadores, es decir, un sistema cuyo propósito
general es registrar y mantener la información
15. Base de datos taxonómicas
Una base de datos de la mayor importancia para la
taxonomía es la nomenclatura, las reglas de
denominación de las especies están claramente
establecidas, y son independientes de los diversos
criterios de delimitación de las especies.
EUA (1996)
Canadá
México
Otros
Sistema Integrado de Información Taxonómica
Elaborar una base de datos completa y accesible de
información taxonómica para cada una de las especies y de
los taxones reconocidos, incluyendo tanto el lugar en el
sistema jerárquico de la clasificación científica , como las
referencias a las autoridades en la materia que lo han situado
en su posición taxonómica
16. Bases de datos curatoriales
<<Información relacionada con los especímenes>>
En los últimos 20 años se ha incrementado el uso de las bases de
datos curatoriales para estimar la riqueza de especies y los
cambios en la biodiversidad, así como otros aspectos de análisis
espacial.
También contienen información cronológica que puede utilizarse
para reconstruir la historia del conocimiento de la biodiversidad.
Datos geográficos y
biogeograficos
17. La mayor parte de esa información se obtiene de colecciones
biológicas, que contienen los datos del colector, el sitio, la fecha
de la recolección, y otros datos que no se encuentran en los
registros de especies descritas en la bibliografía
Es por esto que los museos se convierten en centros
privilegiados para la investigación y planeación de estrategias de
conservación y las bases de datos procedentes de esas fuentes
proporcionan información completa para análisis espaciales y
temporales de la diversidad biológica
Según el fin:
Biosistemática y control biológico de
artrópodos
Base de datos:
Colección Internacional de
Artrópodos de la Soya (ISAC)
Base de datos de artrópodos
inmigrantes del hemisferio occidental
Sistema de Información de
Investigación de Pesticidas (PRIS)
18. Dificultades y perspectivas
• Insatisfacción, escepticismo a banco de datos computarizados
Dificultades:
Datos de etiquetas (Especímenes antiguos)
Grupos Taxonómicos no han sido trabajados
en décadas
Organización de museos o herbarios
Resistencia a la cooperación internacional
entre las instituciones más importantes
Infraestructura de equipo y
telecomunicaciones
De mantenerse las tendencias actuales se agudizará la problemática
Somos responsables de llegar a acuerdos…
19. Literatura consultada
• Llorente B., J e Isolanda Luna Vega (Compiladores). 1994. Taxonomía
Biológica. Ed. Fondo de Cultura Económica. Pp. 259-275
• Oñate-Ocaña, Leonor; Llorente-Bousquets, Jorge. 2010. "El uso de bases
de datos curatoriales para reconstruir la historia del conocimiento
taxonómico: un ejemplo con papiliónidas y piéridas mexicanas (Insecta:
Lepidoptera)". Revista Mexicana de Biodiversidad, num. Sin mes, pp. 343-
362.
• http://www.itis.gov