ViroScan3D est une société de services en génomique et micro-génomique dédiée à l'infectiologie. Nous proposons notre expertise pour vos projets de Recherche de Biomarqueurs et de Pathogènes grâce à des technologies de pointe telles que le séquençage haut débit et les microarrays. Nous sommes particulièrement spécialisés dans le traitement et l'analyse des échantillons complexes : ARN/ADN dégradés, FFPE, micro-quantité, cellule isolée, échantillon dilué, populations complexes...

1. Solutions de services et R&D
en Génomique Infectieuse
Discovery & Detection on Demand

2. Les Offres de ViroScan3D
Biomarker 3D
Pour la recherche de biomarqueurs (diagnostiques, pronostiques, toxicité …) par des signatures :
 Transcriptomiques (ARNs codants et non codants)
 Génomiques (SNP, CNV, InDel)
 Epigénomiques (Méthylation, Hydroxyméthylation, Modifications Histones)
Pour la découverte et la détection de biomarqueurs connus, inconnus, ciblés ou à large débit
(nombre d’échantillons / de gènes marqueurs)
Virus & Microorganismes 3D
Pour l’identification ou la détection :
 De mutants de résistance thérapeutique, de quasi-espèces
 D’agents infectieux, nouveaux ou connus, dans des tissus, fluides biologiques ou des cellules
isolées
 Des sites d’insertions de génomes infectieux (InSeq)
 Des agents contaminants présents ou suspectés dans des produits thérapeutiques (vaccins,
stocks viraux, etc…), cosmétiques, prélèvements environnementaux (eau, boue, etc…)
Whole Genome Sequencing
Pour l’obtention des séquences nucléotidiques complètes :
 De nouveaux génomes (virus, procaryotes, eucaryotes) y compris grands génomes
 De métagénomes, de viromes ou de microbiomes

3. Spécialisation dans les échantillons complexes
 Echantillons dégradés suite à une étape d’inactivation (chaleur, formol) ou à des méthodes de
conservation particulières (FFPE)
 Echantillons en faible quantité (biopsies, cellules en faible quantité, approches cellules
uniques)
 Cibles faiblement représentées, diluées dans le génome de l’hôte
 Grande diversité d’espèces
Exemple d’identification de virus dilués
dans le génome de l’hôte :
Enrichissement en génome viral
Dupinay et al. 2012, 2013
Parnership with VetAgro Sup Lyon
Exemple d’identification de
biomarqueurs transcriptomique à
partir d’une faible quantité de cellules:
Enrichissement en génome humain
Parnership with VirPath Lyon

4. Un parc technologique de pointe
 Un service clé en main de la préparation des échantillons à la validation des données de
l’analyse
 Un service personnalisé réalisé avec la technologie la plus adaptée à vos besoins
 La possibilité de développer de nouveaux protocoles à façon grâce à notre service de R&D
MULTIPLEX & REAL TIME PCR
Roche lightcycler 32 & 480
Applied 7900 HT
Luminex Magpix,
Flexmap 3D
MICROARRAYS
Affymetrix
Agilent
BEAD ARRAYS
iScan Illumina
NGS SEQUENCING
Illumina HiSeq 2500,
MiSeq & NextSeq 500
STORAGE & SOFWARE
Data storage cluster 40 To
Software : Ingenuity Pathway
Analysis, Partek Genomic
Suite, Custom algorithms
CELL ISOLATION
Acturus Microdissector
C1 Fluidigm
Sample
Preparation
NGS, Microarrays,
PCR
Data Analysis Data Validation

5. Nous contacter
Management
Responsable R&D
Adresse
Catherine Legras – Lachuer, CEO
Tél. : +33 (0) 6 63 43 24 04 | Fax : +33 (0) 4 37 28 76 05
Email : catherine.lachuer@viroscan3d.com
Magali Roche
Tél. : +33 (0) 4 78 77 28 89
Email : magali.roche@viroscan3d.com
Bureaux (adresse de Facturation)
ViroScan3D
11 allée des Acacias
01600 Trévoux
Laboratoires (adresse de Livraison des échantillons)
ViroScan3D-ProfileXpert
Faculté de Médecine et de Pharmacie,
8 avenue Rockefeller, Aile 2C et 3B,
69008 Lyon cedex
Site internet
www.viroscan3d.com